Pessoal,
dado um modelo y = Xb + Zu + e , modelo misto com Xb parte fixa e Zu parte aleatoria, estou tentando entender melhor a analise feita neste documento,
http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/bitstream/doc/883425/1/Doc210.pdf , pagina 54, ao meu entendimento é um modelo misto, onde a mudança é a forma que
é construída a matriz Z, que como o autor faz é produzido um efeito aleatório para cada marcador. desta forma gostaria de saber se alguém ja declarou um matriz Z em uma analise de modelo misto no R em especifico na lmer, essa analise é GWS (Seleção genômica ampla), caso alguém tenha familiaridade ficaria grato de umas dicas.
dados <- data.frame(ind=c(1:5),
diametro=c(9.87,14.48,8.91,14.64,9.55),
M1=c(2,1,0,1,1),
M2=c(0,1,2,0,0),
M3=c(0,0,0,1,0),
M4=c(0,0,0,0,1),
M5=c(2,1,0,1,1),
M6=c(0,1,0,0,1),
M7=c(0,0,2,0,0))
dados
require(lme4)
Z <- model.matrix(~-1+M1+M2+M3+M4+M5+M6+M7,dados)
Z ### Esta é a matriz que querro por no modelo
m0 <- lmer(diametro~1+(1|?????),dados)
summary(m0)
ranef(m0)
fixef(m0)
# Meu interesse e ter os componentes de variância e o efeito fixo(Media geral), e os efeitos aleatórios (7, uma para cada marcador)
OBS: Creio que não chegaremos ao valor exato do autor, visto que ele fixou (sigma.erro/(sigma.g/n)) =1.
Obrigado