Pelo pouco que pesquisei não há como criar um executável com arquivos r. Algumas opções:

1 - Criar um pacote no qual o usuário irá apenas precisar instalar tal pacote e rodar algo como "runappp" para a interface aparecer.
2 - Criar o aplicativo utilizando o pacote shiny e disponilizá-lo online.

(s,f,p)
Allaman