O knitr tem muita coisa a mais que o Sweve. Eu destaco a facilidade ao lidar com inserção de figuras (praticidade), a renderização/destaque do código que o torna mais legível (legibilidade) e o serviço de cache que é basicamente não rodar toda vez chunks que não foram modificados (eficiência). As opções de controle nos chunks foram aumentadas e algumas renomeadas. Migrar para knitr é muito rápido, principalmente se você buscar informação no lugar certo. Eu recomendo o curso do Fernando Mayer que foi o que abriu os horizontes para mim (https://github.com/fernandomayer/knitr-rautu). Leia o knitr-rautu.pdf e depois rode o knitr-template.Rnw. Eu só tive um pouco de trabalho para fazer o coisa operar no projeto de um livro porque nesse eu mantenho separado os arquivos em vários diretórios, rnw, tex, figuras, etc, cada um tinha seu diretório. Mas já solucionei o problema e estou muito satisfeito. Eu tive muita resistência em migrar mas hoje vejo que as vantagens valem o esforço. Recomendo! O JC Faria e o próprio Fernando Mayer são usuários veteranos do knitr e podem dar mais detalhes.

À disposição.

Walmes.