Boa noite! Estou tentando analisar um conjunto de dados de germinação, utilizando o pacote glmmADMB, o meu conjunto de dados é como o que se segue:
| 
   dose  | 
  
   dias  | 
  
   Rep  | 
  
   germ  | 
  
   Incrustrado  | 
 
| 
   0  | 
  
   1  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   2  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   3  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   4  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   5  | 
  
   1  | 
  
   12  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   6  | 
  
   1  | 
  
   13  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   7  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   8  | 
  
   1  | 
  
   4  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   9  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   10  | 
  
   1  | 
  
   1  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   11  | 
  
   1  | 
  
   3  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   12  | 
  
   1  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   1  | 
  
   2  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
 |
| 
   0  | 
  
   12  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
 |
| 
   16  | 
  
   6  | 
  
   6  | 
  
   2  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   16  | 
  
   7  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   16  | 
  
   11  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   16  | 
  
   12  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Sim  | 
 
| 
   0  | 
  
   1  | 
  
   1  | 
  
   8  | 
  
   Não  | 
 
| 
   0  | 
  
   2  | 
  
   1  | 
  
   23  | 
  
   Não  | 
 
| 
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
 |
| 
   0  | 
  
   11  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   0  | 
  
   12  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
  
   (...)  | 
 
| 
   8  | 
  
   12  | 
  
   4  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   16  | 
  
   10  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   16  | 
  
   11  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   16  | 
  
   12  | 
  
   6  | 
  
   0  | 
  
   Não  | 
 
| 
   
  | 
  
   
  | 
  
   
  | 
  
   
  | 
  
   
  | 
 
Em que
Dose= são 6 diferentes doses (0,1,2,4,8,16) de composto para acelerar a germinação
Rep= 6 repetições (gerbox com 50 sementes cada)
Germ= quantidade de sementes germinadas no dia
Dias= dias em que foi feita a contagem
Incrustrado= Informação se era incrustrada ou não
A cada dia, durante 12 dias era observado a quantidade de sementes germinadas. Os dados são inflacionados de zeros. Então estou tentando analisar usando uma distribuição binomial negativa com inflação de zeros. Com o seguinte código para ajustar, porém estou com dúvida quanto se essa seria a especificação correta do modelo, pois obtive umas estimativas negativas que não fazem sentido. Se alguém tiver mais familiaridade nesse tipo de análise qualquer ajuda seria bem vinda.
M1<-glmmadmb(germ~(dose+dias)*incrustrado,random=~(1|rep),data=da,family="nbinom1",zeroInflation=TRUE)
Desde já agradeço a atenção,
Fabiana