Bom que o problema se resolveu com os exemplos acima dos colegas da lista. Checagem de erro no R fora da biblioteca padrão é um caos mesmo. Poderia muito bem retornar algo diferente de string (NA por exemplo) e você ia checar e substituir como foi sugerido acima.

Abraços

Em 10 de maio de 2013 15:34, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:

#

sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = function(...)"verificar"))

#

Isso era o que eu queria :), funcionou perfeitamente.

David, o taxisize retorna uma mensagem de erro que é uma String. Por exemplo eu guardava os resultados numa matriz de characters, onde uma coluna é o nome que usei para fazer a busca, a resposta quando da certo são o nome sugerido, um score que é referente a se o nome não esta desatualiado, se tem erro de digitação, se não mudou que são as coisas que eu guardo.

Ai usando o try() tava ficando uma mensagem enorme nas células, ai no r so imprimia 1 coluna por vez,  ai eu queria que ele deixa-se uma palavra menor so para facilitar a visualização, ja que se não deu certo eu quero verificar caso a caso mesmo, ou posso tentar denovo so com o que falhou, porque existem muitos erros de nome de especie muito antigas, que mudou, essas coisas que não é para dar certo mesmo

Mas acho que usando esse tryCatch ai dar certo agora.

Eu imaginei que seria melhor deixar um exemplo mais simples, que produzia o mesmo efeito aqui, o efeito é mais ou menos o mesmo.

Mas muito obrigado pelas resposta. me ajudaram muito.

Abraços

Augusto Ribas

Em 10 de maio de 2013 14:54, Henrique Dallazuanna <wwwhsd@gmail.com> escreveu:

Tente assim:

sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = function(...)"verificar"))

2013/5/9 Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com>

Ola, eu gostaria de saber, se tem como eu mudar de forma simples a
mensagem de erro que o R envia  ao tentar usar uma função e receber um
erro.

Por exemplo:

#Imagine que eu tenho a seguinte lista, e precise aplicar uma função

#Exemplo de lista de dados
teste<-list(2, "a", 1 , 10 , "b")
teste

#Preparando um lugar para guardar os resultados
saida<-list()

#Se eu tentar fazer um loop com for, ele vai parar
#quando chegar a letra, porque nao da para fazer o log de caracter
for( i in 1:length(teste)) {
  saida[i] <-log(teste[i])
}

#nesse caso o loop para e eu nao tenho  a saida que desejo
saida

#Mas então eu tentei usar a função try
#minha ideia era que se der para calcular, calcule
#senão de uma msg de erro e siga em frente pro proximo

for( i in 1:length(teste)) {
  saida[[i]] <-try( log(teste[[i]][1]) )
}

#agora eu tenho minha saida, com erro onde não deu para calcular, isso
que eu queria
saida

#o que eu queria saber se é possivel fazer o seguinte
#se der certo, execute a função, senão imprima o erro que eu falar
#nesse caso eu gostaria de uma saida desse tipo:

saida.exemplo<-list(0.6931472,"Verificar",0,2.302585,"Verificar")
saida.exemplo

#############################################################

Esse exemplo eu peguei na função try.

Mas na verdade eu estou usando o pacote taxize
(http://ropensci.github.io/taxize_/)
para conferir nomes de especies, e para conferir listas grandes, as
vezes para quando a conexão com a internet falha, ou o nome da especie
não é encontrado, resumindo eu queria saber se existe uma forma de
falar pro R, fazer isso (minha função), se der erro retorne isso
(minha mensagem).

Agradeço desde ja a atenção.

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