Provavelmente vc não deve ter o jdk instalado. Tente rodar no terminal: sudo apt-get build-dep r-cran-rjava e depois entre no R tente instalar o rJava novamente. Abs, D On Sun, Nov 11, 2012 at 4:31 PM, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>wrote:
Eu tentei vários servidores.....e agora descobri este outro erro também..
install.packages("rJava", dep=T)
Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’ (as ‘lib’ is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb) URL aberta ================================================== downloaded 524 Kb
* installing *source* package ‘rJava’ ... ** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking for C compiler default output file name... a.out checking whether the C compiler works... yes checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of executables... checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep checking for egrep... /bin/grep -E checking for ANSI C header files... yes checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes checking for sys/types.h... yes checking for sys/stat.h... yes checking for stdlib.h... yes checking for string.h... yes checking for memory.h... yes checking for strings.h... yes checking for inttypes.h... yes checking for stdint.h... yes checking for unistd.h... yes checking for string.h... (cached) yes checking sys/time.h usability... yes checking sys/time.h presence... yes checking for sys/time.h... yes checking for unistd.h... (cached) yes checking for an ANSI C-conforming const... yes checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline... yes checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes checking whether sigsetjmp is declared... yes checking whether siglongjmp is declared... yes checking Java support in R... present: interpreter : '/usr/bin/java' archiver : '/usr/bin/jar' compiler : '/usr/bin/javac' header prep.: '/usr/bin/javah' cpp flags : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include' java libs : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm' checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.
Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R. If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpuZLRQJ/downloaded_packages’ Mensagens de aviso perdidas: In install.packages("rJava", dep = T) :
installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status
André Oliveira Souza ------------------------------ *De:* Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> *Para:* "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> *Enviadas:* Domingo, 11 de Novembro de 2012 16:03
*Assunto:* Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
obrigado. Penso que deve ser algum pacote que devo instalar só não sei qual é. Tentei aqui sua dica: Mas deu este erro.
install.packages("XLConnect", dep=T) Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’ (as ‘lib’ is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto also installing the dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’
tentando a URL ' http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnectJars_0.2-0.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 16488318 bytes (15.7 Mb) URL aberta ================================================== downloaded 15.7 Mb
tentando a URL ' http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb) URL aberta ================================================== downloaded 524 Kb
tentando a URL ' http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnect_0.2-3.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 1667765 bytes (1.6 Mb) URL aberta ================================================== downloaded 1.6 Mb
* installing *source* package ‘rJava’ ... ** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking for C compiler default output file name... a.out checking whether the C compiler works... yes checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of executables... checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep checking for egrep... /bin/grep -E checking for ANSI C header files... yes checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes checking for sys/types.h... yes checking for sys/stat.h... yes checking for stdlib.h... yes checking for string.h... yes checking for memory.h... yes checking for strings.h... yes checking for inttypes.h... yes checking for stdint.h... yes checking for unistd.h... yes checking for string.h... (cached) yes checking sys/time.h usability... yes checking sys/time.h presence... yes checking for sys/time.h... yes checking for unistd.h... (cached) yes checking for an ANSI C-conforming const... yes checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline... yes checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes checking whether sigsetjmp is declared... yes checking whether siglongjmp is declared... yes checking Java support in R... present: interpreter : '/usr/bin/java' archiver : '/usr/bin/jar' compiler : '/usr/bin/javac' header prep.: '/usr/bin/javah' cpp flags : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include' java libs : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm' checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.
Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R. If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’ ERROR: dependency ‘rJava’ is not available for package ‘XLConnectJars’ * removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnectJars’ ERROR: dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’ are not available for package ‘XLConnect’ * removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnect’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmpp7HwvH/downloaded_packages’ Mensagens de aviso perdidas: 1: In install.packages("XLConnect", dep = T) : installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status 2: In install.packages("XLConnect", dep = T) : installation of package ‘XLConnectJars’ had non-zero exit status 3: In install.packages("XLConnect", dep = T) : installation of package ‘XLConnect’ had non-zero exit status
Tem alguma pendencia com o ‘rJava’ que não sei qual é. Alguma dica?
obrigado
André Oliveira Souza ------------------------------ *De:* Daniel C Bezerra <danielcbezerra@gmail.com> *Para:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br *Enviadas:* Domingo, 11 de Novembro de 2012 12:18 *Assunto:* Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
Tente instalar os pacotes "XLConnect" e "XLConnectJars" e depois rode o Rcmdr novamente (não precisa carregar os pacotes após a reinicialização).
Dê uma olhada se a opção de importar arquivos do excel aparece no menu.
Abs,
D
2012/11/11 Edson Lira <edinhoestat@yahoo.com.br>
Por que não converte para .csv? É uma alternativa,
[. ]'s. Edson Lira Estatístico Ma-Am
Em 10/11/2012, às 14:35, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
É uma solução, testei aqui. O Rcmdr está na central de programas do ubuntu 12.04 e quando instalada cria um menu na barra de ferramentas. Na verdade eu gostaria de usar menos linhas de comando possível com os alunos. Eu sempre uso linha de camando acho melhor.
André Oliveira Souza ------------------------------ *De:* Sérgio Henrique <sergio.edfisica@gmail.com> *Para:* "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> *Enviadas:* Sábado, 10 de Novembro de 2012 16:11 *Assunto:* Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
Você usar a linha de comando do Rcmdr. Use require(gdata) read.xls
Obs: não testei pra saber se roda.
Abraços
Enviado via iPad
Em Nov 10, 2012, às 4:08 PM, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Boa tarde, alguns dias atrás tive aqui com mesmo assunto na lista e não consegui resolver a questão. Pesquisei muito e não encontrei como carregar um .xls pelo menu (importar arquivos) do Rcmdr o que é possivel pelo Win$$. Atualmente estou trabalhando no curso de administração e gostaria de trabalhar com Ubuntu+R+Rcmdr. Na escola tem ubuntu em todas máquinas este o motivo de voltar ao assunto. Agora estou com dúvidas será que esta é uma tarefa impossível para Ubuntu+R+Rcmdr?
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