Leonard,
Eu não sabia que tinha como colocar essas restrições. Se você consegue fazer no TeX então conseguirá via Rmd, já que o arquivo passa por LaTeX antes de virar PDF. Então é só dar um jeito de fazer aparecer o que você precisa no preambulo. As opções seriam:
2) faça um pequeno preambulo e carregue ele via opções do YAML para ser incluído ao final do preambulo do template default: "includes: > in_header:" (mesmo link do anterior).
Walmes.