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Fwd: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R
by Leonard de Assis 10 Nov '11

10 Nov '11

-------- Mensagem original -------- Assunto: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R Data: Thu, 10 Nov 2011 12:37:06 -0800 De: Jan de Leeuw <deleeuw(a)stat.ucla.edu> Para: statcompute <computing(a)stat.ucla.edu> R-2.14.0 comes with Luke Tierney's byte-compiler installed. Byte-compilation can speed up R computations by a factor 5, although if your functions are just calls to compiled C code the speedup will be much smaller. By default, only the required packages are byte-compiled. But if you set (in your bash profile) export R_COMPILE_PKGS=1 then all packages will byte-compile when installed. If you set export R_ENABLE_JIT=3 then all functions you define in your interactive or batch session will be byte-compiled the first time they are entered into the workspace (and the same is true for all loops). It should be noted that some contributed packages have namespace problems when byte-compiled. R-2.15.0 (i.e. R-devel) has parallel versions of Map() and mapply(). parallel makes fork or socket cluster and has parallel random number generation. MPI clusters are handled (for now) by passing the information to the snow package. === Jan de Leeuw; Distinguished Professor and Chair, UCLA Department of Statistics; Editor: Journal of Multivariate Analysis, Journal of Statistical Software; US mail: 8125 Math Sciences Bldg, Box 951554, Los Angeles, CA 90095-1554 phone (310)-825-9550; fax (310)-206-5658; email: deleeuw(a)stat.ucla.edu .mac: jdeleeuw ++++++ aim: deleeuwjan ++++++ skype: j_deleeuw homepages: http://gifi.stat.ucla.edu ++++++ http://www.cuddyvalley.org ------------------------------------------------------------------------------------------------- No matter where you go, there you are. --- Buckaroo Banzai http://gifi.stat.ucla.edu/sounds/nomatter.au ------------------------------------------------------------------------------------------------- _______________________________________________ Computing mailing list Computing(a)lists.stat.ucla.edu http://lists.stat.ucla.edu/mailman/listinfo/computing

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problema xlsx
by Vinicius Brito Rocha 10 Nov '11

10 Nov '11

Gente, fui importar uma tabela relativamente pesada no excel 2007 para o R, via read.xlsx e obtive a seguinte mensagem de erro: Erro em .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space alguém sabe o que é e como resolver? -- Vinicius Brito Rocha. Estatístico e Atuário, Mestre em Pesquisa Operacional www.aplicademic.blogspot.com http://twitter.com/viniciusbritor "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.

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Melhor versão do linux para R
by Marcelo Cardoso mello 10 Nov '11

10 Nov '11

Sou inexperiente e estou querendo instalar uma versão do linux. Observei na página do R que algumas versões não tem atualizações. Parece mais atualizado para ubunto e debian. Gostaria de algumas recomendações de qual versão instalar para que o R funcione bem e que seja sempre atualizado. Se eu usar derivativos o R vai funcionar? Por exemplo, no Kurumin, que é derivativo do debian,o R vai funcionar? Obrigado.

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Seleção de níveis de variável
by Edson Lira 09 Nov '11

09 Nov '11

Boa tarde a todos, gente tenho uma variável que tem os seguintes níveis de resposta: 1,2,3,4,5,6,7,8,9 Estou querendo fazer uma análise aonde junto os niveis 1 e 4 para comparar com o nível 9, ou seja, necessito de uma nova variável aonde junta-se 1 e 4 em um único nível e somente o nivel 9, os demais não deverão constar na nova variável. Algo do tipo: nv= 1 e 4 =1_4 e 9=9 Obrigado. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Livretos para usuarios de R
by Benilton Carvalho 09 Nov '11

09 Nov '11

Aos interessados em dizer "nao a pirataria" (incluindo de livros), abaixo seguem materiais para usuarios de R que podem ser de interesse da maioria: http://a-little-book-of-r-for-time-series.readthedocs.org/en/latest/index.h… http://a-little-book-of-r-for-biomedical-statistics.readthedocs.org/en/late… http://little-book-of-r-for-multivariate-analysis.readthedocs.org/en/latest… Notem que os respectivos PDFs encontram-se no inicio de cada uma das paginas.

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[Dúvida] Sobrepor mapas no R
by Pedro Rafael 08 Nov '11

08 Nov '11

Pessoas tenho que unir o mesmo mapa, a saber da Paraíba. Tenho 3 mapas em cores diferentes, ou seja, cada mapa apresenta uma região pintada diferente e com cores diferenciadas. Gostaria de criar um único mapa com todas as regiões pintadas após a sobreposição. Existe algum objeto para fazer isso? -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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cdf da skewed-t - tem alguma rotina pronta??
by julio cesar araujo 08 Nov '11

08 Nov '11

Boa noite pessoal, Tenho que aplicar uma cdf da skewed-t em alguns dados que tenho. Alguém sabe me informar se tem alguma rotina pronta para isso, ou se terei que programar?? Atc Julio

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Coletar informações (texto) de sites
by Daniel Dantas 08 Nov '11

08 Nov '11

Boa tarde pessoal, Existe alguma maneira de "pedir" para o R entrar neste site http://www.cnm.org.br/eleicao/mu_ele_prefeito.asp?iIdMun=100141003 e me retornar o nome do prefeito de 2008 e de 2004? O objetivo disto é obter a listagem dos prefeitos de 2004 e de 2008 para ver quem foi reeleito, se está no 1° ou 2° mandato. Para cada município, o link muda apenas o final, então tem como programar para que ele abra os links de todos os municípios do estado do PARANÁ, mas não sei como fazer ele me retornar o nome do prefeito. Algo interessante que descobri agora, não sei é por causa do Internet Explorer ou é do site, mas se apertarmos com o botão direito no campo onde está escrito o nome do prefeito, surge-se a opção de exportar para Excel as informações daquele ano. Eu poderia fazer isso 399 (qtde de municípios do PR) vezes para o ano de 2004 e 399 para o ano de 2008 e pedir para o R consolidar em 1 planilha. Mas mesmo assim dá um certo trabalho salvar 798 planilhas. Alguém sabe um procedimento mais simples? Espero que eu tenha consigo me fazer entender. Obrigado, Daniel

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exportar grafico
by Luiz André Zardo 08 Nov '11

08 Nov '11

Alguem poderia me indicar como faço para exportar um gráfico? Obrigado!

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scatterplot com gradiente de cores
by Rodrigo Plei 08 Nov '11

08 Nov '11

Bom dia, lista. Tenho uma tabela de dados de posições geográficas (lat-long) por dia para uma população de larvas de peixes, que tem essa cara: Day Lat Long 0 23.3 47.2 0 23.35 47.0 0 23.4 47.0 0 23.4 47.3 1 24.2 47.5 1 24.1 47.23 1 24.4 47.8 1 24.36 47.85 2 24.5 47.8 2 25.2 48.1 2 25.3 48.2 . . Ou seja: cada linha corresponde a posição de uma larva em um determinado dia. Gostaria de plotar uma dispersão simples a trajetória de todas as larvas para todo o período estudado, mas a idéia é que cada ponto tenha uma cor de acordo com a idade (dia), de forma a formar um gradiente com as cores do arco-iris. E também queria colocar uma barra de legenda para esse gradiente (por exemplo: dia 0 = amarelo e dia 30: vermelho. Alguém pode me dar uma dica, ou ao menos indicar um pacote que permita fazer isso? Desde já, grato. Rodrigo -- =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8--> Rodrigo Silvestre Martins, PhD Bolsista FAPESP Pós-Doutorado Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq) Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B) Butantã - São Paulo/SP, Brasil 05508-900 Tel: +55 11 3091 6549 Email: rodrigo.plei(a)gmail.com ; ocersm(a)lycos.com; rsmartins(a)usp.br CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777

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