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fatorial 5x3 + testemunha
by Marcelo Claro de Souza 10 Mar '12

10 Mar '12

Preciso rodar uma análise fatorial 5x3 + testemunha e estou usando i seguinte script segue em anexo o conjunto de dados para tornar o script reproduzível mamona=read.csv2(file.choose(),h=T) mamona.f1=TukeysHSD(aov(IVG~palha:test,data=mamona)) mamona.f2=TukeysHSD(aov(IVG~posicao:test,data=mamona)) mamona.f1.f2=TukeysHSD(aov(IVG~palha*posicao:test,data=mamona)) Vcs poderiam me informar se o erro está no script ou se meu conjunto de dados está organizado errado? Muito onrigado. Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil

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Fwd: [R-pkgs] ggmap : ggplot2 and RgoogleMaps
by Benilton Carvalho 09 Mar '12

09 Mar '12

---------- Forwarded message ---------- From: David Kahle <david.kahle(a)gmail.com> Date: 5 March 2012 17:20 Subject: [R] [R-pkgs] ggmap : ggplot2 and RgoogleMaps To: r-packages(a)r-project.org, ggplot2 <ggplot2(a)googlegroups.com> Dear useRs - ggmap v1.2 is now available on CRAN. ggmap is a relatively new package which combines the power of ggplot2 with the spatial contextual information in Google Maps or OpenStreetMaps (via RgoogleMaps) to provide an easy, consistent and modular framework for spatial graphics. For examples on how to get started with ggmap, see ?ggmapplot for several examples of its use. Happy mapping! Cheers david kahle. ------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------- David J. Kahle, Ph.D. Assistant Professor of Statistical Science Department of Statistical Science Baylor University One Bear Place #97140 Waco, Texas 76798 Office : (254) 710-6102 http://sites.google.com/site/davidkahle/

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arvore de decisão
by Vinicius Brito Rocha 09 Mar '12

09 Mar '12

Senhores, estou com um problema que me parece de uma árvore de decisão, mas não sei se é popssível resolve-lo da forma que gostaria no R. É o seguinte tenho observações diárias de uma árvore, algo mais ou menos assim(extamente assim em uma planilha excel). Data Nível 1 Nível 2 Nível 3 Nível 4 Nível 5 Dia 1 - (Nível 1, Evento 2) - (Nível 2, Evento 1) - (Nível 3, evento 6) Dia 2 - (Nível 1, Evento 3) - (Nível 2, Evento 1) - (Nível 3, evento 1) Dia 3 - (Nível 1, Evento 3) - (Nível 2, Evento 1) - (Nível 3, evento 1) - (Nível 4, evento 1) . . . ou seja, Tenho 5 níveis (não preciso percorrer necessáriamente os 5 níveis) onde dentro de cada nível tenho uma gama de possibilidades, e ao final uma decisão é tomada. Minha pergunta é se existe alguma forma de ajustar uma árvore de decisão, onde eu force cada varíavel a classificar na orde que eu desejo, por exemplo: A oder de particionamento deve sempre seguir a ordem natural dos níveis, não posso começar a particionar pelo nível 3, sempre nível 1,2,3,4,5. Abs -- Vinicius Brito Rocha. Estatístico e Atuário, Mestre em Pesquisa Operacional www.aplicademic.blogspot.com http://twitter.com/viniciusbritor "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.

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Dúvida: R para Windows 7 - 64bits
by Núbia Batista 09 Mar '12

09 Mar '12

Boa noite... Qual a versão do R mais apropriada para o Windows 7 - 64Bits? Instalei a última disponível no site, mas vários erros ocorrem durante a utilização! Agradeço desde já, Núbia Batista

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Baixar figura
by Luís Gustavo 08 Mar '12

08 Mar '12

Pessoal, Estou com o seguinte problema, estou gerando um gráfico utilizando a API do Google Charts, mas agora quero salvar esta figura, como faço para baixá-la via R? http://chart.apis.google.com/chart?cht=bvs&chd=t:10,20,30,20,10&chs=170x100… Desde já agradeço. -- Luís Gustavo Silva e Silva

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sobre a utilização de processamento em vários núcleos
by Antonio Silva 07 Mar '12

07 Mar '12

Olá, Rodo o R 64-bit no Ubuntu 10.04 em uma máquina com processador Core i7 e 8 Gb de RAM. Nesta semana começei a fazer uma análise de cluster, utilizando basicamente o pacote vegan, sobre uma matriz grande. O cálculo das ligações (hclust) levou três hora e meia para ser efetuado (!!!). Vi que apenas um núcleo do processador estava sendo utilizado. Começei então a procurar alternativas que permitissem o aceleramento dos cálculos e a utilização dos outros núcleos, que estão sub-utilizados. Li sobre o pacote multicore e outros, inclusive em mensagens nesta lista. Muitas coisas não ficaram claras para mim e, no final, não compreendi como proceder sua utilização no meu caso (ou mesmo se é possível). É possivel rodar uma análise de cluster fazendo utilização dos diversos núcleos? Agradeço qualquer orientação e/ou indicação de documentação. Abraços, Antônio -- Antônio Olinto Ávila da Silva Biólogo / Oceanógrafo Instituto de Pesca São Paulo, Brasil

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Decision tree - espaço vertical dos nós
by Nathália Machado 06 Mar '12

06 Mar '12

Olá a todos! Estou trabalhando com a Árvore de Classificação (pacote *rpart*) e tenho uma dúvida sobre um dos argumentos da função "*plot.rpart*": Quando usamos "uniform=F", o espaço vertical dos nós será proporcional ao erro no ajuste, como explicado pelo manual do *rpart*. Porém, preciso construir uma escala que mostre isso para cada um dos nós. Então, como poderia ter acesso a esses valores de cada nó, para que possa construir a escala? Por exemplo: library(rpart) fit <- rpart(Price ~ Mileage + Type + Country, cu.summary) plot(fit, uniform=F) text(fit, use.n=TRUE) Cada nó tem um tamanho diferente de acordo com a explicação, certo? Com eu faço pra ver esse valores? Desde já agradeço! -- Nathália Machado PhD student - Ecology and Evolution Universidade Federal de Goiás Conservation Biogeography Lab Lab: wix.com/rdloyola/lab

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[R-BR] Erro em rodar os variogramas empiricos com o pacote geoR
by Rodrigo Sant'Ana 06 Mar '12

06 Mar '12

Boa noite Listeiros da R-BR, estou com um problema no uso de algumas funções do pacote geoR, entretanto, acredito que seja pelo tamanho da base de dados. Infelizmente, não posso disponibilizar a base de dados para replicarmos aqui. Mas simulei algo parecido para que vocês tenham uma ideia. set.seed(125) x <- grf(10000, grid = "reg", xlim = c(-3.34, 8.03), ylim = c(-2.85, 6.32), cov.pars = c(122, 0.2), mean = 45) y <- variog(x, option = "cloud", estimator.type = "modulus", max.dist = 14.61) variog: computing omnidirectional variogram Erro: não é possível alocar vetor de tamanho 381.4 Mb Além disso: Mensagens de aviso perdidas: In if (class(geodata) %in% ls(pattern = glob2rx("Spatial*DataFrame"), : a condição tem comprimento > 1 e somente o primeiro elemento será usado Na base que estou utilizando para análise, não aparece essa mensagem de aviso. Só aparece o Erro de alocação de vetor de tamanho. Será que vocês podem me ajudar a resolver esse impasse? abraço a todos e muito obrigado! _______________ Rodrigo Sant'Ana Oceanógrafo

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semivariograma cruzado
by DANIELA CUNHA DA SE 05 Mar '12

05 Mar '12

Olá gostaria de saber se alguém tem alguma rotina para fazer semivariograma cruzado? Att Daniela

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Escala Gráfica para mapas
by Julianna Trindade 05 Mar '12

05 Mar '12

Pessoal, Gostaria de saber como plotar uma escala gráfica respeitando as dimensões corretas do meu shapefile. Ou seja, mostrar o tamanho da escala condizente com o tamanho em Km do meu mapa. Desde já obrigada, Aguardo resposta. -- Julianna Trindade "Exalta-te, Senhor, na Tua força! Nós cantaremos e louvaremos o Teu poder." Salmos 21; 13

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