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Problemas com loop.
by Paulo Pimenta 03 Jun '14

03 Jun '14

Prezados, Estou com dificuldades para abrir uma série de arquivos (88 arquivos .dbf) por meio de um loop e armazenar suas informações numa variável (x, por exemplo). A idéia, primeiramente, é abrir um arquivo e armazenar suas informações numa variável e posteriormente fazer o processo até o último arquivo. Este é o bloco do programa em R: ###################################################### library("foreign") for (i in 1:88){ x[i] <- read.dbf("F:/qgis_1/exercicio_buffer_L1/testes/teste_1/corte_estrada_aneis[i].dbf") } ##################################################### Cheguei a usar o comando gsub, mas não deu certo. Abraços. -- Paulo Henrique Pimenta. Graduando em Meteorologia - IAGUSP.

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Esquema fatorial
by Ze Henrique 02 Jun '14

02 Jun '14

Boa noite. Gostaria de saber se alguém poderia me recomendar alguma literatura (livro ou artigo) e/ou pacote que faz o seguinte exemplo: Suponha que tenho um experimento com 4 doses de nitrogênio, 5 doses de potássio e 5 avaliações no tempo. Gostaria de saber como chegar aos valores da anova para este modelo que não seria nem fatorial triplo nem subsubparcela, eu acho. Desde já agradeço a todos. -- *José Henrique Soler Guilhen* Graduando em Agronomia Universidade Federal do Espírito Santo - CCAUFES

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Re: [R-br] Como ler arquivo .dbf no R
by Paulo Pimenta 01 Jun '14

01 Jun '14

Muito obrigado Sergio, deu certo! --- Original Message --- From: "sergio.edfisica" <sergio.edfisica(a)gmail.com> Sent: June 1, 2014 4:56 PM To: "Paulo Pimenta" <paulopimenta6(a)hotmail.com>, r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Como ler arquivo .dbf no R library("foreign") ?read.dbf Paulo Pimenta <paulopimenta6(a)hotmail.com> escreveu: >Prezadoslisteiros,EstouusandoumsoftwaredegeoprocessamentochamadoQGISqueexportavaloresemarquivos.dbfdoqualdesejofazeramanipulaçãodestesdadosdentrodoR.Infelizmentequandotentofazeraimportaçãodestesdadosusandoocomandoread.table()receboumamensagemdeerro,assimgostariadepediraajudadoslisteirosparapodersolucionaresteproblema!Qualcomando,pacoteoumétodoparalerum.dbfnoR?Abraçosatodos.--PauloHenriquePimenta.GraduandoemMeteorologia-IAGUSP.

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Re: [R-br] Como ler arquivo .dbf no R
by sergio.edfisica 01 Jun '14

01 Jun '14

library("foreign") ?read.dbf Paulo Pimenta <paulopimenta6(a)hotmail.com> escreveu: >Prezadoslisteiros,EstouusandoumsoftwaredegeoprocessamentochamadoQGISqueexportavaloresemarquivos.dbfdoqualdesejofazeramanipulaçãodestesdadosdentrodoR.Infelizmentequandotentofazeraimportaçãodestesdadosusandoocomandoread.table()receboumamensagemdeerro,assimgostariadepediraajudadoslisteirosparapodersolucionaresteproblema!Qualcomando,pacoteoumétodoparalerum.dbfnoR?Abraçosatodos.--PauloHenriquePimenta.GraduandoemMeteorologia-IAGUSP.

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Como ler arquivo .dbf no R
by Paulo Pimenta 01 Jun '14

01 Jun '14

Prezados listeiros, Estou usando um software de geoprocessamento chamado QGIS que exporta valores em arquivos .dbf do qual desejo fazer a manipulação destes dados dentro do R. Infelizmente quando tento fazer a importação destes dados usando o comando read.table() recebo uma mensagem de erro, assim gostaria de pedir a ajuda dos listeiros para poder solucionar este problema! Qual comando, pacote ou método para ler um .dbf no R? Abraços a todos. -- Paulo Henrique Pimenta. Graduando em Meteorologia - IAGUSP.

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[OFF-TOPIC] Shapefile com vaiáveis climáticas
by ASANTOS 01 Jun '14

01 Jun '14

Boa dia Pessoal, Gostaria de saber se alguém sabe onde encontrar shapefiles com os dados das normais climatológicas para temperatura, insolação, precipitação, dentre outras variáveis para o Brasil. Tentei georeferenciar algumas imagens com essas informações adquiridas no site do INMET, mas devida a baixa resolução não tiveram bom resultado e imagino que pessoas que trabalhem com estatística espacial envolvendo variáveis climáticas possam saber onde achar essas informações, Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Função residente
by Luiz Roberto Martins Pinto 31 Mai '14

31 Mai '14

Caros listeiros, Preparei uma função e desejo colocá-la 'residente' (isto é, desejo instalá-la da mesma forma que faço com o 'install.packages'). Peço ajuda. Luiz Roberto Luiz Roberto Martins Pinto Prof. Pleno/DCET/UESC Laboratório de Estatística Computacional Universidade Estadual de Santa Cruz Ilhéus-Bahia luizroberto.uesc(a)gmail.com skype: lrmpinto http://lattes.cnpq.br/2732314327604831

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Fwd: Representação de gráfico tipo torta em um shapefile
by ASANTOS 30 Mai '14

30 Mai '14

Boa tarde Walmes, Estou tentando postar minha dúvida abaixo e aparece um erro no servidor, saberia me dizer o porque? Obrigado, Alexandre -------- Mensagem original -------- Assunto: Representação de gráfico tipo torta em um shapefile Data: Sat, 24 May 2014 11:24:58 -0400 De: ASANTOS <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Bom dia Pessoal, Estou querendo inserir um gráfico do tipo torta em um shapefile de bacias hidrográficas da América do Sul (bacias), fazendo a inserção de um gráfico torta para cada bacia , onde localizam-se meus pontos de interesse (pontos$LEVEL2), porém os valores do gráfico gostaria que fosse a frequência de pontos$CT em cada pontos$LEVEL2, mas estou tento dificuldades e vou explicar passo a passo: # Start ------------------------------------------------------------------------------------------------------ #Pacotes require (maptools) require(shapefiles) require(rgdal) require(mapplots) require(RColorBrewer) # #Shapefile e dados links <- c( "https://www.dropbox.com/s/enrdm739ts4eba0/sa_bas_ll_r500m.shp", "https://www.dropbox.com/s/fnnumaix0v88jo1/sa_bas_ll_r500m.shx", "https://www.dropbox.com/s/o152vc0n15w54em/sa_bas_ll_r500m.dbf", "https://www.dropbox.com/s/2l24sso20645511/indv_atributos.csv") tokens <- gsub("^.*/s/","",dirname(links)) fileNames <- basename(links) newLinks <- file.path("http://dl.dropbox.com/s", tokens, fileNames); newLinks for (a in newLinks) { tryCatch(download.file(a, dest=basename(a), mode='wb'), error=function(...) print("Falha no download!"))} # #Abrindo o shapefile # CRS.new <- CRS("+proj=longlat +datum=WGS84") bacias <- readOGR(".", "sa_bas_ll_r500m") proj4string(bacias) <- CRS.new plot(bacias) # # #Coordenadas dos pontos + atributos pontos<-read.csv("indv_atributos.csv", sep=";",h=T) coordinates(pontos) <- c("x_long_dec","y_lat_dec") proj4string(pontos) <- CRS.new # # Selecionos os pontos que estão dentro de cada bacia hidrográfica inside.sa <- !is.na(over(pontos, as(bacias, "SpatialPolygons")))## inside.sa # # Pontos pertencentes a cada bacia nível 2, tenho varios niveis de classificação e escolhi o LEVEL2 bacias@bbox pontos@bbox pontos$LEVEL2 <- over(pontos, bacias)$LEVEL2 ## Adiciono o gráfico torta para cada pontos$LEVEL2 a frequencia de pontos$CT add.pie(z=pontos$CT, x=pontos$x_long_dec, y=pontos$y_lat_dec, radius=1, col=c(alpha("orange", 0.6), alpha("blue", 0.6), alpha("black", 0.6), alpha("red", 0.6), alpha("grey", 0.6)), labels=" ") #END---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Mas não obtive sucesso, alguém poderia me dar um help? Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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correlação robusta em dados longitudinais
by Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil 30 Mai '14

30 Mai '14

Amigos de R, Estou conduzindo uma análise de dados longitudinais com a função nlme::lme. POr enquanto o melhor modelo que tenho é expresso como: f7 <- lme(Velocidade ~ lado + as.factor(dia) ,data=l,random = ~1|Id/Arteria,correlation=corAR1(.8,form=~dia)) Nessa função eu gostaria que a correlçao fosse considerada para os diferentes grupos dado para a variável lado, porque que graficamente me parece ser diferente. Mas eu não consegui colocar esse argumento dentro de corAR1. Mas esse nem é o problema que me preocupa mais. A leitura fonte que tenho indica que sempre que possivel, deve-se utilizar uma correlaçao robusta, pois assim provavelmente evita-se o erro de assumir uma estrutura incorreta da correlação, apesar de eu ter experimentado várias. Mas eu não achei no pacote nlme qualquer função/argumento que me levasse acreditar que uma correlçao robusta esteja disponível. Alguem saberia saber no lugar de corAR1 é possivel utilizar alguma coisa que funcionasse como uma correlação robusta? Abraço, Dr. Pedro Emmanuel A. A. do Brasil http://blog.ipec.fiocruz.br/lapclin-chagas/ Curriculum Lattes: http://lattes.cnpq.br/6597654894290806 ResearchGate.net: https://www.researchgate.net/profile/Pedro_Brasil2/ Instituto Nacional de Infectologia/Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas Fundação Oswaldo Cruz Rio de Janeiro - Brasil Av. Brasil 4365, CEP 21040-360, Tel 55 21 3865-9648 e-mail: pedro.brasil(a)ipec.fiocruz.br e-mail: emmanuel.brasil(a)gmail.com ---Apoio aos softwares livres www.zotero.org - gerenciamento de referências bibliográficas. www.broffice.org ou www.libreoffice.org - textos, planilhas ou apresentações. www.epidata.dk - entrada de dados. www.r-project.org - análise de dados. www.ubuntu.com - sistema operacional

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liberação R proxy
by luc.souza＠usp.br 30 Mai '14

30 Mai '14

Prezados, estou com um problema e na verdade não sei bem como explicá-lo: Sou funcionário da CONAB e para acessar a internet tenho que colocar meu login e senha. Alguns sites preciso de liberação para baixar dados. Por exemplo, para baixar dados de clima do site do inmet. Já consegui liberação e ao acessar o site, consigo baixar os dados normalmente. Quando uso um script do R para baixar os dados automaticamente, fala que não consegue se conectar ao host. Minha dúvida é se tem algum parâmetro do R em que ele leia meu login e senha e consiga identificar o proxy. Não sei se passei minha dúvida corretamente. Obrigado Lucas Lucas F. de Souza Eng. Agrícola - CONAB M.Sc. Produção Vegetal - UENF Doutor em Agrometeorologia - ESALQ/USP tel: (19) 98160-7068

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