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Fwd: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R
by Leonard de Assis 10 Nov '11

10 Nov '11

-------- Mensagem original -------- Assunto: [Computing] byte-compiler and parallel computing in R Data: Thu, 10 Nov 2011 12:37:06 -0800 De: Jan de Leeuw <deleeuw(a)stat.ucla.edu> Para: statcompute <computing(a)stat.ucla.edu> R-2.14.0 comes with Luke Tierney's byte-compiler installed. Byte-compilation can speed up R computations by a factor 5, although if your functions are just calls to compiled C code the speedup will be much smaller. By default, only the required packages are byte-compiled. But if you set (in your bash profile) export R_COMPILE_PKGS=1 then all packages will byte-compile when installed. If you set export R_ENABLE_JIT=3 then all functions you define in your interactive or batch session will be byte-compiled the first time they are entered into the workspace (and the same is true for all loops). It should be noted that some contributed packages have namespace problems when byte-compiled. R-2.15.0 (i.e. R-devel) has parallel versions of Map() and mapply(). parallel makes fork or socket cluster and has parallel random number generation. MPI clusters are handled (for now) by passing the information to the snow package. === Jan de Leeuw; Distinguished Professor and Chair, UCLA Department of Statistics; Editor: Journal of Multivariate Analysis, Journal of Statistical Software; US mail: 8125 Math Sciences Bldg, Box 951554, Los Angeles, CA 90095-1554 phone (310)-825-9550; fax (310)-206-5658; email: deleeuw(a)stat.ucla.edu .mac: jdeleeuw ++++++ aim: deleeuwjan ++++++ skype: j_deleeuw homepages: http://gifi.stat.ucla.edu ++++++ http://www.cuddyvalley.org ------------------------------------------------------------------------------------------------- No matter where you go, there you are. --- Buckaroo Banzai http://gifi.stat.ucla.edu/sounds/nomatter.au ------------------------------------------------------------------------------------------------- _______________________________________________ Computing mailing list Computing(a)lists.stat.ucla.edu http://lists.stat.ucla.edu/mailman/listinfo/computing

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problema xlsx
by Vinicius Brito Rocha 10 Nov '11

10 Nov '11

Gente, fui importar uma tabela relativamente pesada no excel 2007 para o R, via read.xlsx e obtive a seguinte mensagem de erro: Erro em .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space alguém sabe o que é e como resolver? -- Vinicius Brito Rocha. Estatístico e Atuário, Mestre em Pesquisa Operacional www.aplicademic.blogspot.com http://twitter.com/viniciusbritor "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.

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Melhor versão do linux para R
by Marcelo Cardoso mello 10 Nov '11

10 Nov '11

Sou inexperiente e estou querendo instalar uma versão do linux. Observei na página do R que algumas versões não tem atualizações. Parece mais atualizado para ubunto e debian. Gostaria de algumas recomendações de qual versão instalar para que o R funcione bem e que seja sempre atualizado. Se eu usar derivativos o R vai funcionar? Por exemplo, no Kurumin, que é derivativo do debian,o R vai funcionar? Obrigado.

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Seleção de níveis de variável
by Edson Lira 09 Nov '11

09 Nov '11

Boa tarde a todos, gente tenho uma variável que tem os seguintes níveis de resposta: 1,2,3,4,5,6,7,8,9 Estou querendo fazer uma análise aonde junto os niveis 1 e 4 para comparar com o nível 9, ou seja, necessito de uma nova variável aonde junta-se 1 e 4 em um único nível e somente o nivel 9, os demais não deverão constar na nova variável. Algo do tipo: nv= 1 e 4 =1_4 e 9=9 Obrigado. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Livretos para usuarios de R
by Benilton Carvalho 09 Nov '11

09 Nov '11

Aos interessados em dizer "nao a pirataria" (incluindo de livros), abaixo seguem materiais para usuarios de R que podem ser de interesse da maioria: http://a-little-book-of-r-for-time-series.readthedocs.org/en/latest/index.h… http://a-little-book-of-r-for-biomedical-statistics.readthedocs.org/en/late… http://little-book-of-r-for-multivariate-analysis.readthedocs.org/en/latest… Notem que os respectivos PDFs encontram-se no inicio de cada uma das paginas.

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[Dúvida] Sobrepor mapas no R
by Pedro Rafael 08 Nov '11

08 Nov '11

Pessoas tenho que unir o mesmo mapa, a saber da Paraíba. Tenho 3 mapas em cores diferentes, ou seja, cada mapa apresenta uma região pintada diferente e com cores diferenciadas. Gostaria de criar um único mapa com todas as regiões pintadas após a sobreposição. Existe algum objeto para fazer isso? -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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cdf da skewed-t - tem alguma rotina pronta??
by julio cesar araujo 08 Nov '11

08 Nov '11

Boa noite pessoal, Tenho que aplicar uma cdf da skewed-t em alguns dados que tenho. Alguém sabe me informar se tem alguma rotina pronta para isso, ou se terei que programar?? Atc Julio

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Coletar informações (texto) de sites
by Daniel Dantas 08 Nov '11

08 Nov '11

Boa tarde pessoal, Existe alguma maneira de "pedir" para o R entrar neste site http://www.cnm.org.br/eleicao/mu_ele_prefeito.asp?iIdMun=100141003 e me retornar o nome do prefeito de 2008 e de 2004? O objetivo disto é obter a listagem dos prefeitos de 2004 e de 2008 para ver quem foi reeleito, se está no 1° ou 2° mandato. Para cada município, o link muda apenas o final, então tem como programar para que ele abra os links de todos os municípios do estado do PARANÁ, mas não sei como fazer ele me retornar o nome do prefeito. Algo interessante que descobri agora, não sei é por causa do Internet Explorer ou é do site, mas se apertarmos com o botão direito no campo onde está escrito o nome do prefeito, surge-se a opção de exportar para Excel as informações daquele ano. Eu poderia fazer isso 399 (qtde de municípios do PR) vezes para o ano de 2004 e 399 para o ano de 2008 e pedir para o R consolidar em 1 planilha. Mas mesmo assim dá um certo trabalho salvar 798 planilhas. Alguém sabe um procedimento mais simples? Espero que eu tenha consigo me fazer entender. Obrigado, Daniel

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exportar grafico
by Luiz André Zardo 08 Nov '11

08 Nov '11

Alguem poderia me indicar como faço para exportar um gráfico? Obrigado!

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scatterplot com gradiente de cores
by Rodrigo Plei 08 Nov '11

08 Nov '11

Bom dia, lista. Tenho uma tabela de dados de posições geográficas (lat-long) por dia para uma população de larvas de peixes, que tem essa cara: Day Lat Long 0 23.3 47.2 0 23.35 47.0 0 23.4 47.0 0 23.4 47.3 1 24.2 47.5 1 24.1 47.23 1 24.4 47.8 1 24.36 47.85 2 24.5 47.8 2 25.2 48.1 2 25.3 48.2 . . Ou seja: cada linha corresponde a posição de uma larva em um determinado dia. Gostaria de plotar uma dispersão simples a trajetória de todas as larvas para todo o período estudado, mas a idéia é que cada ponto tenha uma cor de acordo com a idade (dia), de forma a formar um gradiente com as cores do arco-iris. E também queria colocar uma barra de legenda para esse gradiente (por exemplo: dia 0 = amarelo e dia 30: vermelho. Alguém pode me dar uma dica, ou ao menos indicar um pacote que permita fazer isso? Desde já, grato. Rodrigo -- =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8--> Rodrigo Silvestre Martins, PhD Bolsista FAPESP Pós-Doutorado Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq) Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B) Butantã - São Paulo/SP, Brasil 05508-900 Tel: +55 11 3091 6549 Email: rodrigo.plei(a)gmail.com ; ocersm(a)lycos.com; rsmartins(a)usp.br CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777

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Fwd: Re: benchmarking
by Leonard de Assis 08 Nov '11

08 Nov '11

-------- Mensagem original -------- Assunto: Re: [R-br] benchmarking Data: Fri, 28 Oct 2011 16:31:34 -0200 De: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> Responder a: assis.leonard(a)gmail.com Para: assis.leonard(a)gmail.com Mesma máquina, R 2.13.2, Ubuntu 11.10 x64 ATLAS instalado (Com blas, provavelmente) R Benchmark 2.5 =============== Number of times each test is run__________________________: 3 I. Matrix calculation --------------------- Creation, transp., deformation of a 2500x2500 matrix (sec): 0.679999999999997 2400x2400 normal distributed random matrix ^1000____ (sec): 3.66666666666667 Sorting of 7,000,000 random values__________________ (sec): 0.919999999999999 2800x2800 cross-product matrix (b = a' * a)_________ (sec): 1.77 Linear regr. over a 3000x3000 matrix (c = a \ b')___ (sec): 1.05333333333333 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 1.19704085704037 II. Matrix functions -------------------- FFT over 2,400,000 random values____________________ (sec): 0.756666666666665 Eigenvalues of a 640x640 random matrix______________ (sec): 4.31333333333333 Determinant of a 2500x2500 random matrix____________ (sec): 1.05666666666667 Cholesky decomposition of a 3000x3000 matrix________ (sec): 1.29333333333333 Inverse of a 1600x1600 random matrix________________ (sec): 1.11666666666666 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 1.15130575853477 III. Programmation ------------------ 3,500,000 Fibonacci numbers calculation (vector calc)(sec): 5.47666666666667 Creation of a 3000x3000 Hilbert matrix (matrix calc) (sec): 0.689999999999998 Grand common divisors of 400,000 pairs (recursion)__ (sec): 1.08000000000001 Creation of a 500x500 Toeplitz matrix (loops)_______ (sec): 1.15333333333333 Escoufier's method on a 45x45 matrix (mixed)________ (sec): 0.840000000000003 -------------------------------------------- Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 1.01520238306255 Total time for all 15 tests_________________________ (sec): 25.8666666666667 Overall mean (sum of I, II and III trimmed means/3)_ (sec): 1.11845219568472 --- End of test --- []s Leonard de Assis assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com Em 28/10/2011 14:49, Leonard de Assis escreveu: > Segue meu teste na minha 1a config: > > SAMSUNG RF411 > Core i5 2a Geração 6 GB RAM > Windows 7 Pro x64 > R 2.13.1 x64 Sem BLAS (Tem BLAS pra Intel64?) > > R Benchmark 2.5 > =============== > Number of times each test is run__________________________: 3 > > I. Matrix calculation > --------------------- > Creation, transp., deformation of a 2500x2500 matrix (sec): > 0.563333333333333 > 2400x2400 normal distributed random matrix ^1000____ (sec): > 3.33333333333333 > Sorting of 7,000,000 random values__________________ (sec): > 0.840000000000001 > 2800x2800 cross-product matrix (b = a' * a)_________ (sec): > 14.0966666666667 > Linear regr. over a 3000x3000 matrix (c = a \ b')___ (sec): > 6.73333333333333 > -------------------------------------------- > Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): > 2.66151784278081 > > II. Matrix functions > -------------------- > FFT over 2,400,000 random values____________________ (sec): > 0.486666666666669 > Eigenvalues of a 640x640 random matrix______________ (sec): > 0.946666666666658 > Determinant of a 2500x2500 random matrix____________ (sec): > 3.56000000000001 > Cholesky decomposition of a 3000x3000 matrix________ (sec): > 5.14666666666668 > Inverse of a 1600x1600 random matrix________________ (sec): > 3.53666666666667 > -------------------------------------------- > Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): > 2.28426807887244 > > III. Programmation > ------------------ > 3,500,000 Fibonacci numbers calculation (vector calc)(sec): > 4.11333333333333 > Creation of a 3000x3000 Hilbert matrix (matrix calc) (sec): > 0.506666666666661 > Grand common divisors of 400,000 pairs (recursion)__ (sec): > 0.770000000000001 > Creation of a 500x500 Toeplitz matrix (loops)_______ (sec): > 0.816666666666663 > Escoufier's method on a 45x45 matrix (mixed)________ (sec): 0.5 > -------------------------------------------- > Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): > 0.682997786213496 > > > Total time for all 15 tests_________________________ (sec): 45.95 > Overall mean (sum of I, II and III trimmed means/3)_ (sec): > 1.60730606307823 > --- End of test --- > > Warning messages: > 1: package 'Matrix' was built under R version 2.13.2 > 2: package 'SuppDists' was built under R version 2.13.2 > > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > Em 28/10/2011 11:33, Benilton Carvalho escreveu: >> Aos interessados em fazer algum benchmarking, aqui uma sugestao: >> >> 1) Instale o pacote SuppDists >> 2) Execute: >> >> source('http://r.research.att.com/benchmarks/R-benchmark-25.R') >> >> 3) Reporte aqui: >> >> a) Informacao de Hardware >> b) Versao do R >> c) Informacoes adicionais relevantes (BLAS / LAPACK / etc) >> d) Resultados do benchmark... >> >> Para o meu caso: >> >> Mac Pro 4,1 >> Quad-Core Xeon 2.93GHz x 2 HT >> 16G RAM >> R 2.13.2 (binario padrao) + ATLAS BLAS >> >> Resultados: >> >> >> R Benchmark 2.5 >> =============== >> Number of times each test is run__________________________: 3 >> >> I. Matrix calculation >> --------------------- >> Creation, transp., deformation of a 2500x2500 matrix (sec): 0.617666666666613 >> 2400x2400 normal distributed random matrix ^1000____ (sec): 0.267000000000053 >> Sorting of 7,000,000 random values__________________ (sec): 0.821333333333352 >> 2800x2800 cross-product matrix (b = a' * a)_________ (sec): 0.37166666666667 >> Linear regr. over a 3000x3000 matrix (c = a \ b')___ (sec): 0.316000000000031 >> -------------------------------------------- >> Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.417059757745061 >> >> II. Matrix functions >> -------------------- >> FFT over 2,400,000 random values____________________ (sec): 0.489666666666684 >> Eigenvalues of a 640x640 random matrix______________ (sec): 0.65166666666668 >> Determinant of a 2500x2500 random matrix____________ (sec): 0.430999999999964 >> Cholesky decomposition of a 3000x3000 matrix________ (sec): 0.331666666666706 >> Inverse of a 1600x1600 random matrix________________ (sec): 0.471333333333329 >> -------------------------------------------- >> Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.463342341088548 >> >> III. Programmation >> ------------------ >> 3,500,000 Fibonacci numbers calculation (vector calc)(sec): 0.721333333333367 >> Creation of a 3000x3000 Hilbert matrix (matrix calc) (sec): 0.472333333333268 >> Grand common divisors of 400,000 pairs (recursion)__ (sec): 2.30133333333337 >> Creation of a 500x500 Toeplitz matrix (loops)_______ (sec): 0.733999999999999 >> Escoufier's method on a 45x45 matrix (mixed)________ (sec): 0.533999999999992 >> -------------------------------------------- >> Trimmed geom. mean (2 extremes eliminated): 0.656333300289129 >> >> >> Total time for all 15 tests_________________________ (sec): 9.53200000000008 >> Overall mean (sum of I, II and III trimmed means/3)_ (sec): 0.502429238538774 >> --- End of test --- >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

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exportar saídas
by Luiz André Zardo 07 Nov '11

07 Nov '11

Prezados, Alguém poderia me orientar como proceder para exportar várias saídas para uma planilha excel. Por exemplo, rodei 5 modelos de regressão e gostaria de importar os resultados das anovas de cada modelo para uma planilha excel, como procedo? Obrigado!! Luiz Zardo

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Precisão numéria entre OX, R, Octave e Python
by Pedro Rafael 07 Nov '11

07 Nov '11

Comparação entre precisão matemática entre R, Ox, Octave e Python. Esse link foi enviado pelo Francisco Cribari na comunidade de estatística. http://projecteuclid.org/DPubS?service=UI&version=1.0&verb=Display&handle=e… -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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Intervalo de confiança não paramétrico
by Edson Lira 07 Nov '11

07 Nov '11

Bom dia, caro colegas, Intervalo de confiança para dados paramétricos sei como se calcula. Mas e se meus dados forem não paramétricos? Como calculo os Intervalos? Tem alguma rotina? Essa dúvida me veio porque quando faço fisher.test para tabelas dois por dois, me da o intervalo para o odds e para média, como faço? Ou não é possível? Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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Ajuda com argumento panel em um gráfico com a função xyplot{lattice}.
by Augusto Ribas 07 Nov '11

07 Nov '11

Ola galera. Estou aqui sofrendo com o xyplot(). Eu estou tentando fazer um gráfico a partir de 3 variáveis, 2 categóricas e uma numérica. Gostaria de um xyplot que aparecesse tanto as "bolinhas" que são meus dados como um risco com a média para cada grupo de amostras. Segue um exemplo que é exatamente o que quero fazer, mas usando o xyplot para partir ele em 2 gráficos uma para cada grupo. Acredito que tenho que usar o argumento panel, nossa mas não entendo muito bem a logica de como funciona para fazer funções pra usar no panel, e as que tem não consegui que fizessem o que quero. Se alguém puder dar uma mãozinha. #Começa aqui o exemplo #Abrindo um exemplo require(lattice) demo4<-read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/demo4.csv") Convertendo Variaveis em Tempo demo4 <- within(demo4, { group <- factor(group) time <- factor(time) id <- factor(id) }) par(cex = 1) # Gráfico with(demo4, interaction.plot(time, group, pulse, ylim = c(0, 60), lty = c(1, 12), lwd = 3, ylab = "mean of pulse", xlab = "time", trace.label = "group")) points(as.numeric(demo4$time),demo4$pulse,pch=rep(c(1,16),each=12)) # Gráfico com xyplot xyplot(pulse~time|group,data=demo4,layout=c(2,1),pch=16,col="black",cex=1.3) #Então aqui que eu gostaria so de uma linha ligando as medias pra cada nível do tempo no dois níveis do group #Usei alguns dos panel pronto e tentei fazer um mas não deu muito certo Bem é isso, agradeço a atenção desde ja :) -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://augustoribas.heliohost.org Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

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O que está faltando?
by Leonard Assis 05 Nov '11

05 Nov '11

Bom dia a todos, resolvi seguir hoje cedo a dica postada pelo professor Paulo Justiniano em http://www.leg.ufpr.br/doku.php/dicas:r-compila contudo, ao executar o script, notei que algo estranho estava acontecendo, pois o R não instalava. resolvi então abrir o script e executar passo a passo cada item contido nele. Basicamente, o que ele faz é: 1. apt-get para pegar todas as dependências faltantes (parece que está funcionando, não apresentou erro) 2. checkout no R-devel direto do cran usando svn (está funcionando, baixou corretamente) 3. rsync nos pacotes fonte do r-recommended (também funcionou corretamente) 4. configure, adaptando o R (com os parâmetros --with-tcltk --enable-R-shlib --with-recommended-packages --with-valgrind-instrumentation --enable-memory-profiling --with-system-bzlib --with-rgl --with-blas --with-lapack --enable-R-static-lib --enable-BLAS-shlib) 5. make Bem, ao chegar nesta etapa, aparece a seguinte sequência: gcc -std=gnu99 -Wl,--export-dynamic -fopenmp -L/usr/local/lib -o R.bin Rmain.o -L../../lib -lR -lRblas ../../lib/libR.so: undefined reference to `drot_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `drotg_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dswap_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dgemm_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dnrm2_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dscal_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `zgemm_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dtrsm_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `daxpy_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dcopy_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dsyrk_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `dasum_' ../../lib/libR.so: undefined reference to `ddot_' collect2: ld returned 1 exit status make[3]: ** [R.bin] Erro 1 make[3]: Saindo do diretório `/home/ldeassis/R/R/src/main' make[2]: ** [R] Erro 2 make[2]: Saindo do diretório `/home/ldeassis/R/R/src/main' make[1]: ** [R] Erro 1 make[1]: Saindo do diretório `/home/ldeassis/R/R/src' make: ** [R] Erro 1 ldeassis@ubuntu:~/R/R$ Pelo que conheço de C/C++, está faltando alguma lib. A pergunta é: qual é essa dita cuja? Suponho que na hora do apt, algum pacote não foi encontrado ou coisa parecida. Alguma sugestão? Obrigado lmassis <at> yahoo <dot> com <dot> br assis.leonard <at> gmail <dot> com

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Resolvido: Tirar o cabeçalho do txt
by Simone D. Sartorio 05 Nov '11

05 Nov '11

Pessoal, muito obrigada pela ajuda! Deu certo! bjos Simone Daniela Sartorio Licenciada em Matemática - UNESP (Rio Claro); Mestre e atualmente Doutoranda em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/USP. Cel: (19)9105-9032 - Claro (19)8182-0586 - Tim ******************************************************************* "Gostaria de te desejar tantas coisas. Mas nada seria suficiente. Então, desejo apenas que você tenha muitos desejos. Desejos grandes. E que eles possam te mover a cada minuto, ao rumo da sua felicidade!" (Carlos Drummond de Andrade) ******************************************************************* Tenha um Bom Dia!!! ________________________________ De: Jônatan <jdtatsch(a)gmail.com> Para: Simone D. Sartorio <sisartorio(a)yahoo.com.br> Enviadas: Sexta-feira, 4 de Novembro de 2011 17:22 Assunto: Re: [R-br] Tirar o cabeçalho do txt Olá Simone, os argumentos usados na funcao grep são "Expressões Regulares (ERs)" e são comumente usadas em linhas de comandos de sistemas unix. Como vi que se tratava de dados de saída do DSSAT imaginei que estariam usando SO Windows, por isso enviei como fazer no R. No exemplo que te enviei a ER "^ [0-9]|^@" significa "procura por todas linhas que comecarem ("^") com um espaço seguido de qualquer número ("[0-9]"), ou ("|") linhas que comecarem com @. A função grep retorna as posicoes das linhas com esse padrão. Fora do assunto da questão, eu fiquei pensando depois disso, como vcs vão diferenciar uma simulação da outra? Não verifiquei se há nos seus dados uma coluna que diferencie uma simulação da outra. Acho que teria que por um identificador (p.ex. 1 pra primeira simulação, 2 pra segunda, ...). Se todas simulações tiverem o mesmo numero de linhas é fácil fazer isso com o comando "rep" do R. Do contrário já teria que pensar um pouco mais. Se quiseres saber mais sobre regex veja ?regex (no R) e tem esse link http://aurelio.net/regex/. Gostaria de te pedir para responder a lista r-br que a questão foi resolvida. Quando te respondi não tinha certeza se era isso mesmo que tu queria, que bom que serviu. [ ]'s 2011/11/4 Simone D. Sartorio <sisartorio(a)yahoo.com.br> Oi Jonatan! > >Muito obrigada resolveu.... por tentativa e erro consegui tirar as linhas q eu queria, mas quebrei a cabeça aqui e nao entendi a logica da programação: >"^ [0-9]|^@" >Vc pode me explicar?! Nunca vi, ou melhor, não fui apresentada a esta notação! >Desde já muito obrigada! >abraços >Simone > > > > >________________________________ >De: Jônatan <jdtatsch(a)gmail.com> >Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br; Simone D. Sartorio <sisartorio(a)yahoo.com.br> >Enviadas: Quinta-feira, 3 de Novembro de 2011 16:13 >Assunto: Re: [R-br] Tirar o cabeçalho do txt > > > >Se infelizmente não estiveres usando linux use o R mesmo. > >d <- readLines("~/Desktop/jandaia.txt") >writeLines(d[grep("^ [0-9]|^@", d)],"teste.txt") > > > >[ ]'s > >-- >#------------------------------------------------------------------------------# ># Jônatan Dupont Tatsch # ># Climate and Biosphere Laboratory # ># Department of Atmospheric Sciences # ># Institute of Astronomy, Geophysics and Atmospheric Sciences # ># University of São Paulo # ># Rua do Matão, 1226 # ># Cid. Universitária, São Paulo, SP, Brazil, CEP: 05508-090 # ># Phone:+55 11 3091-4772, Fax:+55 11 3091-4714 # ># http://jonatandupont.weebly.com/index.html # >#------------------------------------------------------------------------------# > > >2011/11/3 Simone D. Sartorio <sisartorio(a)yahoo.com.br> > > >>Pessoal, boa tarde! >> >>Gente, estou com o seguinte problema, apareceu um rapaz aqui com um banco de dados com o formato que eu deixei disponivel no site: >>http://www.datafilehost.com/download-b2091792.html >> >>O programa que ele usa, pelo que ele me disse, solta esse cabeçalho, que não tem como tirar pelo programa: >> >>------------------------------------------------------------------------------------------------ >>*GROWTH ASPECTS OUTPUT FILE >>*DSSAT Cropping System Model Ver. 4.5.0.047 APR 11, 2011; 16:16:38 >> >>*RUN 1 : nov_01_DAS MZCER045 GOJD1105 1 >> MODEL : MZCER045 - Maize >> EXPERIMENT : GOJD1105 SN MILHO_SAFRA_JANDAIA >> DATA PATH : C:\DSSAT45\Seasonal\ >> TREATMENT 1 : nov_01_DAS MZCER045 >>------------------------------------------------------------------------------------------------ >> >>Mas isto ele solta para cada amostra obtida, ou seja, nesse arquivo q deixei no site, que eu salvei em '.txt', tem vários deste tipo, identificando a amostra, mas o cabeçalho é meio q padrão. >>Alguem sabe se é possível apagar este cabeçalho deste arquivo de uma maneira inteligente, sem ser manualmente?! Pq o cara tem 30 anos de informações, dai pensa no trabalho.... >>Deletar linha, coluna, ou celula é facil de uma matriz, mas coisa assim eu desconheço se dá p fazer no R. >>Alguém tem alguma ideia?! Pode ser em outro programa tb! >> >>desde já muito obrigada! >>Simone >> >> >> >>Simone Daniela Sartorio >>Licenciada em Matemática - UNESP (Rio Claro); >>Mestre e atualmente Doutoranda em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/USP. >>Cel: (19)9105-9032 - Claro >> (19)8182-0586 - Tim >> >> ******************************************************************* >> "Gostaria de te desejar tantas coisas. >> Mas nada seria suficiente. >> Então, desejo apenas que você tenha muitos desejos. >> Desejos grandes. >> E que eles possam te mover a cada minuto, ao rumo da sua felicidade!" >> (Carlos Drummond de Andrade) >> ******************************************************************* >> Tenha um Bom Dia!!! >> >> >> >>_______________________________________________ >>R-br mailing list >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> > > > > > > -- #------------------------------------------------------------------------------# # Jônatan Dupont Tatsch # # Climate and Biosphere Laboratory # # Department of Atmospheric Sciences # # Institute of Astronomy, Geophysics and Atmospheric Sciences # # University of São Paulo # # Rua do Matão, 1226 # # Cid. Universitária, São Paulo, SP, Brazil, CEP: 05508-090 # # Phone:+55 11 3091-4772, Fax:+55 11 3091-4714 # # http://jonatandupont.weebly.com/index.html # #------------------------------------------------------------------------------#

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Algoritmo genético
by Ana Paula Sousa 04 Nov '11

04 Nov '11

Alguém já trabalhou com algoritmo genético no R?

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Re: [R-br] Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS e R
by Ivan Bezerra Allaman 04 Nov '11

04 Nov '11

Atenção!! Ao comparar o R com o Satão deve ser utilizado o mesmo tipo de reparametrização do SAS, pois as reparametrizações são diferentes. Use no R o contraste soma zero para comparar com o SAS. (S,f,P) Allaman \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5076 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS e R
by Danilo Scorzoni Ré 04 Nov '11

04 Nov '11

Prezados, desculpe pela falta de informação. Reproduzo, abaixo, os comandos utilizados em cada pacote estatístico. Porém, não estou incluindo o conjunto de dados. No R: ---------------------- dados.VOL = glm(VOL ~ AREA + BLOCO + AREA:BLOCO + TRAT + AREA:TRAT, family=Gamma(link="log")) anova(dados.VOL, test="Chi") summary(dados.VOL) Resultados do anova(dados.VOL, test="Chi"): Terms added sequentially (first to last) Df Deviance Resid. Df Resid. Dev P(>|Chi|) NULL 23 5.0505 AREA 1 0.20472 22 4.8458 0.143019 BLOCO 2 1.33563 20 3.5102 0.000914 *** TRAT 3 0.99568 17 2.5145 0.015220 * AREA:BLOCO 2 0.80620 15 1.7083 0.014642 * AREA:TRAT 3 0.44780 12 1.2605 0.195766 Qualidade do ajuste no R (summary(dados.VOL)): (Dispersion parameter for Gamma family taken to be 0.09543322) Null deviance: 5.0505 on 23 degrees of freedom Residual deviance: 1.2605 on 12 degrees of freedom AIC: 237.67 No SAS: ------------------------- PROC GENMOD DATA = WORK.Dados; CLASS AREA TRAT BLOCO; MODEL VOL = AREA BLOCO AREA|BLOCO TRAT AREA|TRAT / dist = gamma link = log type1 type3; RUN; Resultados (resumidos): Estimativa do parâmetro de escala: Scale 1 19.2056 5.4967 10.9600 33.6546 Criteria For Assessing Goodness Of Fit Criterion DF Value Value/DF Deviance 12 1.2605 0.1050 Scaled Deviance 12 24.2083 2.0174 Pearson Chi-Square 12 1.1452 0.0954 Scaled Pearson X2 12 21.9940 1.8328 Log Likelihood -105.8333 LR Statistics For Type 1 Analysis 2*Log Chi- Source Likelihood DF Square Pr > ChiSq Intercept -245.5958 AREA -244.5698 1 1.03 0.3111 BLOCO -236.6152 2 7.95 0.0187 AREA*BLOCO -230.4331 2 6.18 0.0455 TRAT -219.0362 3 11.40 0.0098 AREA*TRAT -211.6666 3 7.37 0.0610 LR Statistics For Type 3 Analysis Chi- Source DF Square Pr > ChiSq AREA 1 3.83 0.0504 BLOCO 2 15.70 0.0004 AREA*BLOCO 2 13.45 0.0012 TRAT 3 14.20 0.0026 AREA*TRAT 3 7.37 0.0610 OBS: Não coloquei os valores das estimativas dos parâmetros e os testes. Obrigado pela atenção. Att, -- Danilo Scorzoni Ré Engenheiro Florestal Mestrando em Ciência Florestal FCA / UNESP - Botucatu (14) 8180-2494

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Alterar escala eixo x
by Marcelo Claro de Souza 04 Nov '11

04 Nov '11

Plotei um gráfico utilizando os comandos abaixo e minha escala do eixo x aparece de 50 em 50, mas eu gostaria que aparecesse de 10 em 10, como faço essa alteração? Tentei utilizar os comandos axis(1,at=seq(1,170, by=10) para substituir o eixo x, entretanto as legendas ficaram sobrepostas. O conjunto de dados está em anexo. cinetica=read.csv2(file.choose(),h=T) um=lm(um~time,data=cinetica) plot(um~time,data=cinetica,xlab="t (h)",ylab="Q (µg)",xlim=c(0,170)) abline(um) text(2.5,325,"R²=0.9288",adj=c(0,0)) text(2.5,300,"r=0.9637",adj=c(0,0)) Muito obrigado. Marcelo Claro de Souza Biologist, PhD student in Plant Biology Institute of Bioscience - UNESP, Brazil

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ajuda arquivo ncdf
by Rodrigo Plei 04 Nov '11

04 Nov '11

Prezados, Tenho dados de temperatura, latitude, longitude e tempo (anos e meses) em um arquivo do tipo ncdf. Ocorre que eu preciso extrair apenas os dados referentes a temperatura uma área geográfica durante um determinado período. O pacote ncdf oferece o comando get.var.ncdf para extrair os dados, mas eu só consigo extrair a totalidade, e não apenas a área geográfica e o intervalo de tempo que eu preciso. A estrutura do aquivo é a seguinte: [1] "file sst.mnmean.nc has 4 dimensions:" [1] "lat Size: 180" [1] "lon Size: 360" [1] "time Size: 358" [1] "nbnds Size: 2" [1] "------------------------" [1] "file sst.mnmean.nc has 2 variables:" [1] "short sst[lon,lat,time] Longname:Monthly Mean of Sea Surface Temperature Missval:32767" [1] "double time_bnds[nbnds,time] Longname:Time Boundaries Missval:1e+30" Já tentei vários fóruns em inglês e o pessoal nunca fornece um procedimento simples. Alguém pode me dar uma luz? Estou tentando fazer isso ha uma semana! Rodrigo -- =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8--> Rodrigo Silvestre Martins, PhD Bolsista FAPESP Pós-Doutorado Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq) Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B) Butantã - São Paulo/SP, Brasil 05508-900 Tel: +55 11 3091 6549 Email: rodrigo.plei(a)gmail.com ; ocersm(a)lycos.com; rsmartins(a)usp.br CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777

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Digest R-br, volume 9, assunto 7
by Danilo Scorzoni Ré 04 Nov '11

04 Nov '11

Estou utilizando o comando glm() no R e a proc genmod no SAS. 2011/11/4 <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi (Andre Oliveira) > 2. Label teimoso (Fernando Colugnati) > 3. Re: instalação R windows 7 (Jose Claudio Faria) > 4. Re: instalação R windows 7 (Lucas Fernandes de Souza) > 5. Re: [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi (Jose Claudio Faria) > 6. Re: Label teimoso (Benilton Carvalho) > 7. Re: Label teimoso (Fernando Colugnati) > 8. Re: Tirar o cabeçalho do txt (Leonard de Assis) > 9. Re: [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi (Leonard de Assis) > 10. Re: instalação R windows 7 (Leonard de Assis) > 11. Re: instalação R windows 7 (Lucas Fernandes de Souza) > 12. Re: instalação R windows 7 (Lucas Fernandes de Souza) > 13. Re: instalação R windows 7 (Benilton Carvalho) > 14. Re: instalação R windows 7 (Leonard de Assis) > 15. "trocando" versão do R (Linux) (Leonard de Assis) > 16. Re: "trocando" versão do R (Linux) (Benilton Carvalho) > 17. Re: "trocando" versão do R (Linux) (Paulo Justiniano) > 18. Re: [OT] Distancias entre municipios (Mario Azevedo) > 19. Re: [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi (Daniel C Bezerra) > 20. Re: [OT] Distancias entre municipios (Mario Azevedo) > 21. Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS/R (Danilo Scorzoni Ré) > 22. Re: Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS/R (Fernando Colugnati) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Thu, 3 Nov 2011 13:26:20 -0700 (PDT) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > Message-ID: > <1320351980.55294.YahooMailNeo(a)web161804.mail.bf1.yahoo.com> > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Tudo é gosto. Já usei TinnR, Emacs entre outros, mas seja no Linux ou no > win só uso RStudio atualmente. > > > > André Oliveira Souza > > > ________________________________ > De: Antonio Silva <aolinto.lst(a)gmail.com> > Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Enviadas: Quinta-feira, 3 de Novembro de 2011 18:08 > Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > > > Olá, eu uso Linux a maior parte do tempo. Tentei utilizar o emacs/ess mas > me pareceu demandaria um tempo para aprendizagem que eu não dispunha. Estou > adorando o RKWard. Quando uso Windows fico com o RStudio. > > Abraços, > > Antônio > > > > Em 3 de novembro de 2011 17:53, Daniel C Bezerra <danielcbezerra(a)gmail.com> > escreveu: > > O R Studio é legal mas não permite seleção do texto em colunas. Eu gosto > muito do emacs e ess. Como já comentado sugiro tb dar uma olhada nas > mensagens anteriores porque esta discussão já passeou por aqui algumas > vezes. > >Abs, > >D > >On Nov 3, 2011 4:12 PM, "Pedro Rafael" <pedro.rafael.marinho(a)gmail.com> > wrote: > > > >Hoje as IDE's não dão mais facilidade para trabalhar com a programação, > seja em R ou qualquer outra linguagem? Já vi muitas pessoas dizer que o > Emacs parece mais um sistema operacional do que um editor de texto. Não sei > se a IDE do Rstudio me dá mais possibilidades de trabalhar com o R do que > um editor de texto emacs ou vim. > >> > >> > >>Em 3 de novembro de 2011 15:06, Gustavo Carvalho [via R-br] < > ml-node+s2285057n3987143h10(a)n4.nabble.com> escreveu: > >> > >>Para mim, é questão de gosto. Gosto muito desse plugin pro vim: > >>> > >>>http://www.vim.org/scripts/script.php?script_id=2628 > >>> > >>> > >>>2011/11/3 FHRB Toledo <[hidden email]>: > >>> > >>>> Pedro, > >>>> > >>>> Usando o emacs (ESS) tem-se uma série de facilidades como > "autocompletar" os > >>>> códigos, identação, suporte da extenão *.Rnw para Sweave, E todas as > tantas > >>>> peculiaridades que o emacs pode eoferecer! > >>>> > >>>> att, > >>>> FH > >>>> > >>>> 2011/11/3 Pedro Rafael <[hidden email]> > >>>>> > >>>>> Pessoal programar com o R vale a pena com o emacs? Alguém aqui > utiliza ele > >>>>> para programar? Entre o emacs e o vi qual seria a melhor opção.? > >>>>> > >>>>> -- > >>>>> Saudações, > >>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho. > >>>>> Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > >>>>> > >>>>> > >>>>> _______________________________________________ > >>>>> R-br mailing list > >>>>> [hidden email] > >>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>>>> código mínimo reproduzível. > >>>> > >>>> > >>>> _______________________________________________ > >>>> R-br mailing list > >>>> [hidden email] > >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > >>>> mínimo reproduzível. > >>>> _______________________________________________ > >>>R-br mailing list > >>>[hidden email] > >>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >>> > >>> > >>>>>>________________________________ > >>> > >>>If you reply to this email, your message will be added to the > discussion below: > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Programar-no-R-com-Emacs-ou-V… > >>>To unsubscribe from R-br, click here. > >> > >> > >>-- > >>Saudações, > >>Pedro Rafael Diniz Marinho. > >>Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > >> > >> > >> > >> > >>_______________________________________________ > >>R-br mailing list > >>R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > >> > >>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > >> > >_______________________________________________ > >R-br mailing list > >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > > -- > Antônio Olinto Ávila da Silva > Biólogo / Oceanógrafo > Instituto de Pesca (Fisheries Institute) > São Paulo, Brasil > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/e8d4d958/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Thu, 3 Nov 2011 18:45:17 -0200 > From: Fernando Colugnati <fernando(a)ipti.org.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: [R-br] Label teimoso > Message-ID: > <CAOLzYt2RM_NiDYdu3uCVJR0NQ9MTzk5PKjn-F7ybcjuJkD-Uqw(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Pessoal, estou utilizando um pacote que gera alguns gráficos de > diagnóstico, conforme o código abaixo. Reparem que no box-plot eu gostaria > apenas do label "GBM p-scores", mas ele insiste em colocar o método > ks.stat.max junto. Como faço para "apagar" isso? Isso ocorre com vários > gráficos, e estou comparando alguns modelos diferentes para estimação dos > p-scores (propensity scores). > > Obrigado, segue o código (retirado do exemplo do pacote, os dados são > fornecidos como exemplo): > > #Pacote twang para estimação de propensity scores > > library(twang) > data(lalonde) > > ps.lalonde <- ps(treat ~ age + educ + black + hispan + nodegree + > married + re74 + re75, > data = lalonde, > title="Lalonde example", > stop.method=stop.methods[c("ks.stat.max")], > # generate plots? > plots="none", > pdf.plots=FALSE, > # gbm options > n.trees=2000, > interaction.depth=3, > shrinkage=0.005, > perm.test.iters=0, > verbose=FALSE) > > plot(ps.lalonde, label= "GBM p-scores", plots = "ps boxplot") > > -- > Fernando A.B. Colugnati > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/77308aaa/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 3 > Date: Thu, 3 Nov 2011 17:44:37 -0300 > From: Jose Claudio Faria <joseclaudio.faria(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: > <CAN+Emd-u1PHDkNEG4Zr74ksaM7xYWpA-xv_pKg_gpQw_3YA20g(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > Huuummm... Verifique se o download de sua vesão está integro: MD5 checksum! > > Ab, > -- > ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ > Jose Claudio Faria > Estatistica - Prof. Pleno > UESC/DCET/Brasil > joseclaudio.faria at gmail.com > ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ > > Em 3 de novembro de 2011 16:39, Lucas Fernandes de Souza > <luc.souza(a)usp.br> escreveu: > > Já fiz isso também, mas não funcionou, continuou com o mesmo problema... > > > > > > > > -- > > Lucas F. de Souza > > Eng. Agrícola - CONAB > > M.Sc. Produção Vegetal - UENF > > Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP > > tel: (19) 8160-7068 > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > > ------------------------------ > > Message: 4 > Date: Thu, 03 Nov 2011 18:49:24 -0200 > From: Lucas Fernandes de Souza <luc.souza(a)usp.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, Jose Claudio Faria > <joseclaudio.faria(a)gmail.com> > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: <20111103184924.20985j22ltdwflg4(a)webmail.usp.br> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; DelSp="Yes"; > format="flowed" > > Como faço para verificar isso? > abs > > > > -- > Lucas F. de Souza > Eng. Agrícola - CONAB > M.Sc. Produção Vegetal - UENF > Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP > tel: (19) 8160-7068 > > > > ------------------------------ > > Message: 5 > Date: Thu, 3 Nov 2011 17:40:19 -0300 > From: Jose Claudio Faria <joseclaudio.faria(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, Andre Oliveira > <andreolsouza(a)yahoo.com.br> > Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > Message-ID: > <CAN+Emd_c76AMk4whnTQgzHzpDxaicz-cXbiCRou0EydfeAs=pA(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > Minha sugestão é: teste as duas opções e veja quel é mais adequada > para você nesse momento. > (considere também que isso pode mudar com o tempo...) > > Ab, > -- > ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ > Jose Claudio Faria > Estatistica - Prof. Pleno > UESC/DCET/Brasil > joseclaudio.faria at gmail.com > ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ > > Em 3 de novembro de 2011 17:26, Andre Oliveira > <andreolsouza(a)yahoo.com.br> escreveu: > > Tudo é gosto. Já usei TinnR, Emacs entre outros, mas seja no Linux ou no > win > > só uso RStudio atualmente. > > > > > > André Oliveira Souza > > ________________________________ > > De: Antonio Silva <aolinto.lst(a)gmail.com> > > Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Enviadas: Quinta-feira, 3 de Novembro de 2011 18:08 > > Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > > > > Olá, eu uso Linux a maior parte do tempo. Tentei utilizar o emacs/ess > mas me > > pareceu demandaria um tempo para aprendizagem que eu não dispunha. Estou > > adorando o RKWard. Quando uso Windows fico com o RStudio. > > > > Abraços, > > > > Antônio > > > > > > Em 3 de novembro de 2011 17:53, Daniel C Bezerra < > danielcbezerra(a)gmail.com> > > escreveu: > > > > O R Studio é legal mas não permite seleção do texto em colunas. Eu gosto > > muito do emacs e ess. Como já comentado sugiro tb dar uma olhada nas > > mensagens anteriores porque esta discussão já passeou por aqui algumas > > vezes. > > Abs, > > D > > On Nov 3, 2011 4:12 PM, "Pedro Rafael" <pedro.rafael.marinho(a)gmail.com> > > wrote: > > > > Hoje as IDE's não dão mais facilidade para trabalhar com a programação, > seja > > em R ou qualquer outra linguagem? Já vi muitas pessoas dizer que o Emacs > > parece mais um sistema operacional do que um editor de texto. Não sei se > a > > IDE do Rstudio me dá mais possibilidades de trabalhar com o R do que um > > editor de texto emacs ou vim. > > > > Em 3 de novembro de 2011 15:06, Gustavo Carvalho [via R-br] > > <ml-node+s2285057n3987143h10(a)n4.nabble.com> escreveu: > > > > Para mim, é questão de gosto. Gosto muito desse plugin pro vim: > > > > http://www.vim.org/scripts/script.php?script_id=2628 > > > > > > 2011/11/3 FHRB Toledo <[hidden email]>: > >> Pedro, > >> > >> Usando o emacs (ESS) tem-se uma série de facilidades como > "autocompletar" > >> os > >> códigos, identação, suporte da extenão *.Rnw para Sweave, E todas as > >> tantas > >> peculiaridades que o emacs pode eoferecer! > >> > >> att, > >> FH > >> > >> 2011/11/3 Pedro Rafael <[hidden email]> > >>> > >>> Pessoal programar com o R vale a pena com o emacs? Alguém aqui utiliza > >>> ele > >>> para programar? Entre o emacs e o vi qual seria a melhor opção.? > >>> > >>> -- > >>> Saudações, > >>> Pedro Rafael Diniz Marinho. > >>> Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > >>> > >>> > >>> _______________________________________________ > >>> R-br mailing list > >>> [hidden email] > >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>> código mínimo reproduzível. > >> > >> > >> _______________________________________________ > >> R-br mailing list > >> [hidden email] > >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >> código > >> mínimo reproduzível. > >> > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > [hidden email] > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > > > ________________________________ > > If you reply to this email, your message will be added to the discussion > > below: > > > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Programar-no-R-com-Emacs-ou-V… > > To unsubscribe from R-br, click here. > > > > > > -- > > Saudações, > > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > > > > > -- > > Antônio Olinto Ávila da Silva > > Biólogo / Oceanógrafo > > Instituto de Pesca (Fisheries Institute) > > São Paulo, Brasil > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código > > mínimo reproduzível. > > > > > ------------------------------ > > Message: 6 > Date: Thu, 3 Nov 2011 21:00:13 +0000 > From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] Label teimoso > Message-ID: > <CAO-arWOTgodSiG3mPd6gWBC0WWE5PCS2WuA5A4Zfi0-46+eqGA(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > names(ps.lalonde$desc)[2] = '' > plot(ps.lalonde, label= "GBM p-scores", plots = "ps boxplot") > > soh um artificio para obter o q vc quer, imagino que o autor teve seus > motivos pra tentar evitar isso. :) > > > ------------------------------ > > Message: 7 > Date: Thu, 3 Nov 2011 19:13:51 -0200 > From: Fernando Colugnati <fernando(a)ipti.org.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] Label teimoso > Message-ID: > <CAOLzYt2dQx6rS=cqbK1yR_1ob=Sfh50W+eQ_W01_QtSJ8nLFxg(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Obrigado Benilton, funcionou. Tentei artifícios tbm, com as coisas básicas > do plot e seus "..." . > > Bem, não consigo imaginar o motivo, uma vez que ele disponibilizou o pacote > e vários exemplos no site da RAND, e na verdade até consegui modificar e > implementar novos métodos...sacanear no gráfico somente? Talvez seja apenas > falta de "user friendly concern"...pra usuários high-level como eu isso é > sempre um problema. Obrigado novamente > > > > Em 3 de novembro de 2011 19:00, Benilton Carvalho < > beniltoncarvalho(a)gmail.com> escreveu: > > > names(ps.lalonde$desc)[2] = '' > > plot(ps.lalonde, label= "GBM p-scores", plots = "ps boxplot") > > > > soh um artificio para obter o q vc quer, imagino que o autor teve seus > > motivos pra tentar evitar isso. :) > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > -- > Fernando A.B. Colugnati > Pesquisador Associado > > Instituto de Pesquisas em Tecnologia e Inovação - IPTI > Tel. 55 11 8704-9812 > www.ipti.org.br > fernando(a)ipti.org.br > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/d8898704/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 8 > Date: Thu, 03 Nov 2011 20:09:36 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, "Simone D. Sartorio" > <sisartorio(a)yahoo.com.br> > Subject: Re: [R-br] Tirar o cabeçalho do txt > Message-ID: <4EB31120.7090100(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > read.table não resolve? dê uma olhada na opção skip deste comando > > Isso sempre resolveu comigo qdo precisei eliminar as "n" primeiras > linhas de um arquivo de dados > > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > Em 03/11/2011 15:11, Simone D. Sartorio escreveu: > > > > Pessoal, boa tarde! > > > > Gente, estou com o seguinte problema, apareceu um rapaz aqui com um > > banco de dados com o formato que eu deixei disponivel no site: > > http://www.datafilehost.com/download-b2091792.html > > > > O programa que ele usa, pelo que ele me disse, solta esse cabeçalho, > > que não tem como tirar pelo programa: > > > > > ------------------------------------------------------------------------------------------------ > > *GROWTH ASPECTS OUTPUT FILE > > *DSSAT Cropping System Model Ver. 4.5.0.047 APR 11, > > 2011; 16:16:38 > > > > > > *RUN 1 : nov_01_DAS MZCER045 GOJD1105 > > 1 > > MODEL : MZCER045 - > > Maize > > EXPERIMENT : GOJD1105 SN > > MILHO_SAFRA_JANDAIA > > DATA PATH : > > C:\DSSAT45\Seasonal\ > > TREATMENT 1 : nov_01_DAS MZCER045 > > > ------------------------------------------------------------------------------------------------ > > > > Mas isto ele solta para cada amostra obtida, ou seja, nesse arquivo q > > deixei no site, que eu salvei em '.txt',tem vários deste tipo, > > identificando a amostra, mas o cabeçalho é meio q padrão. > > Alguem sabe se é possível apagar este cabeçalho deste arquivo de uma > > maneira inteligente, sem ser manualmente?! Pq o cara tem 30 anos de > > informações, dai pensa no trabalho.... > > Deletar linha, coluna, ou celula é facil de uma matriz, mas coisa > > assim eu desconheço se dá p fazer no R. > > Alguém tem alguma ideia?! Pode ser em outro programa tb! > > > > desde já muito obrigada! > > Simone > > > > > > > > Simone Daniela Sartorio > > Licenciada em Matemática - UNESP (Rio Claro); > > Mestre e atualmente Doutoranda em Estatística e Experimentação > > Agronômica - ESALQ/USP. > > Cel: (19)9105-9032 - Claro > > (19)8182-0586 - Tim > > > > ******************************************************************* > > "Gostaria de te desejar tantas coisas. > > Mas nada seria suficiente. > > Então, desejo apenas que você tenha muitos desejos. > > Desejos grandes. > > E que eles possam te mover a cada minuto, ao rumo da sua > > felicidade!" > > > > (Carlos Drummond de Andrade) > > ******************************************************************* > > Tenha um Bom Dia!!! > > > > > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/fc434c01/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 9 > Date: Thu, 03 Nov 2011 20:17:39 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > Message-ID: <4EB31303.4090709(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Ei ia testar hoje uma opção (pra mim mais natural) que é rodar o R no > eclipse, usando o statET. > > Vi este tipo de uso em um vídeo que assisti semana passada, resolvi > experimentar, mas ainda estou "apanhando" na instalação dos requisitos. > > Qto ao R + qq outro amviente, vai muito do gosto pessoal de cada um. > > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > Em 03/11/2011 15:51, Nory escreveu: > > Olá Pedro, > > > > Eu uso a interface do Emacs para rodar o R e tenho gostado muito. > > Se não me engano, acho que já rolou por aqui uma discussão sobre esse > > tema. > > > > Nory Daniel Erazo > > > > Em 3 de novembro de 2011 14:44, Pedro Rafael > > <pedro.rafael.marinho(a)gmail.com > > <mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com>> escreveu: > > > > Pessoal programar com o R vale a pena com o emacs? Alguém aqui > > utiliza ele para programar? Entre o emacs e o vi qual seria a > > melhor opção.? > > > > -- > > Saudações, > > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e > > forneça código mínimo reproduzível. > > > > > > > > > > -- > > Nory Daniel de Carvalho Erazo > > > > Técnico em Sistemática Vegetal/Herbário > > Coordenação de Pesquisas em Biodiversidade > > Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia-INPA > > Av. André Araújo, 2936, Aleixo, CEP 69060-001, Manaus-AM > > Fone: (92) 3643-3125 > > Celular: (92) 9378-7592 > > E-mail: > > norydaniel(a)gmail.com <mailto:norydaniel@gmail.com> > > <mailto:norydaniel@gmail.com>nory(a)inpa.gov.br <mailto:nory@inpa.gov.br> > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/fdb44028/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 10 > Date: Thu, 03 Nov 2011 20:21:49 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: <4EB313FD.6080209(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > Lucas, > > descreva seu problema, talvez eu possa ajudá-lo. Ultimamente gastei > parte de meu tempo instalando o R no Windows 7 (Seja através do setup, > seja através dos fontes). > > Eu não vi complicação nenhuma instalando via os binários, por isso > gostaria que vc reproduzisse passo a passo o que está acontecendo para > que eu )ou outro colega nosso) possa ajudar > > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > Em 03/11/2011 16:19, Lucas Fernandes de Souza escreveu: > > Boa tarde a todos!! > > > > Não estou conseguindo instalar nenhuma versão do R no windows 7. > > Alguém pode me ajudar, por favor? > > obrigado > > > > > ------------------------------ > > Message: 11 > Date: Thu, 03 Nov 2011 21:05:07 -0200 > From: Lucas Fernandes de Souza <luc.souza(a)usp.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, assis.leonard(a)gmail.com > Cc: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: <20111103210507.88607fw4j2ors0tf(a)webmail.usp.br> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; DelSp="Yes"; > format="flowed" > > Então amigo, eu baixei o setup de várias versões do R. > quando eu mando executar, aparece a janela perguntando em qual idioma > eu quero que o R funcione, ok? > Mas a janela fecha automaticamente e rapidamente, não dando tempo para > eu fazer nada. > Quando em mando executar novamente o setup, ocorre o mesmo problema, > sempre sem nenhuma mensagem de erro. > se puder ajudar, agradeço > abs > > -- > Lucas F. de Souza > Eng. Agrícola - CONAB > M.Sc. Produção Vegetal - UENF > Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP > tel: (19) 8160-7068 > > > > ------------------------------ > > Message: 12 > Date: Thu, 03 Nov 2011 21:05:07 -0200 > From: Lucas Fernandes de Souza <luc.souza(a)usp.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, assis.leonard(a)gmail.com > Cc: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: <20111103210507.88607fw4j2ors0tf(a)webmail.usp.br> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; DelSp="Yes"; > format="flowed" > > Então amigo, eu baixei o setup de várias versões do R. > quando eu mando executar, aparece a janela perguntando em qual idioma > eu quero que o R funcione, ok? > Mas a janela fecha automaticamente e rapidamente, não dando tempo para > eu fazer nada. > Quando em mando executar novamente o setup, ocorre o mesmo problema, > sempre sem nenhuma mensagem de erro. > se puder ajudar, agradeço > abs > > -- > Lucas F. de Souza > Eng. Agrícola - CONAB > M.Sc. Produção Vegetal - UENF > Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP > tel: (19) 8160-7068 > > > > ------------------------------ > > Message: 13 > Date: Thu, 3 Nov 2011 23:43:49 +0000 > From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: > <CAO-arWMsOKKye0sv9f_-h2JgRq5yGN9vwMCgCv=vkdxTOHxqTw(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Anti-virus? > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/b679ea83/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 14 > Date: Thu, 03 Nov 2011 22:03:49 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] instalação R windows 7 > Message-ID: <4EB32BE5.9050906(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > 1. Qual versão do Windows > 2. Qual versão do R q vc está tentando > 3. de onde vc baixou essa versão > 4. Quais softwares estão instalados na máquina > 5. Como você está fazendo para "tentar" instalar > 6. Configuração do Computador (Memória RAM, espaço em disco, etc) > > Tive um problema parecido certa vez instalando o SAS e foi culpa da > pouca memória da máquina. > > > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > Em 03/11/2011 21:05, Lucas Fernandes de Souza escreveu: > > Então amigo, eu baixei o setup de várias versões do R. > > quando eu mando executar, aparece a janela perguntando em qual idioma > > eu quero que o R funcione, ok? > > Mas a janela fecha automaticamente e rapidamente, não dando tempo para > > eu fazer nada. > > Quando em mando executar novamente o setup, ocorre o mesmo problema, > > sempre sem nenhuma mensagem de erro. > > se puder ajudar, agradeço > > abs > > > > > ------------------------------ > > Message: 15 > Date: Thu, 03 Nov 2011 22:07:28 -0200 > From: Leonard de Assis <assis.leonard(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: [R-br] "trocando" versão do R (Linux) > Message-ID: <4EB32CC0.2010404(a)gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 > > Eu rodo em minha máquina o R 2.14 padrão distribuído pelo cran. > > Pretendo trocar por um R "tunado", compilando direto dos fontes. > > Alguma recomendação especial? preciso remover o atual? > > SO: linux ubuntu 11.10 > > -- > []s > Leonard de Assis > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > > ------------------------------ > > Message: 16 > Date: Fri, 4 Nov 2011 00:12:34 +0000 > From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>, > "assis.leonard(a)gmail.com" <assis.leonard(a)gmail.com> > Subject: Re: [R-br] "trocando" versão do R (Linux) > Message-ID: > <CAO-arWMyfxzpJ9F-2hCD3UOnG9N6J4csj4pDFF_Hg6OLESrkMw(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Nao precisa remover. Configure usando --prefix apontando p um dir no seu > home dir ou outro lugar. > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111104/980221ca/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 17 > Date: Thu, 3 Nov 2011 22:42:14 -0200 (BRST) > From: Paulo Justiniano <paulojus(a)leg.ufpr.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, assis.leonard(a)gmail.com > Subject: Re: [R-br] "trocando" versão do R (Linux) > Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1111032241250.14182(a)pataxo.est.ufpr.br> > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed" > > Na pagina : > > tem um script que uso para fazer isto com os passos e instrucoes > http://www.leg.ufpr.br/doku.php/dicas:r-compila > > acabo de atualizar o script para a 2-14 > > > On Thu, 3 Nov 2011, Leonard de Assis wrote: > > > Eu rodo em minha máquina o R 2.14 padrão distribuído pelo cran. > > > > Pretendo trocar por um R "tunado", compilando direto dos fontes. > > > > Alguma recomendação especial? preciso remover o atual? > > > > SO: linux ubuntu 11.10 > > > > -- > > []s > > Leonard de Assis > > assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > ------------------------------ > > Message: 18 > Date: Thu, 3 Nov 2011 23:46:07 -0200 > From: Mario Azevedo <mario.azevedo(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] [OT] Distancias entre municipios > Message-ID: > <CAFjSmc4iW8pM7C4qtKK3sZWJdzpkeUy8Sw+eMmwF=jeybmh2aw(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Sim. O programa irá calcular essa matriz de distâncias e você pode > estabelecer a unidade de medida. > > Lembrando que você deve tomar cuidado porque, talvez, o que lhe interesse > seja o centróide da área da sede do município e não da da área total. Para > alguns municípios a diferença pode ser grande. > > 2011/11/3 Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho(a)gmail.com> > > > Existe alguma forma de converter essa distância euclidiana entre > > centroides de municípios em cm, m, km? > > > > Em 2 de novembro de 2011 22:47, Mario Azevedo [via R-br] < > > ml-node+s2285057n3984003h70(a)n4.nabble.com> escreveu: > > > >> Realmente, para uma área tão grande, me parece melhor usar distâncias > >> euclidianas. Calcular as distâncias por vias terrestres entre cada par > de > >> municípios é uma tarefa que demandaria um trabalho gigantesco, pois não > >> existem bases com essas informações (completas). Dependendo do tipo do > >> problema em estudo, é uma informação que não faz muito sentido. Eu posso > >> ter um trecho de via de 20 km que consigo percorrer em 10 minutos (a 120 > >> km/h) e posso ter outro com a mesma extensão, mas com condições ruins de > >> pavimentação ou de topografia, na qual levarei muito mais tempo. > >> > >> Só completando um pouco as opiniões de alguns. > >> > >> Saudações. > >> > >> Mário > >> > >> > >> 2011/11/2 Ricardo Tavares <[hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=0> > >> > > >> > >>> Oi Leandro e demais colegas, > >>> > >>> A base shape é disponibilizada pelo IBGE no seguinte link: > >>> > >>> > >>> > ftp://geoftp.ibge.gov.br/mapas/malhas_digitais/municipio_2007/Malha_Municipal_Digital_2007_2500/Disseminacao_2007/Proj_Geografica/SIRGAS2000/ArcView_Shp/2007/E2500/Brasil/ > >>> > >>> Um abraço e até mais, > >>> Ricardo. > >>> > >>> Em 1 de novembro de 2011 15:55, Leandro Marino <[hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=1> > >>> > escreveu: > >>> > >>>> Caros,**** > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> Por acaso alguém sabe me dizer se existe em algum local uma tabela / > >>>> matriz de distancias entre TODOS os municípios brasileiros?**** > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> Estava precisando deste tipo de dado.**** > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> Atenciosamente, > >>>> *Leandro Lins Marino** > >>>> **Centro de Avaliação > >>>> Fundação CESGRANRIO > >>>> Rua Santa Alexandrina, 1011 - 2º andar > >>>> Rio de Janeiro, RJ - CEP: 20261-903 > >>>> * > >>>> *(** **<a href="tel:%2821%29%202103-9600" value="+552121039600" > >>>> target="_blank">(21) 2103-9600 R.:236 > >>>> ***** [hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=2> > >>>> * > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> P* **Antes de imprimir* *pense em sua responsabilidade e compromisso > >>>> com o* *MEIO AMBIENTE* **** > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> Esta mensagem, incluindo seus anexos, pode conter informacoes > >>>> privilegiadas e/ou de carater confidencial, nao podendo ser > retransmitida > >>>> sem autorizacao do remetente. Se voce nao e o destinatario ou pessoa > >>>> autorizada a recebe-la, informamos que o seu uso, divulgacao, copia ou > >>>> arquivamento sao proibidos. **** > >>>> > >>>> Portanto, se você recebeu esta mensagem por engano, por favor, nos > >>>> informe respondendo imediatamente a este e-mail e em seguida > apague-a.* > >>>> *** > >>>> > >>>> ** ** > >>>> > >>>> _______________________________________________ > >>>> R-br mailing list > >>>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=3> > >>>> > >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>>> código mínimo reproduzível. > >>>> > >>> > >>> > >>> > >>> -- > >>> Professor Adjunto - área Estatística > >>> Departamento de Matemática > >>> Universidade Federal de Ouro Preto > >>> > >>> _______________________________________________ > >>> R-br mailing list > >>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=4> > >>> > >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>> código mínimo reproduzível. > >>> > >> > >> > >> _______________________________________________ > >> R-br mailing list > >> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=5> > >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >> código mínimo reproduzível. > >> > >> ------------------------------ > >> If you reply to this email, your message will be added to the > >> discussion below: > >> > >> > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-OT-Distancias-entre-municipios-tp396… > >> To unsubscribe from R-br, click here< > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib… > >. > >> > >> > > > > > > > > -- > > Saudações, > > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > > > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111103/cfcf1cc1/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 19 > Date: Fri, 4 Nov 2011 00:28:50 -0200 > From: Daniel C Bezerra <danielcbezerra(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br, assis.leonard(a)gmail.com > Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi > Message-ID: > <CAJGh7uxjXZY14733X2WVn+S3Zj9MEt64eu=_CW1cnewBZuu4jg(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Esqueci de falar. Se vc vai testar o emacs para não ficar muito cansativo > aprender todos os atalhos basta ativar o modo CUA. Dai vc poderá usar > Ctrl-C para copiar, Ctrl-V para colar e por ai vai. > > Abs, > > D > On Nov 3, 2011 8:17 PM, "Leonard de Assis" <assis.leonard(a)gmail.com> > wrote: > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111104/de7e55d5/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 20 > Date: Fri, 4 Nov 2011 00:31:41 -0200 > From: Mario Azevedo <mario.azevedo(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] [OT] Distancias entre municipios > Message-ID: > <CAFjSmc7_SRdeRKVfC96g6j0DdAa2NuUiOGq_7s1+OR6--nD7Qw(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > A matriz será muito grande 5566 x 5566 = 30980356 elementos. Se cada > elemento for um número real, ele consumirá, no mínimo, 4 bytes de memória, > totalizando algo perto de 118 Mbytes. Não sei quais são os limites, mas me > parece que deve ficar difícil tratar de um "bicho" desse tamanho. > > sds. > > 2011/11/3 Mario Azevedo <mario.azevedo(a)gmail.com> > > > Sim. O programa irá calcular essa matriz de distâncias e você pode > > estabelecer a unidade de medida. > > > > Lembrando que você deve tomar cuidado porque, talvez, o que lhe interesse > > seja o centróide da área da sede do município e não da da área total. > Para > > alguns municípios a diferença pode ser grande. > > > > 2011/11/3 Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho(a)gmail.com> > > > >> Existe alguma forma de converter essa distância euclidiana entre > >> centroides de municípios em cm, m, km? > >> > >> Em 2 de novembro de 2011 22:47, Mario Azevedo [via R-br] < > >> ml-node+s2285057n3984003h70(a)n4.nabble.com> escreveu: > >> > >>> Realmente, para uma área tão grande, me parece melhor usar distâncias > >>> euclidianas. Calcular as distâncias por vias terrestres entre cada par > de > >>> municípios é uma tarefa que demandaria um trabalho gigantesco, pois não > >>> existem bases com essas informações (completas). Dependendo do tipo do > >>> problema em estudo, é uma informação que não faz muito sentido. Eu > posso > >>> ter um trecho de via de 20 km que consigo percorrer em 10 minutos (a > 120 > >>> km/h) e posso ter outro com a mesma extensão, mas com condições ruins > de > >>> pavimentação ou de topografia, na qual levarei muito mais tempo. > >>> > >>> Só completando um pouco as opiniões de alguns. > >>> > >>> Saudações. > >>> > >>> Mário > >>> > >>> > >>> 2011/11/2 Ricardo Tavares <[hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=0> > >>> > > >>> > >>>> Oi Leandro e demais colegas, > >>>> > >>>> A base shape é disponibilizada pelo IBGE no seguinte link: > >>>> > >>>> > >>>> > ftp://geoftp.ibge.gov.br/mapas/malhas_digitais/municipio_2007/Malha_Municipal_Digital_2007_2500/Disseminacao_2007/Proj_Geografica/SIRGAS2000/ArcView_Shp/2007/E2500/Brasil/ > >>>> > >>>> Um abraço e até mais, > >>>> Ricardo. > >>>> > >>>> Em 1 de novembro de 2011 15:55, Leandro Marino <[hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=1> > >>>> > escreveu: > >>>> > >>>>> Caros,**** > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> Por acaso alguém sabe me dizer se existe em algum local uma tabela / > >>>>> matriz de distancias entre TODOS os municípios brasileiros?**** > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> Estava precisando deste tipo de dado.**** > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> Atenciosamente, > >>>>> *Leandro Lins Marino** > >>>>> **Centro de Avaliação > >>>>> Fundação CESGRANRIO > >>>>> Rua Santa Alexandrina, 1011 - 2º andar > >>>>> Rio de Janeiro, RJ - CEP: 20261-903 > >>>>> * > >>>>> *(** **<a href="tel:%2821%29%202103-9600" value="+552121039600" > >>>>> target="_blank">(21) 2103-9600 R.:236 > >>>>> ***** [hidden email]< > http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=2> > >>>>> * > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> P* **Antes de imprimir* *pense em sua responsabilidade e compromisso > >>>>> com o* *MEIO AMBIENTE* **** > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> Esta mensagem, incluindo seus anexos, pode conter informacoes > >>>>> privilegiadas e/ou de carater confidencial, nao podendo ser > retransmitida > >>>>> sem autorizacao do remetente. Se voce nao e o destinatario ou pessoa > >>>>> autorizada a recebe-la, informamos que o seu uso, divulgacao, copia > ou > >>>>> arquivamento sao proibidos. **** > >>>>> > >>>>> Portanto, se você recebeu esta mensagem por engano, por favor, nos > >>>>> informe respondendo imediatamente a este e-mail e em seguida > apague-a. > >>>>> **** > >>>>> > >>>>> ** ** > >>>>> > >>>>> _______________________________________________ > >>>>> R-br mailing list > >>>>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=3 > > > >>>>> > >>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>>>> código mínimo reproduzível. > >>>>> > >>>> > >>>> > >>>> > >>>> -- > >>>> Professor Adjunto - área Estatística > >>>> Departamento de Matemática > >>>> Universidade Federal de Ouro Preto > >>>> > >>>> _______________________________________________ > >>>> R-br mailing list > >>>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=4> > >>>> > >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>>> código mínimo reproduzível. > >>>> > >>> > >>> > >>> _______________________________________________ > >>> R-br mailing list > >>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3984003&i=5> > >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >>> código mínimo reproduzível. > >>> > >>> ------------------------------ > >>> If you reply to this email, your message will be added to the > >>> discussion below: > >>> > >>> > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-OT-Distancias-entre-municipios-tp396… > >>> To unsubscribe from R-br, click here< > http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib… > >. > >>> > >>> > >> > >> > >> > >> -- > >> Saudações, > >> Pedro Rafael Diniz Marinho. > >> Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB. > >> > >> > >> > >> _______________________________________________ > >> R-br mailing list > >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > >> código mínimo reproduzível. > >> > > > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111104/62490746/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 21 > Date: Fri, 4 Nov 2011 09:41:56 -0200 > From: Danilo Scorzoni Ré <danilo.scorzoni(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: [R-br] Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS/R > Message-ID: > <CA+bJVrcVhq4VmEV67FfxJQsfCkz5znCuqAXZBGFfMkLGoGzwWA(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Prezados, > > Estou fazendo uma análise de dados do meu experimento utilizando modelo > linear generalizado. No entanto, a estimativa do parâmetro de dispersão > está diferente entre as saídas do SAS e do R. Isso está influenciando nos > p-valores das estimativas dos parâmetros, bem como na análise de deviance > para verificar os efeitos dos diferentes fatores estudados. Alguém tem > alguma idéia por que isso acontece? > > Desde já agradeço! > > Atenciosamente, > > -- > Danilo Scorzoni Ré > Engenheiro Florestal > Mestrando em Ciência Florestal > FCA / UNESP - Botucatu > (14) 8180-2494 > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111104/b9933590/atta… > > > > ------------------------------ > > Message: 22 > Date: Fri, 4 Nov 2011 09:45:56 -0200 > From: Fernando Colugnati <fernando(a)ipti.org.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] Diferenças na Qualidade de Ajuste SAS/R > Message-ID: > <CAOLzYt1hCh6nhyCdzndZHnt-SrzF19PC7cCw4cJG72o_JkAyfg(a)mail.gmail.com > > > Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" > > Qual pacote do R? Qual tipo de modelo e parametrização? Qual proc do SAS? > Abs > > Em 4 de novembro de 2011 09:41, Danilo Scorzoni Ré < > danilo.scorzoni(a)gmail.com> escreveu: > > > Prezados, > > > > Estou fazendo uma análise de dados do meu experimento utilizando modelo > > linear generalizado. No entanto, a estimativa do parâmetro de dispersão > > está diferente entre as saídas do SAS e do R. Isso está influenciando nos > > p-valores das estimativas dos parâmetros, bem como na análise de deviance > > para verificar os efeitos dos diferentes fatores estudados. Alguém tem > > alguma idéia por que isso acontece? > > > > Desde já agradeço! > > > > Atenciosamente, > > > > -- > > Danilo Scorzoni Ré > > Engenheiro Florestal > > Mestrando em Ciência Florestal > > FCA / UNESP - Botucatu > > (14) 8180-2494 > > > > > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > > > > -- > Fernando A.B. Colugnati > Pesquisador Associado > > Instituto de Pesquisas em Tecnologia e Inovação - IPTI > Tel. 55 11 8704-9812 > www.ipti.org.br > fernando(a)ipti.org.br > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20111104/cd1dbecd/atta… > > > > ------------------------------ > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > Fim da Digest R-br, volume 9, assunto 7 > *************************************** > -- Danilo Scorzoni Ré Engenheiro Florestal Mestrando em Ciência Florestal FCA / UNESP - Botucatu (14) 8180-2494

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Re: [R-br] [Dúvida] Programar no R com Emacs ou Vi
by Daniel C Bezerra 04 Nov '11

04 Nov '11

Esqueci de falar. Se vc vai testar o emacs para não ficar muito cansativo aprender todos os atalhos basta ativar o modo CUA. Dai vc poderá usar Ctrl-C para copiar, Ctrl-V para colar e por ai vai. Abs, D On Nov 3, 2011 8:17 PM, "Leonard de Assis" <assis.leonard(a)gmail.com> wrote:

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"trocando" versão do R (Linux)
by Leonard de Assis 03 Nov '11

03 Nov '11

Eu rodo em minha máquina o R 2.14 padrão distribuído pelo cran. Pretendo trocar por um R "tunado", compilando direto dos fontes. Alguma recomendação especial? preciso remover o atual? SO: linux ubuntu 11.10 -- []s Leonard de Assis assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com

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instalação R windows 7
by Lucas Fernandes de Souza 03 Nov '11

03 Nov '11

Boa tarde a todos!! Não estou conseguindo instalar nenhuma versão do R no windows 7. Alguém pode me ajudar, por favor? obrigado -- Lucas F. de Souza Eng. Agrícola - CONAB M.Sc. Produção Vegetal - UENF Doutorando Engenharia de Sistemas Agrícolas - ESALQ/USP tel: (19) 8160-7068

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Tirar o cabeçalho do txt
by Simone D. Sartorio 03 Nov '11

03 Nov '11

Pessoal, boa tarde! Gente, estou com o seguinte problema, apareceu um rapaz aqui com um banco de dados com o formato que eu deixei disponivel no site: http://www.datafilehost.com/download-b2091792.html O programa que ele usa, pelo que ele me disse, solta esse cabeçalho, que não tem como tirar pelo programa: ------------------------------------------------------------------------------------------------ *GROWTH ASPECTS OUTPUT FILE *DSSAT Cropping System Model Ver. 4.5.0.047 APR 11, 2011; 16:16:38 *RUN 1 : nov_01_DAS MZCER045 GOJD1105 1 MODEL : MZCER045 - Maize EXPERIMENT : GOJD1105 SN MILHO_SAFRA_JANDAIA DATA PATH : C:\DSSAT45\Seasonal\ TREATMENT 1 : nov_01_DAS MZCER045 ------------------------------------------------------------------------------------------------ Mas isto ele solta para cada amostra obtida, ou seja, nesse arquivo q deixei no site, que eu salvei em '.txt', tem vários deste tipo, identificando a amostra, mas o cabeçalho é meio q padrão. Alguem sabe se é possível apagar este cabeçalho deste arquivo de uma maneira inteligente, sem ser manualmente?! Pq o cara tem 30 anos de informações, dai pensa no trabalho.... Deletar linha, coluna, ou celula é facil de uma matriz, mas coisa assim eu desconheço se dá p fazer no R. Alguém tem alguma ideia?! Pode ser em outro programa tb! desde já muito obrigada! Simone Simone Daniela Sartorio Licenciada em Matemática - UNESP (Rio Claro); Mestre e atualmente Doutoranda em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/USP. Cel: (19)9105-9032 - Claro (19)8182-0586 - Tim ******************************************************************* "Gostaria de te desejar tantas coisas. Mas nada seria suficiente. Então, desejo apenas que você tenha muitos desejos. Desejos grandes. E que eles possam te mover a cada minuto, ao rumo da sua felicidade!" (Carlos Drummond de Andrade) ******************************************************************* Tenha um Bom Dia!!!

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Label teimoso
by Fernando Colugnati 03 Nov '11

03 Nov '11

Pessoal, estou utilizando um pacote que gera alguns gráficos de diagnóstico, conforme o código abaixo. Reparem que no box-plot eu gostaria apenas do label "GBM p-scores", mas ele insiste em colocar o método ks.stat.max junto. Como faço para "apagar" isso? Isso ocorre com vários gráficos, e estou comparando alguns modelos diferentes para estimação dos p-scores (propensity scores). Obrigado, segue o código (retirado do exemplo do pacote, os dados são fornecidos como exemplo): #Pacote twang para estimação de propensity scores library(twang) data(lalonde) ps.lalonde <- ps(treat ~ age + educ + black + hispan + nodegree + married + re74 + re75, data = lalonde, title="Lalonde example", stop.method=stop.methods[c("ks.stat.max")], # generate plots? plots="none", pdf.plots=FALSE, # gbm options n.trees=2000, interaction.depth=3, shrinkage=0.005, perm.test.iters=0, verbose=FALSE) plot(ps.lalonde, label= "GBM p-scores", plots = "ps boxplot") -- Fernando A.B. Colugnati

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Re: [R-br] Programar no R com Emacs ou Vi
by Ivan Bezerra Allaman 03 Nov '11

03 Nov '11

De acordo com o gráfico em anexo o melhor é vim! kkkkkkkkk Só para descontrair! (S,f,P) Allaman \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5076 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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plotando pontos em um mapa
by Rodrigo Plei 03 Nov '11

03 Nov '11

Prezados, Como faço para plotar pontos (coordenadas geográficas) a partir de um arquivo .csv em um mapa .shp usando os pacotes maps and maptools? Gostaria de fazer no R o que se faz utilizando a função "overlay maps" do Surfer! Agradeço desde logo. Rodrigo -- =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8--> Rodrigo Silvestre Martins, PhD Bolsista FAPESP Pós-Doutorado Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq) Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B) Butantã - São Paulo/SP, Brasil 05508-900 Tel: +55 11 3091 6549 Email: rodrigo.plei(a)gmail.com ; ocersm(a)lycos.com; rsmartins(a)usp.br CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777

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substituindo valores (data.frame)
by Rogerio R. Silva 03 Nov '11

03 Nov '11

Caros, Tenho dois arquivos. Um deles, com milhares de linhas devido a replicação temporal, inclui três colunas (campanha, transecto, parcela). O segundo, contém informação sobre variáveis medidas em cada parcela (um único valor). Eu preciso substituir os dados das parcelas (primeiro arquivo) por valores das variáveis (segundo arquivo) condicionando a que transecto a parcela pertença. Um exemplo abaixo para uma variável, mas que não trabalha corretamente. coletas<-data.frame (campanha=c(gl(4,8,64,labels=c("C1","C2","C3","C4"))),transecto=c(gl(8,4,64,labels=c("T1","T2","T3","T4","T5","T6","T7","T8"))),parcela=c(gl(4,1,64,labels=c("P1","P2","P3","P4")))) dados<- data.frame (transecto=c(gl(8,4,32,labels=c("T1","T2","T3","T4","T5","T6","T7","T8"))), parcela=c(gl(4,1,32,labels=c("P1","P2","P3","P4"))), alt=rnorm(32)) x.temp<-coletas for (i in 1:length(levels(coletas$transecto))){ x.temp[which(coletas$parcela[i,]==dados$parcela[i,])] <- dados$Alt[i,] } x.temp Error in coletas$parcela[i, ] : incorrect number of dimensions Obrigado.- rogério

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Carregar muitos arquivos txt
by Eder David Borges da Silva 03 Nov '11

03 Nov '11

Bom dia pessoal, venho mais uma vez pedir ajuda de vocês, O problema é o seguinte, tenho 7 pastas(Cenários), dentro dos mesmo tenho 949 arquivos TXT (1.5 Mb) cada, preciso carregar estes 7*949 arquivos e guardar em um array, tenho que carregar tudo pois tudo isso será plotado. meu código é o seguinte: cenarios <- c(1:7) con <- 1 for (i in cenarios){ setwd(paste('C:\\Users\\l01199\\Desktop\\Modelo\\Resultados\\Modelo_Cenario',i,'_Q1300',sep='')) files <- sort(list.files(pattern = "m000.TXT"))[1:50] tempo <- as.numeric(gsub("m000.TXT","",gsub("CON", "", files))) dim.a <- c(dim(read.table(files[1],head=T)),length(tempo)) if(con==1){ dados <- array(NA,c(length(cenarios),dim.a)) nomes.col <- names(read.table(files[1],head=T)) } con1 <- 1 for (j in files){ dados[con,,,con1] <- as.matrix(read.table(j,head=TRUE)) con1 <- con1+1 } print(con) con <- con+1 } tenho 4 gb de memoria na maquina, porem quando crio o objeto dados que é um array de tamanho c(length(cenarios),dim.a) [1] 7 11069 11 949 Não tenho memoria para tudo isso, alguém tem uma sugestão para guardar isso, dei uma olhada no pacote SOAR, mas como ele guarda e depois tenho que acessar novamente não sei se é a melhor saída(Posso estar equivocado em minha interpretação). Alguém possui um dica para contornar este problema. Att

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Script para atualização de versão
by Marcio Nicolau 02 Nov '11

02 Nov '11

Olá Pessoas! Eu sei que já passaram várias formas para se atualizar o R para uma nova versão, mas gostaria de deixar aqui os meus $0,002 O processo é o seguinte: 1.) Crie uma pasta chamada UpdateR no home do usuário 2.) Copie os arquivos oldVersion.R e newVersion.R 3.) Na versão antiga (antes da atualização) execute o arquivo oldVersion.R no Passo (3) o script copia os arquivos (Rprofile.site e Rconsole) com as "configurações do usuário" - caso tenha outros arquivos, altere o script - para a pasta atual "UpdateR" e salva uma lista com as bibliotecas instaladas. 4.) Desinstale o R 5.) Instale a nova versão 6.) Execute o arquivo newVersion.R no Passo (6) o script copia os arquivos (Rprofile.site e Rconsole) e instala as bibliotecas da lista. Espero que seja util! Abraços e bom feriado! MN (@marcionicolau)

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teste de médias para interação
by Daniele Portela de oliveira 01 Nov '11

01 Nov '11

Caros colegas gostaria de fazer um teste de médias para interação pelo pacote multcomp. Onde eu poderia encontrar um exemplo para distribuição de poisson ou binomial? Daniele Portela de Oliveira Mestranda Produção Animal - UEM Cel: 44 9949 3525 67 9617 0965

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Duvida com métodos de plot pra função stripchart
by Augusto Ribas 01 Nov '11

01 Nov '11

Ola pessoal. Estava usando o comando stripchart para fazer alguns gráficos e gostaria de saber se alguém tem alguma forma simples de fazer um grafico similar a esse da figura do systat. http://www.intesoft.com/produits/tech/systat/images/density/pic7.jpg aqui tem outra imagem mas com um boxplot do lado, mas eu quero so as bolinhas alinhadas centralizadas mesmo. http://www.solutions4u-asia.com/PDT/SYSTAT/sigmaplot/SP1110/DotdensityGraph… Acredito que seria alguma coisa tipo o method="stack" mas que ele não alinha-se os pontos a esquerda mas centralizado. Não encontrei mais métodos fora o stack e o jitter. Espero ter conseguido me explicar. Bem é isso, segue um cmr de exemplo: #dados Densidade<-round(c(rnorm(30,2),rnorm(30,5))) Local<-rep(c("A","B"),each=30) #grafico stripchart(Densidade~Local,vertical=T,method="stack",offset=0.6,at=c(1.2,2.2),frame.plot=F,pch=16,cex=1.4) -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://augustoribas.heliohost.org Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

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Fwd: Windows binary of 2.14.0
by Leonard de Assis 01 Nov '11

01 Nov '11

-------- Mensagem original -------- Assunto: Windows binary of 2.14.0 Data: Tue, 01 Nov 2011 16:03:48 -0400 De: Duncan Murdoch <murdoch.duncan(a)gmail.com> Para: r-announce(a)lists.r-project.org <r-announce(a)r-project.org> To all Windows users: The binary build of 2.14.0 that was uploaded yesterday was missing Cairo support. I have rebuilt it, and uploaded a new copy. You can tell which one you have by running "svg()", which works on the new one, but not the old one. You can tell which one is on your CRAN mirror by looking at the last changed date: it is today (November 1) for the corrected build. Sorry for the inconvenience.... Duncan Murdoch _______________________________________________ R-announce(a)r-project.org mailing list https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-announce

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Problemas com split+lapply
by Rubem Kaipper Ceratti 01 Nov '11

01 Nov '11

Caros listeiros, estou com uma base de dados para a qual preciso calcular médias móveis para dois atributos com relação a certos níveis de fatores. Para isso, pensei em utilizar uma combinação de split+lapply, mas mesmo com apenas pouco mais de 126.000 observações o split do banco de dados leva uma eternidade (um dos fatores possui 1242 níveis). Posteriormente tentei utilizar a função ddply (pacote plyr), mas retorna um erro. Alguma sugestão? Segue um exemplo abaixo (base com menos observações que a original): P<-2000:2010 Rep<-letters[1:5] TF<-1:2 CC<-paste("H-",101:299,sep="") a<-expand.grid(P=P,R=Rep,TF=TF,CC=CC) a$y<-rnorm(nrow(a)) a$z<-runif(nrow(a)) library(zoo) ma.fun<-function(x,k){ mm.y<-rollmean(x$y,k) mm.z<-rollmean(x$z,k) cbind(x[-c(1:2),-c(5:6)],ma.y=c(mm.y),ma.z=c(mm.z)) } # Abordagem 1: Nem chega a completar o split a.1<-split(a,list(a$R,a$TF,a$CC),drop=T) a.2<-lapply(a.1,ma.fun,k=3) # Abodagem 2: Mensagem de erro: # Erro em do.ply(i) : # task 1 failed - "adicionando classe "factor" a um objeto inválido" # Além disso: Mensagens de aviso perdidas: # 1: <anonymous>: ... may be used in an incorrect context: ‘.fun(piece, ...)’ # # 2: <anonymous>: ... may be used in an incorrect context: ‘.fun(piece, ...)’ library(plyr) library(doSNOW) library(foreach) ncpu<-4 cl<-makeSOCKcluster(rep("localhost",ncpu)) registerDoSNOW(cl) clusterEvalQ(cl,c(library(plyr),library(zoo))) a.2<-ddply(a,c('R','CC','TF'),ma.fun,k=3,.parallel=T) Grato, Rubem

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Linguagens para simulações Estatísticas e Matemáticas
by Pedro Rafael 01 Nov '11

01 Nov '11

Pessoal qual seria algumas linguagens interessantes fora o R boa para simulações estatística e matemáticas para se estudar? Qual dessas é melhor para trabalhar com banco de dados. Estou estudando o R mas queria estudar outra linguagem em paralelo. A linguagem Ox, O-Matrix, Scilab ou Octave cumpre bem esse papel? -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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Tabela de contingẽncia com freq. relativa: dúvida sobre validade teste qui-quadrado
by Jose Claudio Faria 01 Nov '11

01 Nov '11

Pessoal, Recorro aos mais especializados sobre a validade do teste qui-quadrado aplicados a uma tabela de contingência (dados e script abaixo). Os dados são de freq. relativa (cada linha fecha em 100%) de 5 estágios vegetativos (Seedling, Infant, Juvenile, Imature e Adult) do palmito juçara em 4 ambientes (MAR, ECO, MEF e MAZ). dad <- structure(list(Seedling = c(2.1664766249, 0.4830917874, 2.1466905188, 11.8236472946), Infant = c(53.2497149373, 55.0724637681, 65.831842576, 51.9038076152), Juvenile = c(33.7514253136, 33.8164251208, 26.4758497317, 28.0561122244), Imature = c(8.3238312429, 8.2125603865, 3.7567084079, 5.8116232465), Adult = c(2.5085518814, 2.4154589372, 1.7889087657, 2.4048096192)), .Names = c("Seedling", "Infant", "Juvenile", "Imature", "Adult"), class = "data.frame", row.names = c("MAR", "ECO", "MEF", "MAZ")) chisq.test(dad, correct=F)$observed chisq.test(dad, correct=F)$expected chisq.test(dad, correct=F) O objetivo da pesquisadora é saber se os ambientes podem ser considerados homogêneos (similares) ou não em relação as freq. dos estágios vegetativos. Havia aplicado o teste (foi significativo) e a pesquisadora comentou que ela havia lido que o teste do qui-quadrado não poderia ser aplicado em tabelas de contingência desse tipo. Sugestões e indicação de testes alternativos são bem vindas. Ab, -- ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\ Jose Claudio Faria Estatistica - Prof. Pleno UESC/DCET/Brasil joseclaudio.faria at gmail.com ///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\///\\\

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Qual distribuição segue meus dados?
by Daniel Dantas 31 Out '11

31 Out '11

Boa noite pessoal, mais uma vez recorro a ajuda de vocês. Abaixo tenho frequencias de furtos e roubos que aconteceram mês a mês.A pergunta que tenho que resolver é a seguinte: Aplicar o teste de igualdade de distribuições para identificar qual é o tipo de distribuição que melhor descreve a distribuição de frequências. Alguém tem uma luz? ###### conjunto de dados (Esses dados são frequencias de furtos e roubos que aconteceram por mês, ou seja, temos 18 meses observados )x <- c(20,19,28,44,23,52,34,36,20,43,62,69,49,85,65,27,34,21)hist(x) Muito obrigado desde já e desejo a todos um excelente final de semana,Daniel

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boxplot (tem jeito?)
by Leonard de Assis 31 Out '11

31 Out '11

olhem o seguinte boxplot: boxplot(decrease ~ treatment, data = OrchardSprays, horizontal=TRUE) o negócio é o seguinte. observem o eixo Y. Eu preciso que estes labels fiquem não na vertical, mas na horizontal, pois são descrições que quando plotadas, não aparecem todas. tem como fazer? se tem, alguma dica? -- []s Leonard de Assis assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com

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Re: [R-br] Tabela de contingẽncia com freq. relativa: dúvida sobre validade teste qui-quadrado
by Ivan Bezerra Allaman 31 Out '11

31 Out '11

Faria, Como já comentado anteriormente, não muito sentido utilizar as frequências relativas uma vez que a hipótese de nulidade é justamente avaliar se as proporções relativas de uma variável são independentes da outra variável. Quando utilizado as freq. relativas, a impressão que fica, é que será testado as proporções das proporções, que é sem sentido. A influência que você fala da "abundância das absoluta" é justamente o que se quer testar. Os links abaixo talvez seja interessante. http://udel.edu/~mcdonald/statchiind.html http://psychology.wikia.com/wiki/Pearson's_chi-square_test Abraços! (S,f,P) Allaman \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5076 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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amostras aleatorias de um dataframe
by Samuel Carvalho 30 Out '11

30 Out '11

Caros, Boa tarde,Alguem tem alguma dica para fazer amostras aleatorias de um conjunto de dados agrupado por parcela? Segue um #RCMR de exemplo dados <- data.frame(parcela = rep(1:5,each=5), obs=rep(1:5,5), y=rnorm(25), z=rnorm(25)) dados a idéia é que sejam retiradas amostras aleatorias deste conjunto. Segue um exemplo de um código sugerido pelo Ivan, valeu Ivan amostras <- list() for(i in 1:5){ amostras[[i]] <- apply(subset(dados,parcela==i),2,function(x) sample(x,3,replace=F)) } amostras tmp <- as.data.frame(rbind(amostras[[1]],amostras[[2]],amostras[[3]],amostras[[4]],amostras[[5]])) tmp #Problema aqui é inserir uma a uma. Neste caso tenho cinco parcelas daí fica tranquilo mas a base que estou usando tem mais de 9mil, enfim Grande abraço e bom fds a todos ==================================== Samuel P. C. Carvalho Mestre em Ciências Florestais [UFLA] Doutorando em Recursos Florestais [ESALQ/USP] =============================================

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Re: [R-br] Qual distribuição segue meus dados?
by Ivan Bezerra Allaman 29 Out '11

29 Out '11

Bootstrap! \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5076 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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Tempo de simulação no Linux e Windows
by Pedro Rafael 27 Out '11

27 Out '11

Pessoal fiz um programa bem simples para que que a cada interação o R inverta uma matriz. Fiz isso no Windows 7 64 bits e no Ubuntu 11.10 64 bits no mesmo computador. simulei 5 vezes no windows e 5 vezes no linux. O número de simulações não tem nenhum respaldo estatístico, fiz por conveniência. O programa é: rm(list = ls (all = TRUE)) tempo_inicial = Sys.time() M = matrix(abs(runif(10000,7,1000000)),100,100) inversas <- function(A,numero){ i = NULL for(i in 1:numero){ A = solve(A) } } inversas(M,10000) tempo_final = Sys.time() tempo = tempo_final - tempo_inicial tempo No final me estranhou porque no Windows levou em todas as vezes 8 segundos a menos que no Linux. O que pode ser? Os tempos em segundos: Windows 7 64 bits Tempos: 20,729; 20,695; 20,677; 20,663 Linux Ubuntu 11.10 64 bits: Tempos: 28,05745; 28,04319; 28,0124; 28;0885 A matriz M aí apresentada na terceira linha de código é uma matriz aleatória mas em que a cada vez que o script é lido ela muda, contudo eu fixei para os dois sistemas a mesma matriz. Vale salientar que isso não passa de uma tentativa simples de verificar os tempos de execução de um código. -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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[OFF_TOPIC] Unisc tem vaga para professor de Estatística
by ASANTOS 27 Out '11

27 Out '11

JC e-mail 4372, de 26 de Outubro de 2011. *Unisc tem vaga para professor de Estatística* O prazo de inscrição para concorrer à vaga se encerra no dia 4 de novembro. A Universidade de Santa Cruz do Sul (Unisc), no Rio Grande do Sul (RS), por meio do Departamento de Matemática e dos Programas de Pós-Graduação em Sistemas e Processos Industriais e em Tecnologia Ambiental, seleciona um professor Doutor para atuar em atividades de docência, pesquisa e orientação de alunos na área de Estatística, com ênfase em Controle Estatístico da Qualidade. O regime de trabalho é de 40 horas. Os interessados devem encaminhar mensagem para o endereço pgss(a)unisc.br, manifestando sua intenção de concorrer à vaga, e manter seu Currículo Lattes atualizado na página do CNPq. As inscrições podem ser feitas até o dia 4 de novembro. As entrevistas acontecerão de 16 a 18 de novembro e no dia 22 de novembro será divulgado o resultado. Mais informações no site http://www.unisc.br/ ou pelo email pgss(a)unisc.br. (Com informações da coordenação do curso) -- Alexandre DOS SANTOS Engenheiro Florestal, Msc. Laboratório de Pragas Florestais Departamento de Entomologia Universidade Federal de Lavras Caixa Postal 3037 37200-000 - Lavras - Minas Gerais Tel: +55 35 92230304

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warning message
by Leonard de Assis 27 Out '11

27 Out '11

Warning message: package 'RSQLite' was built under R version 2.13.2 Esse Warning não dá nenhum efeito colateral não, né? -- []s Leonard de Assis assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com

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chave dupla no merge
by Vinicius Brito Rocha 27 Out '11

27 Out '11

Amigos, consigo usar a função merge para realizar um left join com duas chaves? com uma uso normalmente. Abs. -- Vinicius Brito Rocha. Estatístico e Atuário, Mestre em Pesquisa Operacional www.aplicademic.blogspot.com http://twitter.com/viniciusbritor "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.

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RODBC - odbcConnect
by Eder David Borges da Silva 26 Out '11

26 Out '11

Pessoal, Eu ainda estou tentando abrir o arquivo que tinha posto em outro post disponível em: http://www.leg.ufpr.br/~eder/E2D00007.DB Com a Ajuda do Leonard e Benilton consegui descobri que ele é paradox, até consegui abrir em em Acess importando como paradox, porem como tenho milhares deles preciso de uma rotina automática. Pelas minhas pesquisas o RODBC seria capaz de abri ele com a função odbcConnect, li o help dela procurei na internet e tive a infeliz ideia de colocar minha duvida como post na R-SIG-DB, e com toda a gentileza e educação do mundo O prof Bray Ripley respodeu leia o HELP...., porem pesquisei outros post na R-HELP e na R-SIG-DB vi que inúmeras pessoas tem a mesma duvida, de como utilizar a função e oque é o DSN e como declarar isso, realmente não tenho muita experiencia com banco de dados, mas creio que utilizar a odbcConnect seja possível para um mero mortal como eu. Se alguém de livre e espontânea vontade, tem experiencia com essa função e quiser ajudar ficarei muito grato. Atenciosamente

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Uso do ifelse
by Edson Lira 26 Out '11

26 Out '11

Gente tenho 4 variáveis: v1,v2;v3;v4 com respostas 0,1,2. Preciso fazer az seguinte operação: Se v1 ou v2 ou v3 ou v4 =1 , então: irl3 assume alto produtor se v1 ou v2 ou v3 ou v4 =1,nulo se v1 ou v2 ou v3 ou v4 =0, baixo produtor se v1 ou v2 ou v3 ou v4 =2 . []'s. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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