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Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP) - Sexta 09 de outubro do 2015
by Luis Benites Sánchez 26 Set '15

26 Set '15

Caros, O Meetup R São Paulo Users Group, iniciativa dos estudantes de Doutorado em Estatística do IME, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara com a colaboração das professoras Viviana Giampioli e Márcia D'Elia Branco do IME, anuncia a seguinte palestra do Meetup do mês de outubro (lembrar que temos atividades planejadas até o 4 de dezembro, veja a programação completo no site do Meetup). Breve descrição do Meetup: As reuniões do Meetup R acontecerão geralmente duas vezes por mês, as sextas, das 14h às 16h. Em cada reunião teremos a apresentação de duas palestras com duração de 45 minutos cada e 10 minutos de perguntas. As palestras serão ministradas por professores e estudantes de pós-graduação de diversas universidades do interior como do exterior. A maioria de las serão online, mais também teremos algumas palestras presenciais. Faremos sorteios de 2 livros. Para o mês de setembro a programação é a seguinte: Sexta 9 de outubro (14h-16h) - Conferências: 1) Modelo Poisson BS para dados de longa duração em R - Profa.Elizabeth Mie Hashimoto, Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR. Resumo: Neste trabalho, foi proposto um modelo para dados de tempo de vida que se caracterizam por apresentar uma função de sobrevivência imprópria, ou seja, a medida que o tempo aumenta a função de sobrevivência não tende para zero, mas sim, para uma proporção denotada por p0, que representa os indivíduos não susceptíveis ao evento de interesse. Assim, para a construção do modelo fez-se a suposição de que o número de causas concorrentes do evento de interesse segue uma distribuição Poisson e o tempo para a ocorrência do evento segue uma distribuição Birnbaum-Saunders. A vantagem dos modelos de longa duração é a possibilidade estimar o parâmetro, p0. Dessa forma, para ilustrar a aplicação do modelo Poisson Birnbaum-Saunders fazendo uso do R, foi utilizado um conjunto de dados da literatura e as estimativas dos parâmetros do modelo foram obtidas a partir do método da máxima verossimilhança. 2) Shiny: aplicações web com R - Eduardo Elias Ribeiro Junior, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Paraná. Resumo: O R possui excelentes formas para visualização e análise de dados. Porém os resultados provenientes das análises no R são geralmente estáticos, apresentados em forma de relatórios. Isto impossibilita que o leitor submeta novos valores para mesma análise sem que se compile novamente os códigos. Em contraste, o pacote shiny facilita a criação de aplicações web que são interativas a estímulos do leitor, permitindo visualizar novos resultados assim que novos valores forem inseridos. A palestra tem como objetivo apresentar o pacote shiny e introduzir os conceitos principais para a contrução de aplicações web. Obs. As palestras serão transmitidas ao vivo pela conexão IPTV da USP e YouTube (os links de transmissão serão disponibilizados no site do meetup ou também podem acessar ao link <https://plus.google.com/u/0/events/c1l0eia9apmbjbhhc8k1qfh36lg> e confirmar sua participação online caso não possam comparecer fisicamente no auditório Gilioli do IME-USP. ). As sessões são filmados (se os palestrantes concordar) e ditos vídeos serão disponibilizados no Canal de YouTube do Meetup. Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP YouTube: www.youtube.com/channel/UCb9PdJYYaElE6Uqb1KxhE8w e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara Organizadores do São Paulo R Users Group

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regressão qauntilica
by geovane barbosa 25 Set '15

25 Set '15

Olá pessoal tudo bem. Estou trabalhando com a regressão quantilica. Abaixo segue um exemplo. Porém gostaria que a aproximação fosse por splines. Como posso fazer isso? set.seed(1) n <- 500x <- floor(runif(n, 18, 80))y <- 5*x - 0.05*x^2 + rnorm(n, mean=0, sd=10*sqrt(x))plot(x, y)taus <- 1:9/10 library(quantreg)modelo <- rq(y ~ x , tau=taus) valoresPreditos <- predict(modelo) dadosGraficos <- data.frame(valoresPre = as.numeric(valoresPreditos), tau = as.factor(rep(taus, each=n)), x = rep(x, times=length(taus))) library(ggplot2)g <- ggplot(unique(dadosGraficos), aes(x=x, y=valoresPre, group=tau)) + theme_bw()g + geom_line(aes(linetype=tau)) Abaixo em anexo segue uma imagem do que realmente gostaria de visualizar. Como poderia fazer isso no R? Obrigado

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Instalar pacote R-Studio (Windows)
by Maurício Lordêlo 24 Set '15

24 Set '15

Caros, Estou iniciando no R-Studio e surgiu uma dificuldade. Ao solicitar a instalação de um pacote, aparece a seguinte caixa de diálogo: Creat Package Library Would you like to create a personal library 'C:/Users/.../R/win-library/3.2' to install packages into? Opções: YES ou NO A optar por YES, a mesma mensagem aparece, ou seja, continua a aparecer a mesma caixa e nada acontece. Ao optar por NO, aparece uma outra caixa com a seguinte mensagem: Install Packages Unable to install packages (default library 'C/Program Files/R/R-3.2.2/library' is not writeable) Com a única opção: OK Já reinstalei tanto o R como o R-Studio e o problema continua. Alguém tem alguma sugestão? Grato, Maurício

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Re: [R-br] RES: Intervalos de confiança com boot.ci
by sznelwar 24 Set '15

24 Set '15

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Intervalos de confiança com boot.ci
by Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil 24 Set '15

24 Set '15

Amigos de R, Eu estou envolvido num projeto que o coordenador deseja estimar SMR em diversos subgrupos. Aqui SMR (standardized mortality ratios) é definido como a quantidade de mortes observadas pela quantidade de mortes esperdas dada a probabilidade de um modelo de predição de morte. Eu fiz uma pequena função (abaixo) para estimar os SMRs dentre diversos subgrupos. Usei uma referencia de um inspirador para montar o ICs, mas percebi que dentre diversos trabalhos que fazem coisas parecidas a variedade de formulas para estimativas de CIs para os SMRs varia muito. Assim, como tenho muitos dados, achei que talvez fosse interessante fazer intervalos de confiança com bootstrap. Mas eu não estou sabendo ao certo como usar a função, já que a função pede pesos ou frequencias. > dput(a[sample(1:nrow(a),100),c("Hosp_Death","SAPS3Pro2")]) structure(list(Hosp_Death = c(0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L), SAPS3Pro2 = c(0.1205, 0.3768, 0.315, 0.3768, 0.0311, 0.0719, 0.1735, 0.75, 0.01, 0.1454, 0.1093, 0.0511, 0.0891, 0.3353, 0.0073, 0.0401, 0.0044, 0.0239, 0.5246, 0.1591, 0.0453, 0.0511, 0.8715, 0.1735, 0.6037, 0.4405, 0.2047, 0.0208, 0.1591, 0.2047, 0.1205, 0.2759, 0.0273, 0.0044, 0.2759, 0.0157, 0.0643, 0.2215, 0.2047, 0.1735, 0.1591, 0.0273, 0.0062, 0.0311, 0.0157, 0.4192, 0.0643, 0.1735, 0.239, 0.4618, 0.0401, 0.0802, 0.0273, 0.0239, 0.0025, 0.0157, 0.0311, 0.0157, 0.0719, 0.239, 0.0574, 0.0157, 0.0085, 0.0085, 0.1093, 0.2215, 0.1591, 0.0719, 0.0044, 0.8563, 0.0453, 0.2047, 0.1454, 0.0273, 0.0891, 0.0802, 0.0239, 0.0135, 0.0802, 0.2571, 0.1735, 0.0157, 0.3768, 0.2759, 0.0891, 0.2047, 0.1735, 0.1454, 0.0643, 0.0311, 0.0453, 0.2759, 0.0239, 0.0181, 0.4405, 0.0085, 0.0311, 0.1205, 0.6579, 0.1093)), .Names = c("Hosp_Death", "SAPS3Pro2"), row.names = c(21875L, 6572L, 48643L, 11869L, 35683L, 48246L, 23919L, 29666L, 3676L, 45549L, 36453L, 14510L, 5082L, 1898L, 41549L, 25481L, 28590L, 38198L, 12822L, 12834L, 33267L, 34088L, 47720L, 30063L, 18326L, 11582L, 11454L, 34960L, 18785L, 11385L, 20605L, 28105L, 25496L, 1607L, 48766L, 36534L, 41868L, 45312L, 37206L, 26927L, 38944L, 21087L, 22343L, 1332L, 11496L, 29485L, 38316L, 4486L, 19757L, 45768L, 33028L, 12205L, 13150L, 41270L, 2780L, 44400L, 19696L, 26015L, 14651L, 39093L, 24905L, 17870L, 35016L, 42851L, 20464L, 33155L, 24924L, 33220L, 15379L, 28989L, 33286L, 34782L, 48534L, 9045L, 20403L, 40222L, 8821L, 31240L, 12465L, 11024L, 24407L, 45729L, 7412L, 22344L, 17737L, 3514L, 2335L, 22491L, 22493L, 14077L, 20346L, 12114L, 36868L, 16431L, 25112L, 31272L, 10877L, 14391L, 8422L, 45130L), class = "data.frame") > SMR <- function(obs.var,pred.var){ + if(length(obs.var) != length(pred.var)){ + stop("Length of pred.var and obs.var differ.") + } + if(any(min(pred.var) <0 | max(pred.var) > 1)){ + stop("The individual predicted death must range from 0 to 1.") + } + if(any(levels(as.factor(obs.var)) != c(0,1))){ + stop("Observed death variable must be coded as 0 and 1.") + } + O <- length(obs.var[which(obs.var==1)]) + E <- length(pred.var) * mean(pred.var) + SMR <- O / E + lowerCL <- O / E * (1 - 1 / (9 * O) - 1.96 / (3 * sqrt(O)))^3 * 100 + upperCL <- (O + 1) / E * (1 - (1 / (9 * (O + 1))) + 1.96 / (3 * sqrt(O + 1)))^3 * 100 + output <- c(SMR=SMR,lower.Cl=lowerCL,upper.Cl=upperCL) + output + } > SMR(a$Hosp_Death,a$SAPS3Pro2) SMR lower.Cl upper.Cl 1.000319 97.855941 102.244112 O intervalo de confiança abaixo roda mas retorna valores sempre iguais a zero. SMR2 <- function(a,w=1){length(a$Hosp_Death[which(a$Hosp_Death==1)])*w/(length(a$SAPS3Pro2) * mean(a$SAPS3Pro2))*w} # boot(city, ratio, R = 999, stype = "w") boot.ci(boot(a, SMR2, R = 10, stype = "w",parallel = "multicore")) x <- boot.ci(boot(a, SMR2, R = 10, stype = "w",parallel = "snow")) Pedro Brasil

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precisão da operação
by Cleber N.Borges 22 Set '15

22 Set '15

> 12345678912345678+1 [1] 12345678912345680 > 1.2345678912345678+0 [1] 1.2345678912345679 Prezados, pq exatamente o fato acima apresentado acontece? se a capacidade de representação dos números estão na faixa de 1.xxe-308 a 1.xxe+308 agradeço antecipadamente pela atenção cleber --- Este email foi escaneado pelo Avast antivírus. https://www.avast.com/antivirus

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Automatizar a inclusão de váriaveis
by Nicolay Cunha 22 Set '15

22 Set '15

Prezados, Gostaria de ajuda para automatizar a inclusão de variáveis dependentes em um modelo de RDA. Usarei o valor de F como critério para seleção do número de variáveis Y a serem usadas posteriormente, entretanto, preciso de uma forma automatizada para incluir as 59 colunas que tenho em minha matriz. Basicamente o que preciso fazer é calcular RDA s com o número crescente de Ys. Abaixo um CMR. # library(vegan) y <- matrix(sample(rnorm(3540)+10), 60) x <- rep(c("A", "B", "C"), each = 20) # Aqui gero o modelo com somente as colunas 1 e 2 da matriz y m1 <- capscale((y[,1:2]) ~ x, dist="bray") anova(m1) # agora incluindo a terceira coluna m2 <- capscale((y[,1:3]) ~ x, dist="bray") anova(m2) # adicionando a quarta coluna m3 <- capscale((y[,1:4]) ~ x, dist="bray") anova(m3) # e assim até incluir as 59 colunas na RDA m59 <- capscale((y[,1:59]) ~ x, dist="bray") anova(m59) Feito isso, preciso acessar os valores de F gerados para cada modelo para fazer a comparação. Alguém saberia me ajudar com isso? Muito Obrigado, Nicolay

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 57, assunto 13
by Carlos Matos 21 Set '15

21 Set '15

Prezados: Talvez os rankings de linguagens de programação abaixo possam ajudar: http://www.tiobe.com/index.php/content/paperinfo/tpci/index.html http://redmonk.com/sogrady/2015/07/01/language-rankings-6-15/ At.te, Em 20/9/2015 12:00, r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Estísticas da evolução do uso do R (Andre Oliveira) > 2. Re: Estísticas da evolução do uso do R (Walmes Zeviani) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Sun, 20 Sep 2015 12:08:15 +0000 (UTC) > From: Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> > To: R-br Lista <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] Estísticas da evolução do uso do R > Message-ID: > <964026555.429902.1442750895740.JavaMail.yahoo(a)mail.yahoo.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Pessoas bom dia,me preparo para apresentação sobre o R. Gostaria de mostrar um gráfico oficial acerca do uso do R em reação a outros software ao longo do tempo. Gostaria de mostrar a evolução do número de bibliotecas ao longo da tempo e por último quantas bibliotecas oficiais existem disponíveis hoje nos repositórios. Alguém poderia indicar ou sugerir como posso conseguir tais informações? Julgo que estas informações seriam interessantes para a divulgação na apresentação. > André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150920/d859cfb7/atta…> > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Sun, 20 Sep 2015 10:40:56 -0300 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>, Andre > Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br> > Subject: Re: [R-br] Estísticas da evolução do uso do R > Message-ID: > <CAFU=EkZoynY+0623ZuUsz50yALxg=WjpPxWWu0O-Rgqw=6akvA(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Nessa exposição de números eu incluiria as listas de discussão. O markmail > reúne as oficiais. O gráfico mostra o número de mensagens. > > http://r-project.markmail.org/search/ > > Você pode explorar as 24 listas disponíveis e os mecanismos de buscas. > Lembrar que a queda na troca de mensagens depois de 2010 não representa > redução de popularidade mas sim que o histórico de mensagens disponível > retroalimenta a lista, ou seja, os novos usuários precisam postar menos > pois o histórico é rico, existem menos problemas novos, além disso muitos > novos usuários usam o stackoverflow. > > A nossa lista pode ser considerada também. Pegue os números em > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/. O tamanho do zip reflete o > tráfego. > > Google com "R popularity softwareA softwareB" a adicione na busca o nome de > outros softwares para restringir as busca. > > À disposição. > Walmes. > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150920/7ba77fa4/atta…> > > ------------------------------ > > Subject: Legenda do Digest > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > ------------------------------ > > Fim da Digest R-br, volume 57, assunto 13 > ***************************************** -- ------------------------------------------------------------------------ *Carlos Alberto Oliveira de Matos* Professor Assistente Doutor Unesp - Campus de Itapeva Telefone: (15) 3524-9100 Ramal 9129 *Opção do Windows 8.1: Atualize seu computador sem afetar os arquivos.* *Resultado: perda de emails desde 26/5/14 até 19/3/2015* ****

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Estísticas da evolução do uso do R
by Andre Oliveira 21 Set '15

21 Set '15

Pessoas bom dia,me preparo para apresentação sobre o R. Gostaria de mostrar um gráfico oficial acerca do uso do R em reação a outros software ao longo do tempo. Gostaria de mostrar a evolução do número de bibliotecas ao longo da tempo e por último quantas bibliotecas oficiais existem disponíveis hoje nos repositórios. Alguém poderia indicar ou sugerir como posso conseguir tais informações? Julgo que estas informações seriam interessantes para a divulgação na apresentação. André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES

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somar 1+1 mas com R e C
by Cleber N.Borges 21 Set '15

21 Set '15

Prezados, Gostaria de uma ajuda em como fazer a soma de 1+1 mas usando a interface entre R e C. a chamada da função .Call faz travar e fechar o R. Agradeço por qualquer ajuda nisso Cleber # um CMR (do conceito) abaixo: ################################################ > texto_code <-" + #include <stdlib.h> + #include <R.h> + #include <Rdefines.h> + + void testef( double *k, double *res ) + { + res = k + 1; + } + " > > sink('teste.c') > cat( texto_code ) > sink() > > system("R CMD SHLIB teste.c") cygwin warning: MS-DOS style path detected: C:/R/etc/x64/Makeconf Preferred POSIX equivalent is: /cygdrive/c/R/etc/x64/Makeconf CYGWIN environment variable option "nodosfilewarning" turns off this warning. Consult the user's guide for more details about POSIX paths: http://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#using-pathnames gcc -m64 -I"C:/R/include" -DNDEBUG -I"d:/RCompile/r-compiling/local/local320/include" -O2 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c teste.c -o teste.o gcc -m64 -shared -s -static-libgcc -o teste.dll tmp.def teste.o -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib/x64 -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib -LC:/R/bin/x64 -lR > dyn.load( "teste.dll" ) > is.loaded( 'testef' ) [1] TRUE > > k=1 > ############################ ########## # ( .Call('testef', k=as.double(k), res=as.double(0) ) ) # # aqui o R trava e fecha !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! --- Este email foi escaneado pelo Avast antivírus. https://www.avast.com/antivirus

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Ajuda usuários linux
by Fernando Antonio de souza 21 Set '15

21 Set '15

Caros amigos, Sei que a lista é restrita a questões do R, mas como aqui há usuários linux pode ser q alguém me ajude. ja procurei na NET em várias comunidades linux e não consegui nenhuma solução. Recentemente formato meu computador para o sistema Debian jessie com KDE. Após a formatação tudo estava correndo bem. Porém após uma atualização automática (acredito q foi isso) minha tecla CTR e FN não funciona. O comando xev no terminal não retorna nenhum evento. Já reformatei e desta vez instalou gnome e continua a mesma coisa. Possuo um Dell vostro 3550. Alguém sabe como resolver.

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Elipse circundados pontos e cálculo do centro de massa
by ASANTOS 20 Set '15

20 Set '15

Boa tarde Listeiros, Tenho dois conjuntos de pontos A e B (dados$Class) e suas coordenadas (dados$x e dados$y), gostaria de saber se é possível desenhar uma elipse que circunde todos os pontos A e outra elipse que circunde todos os pontos B, posteriormente gostaria de calcular o centro de massa para cada conjunto de pontos A e B, isso é possível? Segue CRM: #Criação do data frame dados<-NULL #Coordenadas x dados$x<-c(0.350,0.487,0.637,0.775,0.825,0.087,0.237,0.400,0.575,0.737,0.062,0.212) #Coordenadas y dados$y<-c(0.025,0.087,0.050,0.025,0.125,0.187,0.150,0.162,0.212,0.237,0.362,0.337) #Classificação dados$Class<-c("A","A","A","A","A","A","B","B","B","B","B","B") #Visualização plot(dados$x,dados$y) text(dados$x,dados$y+0.01,labels=dados$Class,col="red") # Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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OPLS
by marcelo claro de souza 18 Set '15

18 Set '15

Olá pessoal, Preciso rodar umas análises de OPLS (Orthogonal Partial Least Squares) entretanto parece que não existe nenhum pacote no R para rodar esse tipo de análise. Alguém teria um script ou então poderia me indicar algum pacote para o R? Muito obrigado Abraço Marcelo -- *Dr. Marcelo Claro de Souza* Postdoctoral researcher FCFRP - USP Department of Pharmacy Laboratory of Pharmacognosy Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil Av. do Café s/n CEP 14040-230

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Link de transmissão ao vivo pelo YouTube do Meetup em R (IME-USP) 18 de setembro
by Luis Benites Sánchez 18 Set '15

18 Set '15

Caros, Link de transmissão ao vivo pelo Youtube do Meetup de R no IME-USP. http://youtu.be/EDXuYbXTl5c Um abraço Luis Benites Sánchez Organizador do Meetup em R -- Luis B. Sánchez Ph.D Candidate Dept. of Statistics-IME, University at São Paulo (USP) São Paulo, BRAZIL lsanchez(a)ime.usp.br Skype: lbenitesanchez Twitter: @lbenitesanchez www.luis-benites.com/

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Escala de um eixo
by Carise Schmidt 17 Set '15

17 Set '15

Boa tarde, Por gentileza, se alguém puder me auxiliar.. Desejo plotar um gráfico de incidência para três localidades ao longo de um período de tempo (anos). Contudo, não estou conseguindo alterar a escala de forma que todos os anos apareçam no gráfico. Da forma como estou plotando os anos aparecem apenas de 2 em 2. Estou usando os dados abaixo: AnoBRSCCC20014,41857818,73841140,917820024,52434718,5791112,655620036,326457 19,4572784,2161320047,37766619,5902581,1693320058,17768923,0116690,396152006 7,84705922,9260271,5683320075,38251819,0436833,8531720085,9479118,53753 82,0774320096,79231719,5792460,8548420106,29338719,5248957,7562320117,539273 22,146469,7660720127,01532323,9061876,69847 E os comandos são os seguintes: >taxa <- read.table("clipboard",header=TRUE,dec=",") >matplot(taxa$Ano,cbind(taxa$BR,taxa$SC,taxa$CC),lty=2,col="black",lwd=1,type="b",pch=c(1,2,4),xlab="Ano", ylab="Incidência (X 100.000 habitantes)",cex.axis=0.5) Carise Schmidt

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Atualização de pacote
by Jobenil - Gmail 17 Set '15

17 Set '15

Prezados amigos, Estou testando a integração com um outro software e necessito instalar o pacote abaixo. Parece que ele foi descontinuado. Vi algumas discussões nesta lista sobre a possibilidade de compilar pacotes. É possível fazer isso para este? Estou trabalhando no Win10 Agradeço desde já qualquer orientação de vocês. Atenciosamente Jobenil Júnior install.packages('COMadaptR') Installing package into C:/Users/Jobenil/Documents/NoteJobenil/R/win-library/3.2 (as lib is unspecified) Warning message: package COMadaptR is not available (for R version 3.2.2)

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substituir no eixo x de um gráfico o "." Pela ",".
by Humberto Hazin 17 Set '15

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Pessoal, Gostaria de substituir no eixo x de um gráfico o . Pela ,. Nos valores! Por exemplo 0.02 por 0,02. Existe alguma forma de fazer isso! Abr Humberto

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Construir tabela para várias variáveis quantitativas
by Mauricio Cardeal 17 Set '15

17 Set '15

Olá pessoal! Gostaria de escrever uma função no R que fosse capaz de gerar uma única tabela com, por exemplo, média, desvio-padrão, mínimo, máximo e tamanho da amostra, para várias variaveis. Fiz o script abaixo aproveitando uma sugestão de Simon O'Hanlon no stackoverflow: a <- c(4,5,3,2,8) b <- c(3,2,7,6,1) c <- c(7,6,5,8,7) bd <- data.frame(a,b,c) res <- lapply( bd , function(x) rbind( media = mean(x) , dp = sd(x) , minimo = min(x) , maximo = max(x) , n = length(x) ) ) data.frame( res ) > data.frame( res ) a b c media 4,4000 3,8000 6,6000 dp 2,3022 2,5884 1,1402 minimo 2,0000 1,0000 5,0000 maximo 8,0000 7,0000 8,0000 n 5,0000 5,0000 5,0000 O problema é que gostaria de que esse resultado estivesse transposto, quero dizer, com as estatísticas nas colunas e as variáveis nas linhas, assim: media dp minimo maximo n a b c Tentei mudar o script, mas não consegui o resultado desejado (o cbind bagunça). Há uma solução para isso sem precisar recorrer a funções prontas? Como havia enviado essa mensagem para a lista no período em que houve o problema técnico, voltei aos estudos e encontrei uma solução simples em uma apostila do professor Paulo: t(data.frame( res )) media dp minimo maximo n a 4,4 2,3022 2 8 5 b 3,8 2,5884 1 7 5 c 6,6 1,1402 5 8 5 Deixo então na lista o problema e a solução porque pode ser útil para alguem. Essa função é interessante porque aceita diversas modificações, como outras estatísticas, arredondamento, etc. De qualquer modo, se houver outra forma de se fazer isso, como função própria de usuário, agradeço. Obrigado, -- Mauricio Cardeal UFBA

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Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística
by Marcos Vital 16 Set '15

16 Set '15

Obrigado, João Paulo! Toda ajuda, seja com contribuição direta ou seja com alguma divulgação, é muito importante pra gente. Hoje divulgamos uma pequena animação sobre a campanha, e estamos tentando espalhar pela internet: https://youtu.be/_648seXIHk8 Abraços! > Message: 3 > Date: Wed, 16 Sep 2015 10:12:29 -0300 > From: João Paulo Alves <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e > Bioestatística > Message-ID: > <CAMt4aO= > oRKz0rOZqTiMBnSk+Wmp6wFpbkvstBazgS_JypwB31Q(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Otima iniciativa, vamos ajudar > > Em 15 de setembro de 2015 10:14, Marcos Vital <marcosvital(a)gmail.com> > escreveu: > > > Olá, listeiros do R > > > > Gente, vou ser rápido, já que a lista é voltada para dúvidas e problemas > > no R. > > > > Meus alunos e eu criamos uma campanha de financiamento coletivo para > > financiar um projeto do nosso laboratório (na UFAL, em Maceió), que > > envolve, entre outras coisas, produzir material didático sobre > > Bioestatística no R. > > > > Se alguém quiser conferir, o link é este: > > > http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistic… > > > > E mesmo para quem não quiser contribuir diretamente, basta compartilhar > > que já será de grande ajuda. > > > > Abraços a todos > > > > Prof Marcos > > > > -- > > Marcos Vinícius Carneiro Vital > > Universidade Federal de Alagoas > > Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde > > Setor de Biodiversidade e Ecologia > > > > _______________________________________________ > -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 57, assunto 9
by sirio＠ig.com.br 16 Set '15

16 Set '15

Em 16/09/2015 12:00, r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: (resolvido) Erro instalar pacote smatr > (marcelo claro de souza) > 2. [LEMBRETE] Nesta Sexta 18 de setembro do 2015 - Meetup R São > Paulo Users Group (IME-USP) (Luis Benites Sánchez) > 3. Re: Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística > (João Paulo Alves) > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Tue, 15 Sep 2015 14:21:18 -0300 > From: marcelo claro de souza <marcelo.claro.souza(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] (resolvido) Erro instalar pacote smatr > Message-ID: > <CAAVN66PycVXzWADntbROE15xFVd9wLd+v0HRSnhVYuqLqWP-Bg(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Olá pessoal > Restaurei o Win e agora deu certo. > Muito obrigado pelas colaborações > Abraço > > Marcelo > Em 15/09/2015 2:18 PM, "Benilton Carvalho" <beniltoncarvalho(a)gmail.com> > escreveu: > Veja o que diz a mensagem de instalação: package 'Rcpp' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: unable to move temporary installation 'C:UsersmarceloclaroDocumentsRwin-library3.2file25a415bf417eRcpp' to 'C:UsersmarceloclaroDocumentsRwin-library3.2Rcpp' A dica está aí. B On Tue, Sep 15, 2015, 11:45 marcelo claro de souza < marcelo.claro.souza(a)gmail.com> wrote: Olá Eu já tentei instalar esse pacote e tb está dando erro: install.packages("Rcpp") Installing package into 'C:/Users/marceloclaro/Documents/R/win-library/3.2' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL ' https://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.2/Rcpp_0.12.1.zip [2]' Content type 'application/zip' length 3189570 bytes (3.0 MB) downloaded 3.0 MB package 'Rcpp' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: unable to move temporary installation 'C:UsersmarceloclaroDocumentsRwin-library3.2file25a415bf417eRcpp' to 'C:UsersmarceloclaroDocumentsRwin-library3.2Rcpp' The downloaded binary packages are in C:UsersmarceloclaroAppDataLocalTempRtmpgPcNEOdownloaded_packages Será alguma incompatibilidade entre o R e o Win10? Muito obrigado Marcelo Em 15 de setembro de 2015 11:35, salah <salah3.1416(a)gmail.com> escreveu: Olá Marcelo Na mensagem de erro diz: there is no package called 'Rcpp' Instale o pacote Rcpp saudações _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [3]) e fornea cdigo mnimo reproduzvel. -- *Dr. Marcelo Claro de Souza* Postdoctoral researcher FCFRP - USP Department of Pharmacy Laboratory of Pharmacognosy Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil Av. do Café s/n CEP 14040-230 _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [3]) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [3]) e forneça código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/77bf7bad/atta… [5]> ------------------------------ Message: 2 Date: Wed, 16 Sep 2015 05:54:30 -0300 From: Luis Benites Sánchez <lbenitesanchez(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: [R-br] [LEMBRETE] Nesta Sexta 18 de setembro do 2015 - Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP) Message-ID: <CAG4re2uSrnx3mOqUpDfZaGPXvVpCgGhKAJsU5PGVnxyCS4EeXw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caros, O Meetup R São Paulo Users Group, iniciativa dos estudantes de Doutorado em Estatística do IME, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara com a colaboração das professoras Viviana Giampioli e Márcia D'Elia Branco do IME, anuncia a seguinte palestra do Meetup do mês de setembro (lembrar que temos atividades planejadas até o 4 de dezembro, veja a programação completo no site do Meetup). Breve descrição do Meetup: As reuniões do Meetup R acontecerão geralmente duas vezes por mês, as sextas, das 14h às 16h. Em cada reunião teremos a apresentação de duas palestras com duração de 45 minutos cada e 10 minutos de perguntas. As palestras serão ministradas por professores e estudantes de pós-graduação de diversas universidades do interior como do exterior. A maioria de las serão online, mais também teremos algumas palestras presenciais. Faremos sorteios de 2 livros. Para o mês de setembro a programação é a seguinte: Sexta 18 de setembro (14h-16h) - Conferências: 1) Gauss Hermite Quadrature with Pruning - Prof. Freddy Hernández Barajas, Universidad Nacional de Colombia. Resumo: Nesta palestra apresenta-se uma melhora à tecnica de Gauss Hermite é usada para obter estimativas nos modelos mistos com efeitos aleatorios normais. 2) R Markdown - Prof. Fernando Mayer, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Paraná. Resumo: O R Markdown é um formato para a criação de documentos dinâmicos, apresentações e relatórios em R. Combina a sintaxe Markdown (uma linguagem de marcação simples) com códigos do R embutidos, gerando gráficos e tabelas automaticamente no documento final. Nesta palestra será apresentada uma introdução à criação de documentos escritos em R Markdown, e algumas de suas extensões. Obs. As palestras serão transmitidas ao vivo pela conexão IPTV da USP e YouTube (os links de transmissão serão disponibilizados no site do meetup). As sessões são filmados (se os palestrantes concordar) e ditos vídeos serão disponibilizados no Canal de YouTube do Meetup. Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP [6] YouTube: www.youtube.com/channel/UCb9PdJYYaElE6Uqb1KxhE8w [7] e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez Organizador do São Paulo R Users Group -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150916/646566c0/atta… [8]> ------------------------------ Message: 3 Date: Wed, 16 Sep 2015 10:12:29 -0300 From: João Paulo Alves <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística Message-ID: <CAMt4aO=oRKz0rOZqTiMBnSk+Wmp6wFpbkvstBazgS_JypwB31Q(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Otima iniciativa, vamos ajudar Em 15 de setembro de 2015 10:14, Marcos Vital <marcosvital(a)gmail.com> escreveu: > Olá, listeiros do R Gente, vou ser rápido, já que a lista é voltada para dúvidas e problemas no R. Meus alunos e eu criamos uma campanha de financiamento coletivo para financiar um projeto do nosso laboratório (na UFAL, em Maceió), que envolve, entre outras coisas, produzir material didático sobre Bioestatística no R. Se alguém quiser conferir, o link é este: http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistic… [4] E mesmo para quem não quiser contribuir diretamente, basta compartilhar que já será de grande ajuda. Abraços a todos Prof Marcos -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [3]) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150916/3c41c9cf/atta… [9]> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [1] ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 57, assunto 9 **************************************** Links: ------ [1] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [2] https://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.2/Rcpp_0.12.1.zip [3] http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [4] http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistic… [5] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/77bf7bad/atta… [6] http://www.meetup.com/pt/useR-SP [7] http://www.youtube.com/channel/UCb9PdJYYaElE6Uqb1KxhE8w [8] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150916/646566c0/atta… [9] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150916/3c41c9cf/atta…

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Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística
by Marcos Vital 16 Set '15

16 Set '15

Olá, listeiros do R Gente, vou ser rápido, já que a lista é voltada para dúvidas e problemas no R. Meus alunos e eu criamos uma campanha de financiamento coletivo para financiar um projeto do nosso laboratório (na UFAL, em Maceió), que envolve, entre outras coisas, produzir material didático sobre Bioestatística no R. Se alguém quiser conferir, o link é este: http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistic… E mesmo para quem não quiser contribuir diretamente, basta compartilhar que já será de grande ajuda. Abraços a todos Prof Marcos -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia

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[LEMBRETE] Nesta Sexta 18 de setembro do 2015 - Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP)
by Luis Benites Sánchez 16 Set '15

16 Set '15

Caros, O Meetup R São Paulo Users Group, iniciativa dos estudantes de Doutorado em Estatística do IME, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara com a colaboração das professoras Viviana Giampioli e Márcia D'Elia Branco do IME, anuncia a seguinte palestra do Meetup do mês de setembro (lembrar que temos atividades planejadas até o 4 de dezembro, veja a programação completo no site do Meetup). Breve descrição do Meetup: As reuniões do Meetup R acontecerão geralmente duas vezes por mês, as sextas, das 14h às 16h. Em cada reunião teremos a apresentação de duas palestras com duração de 45 minutos cada e 10 minutos de perguntas. As palestras serão ministradas por professores e estudantes de pós-graduação de diversas universidades do interior como do exterior. A maioria de las serão online, mais também teremos algumas palestras presenciais. Faremos sorteios de 2 livros. Para o mês de setembro a programação é a seguinte: Sexta 18 de setembro (14h-16h) - Conferências: 1) Gauss Hermite Quadrature with Pruning - Prof. Freddy Hernández Barajas, Universidad Nacional de Colombia. Resumo: Nesta palestra apresenta-se uma melhora à tecnica de Gauss Hermite é usada para obter estimativas nos modelos mistos com efeitos aleatorios normais. 2) R Markdown - Prof. Fernando Mayer, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Paraná. Resumo: O R Markdown é um formato para a criação de documentos dinâmicos, apresentações e relatórios em R. Combina a sintaxe Markdown (uma linguagem de marcação simples) com códigos do R embutidos, gerando gráficos e tabelas automaticamente no documento final. Nesta palestra será apresentada uma introdução à criação de documentos escritos em R Markdown, e algumas de suas extensões. Obs. As palestras serão transmitidas ao vivo pela conexão IPTV da USP e YouTube (os links de transmissão serão disponibilizados no site do meetup). As sessões são filmados (se os palestrantes concordar) e ditos vídeos serão disponibilizados no Canal de YouTube do Meetup. Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP YouTube: www.youtube.com/channel/UCb9PdJYYaElE6Uqb1KxhE8w e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez Organizador do São Paulo R Users Group

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Re: [R-br] (resolvido) Erro instalar pacote smatr
by marcelo claro de souza 15 Set '15

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Olá pessoal Restaurei o Win e agora deu certo. Muito obrigado pelas colaborações Abraço Marcelo Em 15/09/2015 2:18 PM, "Benilton Carvalho" <beniltoncarvalho(a)gmail.com> escreveu: > Veja o que diz a mensagem de instalação: > > package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked > Warning: unable to move temporary installation > ‘C:\Users\marceloclaro\Documents\R\win-library\3.2\file25a415bf417e\Rcpp’ > to ‘C:\Users\marceloclaro\Documents\R\win-library\3.2\Rcpp’ > > A dica está aí. > > B > > On Tue, Sep 15, 2015, 11:45 marcelo claro de souza < > marcelo.claro.souza(a)gmail.com> wrote: > >> Olá >> >> Eu já tentei instalar esse pacote e tb está dando erro: >> >> > install.packages("Rcpp") >> Installing package into >> ‘C:/Users/marceloclaro/Documents/R/win-library/3.2’ >> (as ‘lib’ is unspecified) >> tentando a URL ' >> https://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.2/Rcpp_0.12.1.zip' >> Content type 'application/zip' length 3189570 bytes (3.0 MB) >> downloaded 3.0 MB >> >> package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked >> Warning: unable to move temporary installation >> ‘C:\Users\marceloclaro\Documents\R\win-library\3.2\file25a415bf417e\Rcpp’ >> to ‘C:\Users\marceloclaro\Documents\R\win-library\3.2\Rcpp’ >> >> The downloaded binary packages are in >> >> C:\Users\marceloclaro\AppData\Local\Temp\RtmpgPcNEO\downloaded_packages >> >> Será alguma incompatibilidade entre o R e o Win10? >> Muito obrigado >> >> Marcelo >> >> >> >> Em 15 de setembro de 2015 11:35, salah <salah3.1416(a)gmail.com> escreveu: >> >>> Olá Marcelo >>> >>> Na mensagem de erro diz: there is no package called ‘Rcpp’ >>> Instale o pacote Rcpp >>> saudações >>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e fornea >>> cdigo mnimo reproduzvel. >> >> >> >> >> -- >> *Dr. Marcelo Claro de Souza* >> Postdoctoral researcher >> >> FCFRP - USP >> Department of Pharmacy >> Laboratory of Pharmacognosy >> Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil >> Av. do Café s/n >> CEP 14040-230 >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. >

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Erro instalar pacote smatr
by marcelo claro de souza 15 Set '15

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Olá pessoal, tudo bem com vocês? Estou utilizando o R 3.2.2 para win10 e está dando erro na instalação do pacote smatr. > install.packages("smatr") Installing package into ‘C:/Users/marceloclaro/Documents/R/win-library/3.2’ (as ‘lib’ is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- tentando a URL ' https://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.2/smatr_3.4-3.zip' Content type 'application/zip' length 134092 bytes (130 KB) downloaded 130 KB package ‘smatr’ successfully unpacked and MD5 sums checked The downloaded binary packages are in C:\Users\marceloclaro\AppData\Local\Temp\RtmpgPcNEO\downloaded_packages > require(smatr) Carregando pacotes exigidos: smatr Carregando pacotes exigidos: plyr Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) : there is no package called ‘Rcpp’ Failed with error: ‘package ‘plyr’ could not be loaded’ Anteriormente eu utilizei esse mesmo pacote em outras versões do Win e tb no Ubuntu sem nenhum problema. Alguém tem alguma ideia de como solucionar o problema? Muito obrigado pela ajuda Abraço Marcelo -- *Dr. Marcelo Claro de Souza* Postdoctoral researcher FCFRP - USP Department of Pharmacy Laboratory of Pharmacognosy Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil Av. do Café s/n CEP 14040-230

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Gráfico regressão quantilica
by geovane barbosa 15 Set '15

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Olá pessoal tudo bem. Alguém. Já gerou um desses gráficos abaixo? Suponha que eu tenha a seguinte regressão quantilica k=rq(y ~ x, tau=c(0.1,0.25,0.5,0.75,0.9),data=dados) Como eu faço para gerar esses gráficos em anex

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Exibição de matriz de correlação dada uma condição [RESOLVIDO]
by ASANTOS 15 Set '15

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> Agora sim Hélio, > > Agora com correlação direta e inversa e com cores, segue CRM: > > #Pacote > require(gplots) > > #Variáveis artificiais > dados<-runif(1000) > dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) > dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) > dados<-as.data.frame(dados) > names(dados)<-c("var1", > "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") > > > #Função by Walmes > pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))} > > cor.prob <- function(X){ > pair.SampSize <- pn(X) > above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) > pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 > > R <- cor(X, use="pair") > above2 <- row(R) < col(R) > r2 <- R[above2]^2 > Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) > R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) > R > } > > > correla <- round(cor.prob(dados),4) > > > #Função by Helio > > sig<-0.05## Significância pos > > rP<-0.50 ## Correlação positiva > rN<--0.50## Correlação negativa > > cor.probC <- function(x){ > > results <- x > ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=rP&x>=rN,NA,x)) > } > > cr <- cor.probC(correla) > colnames(cr) <- names(dados) > rownames(cr) <- names(dados) > cr > # > > #Plota a matriz > paleta<- colorRampPalette(c(rgb(0.96,0.96,1), rgb(0.1,0.1,0.9)), space > = "rgb") > xval <- formatC(cr, format="f", digits=2) > x_hm <- heatmap.2(cr, Rowv=FALSE, Colv=FALSE, > dendrogram="none",col=paleta, > trace="none", cellnote=xval, notecol="black", notecex=0.8) > # > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > Campus Cáceres > Caixa Postal 244 > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br > Lattes:http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 > ====================================================================== > > > > Em 02/09/2015 22:29, Hélio Gallo Rocha escreveu: >> >> Alexandre. Estou num celular, mas acho que incluindo o caracter & no >> campo relativo a correlação, vai funcionar >> >> Em 02/09/2015 22:36, "ASANTOS [via R-br]" >> <ml-node+s2285057n4665035h53(a)n4.nabble.com >> <mailto:ml-node%2Bs2285057n4665035h53@n4.nabble.com>> escreveu: >> >> Boa noite Helio, >> >> O problema é que a função some também com variáveis >> significantes mas inversamente correlacionadas, se altero >> ifelse(x>=0.08,NA,x), tenho o problema inverso. Veja as >> alterações que >> fiz, também criei uma estrutura de correlação um pouco melhor nos >> dados >> artificiais. Outro problema para colorir estão sendo os NA's, mas >> acho >> que estamos chegando lá, segue o CRM: >> >> #Variáveis artificiais >> dados<-runif(1000) >> dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) >> dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) >> dados<-as.data.frame(dados) >> names(dados)<-c("var1", >> "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") >> >> >> #Função by Walmes >> pn <- function(X){crossprod(!is.na <http://is.na>(X))} >> >> cor.prob <- function(X){ >> pair.SampSize <- pn(X) >> above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) >> pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 >> >> R <- cor(X, use="pair") >> above2 <- row(R) < col(R) >> r2 <- R[above2]^2 >> Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) >> R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) >> R >> } >> >> >> correla <- round(cor.prob(dados),4) >> >> >> #Função by Helio >> >> sig<-0.05## Significância >> r<-0.30 ## Correlação >> >> cor.probC <- function(x){ >> >> results <- x >> ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=r,NA,x)) >> } >> >> cr <- cor.probC(correla) >> colnames(cr) <- names(dados) >> rownames(cr) <- names(dados) >> cr >> # >> >> Abraço, >> >> -- >> ====================================================================== >> >> Alexandre dos Santos >> Proteção Florestal >> IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de >> Mato Grosso >> Campus Cáceres >> Caixa Postal 244 >> Avenida dos Ramires, s/n >> Bairro: Distrito Industrial >> Cáceres - MT CEP: 78.200-000 >> Fone: (+55) 65 8132-8112 <tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112> (TIM) >> (+55) 65 9686-6970 <tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970> (VIVO) >> e-mails:[hidden email] >> <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=0> >> [hidden email] >> <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=1> >> Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 >> ====================================================================== >> >> >> >> >> >> >> >> >> >> >> >> Em 02/09/2015 12:09, Hélio Gallo Rocha escreveu: >> > var1<-sort(rnorm(30,1), decreasing = TRUE) >> > var2<-rnorm(30,10) >> > var3<-sort(rnorm(30,22)) >> > var4<-sort(rnorm(30,10)) >> > var5<-sort(rnorm(30,0.5), decreasing = TRUE) >> > var6<-sort(rnorm(30,25), decreasing = TRUE) >> > var7<-rnorm(30,10) >> > dados<-cbind(var1,var2,var3,var4,var5,var6,var7) >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> [hidden email] >> <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=2> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e >> forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> ------------------------------------------------------------------------ >> If you reply to this email, your message will be added to the >> discussion below: >> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad… >> >> To unsubscribe from R-br, click here >> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib…>. >> NAML >> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view…> >> >> >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes:http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Teste sobre funcionamento da lista
by sirio＠ig.com.br 15 Set '15

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Recebido, ok Em 15/09/2015 10:10, r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > Tópicos de Hoje: > > 1. [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista (Walmes Zeviani) > 2. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (Fátima Lima Paula) > 3. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista (ASANTOS) > 4. Lista de discussão fora do ar (Walmes Zeviani) > 5. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (Luiz Roberto Martins Pinto) > 6. Exibição de matriz de correlação dada uma condição > [RESOLVIDO] (ASANTOS) > 7. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (juan manuel Otalora) > 8. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (João Paulo Alves) > 9. Re: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (Rebeca Barreto) > 10. RES: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (Humberto Hazin) > 11. Re: Exibição de matriz de correlação dada uma condição > [RESOLVIDO] (Hélio Gallo Rocha) > 12. Re: RES: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > (Ari Clecius) > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Mon, 14 Sep 2015 18:06:46 -0300 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > Message-ID: > <CAFU=EkZrrHii5HUZD=DDSUpHx=Kvj5XJ+sPdzOJcnfXLR+r=ew(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que > hospeda a lista de discussão. > > W. > > ======================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 > pages & profiles: > http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] > http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] > https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] > ======================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/aa1f2911/atta… [9]> > > ------------------------------ > > Message: 2 > Date: Mon, 14 Sep 2015 18:10:29 -0300 > From: Fátima Lima Paula <fatima.lima.paula(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > Message-ID: > <CAJzNC0uhdmtXJ_n9ui1Wcsny_6G1FWVtPs7yC04Mw2vPRajrvw(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Recebido > > Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > escreveu: > >> Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. > > -- > "Minha felicidade depende da qualidade dos meus pensamentos" > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/474a440a/atta… [10]> > > ------------------------------ > > Message: 3 > Date: Mon, 14 Sep 2015 17:11:25 -0400 > From: ASANTOS <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > Message-ID: <55F737FD.1050407(a)yahoo.com.br> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" > > Funcionou!!! > > -- > ====================================================================== > Alexandre dos Santos > Proteção Florestal > IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso > Campus Cáceres > Caixa Postal 244 > Avenida dos Ramires, s/n > Bairro: Distrito Industrial > Cáceres - MT CEP: 78.200-000 > Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) > e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br > alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br > Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11]====================================================================== > > Em 14/09/2015 17:06, Walmes Zeviani escreveu: > >> Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] <http://www.leg.ufpr.br/%7Ewalmes [8]> | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/7d5b92f6/atta… [12]> > > ------------------------------ > > Message: 4 > Date: Mon, 14 Sep 2015 18:29:43 -0300 > From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: [R-br] Lista de discussão fora do ar > Message-ID: > <CAFU=EkZphO+dD1mLgWd+Fnd2n9s++ybhhgvC-L5sANm5PFG__A(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Saudações à todos, > > Venho por meio deste comunicar que a lista de discussão voltou a funcionar. > Estávamos em off desde o dia 03/09. Pedimos desculpas por qualquer prejuízo > nesse período que ficamos em off. Como sabem, a lista de discussão R-BR é > mantida por serviço de email gerenciado pela equipe do c3sl, que são nossos > colaboradores e mantenedores do espelho R da UFPR. Não só a nossa lista mas > todas as listas de discussão mantidas por eles sofreu avaria. Em situações > como essa, quando o problema está além das configurações da lista e sim nos > servidores do c3sl, não temos muito o que fazer se não aguardar por > encaminhamentos ou soluções por parte deles. Eles são sempre ágeis na > correção dos eventuais problemas mas como a UFPR esteve de greve todo > processo acaba tomando mais tempo. Lamentamos pelos prejuízos e agradeçemos > à todos pela compreensão. Esperamos não ter mais contratempos como esse. > > À disposição. > Walmes. > > ======================================================================== > Walmes Marques Zeviani > LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] > Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná > fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 > pages & profiles: > http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] > http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] > https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] > ======================================================================== > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/4a54c0ce/atta… [13]> > > ------------------------------ > > Message: 5 > Date: Mon, 14 Sep 2015 18:39:44 -0300 > From: Luiz Roberto Martins Pinto <luizroberto.uesc(a)gmail.com> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista > Message-ID: > <CAK4=-FAkCpVjHbwt_9wnrj0uzwZx2M0pjyn62V0Fc1Kg5Z_t2w(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Ok. > Luiz Roberto. > > Luiz Roberto Martins Pinto > Prof. Pleno/DCET/UESC > Laboratório de Estatística Computacional > Universidade Estadual de Santa Cruz > Ilhéus-Bahia-Brasil > > luizroberto.uesc(a)gmail.com > skype: lrmpinto > http://lattes.cnpq.br/2732314327604831 [14] > > Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > escreveu: > >> Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/0491b447/atta… [15]> > > ------------------------------ > > Message: 6 > Date: Mon, 14 Sep 2015 20:22:05 -0400 > From: ASANTOS <alexandresantosbr(a)yahoo.com.br> > To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > Subject: [R-br] Exibição de matriz de correlação dada uma > condição [RESOLVIDO] > Message-ID: <55F764AD.5010402(a)yahoo.com.br> > Content-Type: text/plain; charset="windows-1252"; Format="flowed" > Agora sim Hélio, Agora com correlação direta e inversa e com cores, segue CRM: #Pacote require(gplots) #Variáveis artificiais dados<-runif(1000) dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) dados<-as.data.frame(dados) names(dados)<-c("var1", "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") #Função by Walmes pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))} cor.prob <- function(X){ pair.SampSize <- pn(X) above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 R <- cor(X, use="pair") above2 <- row(R) < col(R) r2 <- R[above2]^2 Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) R } correla <- round(cor.prob(dados),4) #Função by Helio sig<-0.05## Significância pos rP<-0.50 ## Correlação positiva rN<--0.50## Correlação negativa cor.probC <- function(x){ results <- x ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=rP&x>=rN,NA,x)) } cr <- cor.probC(correla) colnames(cr) <- names(dados) rownames(cr) <- names(dados) cr # #Plota a matriz paleta<- colorRampPalette(c(rgb(0.96,0.96,1), rgb(0.1,0.1,0.9)), space = "rgb") xval <- formatC(cr, format="f", digits=2) x_hm <- heatmap.2(cr, Rowv=FALSE, Colv=FALSE, dendrogram="none",col=paleta, trace="none", cellnote=xval, notecol="black", notecex=0.8) # -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes:http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11]====================================================================== Em 02/09/2015 22:29, Hélio Gallo Rocha escreveu: Alexandre. Estou num celular, mas acho que incluindo o caracter & no campo relativo a correlação, vai funcionar Em 02/09/2015 22:36, "ASANTOS [via R-br]" <ml-node+s2285057n4665035h53(a)n4.nabble.com <mailto:ml-node%2Bs2285057n4665035h53@n4.nabble.com>> escreveu: Boa noite Helio, O problema é que a função some também com variáveis significantes mas inversamente correlacionadas, se altero ifelse(x>=0.08,NA,x), tenho o problema inverso. Veja as alterações que fiz, também criei uma estrutura de correlação um pouco melhor nos dados artificiais. Outro problema para colorir estão sendo os NA's, mas acho que estamos chegando lá, segue o CRM: #Variáveis artificiais dados<-runif(1000) dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) dados<-as.data.frame(dados) names(dados)<-c("var1", "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") #Função by Walmes pn <- function(X){crossprod(!is.na <http://is.na [16]>(X))} cor.prob <- function(X){ pair.SampSize <- pn(X) above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 R <- cor(X, use="pair") above2 <- row(R) < col(R) r2 <- R[above2]^2 Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) R } correla <- round(cor.prob(dados),4) #Função by Helio sig<-0.05## Significância r<-0.30 ## Correlação cor.probC <- function(x){ results <- x ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=r,NA,x)) } cr <- cor.probC(correla) colnames(cr) <- names(dados) rownames(cr) <- names(dados) cr # Abraço, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 <tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112> (TIM) (+55) 65 9686-6970 <tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970> (VIVO) e-mails:[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=0> [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=1> Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11] ====================================================================== Em 02/09/2015 12:09, Hélio Gallo Rocha escreveu: > var1<-sort(rnorm(30,1), decreasing = TRUE) > var2<-rnorm(30,10) > var3<-sort(rnorm(30,22)) > var4<-sort(rnorm(30,10)) > var5<-sort(rnorm(30,0.5), decreasing = TRUE) > var6<-sort(rnorm(30,25), decreasing = TRUE) > var7<-rnorm(30,10) > dados<-cbind(var1,var2,var3,var4,var5,var6,var7) _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=2> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. ------------------------------------------------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad… [17] To unsubscribe from R-br, click here <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib… [18]>. NAML <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view… [19]> _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes:http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11] ====================================================================== -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/391ad595/atta… [20]> ------------------------------ Message: 7 Date: Mon, 14 Sep 2015 22:05:54 -0300 From: juan manuel Otalora <juanmanuelotalora(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista Message-ID: <CAAGqf2CEy_LFBcPann5FmF2QFA40v3x-z4nioBdOYwkMoJ2cmw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" ok 2015-09-14 18:39 GMT-03:00 Luiz Roberto Martins Pinto < luizroberto.uesc(a)gmail.com>: > Ok. Luiz Roberto. Luiz Roberto Martins Pinto Prof. Pleno/DCET/UESC Laboratório de Estatística Computacional Universidade Estadual de Santa Cruz Ilhéus-Bahia-Brasil luizroberto.uesc(a)gmail.com skype: lrmpinto http://lattes.cnpq.br/2732314327604831 [14] Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> escreveu: > >> Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. > _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- *Juan Manuel Otálora Villamil* -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/a5e991af/atta… [21]> ------------------------------ Message: 8 Date: Tue, 15 Sep 2015 07:51:24 -0300 From: João Paulo Alves <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista Message-ID: <CAMt4aOmXNte0BCjxwmnGuS3eshHdco8LOUeDwSAJXZQNdJfxuw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" recebido Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> escreveu: > Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/b58d7d7e/atta… [22]> ------------------------------ Message: 9 Date: Tue, 15 Sep 2015 09:50:09 -0300 (BRT) From: Rebeca Barreto <rebeca.mfbarreto(a)univasf.edu.br> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista Message-ID: <234955195.7654289.1442321409248.JavaMail.zimbra(a)univasf.edu.br> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" recebido Rebeca Mascarenhas Fonseca Barreto ***************************************************** De: "João Paulo Alves" <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 15 de setembro de 2015 6:51:24 Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani < walmeszeviani(a)gmail.com > escreveu: Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem ( http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7] ) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/d467dbcd/atta… [23]> ------------------------------ Message: 10 Date: Tue, 15 Sep 2015 09:57:11 -0300 From: Humberto Hazin <hghazin(a)hotmail.com> To: <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] RES: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista Message-ID: <BAY402-EAS1566BC626ACE8DFA5BC99BDB45C0(a)phx.gbl> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Recebido! De: R-br [mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] Em nome de Rebeca Barreto Enviada em: Tuesday, September 15, 2015 9:50 Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Rebeca Mascarenhas Fonseca Barreto ***************************************************** _____ De: "João Paulo Alves" < <mailto:joaopaulogoisalves@gmail.com> joaopaulogoisalves(a)gmail.com> Para: <mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br> r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 15 de setembro de 2015 6:51:24 Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com <mailto:walmeszeviani@gmail.com> > escreveu: Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 <tel:%28%2B55%29%2041%203361%203573> linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. _______________________________________________ R-br mailing list <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br <https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6]> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem ( <http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]> http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/573125cf/atta… [24]> ------------------------------ Message: 11 Date: Tue, 15 Sep 2015 09:57:33 -0300 From: Hélio Gallo Rocha <heliogallorocha(a)gmail.com> To: r-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Exibição de matriz de correlação dada uma condição [RESOLVIDO] Message-ID: <CA+ppPW7x=2T1a5nkpTLrTULE6M3JmCxkXL_K1XJOJqY1NW3=JQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Alexandre, bom dia. Não consegui identificar essa msg de erro, que ocorre após executar a ultima linha: x_hm <- heatmap(cr, Rowv=FALSE, Colv=FALSE, dendrogram="none",col=paleta, trace="none", cellnote=xval, notecol="black", notecex=0.8) msg de erro: Error in hclustfun(distfun(x)) : NA/NaN/Inf em chamada de função externa (argumento 11) OBS: retirei o ".2" após a função heatmap, poiis com esse dois, não rodava. abraço Em 14 de setembro de 2015 21:15, ASANTOS [via R-br] < ml-node+s2285057n4665047h25(a)n4.nabble.com> escreveu: > Agora sim Hélio, Agora com correlação direta e inversa e com cores, segue CRM: #Pacote require(gplots) #Variáveis artificiais dados<-runif(1000) dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) dados<-as.data.frame(dados) names(dados)<-c("var1", "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") #Função by Walmes pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))} cor.prob <- function(X){ pair.SampSize <- pn(X) above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 R <- cor(X, use="pair") above2 <- row(R) < col(R) r2 <- R[above2]^2 Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) R } correla <- round(cor.prob(dados),4) #Função by Helio sig<-0.05## Significância pos rP<-0.50 ## Correlação positiva rN<--0.50## Correlação negativa cor.probC <- function(x){ results <- x ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=rP&x>=rN,NA,x)) } cr <- cor.probC(correla) colnames(cr) <- names(dados) rownames(cr) <- names(dados) cr # #Plota a matriz paleta<- colorRampPalette(c(rgb(0.96,0.96,1), rgb(0.1,0.1,0.9)), space = "rgb") xval <- formatC(cr, format="f", digits=2) x_hm <- heatmap.2(cr, Rowv=FALSE, Colv=FALSE, dendrogram="none",col=paleta, trace="none", cellnote=xval, notecol="black", notecex=0.8) # -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=0> [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=1> Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11]====================================================================== Em 02/09/2015 22:29, Hélio Gallo Rocha escreveu: Alexandre. Estou num celular, mas acho que incluindo o caracter & no campo relativo a correlação, vai funcionar Em 02/09/2015 22:36, "ASANTOS [via R-br]" <[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=2>> escreveu: Boa noite Helio, O problema é que a função some também com variáveis significantes mas inversamente correlacionadas, se altero ifelse(x>=0.08,NA,x), tenho o problema inverso. Veja as alterações que fiz, também criei uma estrutura de correlação um pouco melhor nos dados artificiais. Outro problema para colorir estão sendo os NA's, mas acho que estamos chegando lá, segue o CRM: #Variáveis artificiais dados<-runif(1000) dados<-(dados*100)+c(1:500, 500:1) dados<-matrix(dados,nrow=100,ncol=10) dados<-as.data.frame(dados) names(dados)<-c("var1", "var2","var3","var4","var5","var6","var7","var8","var9","var10") #Função by Walmes pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))} cor.prob <- function(X){ pair.SampSize <- pn(X) above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 R <- cor(X, use="pair") above2 <- row(R) < col(R) r2 <- R[above2]^2 Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) R } correla <- round(cor.prob(dados),4) #Função by Helio sig<-0.05## Significância r<-0.30 ## Correlação cor.probC <- function(x){ results <- x ifelse(row(x)< col(x),ifelse(x<=sig,NA,x),ifelse(x<=r,NA,x)) } cr <- cor.probC(correla) colnames(cr) <- names(dados) rownames(cr) <- names(dados) cr # Abraço, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: <a moz-do-not-send="true" href="tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112" value="+556581328112" target="_blank">(+55) 65 8132-8112 (TIM) <a moz-do-not-send="true" href="tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970" value=" +556596866970" target="_blank">(+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=0> [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=1> Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11]====================================================================== Em 02/09/2015 12:09, Hélio Gallo Rocha escreveu: var1<-sort(rnorm(30,1), decreasing = TRUE) var2<-rnorm(30,10) var3<-sort(rnorm(30,22)) var4<-sort(rnorm(30,10)) var5<-sort(rnorm(30,0.5), decreasing = TRUE) var6<-sort(rnorm(30,25), decreasing = TRUE) var7<-rnorm(30,10) dados<-cbind(var1,var2,var3,var4,var5,var6,var7) _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665035&i=2> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. ------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad… [17] To unsubscribe from R-br, click here. NAML <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view… [19]> _______________________________________________ R-br mailing list[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=3>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)[hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=4> [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=5> Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [11] ====================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list [hidden email] <http:///user/SendEmail.jtp?type=node&node=4665047&i=6> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. ------------------------------ If you reply to this email, your message will be added to the discussion below: http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad… [27] To unsubscribe from R-br, click here <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib… [18]> . NAML <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view… [19]> -- Hélio Gallo Rocha IFSULDEMINAS - Câmpus Muzambinho -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/df106136/atta… [25]> ------------------------------ Message: 12 Date: Tue, 15 Sep 2015 13:10:50 +0000 (UTC) From: Ari Clecius <ari072000(a)yahoo.com.br> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] RES: [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista Message-ID: <1226474123.131471.1442322650098.JavaMail.yahoo(a)mail.yahoo.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Recebido. Att, Ari Clecius Alves de Lima Engenheiro Químico Me. Engenharia Civil Dr. Engenharia Civil (085)84174333 (085)33669042 Em Terça-feira, 15 de Setembro de 2015 9:57, Humberto Hazin <hghazin(a)hotmail.com> escreveu: #yiv6666753403 #yiv6666753403 -- _filtered #yiv6666753403 {panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;} _filtered #yiv6666753403 {font-family:Calibri;panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;} _filtered #yiv6666753403 {font-family:Tahoma;panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;} _filtered #yiv6666753403 {panose-1:2 11 6 3 2 2 2 2 2 4;}#yiv6666753403 #yiv6666753403 p.yiv6666753403MsoNormal, #yiv6666753403 li.yiv6666753403MsoNormal, #yiv6666753403 div.yiv6666753403MsoNormal {margin:0in;margin-bottom:.0001pt;font-size:12.0pt;}#yiv6666753403 a:link, #yiv6666753403 span.yiv6666753403MsoHyperlink {color:blue;text-decoration:underline;}#yiv6666753403 a:visited, #yiv6666753403 span.yiv6666753403MsoHyperlinkFollowed {color:purple;text-decoration:underline;}#yiv6666753403 p.yiv6666753403msonormal0, #yiv6666753403 li.yiv6666753403msonormal0, #yiv6666753403 div.yiv6666753403msonormal0 {margin-right:0in;margin-left:0in;font-size:12.0pt;}#yiv6666753403 span.yiv6666753403EstiloDeEmail18 {color:#1F497D;}#yiv6666753403 .yiv6666753403MsoChpDefault {font-size:10.0pt;} _filtered #yiv6666753403 {margin:70.85pt 85.05pt 70.85pt 85.05pt;}#yiv6666753403 div.yiv6666753403WordSection1 {}#yiv6666753403 Recebido! De: R-br [mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] Em nome de Rebeca Barreto Enviada em: Tuesday, September 15, 2015 9:50 Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Rebeca Mascarenhas Fonseca Barreto *****************************************************De: "João Paulo Alves" <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 15 de setembro de 2015 6:51:24 Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> escreveu: Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão.W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes [1] | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [2] http://git.leg.ufpr.br/walmes [3] | https://github.com/walmes [4] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [5] ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [7]) e forne� c�igo m�imo reproduz�el. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/9dc9361c/atta… [26]> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [6] ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 57, assunto 5 **************************************** Links: ------ [1] http://www.leg.ufpr.br/~walmes [2] http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 [3] http://git.leg.ufpr.br/walmes [4] https://github.com/walmes [5] https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ [6] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br [7] http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia [8] http://www.leg.ufpr.br/%7Ewalmes [9] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/aa1f2911/atta… [10] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/474a440a/atta… [11] http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 [12] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/7d5b92f6/atta… [13] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/4a54c0ce/atta… [14] http://lattes.cnpq.br/2732314327604831 [15] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/0491b447/atta… [16] http://is.na [17] http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad… [18] http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscrib… [19] http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view… [20] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/391ad595/atta… [21] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150914/a5e991af/atta… [22] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/b58d7d7e/atta… [23] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/d467dbcd/atta… [24] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/573125cf/atta… [25] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/df106136/atta… [26] http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150915/9dc9361c/atta… [27] http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Exibicao-de-matriz-de-correlacao-dad…

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Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista
by Rebeca Barreto 15 Set '15

15 Set '15

recebido Rebeca Mascarenhas Fonseca Barreto ***************************************************** De: "João Paulo Alves" <joaopaulogoisalves(a)gmail.com> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Terça-feira, 15 de setembro de 2015 6:51:24 Assunto: Re: [R-br] [OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista recebido Em 14 de setembro de 2015 18:06, Walmes Zeviani < walmeszeviani(a)gmail.com > escreveu: Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 http://git.leg.ufpr.br/walmes | https://github.com/walmes https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ ======================================================================== _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem ( http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia ) e forneça código mínimo reproduzível. -- J.P.G.A. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.

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Lista de discussão fora do ar
by Walmes Zeviani 14 Set '15

14 Set '15

Saudações à todos, Venho por meio deste comunicar que a lista de discussão voltou a funcionar. Estávamos em off desde o dia 03/09. Pedimos desculpas por qualquer prejuízo nesse período que ficamos em off. Como sabem, a lista de discussão R-BR é mantida por serviço de email gerenciado pela equipe do c3sl, que são nossos colaboradores e mantenedores do espelho R da UFPR. Não só a nossa lista mas todas as listas de discussão mantidas por eles sofreu avaria. Em situações como essa, quando o problema está além das configurações da lista e sim nos servidores do c3sl, não temos muito o que fazer se não aguardar por encaminhamentos ou soluções por parte deles. Eles são sempre ágeis na correção dos eventuais problemas mas como a UFPR esteve de greve todo processo acaba tomando mais tempo. Lamentamos pelos prejuízos e agradeçemos à todos pela compreensão. Esperamos não ter mais contratempos como esse. À disposição. Walmes. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 http://git.leg.ufpr.br/walmes | https://github.com/walmes https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ ========================================================================

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Verificar se há nova versão disponível.
by Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil 03 Set '15

03 Set '15

Amigos de R, Gostaria de configurar o meu R para que toda vez que o inicie, ele verifique se há uma nova versão disponível. Descobri que há uma função gtools::checkRVersion() que faz isso. Eu procurei um tanto e descobri que dá pra editar o profile do R pra isso acontecer. Mas eu não sei nem por onde começar. Alguem tem um passo a passo ou um link que possa ler algum material para eu resolver essa questão? Abraços, Pedro Brasil

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Matriz de covariância fenotípica e genotípica
by Euriann Yamamoto 03 Set '15

03 Set '15

Bom dia, o R gera matriz de covariância genotípica e fenotípica e dados de análise de variância multivariada? Algum material que possua a rotina pra isso? Obrigada Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados(67) 9910-6787

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Exibição de matriz de correlação dada uma condição
by ASANTOS 03 Set '15

03 Set '15

Prezados listeiros, No meu CRM abaixo tenho uma matriz de correlação com o valor de p na diagonal superior o e valor r de Pearson da diagonal inferior, no entanto eu gostaria de exibir uma matriz de correlação apenas com os p valores maiores ou igual 0.05 e r maior ou igual a 0.08 isso é possível? Segue CRM: require(Hmisc)## Pacote #Variáveis artificiais var1<-sort(rnorm(500,1), decreasing = TRUE) var2<-rnorm(500,10) var3<-sort(rnorm(500,22)) var4<-sort(rnorm(500,10)) var5<-sort(rnorm(500,0.5), decreasing = TRUE) var6<-sort(rnorm(500,25), decreasing = TRUE) var7<-rnorm(500,10) dados<-cbind(var1,var2,var3,var4,var5,var6,var7) #Função que dispõem p valor na diagonal superior e r valor na inferior pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))} cor.prob <- function(X){ pair.SampSize <- pn(X) above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize) pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2 R <- cor(X, use="pair") above2 <- row(R) < col(R) r2 <- R[above2]^2 Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2) R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df) R } #Resultado da matriz cor.prob(dados) # -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Como extrair dados PNAD
by Thaís Brenda Martins 02 Set '15

02 Set '15

Boa tarde pessoal, Estou tentando extrair estas variáveis do banco de dados PNAD 2013: Variável Posição Inicial Tamanho Descrição V7122 121 12 Rendimento mensal em dinheiro que recebia normalmente no mês de referência no(s) trabalho(s) da semana de referência V9532 327 12 Rendimento mensal em dinheiro que recebia normalmente, no mês de referência, no trabalho principal da semana de referência V9982 426 12 Rendimento mensal em dinheiro que recebia normalmente, no mês de referência, nesse trabalho secundário V1022 457 12 Rendimento mensal em dinheiro que recebia normalmente, no mês de referência, no(s) outro(s) trabalho(s) da semana de referência V9122 516 1 Era aposentado de instituto de previdência federal (INSS), estadual ou municipal ou do governo federal na semana de referência V1251 519 2 Código 01 - recebia normalmente rendimento de aposentadoria de instituto de previdência ou do governo federal, no mês de referência V1252 521 12 Rendimento de aposentadoria de instituto de previdência ou do governo federal que recebia, normalmente, no mês de referência V1257 547 2 Código 03 - recebia normalmente rendimento de outro tipo de aposentadoria, no mês de referência Já tentei rodar o próprio pacote do IBGE o IBGEPesq, mas não funciona. Já tentei com outros códigos e não consegui. Alguém que trabalhe com PNAD pode me ajudar? Abraços. Att.,Thaís Brenda Martins

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Existe algum pacote que ajude na tabulação de dados?
by thiago franklin 02 Set '15

02 Set '15

Gostaria de saber se existir algum pacote que ajude na tabulação de dados diretamente no R.

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Uso da função sort()
by Michelle Bau Graczyk 02 Set '15

02 Set '15

Boa noite, Eu preciso ordenar uma tabela de dados na forma crescente de datas. Na coluna 1 eu tenho as datas e nas outras 400 colunas eu tenho números correspondente a valores de venda de um certo produto. O problema é que quando eu aplico o sort() na coluna de datas, ele só ordena a mesma. Para ser mais clara, ela não leva junto a linha de dados com as outros 400 valores para a nova posição. Por favor, Vocês sabem me dizer como eu posso arrumar isto? Muito obrigada, Michelle

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juntar base de dados
by joão Rodrigo Castro 02 Set '15

02 Set '15

Bom dia listeiros, Estou com um problema ao juntar duas bases de dados, sendo que já tentei o merge e não ficou bom (encontrei uma solução na lista, em uma postagem de fevereiro deste ano, e também não deu certo). Tenho dados de uma estação meteorológica e dados estimados. Preciso juntar os dados estimados com os dados observados, ou seja, para o mesmo dia e ano eu preciso dos fatores "Tmax" e "Tmin" (arquivo "dados") e de "Rad". A dimensão dos arquivos é diferentes pois há dias em que os dados não foram registrados na estação. Segue parte dos arquivos. dados = read.table("CANG_NASA.txt", dec=".", h=T ,col.names = c( "ano", "jday","Rad","Tmax", "Tmin","prec","vento","td","t2m","rh2m")) > dados1 = read.table("diario_original_CANG.dat", dec=".", h=T ,col.names = c( "ano", "mes","jday","Rad","Tmax", "Tmin","stopo","trans","dt")) > > head(dados) ano jday Rad Tmax Tmin prec vento td t2m rh2m 1 2008 1 24.9 20.7 19.2 0.0 8.5 17.8 20.0 87.3 2 2008 2 22.2 21.6 20.8 0.0 8.3 19.1 21.2 87.5 3 2008 3 31.2 22.0 21.2 0.0 7.4 20.1 21.6 91.7 4 2008 4 29.6 22.3 21.7 0.2 7.0 20.3 22.1 89.6 5 2008 5 18.4 22.7 22.1 7.9 8.0 21.0 22.3 92.7 6 2008 6 9.1 22.3 21.9 32.9 11.5 21.3 22.1 95.4 > head(dados1) ano mes jday Rad Tmax Tmin stopo trans dt 1 2008 1 1 32.731 32.2 19.2 44.054 0.743 13.0 2 2008 1 2 30.269 30.7 19.6 44.024 0.688 11.1 3 2008 1 3 23.485 32.0 20.1 43.991 0.534 11.9 4 2008 1 4 21.110 26.5 19.6 43.954 0.480 6.9 5 2008 1 5 26.837 27.3 18.1 43.915 0.611 9.2 6 2008 1 6 26.766 26.5 17.4 43.873 0.610 9.1 > dim(dados) [1] 2557 10 > dim(dados1) [1] 1911 9 Obrigado. -- João Rodrigo de Castro Programa de Pós-Graduação em Meteorologia Bolsista Laboratório de Agrometeorologia - Embrapa Clima Temperado Universidade Federal de Pelotas

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Otimização de parametros
by Leonardo Monteiro 02 Set '15

02 Set '15

Boa noite, Tenho a seguinte cjto de dados: x<- c(0, 1,2.1,3,5,5.2,5.5,6,5.8, 5.6, 5.4, 4.9, 4.8, 4.2, 3.3, 2.7, 2.3, 1.8, 0.5) e quero ajustar uma função y = ax^2+bx +c, como faço para achar os parametros a,b e c, para que o erro seja minimizado? obrigado, Leonardo

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Sobre lista de pacotes para formatação
by Franklin Januario da Silva 01 Set '15

01 Set '15

Bom dia, Eu recomendaria fazer um backup da pasta de instalação do R, a menos que você creia haver alguma corrupção em seus arquivos. Depois de reinstalado é só substituir as pastas originais pelas do backup e você não teria que fazer nem lista nem baixar tudo novamente. Att. -----Mensagem original----- De: R-br [mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] Em nome de r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Enviada em: sábado, 29 de agosto de 2015 12:00 Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Digest R-br, volume 56, assunto 28 Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 2. conversão caracter para formato hora (Heloíse Pavanato) 3. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Marcus Nunes) 4. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 5. Re: duvida em if else (Cesar Rabak) 6. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Walmes Zeviani) 7. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Cesar Rabak) 8. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Cesar Rabak) 9. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Paulo Justiniano) 10. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Euriann Yamamoto) 11. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Mayer) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:20:55 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFrWFs=RG9p2Td_CdSeSBQpFmYA7v9agrKuBiHVRJPKCf6OM0w(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caros colegas. Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver Att -- ======================================================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção Animal e-mail:nandodesouza@gmail.com https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ======================================================================== -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/8d87cffe/atta…> ------------------------------ Message: 2 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:45:58 -0300 From: Heloíse Pavanato <helopavanato(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: [R-br] conversão caracter para formato hora Message-ID: <CAPw23dGUaUO3xfH8nK7KnWAT27-_jDLUWaSAO-wVR0O3mfPNog(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Cara lista, Tenho uma dúvida quanto a conversão de um vetor (importado por read.table) com caracteres em formato de hora (H:M:S). Por exemplo, este vetor: hora <- c('10:57:41', '11:04:41', '11:04:41', '11:05:56') Agradeço qualquer ajuda. Heloise -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/07f01429/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Fri, 28 Aug 2015 13:24:37 -0300 From: Marcus Nunes <marcus.nunes(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CA+QGQvtj7ho3=DC2g3rvQdrSzMbuM_EGYJR2fLg7gFaqWdzZxw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes casos é o seguinte: 1- Entre no R e digite .libPaths() [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library" Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados 2- No terminal, rode ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada. 3- Formate o computador e instale o R 4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt nele e instale os pacotes contidos nele: pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") install.packages(pacotes) 5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los também 2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza <nandodesouza(a)gmail.com >: > Caros colegas. > > Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria > de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor > após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou > terei de fazer de maneira automática? > Qual a melhor forma de resolver > > Att > > -- > ====================================================================== > = > Fernando Souza > Zootecnista, DSc. Produção Animal > e-mail:nandodesouza@gmail.com > https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ > ====================================================================== > == > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- Marcus Nunes http://marcusnunes.me/ -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/36979554/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:12:36 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFrWFsmD8HCd+UJT+Tf9i-F2y_yZ9+otgmtg1SfTFN9yWdeF9A(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Obrigado Marcus! Em 28 de agosto de 2015 13:24, Marcus Nunes <marcus.nunes(a)gmail.com> escreveu: > Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes > casos é o seguinte: > > 1- Entre no R e digite > > .libPaths() > [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library" > > Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados > > 2- No terminal, rode > > ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt > > Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os > pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada. > > 3- Formate o computador e instale o R > > 4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt > nele e instale os pacotes contidos nele: > > pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") > install.packages(pacotes) > > 5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los > também > > > > > > 2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza < > nandodesouza(a)gmail.com>: > >> Caros colegas. >> >> Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria >> de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor >> após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou >> terei de fazer de maneira automática? >> Qual a melhor forma de resolver >> >> Att >> >> -- >> ===================================================================== >> == >> Fernando Souza >> Zootecnista, DSc. Produção Animal >> e-mail:nandodesouza@gmail.com >> https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ >> ===================================================================== >> === >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > > -- > Marcus Nunes > http://marcusnunes.me/ > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- ======================================================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção Animal e-mail:nandodesouza@gmail.com https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ======================================================================== -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/2f303a80/atta…> ------------------------------ Message: 5 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:25:09 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] duvida em if else Message-ID: <CAKrF98k-vUkiYkntY20hjR05LrRnL9zPGLwrsTEhYoet_fumWA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Leonardo, Eu já toquei nesse assunto em resposta a outra questão parecida com essa sua, por isso serei mais breve. A linguagem R é por excelência uma linguagem voltada para o tratamento de dados em grupos que *grosso modo* podemos denominar de "matriciais". Por a maioria das "coisas" que se pode fazer em R são "automagicamente" feitas em vetores ou matrizes de dados. Como um exemplo "bobinho" veja: > 1:10 + 0.07 [1] 1,07 2,07 3,07 4,07 5,07 6,07 7,07 8,07 9,07 10,07 Se você quiser pensar de maneira procedural você *poderia* (mas IMNSHO *não deve*) fazer: > for (i in 1:10) print(i + 0.07) [1] 1,07 [1] 2,07 [1] 3,07 [1] 4,07 [1] 5,07 [1] 6,07 [1] 7,07 [1] 8,07 [1] 9,07 [1] 10,07 Então vejamos: Seu teste if(x < 4) retorna o vetor > x < 4 [1] TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE Mas você está tentando resolver um teste encima de um objeto com dez elementos e faz um único teste. . . Veja que no seu caso seu depoimento "porem isso nao esta funcionando." não está correto de todo, pois o R lhe indica com clareza qual é o problema: > if(x < 4) {print ("a")} else {print ("b")} [1] "a" Mensagens de aviso perdidas: In if (1:10 < 4) {: a condição tem comprimento > 1 e somente o primeiro elemento será usado Aliás, o seu código no exemplo acima do "if" tem erro de sintaxe, que talvez esteja mascarando a mensagem de erro: > if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)} Erro: símbolo inesperado in "if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b" Portanto, entenda que para um programador do R a forma mais clara no script é a natural da linguagem, como mostrou a Fátima. Como curiosidade, veja como mesmo o ifelse poderia ser removido, se você quisesse fazer algo mais "críptico" (que aí eu considero exagero no malabarismo do uso dos recursos da linguagem, mas vez por outra eu me deparo em código escrito até pelos mantenedores do corpo de pacotes do R): > c("a","b")[(x < 4) + 1] [1] "b" "b" "b" "a" "a" "a" "a" "a" "a" "a" HTH -- Cesar Rabak 2015-08-23 23:27 GMT-03:00 Leonardo Monteiro <monteiroleonardo6(a)gmail.com>: > Prezados, eu sei que existem outras maneiras (funcoes, tipo ifelse) de > se fazer isso, porem eu gostaria de fazer pelo if else , pq fica mais > claro no meu script. > > > bom.. eu venho tentando aplicar a condicao em um vetor, por exemplo > > x<- 1:10 > if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)} > > porem isso nao esta funcionando. > > Há algum outra maneira de aplicar a funcao if else para teste e/ou > avaliacao dos dados de um vetor? > > > obrigado, > > Leonardo. > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/d07f7b76/atta…> ------------------------------ Message: 6 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:31:12 -0300 From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFU=EkZb1AGJRm1AemWQ3Lp_XnOchcx8LDmBvd+9NSH9wdRDpQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos. À disposição. Walmes. ? -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/f9045ca7/atta…> ------------------------------ Message: 7 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <CAKrF98=9HEL1H4e=dxRCUtTTTa5Yovfea3ptC4wkxMFrGEKCuw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Euriann, Bem vinda à lista R-Br! Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?. Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita. Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise. HTH -- Cesar Rabak 2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann(a)outlook.com>: > Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio. > > Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um > índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso > gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei > a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como > fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo? > > Obrigada > > > *Euriann Yamamoto* > *Doutoranda em Agronomia* > *Universidade Federal da Grande Dourados* > > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/4d94523f/atta…> ------------------------------ Message: 8 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:45:40 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAKrF98kjAnCoSqw6C1ts8n8d4bjf9NwV3sFeuKJ=Lgh0SjmCVQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Apenas como sugestão adicional, vejam este blog do Tal Galili, que parece ficou tão fissurado com esse tema de (re-)instalação de pacotes no R que até criou um para facilitar esse trabalho (o installr [mas não me lembro se a versão atual já funciona em "sabores" do Linux]) http://www.r-bloggers.com/automated-re-install-of-packages-for-r-3-0/ A lição mais importante, IMHO, é que existe um comando especialmente para saber quais são os pacotes instalados! Como se isso surpreenderia alguém que usa o R ? HTH -- Cesar Rabak 2015-08-28 14:31 GMT-03:00 Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com>: > Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos > diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e > instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo > vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa > partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder > os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de > então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", > lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos. > > À disposição. > Walmes. > ? > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/ced95361/atta…> ------------------------------ Message: 9 Date: Fri, 28 Aug 2015 15:36:55 -0300 (BRT) From: Paulo Justiniano <paulojus(a)leg.ufpr.br> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1508281535350.14896(a)pataxo.est.ufpr.br> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" pac <- packageStatus() names(pac) terá uma dista com istalados e dispobíveis exporte em um arquivo e depois leir e passe o vetor dos instalados para o install.packages() On Fri, 28 Aug 2015, Fernando Antonio de souza wrote: > Caros colegas. > > Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma > lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma > automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? > Qual a melhor forma de resolver > > Att > > -- > ======================================================================= > Fernando Souza > Zootecnista, DSc. Produção Animal > e-mail:nandodesouza@gmail.com > https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ > ======================================================================== > > ------------------------------ Message: 10 Date: Fri, 28 Aug 2015 18:41:27 +0000 From: Euriann Yamamoto <euriann(a)outlook.com> To: Dúvidas R <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <COL128-W34295A7F42963CC461585BB66E0(a)phx.gbl> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Obrigada. Vou conferir! Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados(67) 9910-6787 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: cesar.rabak(a)gmail.com To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Euriann, Bem vinda à lista R-Br! Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?. Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita. Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise. HTH--Cesar Rabak 2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann(a)outlook.com>: Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio. Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo? Obrigada Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/0d3e972e/atta…> ------------------------------ Message: 11 Date: Fri, 28 Aug 2015 22:42:56 -0300 From: Fernando Mayer <fernandomayer(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAO4bAdOu9RMX90es0YkeaXWvEzhXDBQF9hKp2h-UFvDcoiXFJg(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Para uma solução mais permanente, crie um diretório onde vc tem permissão de escrita, por exemplo em /home/fernando/R/library Ainda no seu HOME, crie um arquivo .Renviron (/home/fernando/.Renviron) com a seguinte variável de ambiente: R_LIBS=~/R/library Salve esse arquivo e reinicie uma sessão do R. Agora seu .libPaths() deve ser algo como .libPaths() [1] "/home/fernando/R/library" "/usr/local/lib64/R/library" O importante é que sua biblioteca particular é a primeira dessa lista. Agora qualquer pacote que vc instalar, tanto com install.packages() ou devtools::install_git() por exemplo, será instalado nessa biblioteca por padrão. Quando vc for formatar seu computador basta salvar esse diretório, e na nova instalação colocar ele no mesmo lugar e não esquecer de criar o ~/.Rprofile. Dessa forma tudo funcionará como antes. Esse procedimento também é válido para quando vc atualizar a versão do R. Se o seu .Rprofile estiver presente, a nova versão já ira carregar os pacotes desse local, sem a necessidade de fazer qualquer configuração adicional, e sem ter que reinstalar tudo novamente. Para mais detalhes de instalação e gerenciamento de pacotes no R, veja: http://git.leg.ufpr.br/fernandomayer/R-pacotes-rautu/blob/master/R_gerencia… --- Fernando de Pol Mayer Laboratório de Estatística e Geoinformação - LEG Departamento de Estatística - DEST Universidade Federal do Paraná - UFPR URL: http://www.leg.ufpr.br/~fernandomayer e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com, ufpr.br} 2015-08-28 15:36 GMT-03:00 Paulo Justiniano <paulojus(a)leg.ufpr.br>: > pac <- packageStatus() > names(pac) > > terá uma dista com istalados e dispobíveis > > exporte em um arquivo e depois leir e passe o vetor dos instalados para o > install.packages() > > > > On Fri, 28 Aug 2015, Fernando Antonio de souza wrote: > > Caros colegas. >> >> Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de >> salvar uma >> lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação >> de forma >> automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira >> automática? >> Qual a melhor forma de resolver >> >> Att >> >> -- >> ======================================================================= >> Fernando Souza >> Zootecnista, DSc. Produção Animal >> e-mail:nandodesouza@gmail.com >> https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ >> ======================================================================== >> >> > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/426c1485/atta…> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 56, assunto 28 ***************************************** [http://www.cerradinho.com/CBio.png] Franklin Januario da Silva Agricola 64 3634-2806 64 9979-0608 cerradinho.com.br<http://www.cerradinho.com.br>

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Correção entre os PCAs obtidos e os Ys
by Andre Oliveira 31 Ago '15

31 Ago '15

Prezad@s boa noite,existe um pacote que faz a matriz de correção entre os PCAs obtidos e os Ys? Estou fazendo na mão e gostaria de fazer de forma simples para uma apresentação com R. # CMRdata(mtcars) resultado<-prcomp(mtcars,scale=T,center = TRUE) summary(resultado) resultado$x André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES

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Rcmdr - não abre janela por problema leitura RcmdrMisc
by Ederson Civardi 31 Ago '15

31 Ago '15

Bom dia a todos. Estou tentando abrir o Rcmdr no R version 3.2.2 (2015-08-14), Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) com o Windows 10. Porém ocorre esse erro abaixo. Alguém saberia me dizer o que devo fazer para solucionar o problema? Desde já agradeço. Ederson > require(Rcmdr) Carregando pacotes exigidos: Rcmdr Carregando pacotes exigidos: splines Carregando pacotes exigidos: RcmdrMisc Carregando pacotes exigidos: car Carregando pacotes exigidos: sandwich Error in get(Info[i, 1], envir = env) : não foi possível abrir o arquivo 'C:/Users/Ederson/Documents/R/win-library/3.2/rpart/R/rpart.rdb': No such file or directory Failed with error: ‘package ‘RcmdrMisc’ could not be loaded’

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Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP) nesta Sexta 4 de setembro do 2015
by Luis Benites Sánchez 31 Ago '15

31 Ago '15

Caros, O Meetup R São Paulo Users Group, iniciativa dos estudantes de Doutorado em Estatística do IME, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara com a colaboração das professoras Viviana Giampioli e Márcia D'Elia Branco, anuncia a seguinte série de palestras do Meetup em R do mês de setembro (lembrar que temos atividades planejadas até o 4 de dezembro). Breve descrição do Meetup: As reuniões do Meetup R acontecerão geralmente duas vezes por mês, as sextas, das 14h às 16h. Em cada reunião teremos a apresentação de duas palestras com duração de 45 minutos cada e 10 minutos de perguntas. As palestras serão ministradas por professores e estudantes de pós-graduação de diversas universidades do interior como do exterior. A maioria de las serão online, mais também teremos algumas palestras presenciais. Para o mês de setembro a programação é a seguinte: *Sexta 4 de setembro (14h-16h)* - Conferências: 1) Uma introdução a Séries Temporais em R - Prof. Carlos Abanto Valle, Departamento de Métodos Estatísticos, Universidade Federal de Rio de Janeiro. 2) Uma Introdução ao Rcpp - Msc. Carlos Trucíos, Doutorado em andamento em Estatística, IMECC-UNICAMP. *Sexta 18 de setembro (14h-16h)* - Conferências: 1) Gauss Hermite Quadrature with Pruning - Prof. Freddy Hernández Barajas, Universidad Nacional de Colombia. 2) R Markdown - Prof. Fernando Mayer, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Paraná. Obs. As palestras serão transmitidas ao vivo pela USP e YouTube (os links de transmissão serão disponibilizados no site do meetup). As sessões são filmados (se os palestrantes concordar) e ditos vídeos serão disponibilizados no Canal de YouTube do Meetup. Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez Organizador do São Paulo R Users Group

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Mapas de preferência interno e externo
by Andre Oliveira 29 Ago '15

29 Ago '15

Alguém sabe de algum pacote além do SensoMineR que faça tal análise? André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES

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Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação
by Fernando Antonio de souza 29 Ago '15

29 Ago '15

Caros colegas. Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver Att -- ======================================================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção Animal e-mail:nandodesouza@gmail.com https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ========================================================================

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ANOVA via bootstrap não-paramétrico
by Euriann Yamamoto 28 Ago '15

28 Ago '15

Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio. Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo? Obrigada Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados

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duvida em if else
by Leonardo Monteiro 28 Ago '15

28 Ago '15

Prezados, eu sei que existem outras maneiras (funcoes, tipo ifelse) de se fazer isso, porem eu gostaria de fazer pelo if else , pq fica mais claro no meu script. bom.. eu venho tentando aplicar a condicao em um vetor, por exemplo x<- 1:10 if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)} porem isso nao esta funcionando. Há algum outra maneira de aplicar a funcao if else para teste e/ou avaliacao dos dados de um vetor? obrigado, Leonardo.

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conversão caracter para formato hora
by Heloíse Pavanato 28 Ago '15

28 Ago '15

Cara lista, Tenho uma dúvida quanto a conversão de um vetor (importado por read.table) com caracteres em formato de hora (H:M:S). Por exemplo, este vetor: hora <- c('10:57:41', '11:04:41', '11:04:41', '11:05:56') Agradeço qualquer ajuda. Heloise

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tamanho da amostra em experimentos com 4 tratamentos (proporção)
by Manoel Galdino 27 Ago '15

27 Ago '15

Caros, alguém sabe como faço para calcular o tamanho de uma amostra para um experimento com 3 tratamentos e um controle, rodados em paralelo, para um nível de significância de 5% e poder do teste de 80%? A variável é uma proporção (taxa de usuários que se cadastraram num site). Eu sei calcular o tamanho da amostra para um teste de duas proporções, mas aqui eu quero testar quatro proporções e escolher a maior das quatro. Eu tenho a proporção esperada de cada um dos tratamentos e controle (seja p1 o controle, e p2, p3 e p4 o tratamento, p1 = .2, p2= .22, p3=.24 e p4 = .3). O caminho mais simples é calcular o tamanho da amostra para duas proporções, considerando p1 e p4 (maior e menor, sendo que o menor é também o controle). Mas parece que assim estou subestimando a variabilidade em p2 e p3 e a possibilidade de que eles sejam maiores que p4 e p1. Além disso, parece haver o problema de múltiplas comparações. Li um pouco e eu poderia tentar a correção de Bonferroni para múltiplos experimentos, e calcular o tamanho da amostra para duas propoções com p1 e p4, e usar alhpa_novo = alpha/m, em que alpha é o nível de significância original (5%) e m é o número de tratamentos (4... ou seria 3?). Porém esse método não leva em conta os valores esperados de p2 e p3, apenas p1 e p4, e isso nåo parece certo. Por fim, vale mebrar que o que quero é descobrir o melhor tratamento (conversão), e nåo testar se as propoções são iguais (eu já sei que não são exatamente iguais). Eu fiz um script simulando para o meu caso particular vários tamanhos de amostra, e qual a probabilidade de eu escolher o melhor tratamento [ ou seja, prob(escolher p4| dados e que p4 é o melhor). Mas não estou seguro nem que meu script está certo e, mais do que isso, qual a relação entre o número de tratamtnos, e as diferenças esperadas no efeito de cada tratamento sobre o tamanho da amostra (no caso de duas propoções, é fåcil estabelecer quanto minha amostra aumenta pela diferença esperada entre p1 e p2, para um dado alpha e beta). Se alguém tiver também referência na litertatura, já ajuda. Obrigado. Manoel segue o script: n.sim <-2000 # número de simulações mat <- matrix( nrow=n.sim, ncol=4) n.sample <- seq(500, 5500, by=1000) # tamanho de amostras para ver taxa de acerto para cada tamanho ## proporção de cada tratamento ## vou criar 10 combinações de proporção para 4 tratamentos ## a primeira todos os tratamentos têm a mesma proporção, igual a 20% ## me ajuda a ter uma base do resultado da simulação. set.seed(2) # fixa a semente, para resultados serem reproduíveis p1 <- c(.2, runif(9, .15, .3)) p2 <- c(.2, runif(9, .15, .3)) p3 <- c(.2, runif(9, .15, .3)) p4 <- c(.2, runif(9, .15, .3)) mat.p <- matrix(c(p1, p2, p3, p4), nrow=10, ncol=4, byrow=F) # para armazenar qual é o melhor tratamento, entre 10 combinações de efeitos diferentes dos tratamentos maior <- numeric() # simulação for ( i in 1:10) maior[i] <- which.max(mat.p[i,]) mat.true.max <- matrix(nrow=length(n.sample), ncol=10) num.true.max <- 0 for (h in 1:6) { for ( k in 1:10) { for ( i in 1:n.sim) { for ( j in 1:4) { mat[i,j] <- sum(rbinom(n.sample[h], 1, mat.p[k,j])) } num.true.max <- num.true.max + as.numeric(which.max(mat[i,]) == maior[k]) } mat.true.max[h,k] <- num.true.max/n.sim num.true.max <- 0 } } # verifito taxa de acerto para cada um dos tamanhos da amostra. Acerto é escolher a maior proporção. mat.true.max 2015-08-24 19:04 GMT-03:00 Andre Oliveira <andreolsouza(a)yahoo.com.br>: > Pessoal boa noite, > seria de grande valia divulgar as próximas transmissões no grupo rbr. > > André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística > aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito > Santo. IFES > > > > Em Sábado, 22 de Agosto de 2015 21:26, David Feitosa < > contato(a)davidfeitosa.com> escreveu: > > > Eu tb achei muito boa. > > Sabia nem que o ShareLatex estava com integração com o R. > Fico usando o knitr local no RStudio mesmo. > > Aqui em Fortaleza não há muitos usuários de R. > Só conheço duas pessoas por aqui e uma delas sou eu. Hahaha > > Python tem recebido mais destaque por aqui do que o R. > Java ainda domina desenvolvimento e pesquisa na região. > > > Atenciosamente, > > David F. > > Em 22 de agosto de 2015 17:45, Luis Benites Sánchez < > lbenitesanchez(a)gmail.com> escreveu: > > Prezado Jobenil, > > Muito obrigado, temos ainda mais palestras no Meetup de usuários de R em > São Paulo, ainda temos 13 palestras mais. Em todos os meetup (se os > palestrantes concordam) teremos as filmações das reuniões e estarão > disponíveis no canal de YouTube do Meetup. > > Não esqueçam de junstar-se ao Meetup de usuários de R em São Paulo em > nosso site www.meetup.com/pt/useR-SP/ para que possa conhecer mais > detalhes sobre as futuras reuniões que estão sendo realizadas no IME-USP > (Auditório Jacy Monteiro e que são transmitidas ao vivo). > > A palestra do 4 e 18 de setembro que minha colega e esposa Rocío Maehara > comentou em seu e-mail serão de 14 a 16 horas (sextas). > > Um abraço > > Luis Benites Sánchez > Organizador del Meetup de usuários de R em São Paulo > > > 2015-08-22 17:26 GMT-03:00 Jobenil - Gmail <pjobenil(a)gmail.com>: > > Prezados, > > Acabei de assistir à apresentação dos Professores Paulo, Walmes e > Fernando. Parabéns pelo evento e aos organizadores do Meetup pela > iniciativa. > Este é uma grande oportunidade para quem trabalha isolado em alguns > rincões do país a fora. > Abraços > Jobenil Júnior > > > *De:* R-br [mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] *Em nome de *Luiz > Roberto Martins Pinto > *Enviada em:* sexta-feira, 21 de agosto de 2015 19:27 > *Para:* r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > *Assunto:* Re: [R-br] (Transmissão ao vivo) Meetup R São Paulo Users > Group (IME-USP) Sexta 21 de agosto do 2015 > > Walmes, > > Agradeço o link. > > Tive dificuldades para acessar. E ainda não entendi o que aconteceu. > > Luiz Roberto. > > Luiz Roberto Martins Pinto > Prof. Pleno/DCET/UESC > Laboratório de Estatística Computacional > Universidade Estadual de Santa Cruz > Ilhéus-Bahia-Brasil > > luizroberto.uesc(a)gmail.com > skype: lrmpinto > http://lattes.cnpq.br/2732314327604831 > > > Em 21 de agosto de 2015 16:54, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > escreveu: > > Para os que não estiveram presentes, passaram por dificuldades ou querer > rever, o vídeo também está disponível em > https://www.youtube.com/watch?v=UgPX49gkby4. Caso interessar, o endereço > memorizável do canal é http://www.leg.ufpr.br/youtube, e o perfil na > Google+ é http://www.leg.ufpr.br/g+. > À disposição. > Walmes. > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > > -- > > Luis B. Sánchez > Ph.D Candidate > Dept. of Statistics-IME, University at São Paulo (USP) > São Paulo, BRAZIL > lsanchez(a)ime.usp.br > Skype: lbenitesanchez > Twitter: @lbenitesanchez > www.luis-benites.com/ > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- Manoel Galdino https://sites.google.com/site/galdinomcz/

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Classificador Bayesiano
by Jodavid Ferreira 26 Ago '15

26 Ago '15

Existe algum pacote no R para classificação baseada em decisão bayesiana? -- Jodavid Ferreira Mestrando em Estatística - Universidade Federal de Pernambuco - www.ufpe.br/ppge/ Bacharel em Estatística - Universidade Federal da Paraíba - www.de.ufpb.br Site Pessoal - http://blog.jodavidferreira.com Twitter - @JodavidFerreira <http://twitter.com/JodavidFerreira>

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Criar um novo shapefile à partir da seleção de áreas no shapefile original
by ASANTOS 26 Ago '15

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Caros listeiros, Tenho um shapefile com inúmeras áreas e gostaria de selecionar apenas duas e criar um novo shapefile, no entanto, quanto tento unir os dois polígonos e visualizar a seleção, recebo o erro: Erro em polypath(x = mcrds[, 1], y = mcrds[, 2], border = border, col = col, : Caminho gráfico inválido *Segue o caminho que estou trilhando:* #Arquivo shapefile original contorno_line_a <- readShapeLines ("completo.shp", proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south +datum=WGS84 +units=m +no_defs")) df.data = as.data.frame(contorno_line_a) # Seleciono o primeiro polígono df.serra15 = contorno_line_a[contorno_line_a$Link=='00496015',]## Seleciono um talhão no mapa inteiro contorno_serra15<- PolySet2SpatialPolygons(SpatialLines2PolySet(df.serra15), close_polys=TRUE) ## P1 = Polygon (contorno_serra15) # # Seleciono o segundo polígono df.serra16 = contorno_line_a[contorno_line_a$Link=='00496016',]## Seleciono um talhão no mapa inteiro contorno_serra16<- PolySet2SpatialPolygons(SpatialLines2PolySet(df.serra16), close_polys=TRUE) ## P2 = Polygon (contorno_serra16) # #União dos dois polígonos Ps1 = Polygons (list (P1,P2), ID = "t") # Crio uma estrutura em data frame dos polígonos espaciais SPs = SpatialPolygons (list(Ps1), proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south +datum=WGS84 +units=m +no_defs")) plot(SPs) SPDF = SpatialPolygonsDataFrame (SPs, data.frame (N = c ("t"), row.names = c("t"))) SPDF@data #Crio o novo shapefile writeOGR(SPDF, getwd(), 'parcial', 'ESRI Shapefile') # #Chamo o shapefile novo e visualizo contorno_line_b <- readShapeLines ("parcial.shp", proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south +datum=WGS84 +units=m +no_defs")) plot(contorno_line_b) # Alguém poderia me dar uma ajuda, Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Meetup R São Paulo Users Group (IME-USP) Sexta 4 e 18 de setembro do 2015
by Luis Benites Sánchez 24 Ago '15

24 Ago '15

Caros, O Meetup R São Paulo Users Group, iniciativa dos estudantes de Doutorado em Estatística do IME, Luis Benites Sánchez e Rocío Paola Maehara com a colaboração das professoras Viviana Giampioli e Márcia D'Elia Branco, anuncia a seguinte série de palestras do Meetup em R do mês de setembro (lembrar que temos atividades planejadas até o 4 de dezembro). Breve descrição do Meetup: As reuniões do Meetup R acontecerão geralmente duas vezes por mês, as sextas, das 14h às 16h. Em cada reunião teremos a apresentação de duas palestras com duração de 45 minutos cada e 10 minutos de perguntas. As palestras serão ministradas por professores e estudantes de pós-graduação de diversas universidades do interior como do exterior. A maioria de las serão online, mais também teremos algumas palestras presenciais. Para o mês de setembro a programação é a seguinte: *Sexta 4 de setembro (14h-16h)* - Conferências: 1) Uma introdução a Séries Temporais em R - Prof. Carlos Abanto Valle, Departamento de Métodos Estatísticos, Universidade Federal de Rio de Janeiro. 2) Uma Introdução ao Rcpp - Msc. Carlos Trucíos, Doutorado em andamento em Estatística, IMECC-UNICAMP. *Sexta 18 de setembro (14h-16h)* - Conferências: 1) Gauss Hermite Quadrature with Pruning - Prof. Freddy Hernández Barajas, Universidad Nacional de Colombia. 2) R Markdown - Prof. Fernando Mayer, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Paraná. Obs. As palestras serão transmitidas ao vivo pela USP e YouTube (os links de transmissão serão disponibilizados no site do meetup). As sessões são filmados (se os palestrantes concordar) e ditos vídeos serão disponibilizados no Canal de YouTube do Meetup. Para mais informações: Site: www.meetup.com/pt/useR-SP e-mail: meetuprsp(a)gmail.com Um abraço, Luis Benites Sánchez Organizador do São Paulo R Users Group

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