Maio 2020 - R-br - DINF UFPR

Dificuldades em substituição de programas
by Leonardo Luiz Calado 17 Mai '20

17 Mai '20

Caros Amigos, boa tarde. Estou com dificuldades, por ser iniciante no R, em conseguir substituir um pacote no mesmo de essencial funcionamento no meu escopo de trabalho. O pacote a ser 'rimage' já não consta nas instalações do R e mesmo os antigos não funcionam. Gostaria de saber se existe algum que substituiria o mesmo realizando o mesmo trabalho. Atualmente estou trabalhando fotos para morfometria geométrica em especies animais e necessito em suma manipular e transformar essas fotos estabelecendo coordenadas na imagem para landmarks, estabelecer escalas, transformar grids de deformação dentre outras coisas. Grande abraço a todos e muito obrigado LCalado PhD. Biotechnology in natural resources http://lattes.cnpq.br/2459740082072347 leonardocalado(a)hotmail.com 84-9 9931-1630

2 2

Dificuldade em instalar pacotes
by Marco Tadeu Gonçalves 13 Mai '20

13 Mai '20

Bom dia, Sou novo no R e estou com dificuldade na instalação de um pacote. Uso o Ubuntu 18.04 e também utilizo o Rstudio. O pacote que não consigo instalar é o devtools. Já tentei no script do Rstudio e também pelo terminal o comando install.packages, mas não funcionou, aparecendo a seguinte mensagem: 1: In install.packages("devtools") : installation of package ‘xml2’ had non-zero exit status 2: In install.packages("devtools") : installation of package ‘roxygen2’ had non-zero exit status 3: In install.packages("devtools") : installation of package ‘rversions’ had non-zero exit status 4: In install.packages("devtools") : installation of package ‘devtools’ had non-zero exit status Desde já agradeço. -- *Marco Tadeu Gonçalves - Professor EBTT* *Área de atuação: Matemática* Instituto Federal do Paraná Campus Avançado de Goioerê Rodovia BR 180 - Trevo da UEM s/n CEP: 87360-000 (44) 3522 - 5432

2 2

Informações para análises na nuvem.
by Ze Henrique 13 Mai '20

13 Mai '20

Bom dia Srs., estou necessitando realizar análises de um grande conjunto de dados só que estou sem servidor neste momento e meu computador não suporta. Gostaria de saber se os Srs. poderiam me recomendar alguma plataforma que tenha um preço acessível e posso realizar para realizar as análises pelo R. Desde já obrigado. -- *José Henrique Soler Guilhen* Doutor em Genética e Melhoramento Universidade Federal do Espírito Santo - CCAUFES [image: Mailtrack] <https://mailtrack.io?utm_source=gmail&utm_medium=signature&utm_campaign=sig…> Remetente notificado por Mailtrack <https://mailtrack.io?utm_source=gmail&utm_medium=signature&utm_campaign=sig…> 13/05/20 08:14:43

2 2

Pesquisa de artigos na área de Estatística
by Manasses Nóbrega 13 Mai '20

13 Mai '20

Boa noite, pessoal. Por conta de meus estudos, tenho utilizado nos últimos anos a plataforma PubMEd para busca de artigos científicos na área das "ciências da vida". Entretanto, surgiu a necessidade de pesquisar alguns temas da área de Estatística. Assim como no caso do PubMed, existe alguma plataforma específica para busca de artigos científicos na área de Estatística? Caso não haja, poderiam me indicar sites de busca específicos da área? Desde já agradeço a colaboração de vocês. Atenciosamente, Manasses -- *I am a brain, Watson. The rest of me is a mere appendix. * *(Sherlock Holmes)*

3 2

Atualizar pacotes R em outra versão
by Diogo Jerônimo 09 Mai '20

09 Mai '20

Bom dia!!! Talvez ridícula, mas não achei resposta. Quero atualizar meu R para outra versão (3.6.0 para 4.0.0). Tem um monte de libraries no anterior que não estão no atual, e que me darão muito trabalho de reinstalar, devido a quantidade. Pergunta: é possível instalar a versão nova, e fazer com que as libraries do antigo apareçam no atual? Obrigado!!! Diogo JerônimoBacharel em Ciências Estatísticas - ENCE/IBGEMestre em Metrologia - PUC-Rio/PósMQICONRE: 8514 - SÉRIE AEmail: diogojose21@yahoo.com.brhttp://lattes.cnpq.br/8996149312896520

8 9

Problema com a instalação de pacotes no R!
by Andre Oliveira 09 Mai '20

09 Mai '20

bom dia, mesmo depois de executar o R como administrador tenho alguns problemas para instalar alguns pacotes no R (nlme e lubridate entre outros). Alguma dica para solução deste problema? > install.packages("nlme") Installing package into 'C:/Users/andreoliveira/Documents/R/win-library/3.6' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/.../contrib/3.6/nlme_3.1-147.zip' Content type 'application/zip' length 2374568 bytes (2.3 MB) downloaded 2.3 MB package 'nlme' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: cannot remove prior installation of package 'nlme' Warning: restored 'nlme' The downloaded binary packages are in C:\Users\andreoliveira\AppData\Local\Temp\RtmpMH69CO\downloaded_packages Warning message: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) : problem copying C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\00LOCK\nlme\libs\x64\nlme.dll to C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\nlme\libs\x64\nlme.dll: Permission denied att,.André

4 4

Pacote Bipartite
by Sarah Reis 09 Mai '20

09 Mai '20

Olá pessoal, Estou realizando análises de interações ectoparasita-hospedeiro utilizando o pacote Bipartite. Utilizei a função dfun, porém, com o modelo padrão fornecido pelo pacote, sendo dfun(web,abuns=NULL), onde a abundância não é levada em consideração, só a frequência de interações. Agora, gostaria de refazer as análises levando em consideração a abundância dos ectoparasitas, contudo, quando insiro o vetor abundância, o R diz que "o comprimento do vetor não condiz com o número de espécies do nível trófico mais alto". Utilizo uma matriz de abundância do mesmo modelo da matriz de frequência utilizada para a análise. Já tentei inverter a matriz, mas o erro continua o mesmo. Alguém pode me ajudar? Desde já, muito obrigada! -- Sarah Fontes Reis Mestranda em Biologia Animal - UFV Bacharela em Ciências Biológicas - UFV Museu de Zoologia João Moojen Contato: (31)9-98993346 (wpp)

1 0

Re: [R-br] Atualizar pacotes R em outra versão
by sznelwar＠uol.com.br 07 Mai '20

07 Mai '20

3 2

Boxplot
by Alexandre Loures 07 Mai '20

07 Mai '20

Boa noite, Listeiros! Saberiam como adaptar meu script para criar um Boxplot igual ao da figura anexada? p <- ggplot (df, aes (type, lmean, fill = type)) + geom_boxplot () + scale_fill_viridis (discrete = TRUE, alpha = .6) + geom_jitter (color = 'black', size = 1, alpha = .9) + theme_ipsum () + theme (legend.position = 'none', plot.title = element_text (size = 11)) + ggtitle ('A boxplot with jitter') + xlab (' ') Seguem meus dados abaixo: dput (df) structure(list(Mean = c(14935404544, 15222448128, 38751113216, 14268438528, 14946194432, 15161123840, 9273937920, 9673856000, 14560262144, 17200879616, 3811098880, 7633272320, 290639968, 89202434048, 2005522432, 625789952, 1819531136, 2311044096, 1209199872, 296506752, 915887232, 2633880832, 488109632, 91674344, 694895872, 170653968, 586009152, 67529624, 2587323136, 66061892), type = c("gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "gmean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean", "mean"), lmean = c(23.4270003752245, 23.4460370258537, 24.380425320488, 23.3813158390422, 23.4277225513355, 23.4420003463391, 22.9504739289101, 22.992692825977, 23.4015618839485, 23.5682263599233, 22.0611834044475, 22.7557824657935, 19.4875958357754, 25.2141741636937, 21.4191704283524, 20.2545253328222, 21.3218446872636, 21.560965248974, 20.9132247150145, 19.5075805484868, 20.6354038058895, 21.6917241970269, 20.0060505943238, 18.3337531161829, 20.3592725678438, 18.9551484853174, 20.1888459651668, 18.0280769336398, 21.673889639965, 18.0061026181465)), datalabel = "", time.stamp = " 1 May 2020 12:05", formats = c("%9s", "%9.0g", "%9s"), types = c(5L, 254L, 5L), val.labels = c("", "", ""), var.labels = c("Reporter.ISO", "", ""), row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "29", "30"), version = 12L, class = "data.frame")Boxplot com dados experimentais plotados -- *Alexandre Loures* Professor Substituto Universidade Federal da Paraíba <https://ufpb.br> Pós-graduação em Economia - PPGE <https://sigaa.ufpb.br/sigaa/public/programa/portal.jsf?lc=pt_BR&id=1875> www.rodriguesloures.com

1 0

IC em tabelas de frequência
by Emerson Cotta Bodevan 07 Mai '20

07 Mai '20

Prezados, boa noite. Uma dúvida sobre como reproduzir alguns resultados de um artigo no R. O artigo tem o seguinte DOI: 10.1590/1980-549720190009 (Revista Brasileira de Epidemiologia). Tem-se uma amostra de 28427 indivíduos. Destes 17244 tem o habito de ler a bula de remédios (A) e 11183 (o restante) não tem este hábito (B). A dúvida é como obter a prevalência e o IC95% que eles conseguiram no artigo, a saber: (A) 59.6 (57.7 - 61.5) (B) 40.4 (38.5 - 42.5) Eu obtive os seguintes resultados: (A) 17244/28427 = 60.7 17244/28427-1.96*sqrt(17244/28427*(1-17244/28427)/28427) = 60.1 17244/28427+1.96*sqrt(17244/28427*(1-17244/28427)/28427) = 61.2 *60.7 (60.1 - 61.2)* (B) 11183/28427 = 39.3 11183/28427-1.96*sqrt(11183/28427*(1-11183/28427)/28427) = 38.8 11183/28427+1.96*sqrt(11183/28427*(1-11183/28427)/28427) = 39.9 *39.3 (38.8, 39.9)* Primeiro... o porquê das diferenças. Segundo... sugestão de material para leitura. E terceiro... como fazer isso no R? Há algum pacote pronto? Qualquer ajuda será bem vinda. Obrigado. *Emerson*

2 2