Abril 2020 - R-br - DINF UFPR

[OFF -Tópic] Cotas em concursos para negros e índios!
by Andre Oliveira 12 Jun '49

12 Jun '49

Pessoal, tem um colegar meu que vou fazer um concurso ele é descendente de negro ele é pardo. Ele veio com a pergunta como provar que sou negro, pois, tem vagas reservada para negros e índios? Eu sinceramente não sei e não tenho ideia pois nunca tive esta curiosidade. O que de fato comprova sua raça? Algum documento? O que são usados em concursos para provar? obrigado André Oliveira Souza

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Legenda eixo X
by Luciano F. Sgarbi 10 Jun '49

10 Jun '49

Prezados, Estou tentando centralizar a legenda do eixo X em uma figura com vários gráficos. Estou conseguindo centralizar a legenda da linha inferior como no exemplo, mas as linhas do meio não. par(mfrow=c(2,2)) plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 1",outer=TRUE) ### o problema está aqui, pois a legenda desce para a parte inferior da figura. plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 2",outer=TRUE)## Esse dá certo Alguém podia dar uma luz de como eu posso fazer isso? Abraços -- *Luciano F. Sgarbi* Mestrando em Ecologia e Evolução Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222) Departamento de Ecologia Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1 Universidade Federal de Goiás, campus II Goiânia-GO 74001-970 Brazil

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Duvidas Análise de Componentes Principais
by Fernando Souza 09 Dez '20

09 Dez '20

Olá pessoal tudo bem Estou realizando uma análise de componentes principais, com o objetivo de selecionar as melhores variáveis para uma análise multivariada. Gostaria de uma orientação sobre a interpretação. Eu interpretei de forma correta? Variáveis que possuem alta correlação com um CP também estão correlacionadas entre si. Isso significa que posso utilizar somente uma das principais variáveis do CP1 (por exemplo) para incluir no modelo multivariado? No caso a variável que apresentar significado para o trabalho. Os círculos de correlação, screem plot e corrplot geradas pelo Pca estão disponíveis no link https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks A interpretação que fiz foi a seguinte: Considerei as variáveis PC,IC e Prod leite (Azul no gráfico) como variável suplementar quantitativa. Baseado no ScreenPlot selecionei somente 5 CP para avaliação que explicaram 67,80% da variancia total. Pela minha interpretação cheguei as seguintes conclusões Principais variáveis para cada componente: Consumos (CP1): CMS,CMO,CPB,CEE,CCNF,CFDNcp,CFDA,CNDT,CEB,CED,CEM,CEL Energia (CP2) : EB,ED,EM,EL Peso (CP3): PV,PCJ,PCVZ,PCVZ075 Composição do Leite(CP4) : Solido e DCNF Variaveis sanguíneas (CP5): PT e ALBUMINA Segue uma descrição do trabalho para compreensão. Aceito sugestões sobre a melhor forma trabalhar esses dados O banco de dados é oriundo dois estudos realizados pelo mesmo grupo de pesquisa nas mesmas condições experimentais (animais,instalação,dieta,manejo) e avaliaram 48 variáveis. Os fatores experimentais foram: *Raça*: Estudo 1 avaliou 12 animais (6 raça1 e 6 da raça 2). O estudo 2 avaliou 13 animais (6 raça 1 e 7 raça 2) *Plano nutricional:* O estudo 1 avaliou os níveis (0,15,30) o estudo 2 avaliou os níveis (0,5,10,20) *Dias em lactação-DEL* (medidas repetidas no tempo): Estudo 1, dias dispersos entre os períodos de 30 a 120 dias. No estudo 2 os DEL foram avaliados em dias entre 150 a 250 dias. Eu realizei uma análise gráfica e não há indicações de haver diferenças entre estudos, o que era de certo modo esperado. Raça e DEL parecem ser os fatores que afetam as variáveis respostas. -- ========================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal Celular: (31)99796-8781 (Vivo) E-mail:nandodesouza@gmail.com <e-mail%3Anandodesouza(a)gmail.com> Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307 Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ==========================================

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Pesquisa de artigos na área de Estatística
by Manasses Nóbrega 13 Mai '20

13 Mai '20

Boa noite, pessoal. Por conta de meus estudos, tenho utilizado nos últimos anos a plataforma PubMEd para busca de artigos científicos na área das "ciências da vida". Entretanto, surgiu a necessidade de pesquisar alguns temas da área de Estatística. Assim como no caso do PubMed, existe alguma plataforma específica para busca de artigos científicos na área de Estatística? Caso não haja, poderiam me indicar sites de busca específicos da área? Desde já agradeço a colaboração de vocês. Atenciosamente, Manasses -- *I am a brain, Watson. The rest of me is a mere appendix. * *(Sherlock Holmes)*

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Problema com a instalação de pacotes no R!
by Andre Oliveira 09 Mai '20

09 Mai '20

bom dia, mesmo depois de executar o R como administrador tenho alguns problemas para instalar alguns pacotes no R (nlme e lubridate entre outros). Alguma dica para solução deste problema? > install.packages("nlme") Installing package into 'C:/Users/andreoliveira/Documents/R/win-library/3.6' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/.../contrib/3.6/nlme_3.1-147.zip' Content type 'application/zip' length 2374568 bytes (2.3 MB) downloaded 2.3 MB package 'nlme' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: cannot remove prior installation of package 'nlme' Warning: restored 'nlme' The downloaded binary packages are in C:\Users\andreoliveira\AppData\Local\Temp\RtmpMH69CO\downloaded_packages Warning message: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) : problem copying C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\00LOCK\nlme\libs\x64\nlme.dll to C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\nlme\libs\x64\nlme.dll: Permission denied att,.André

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Re: [R-br] Problema com a instalação de pacotes no R!
by Andre Oliveira 27 Abr '20

27 Abr '20

Oi Rodrigo, obrigado pelas ponderações! Faz poucos dias que coloquei a versão do R mais nova na tentativa de resolução do problema e alguns destes pacotes não estão instalados e tem o mesmo problema! att,.André Em segunda-feira, 27 de abril de 2020 09:27:54 BRT, Rodrigo Araujo e Castro <webyard1(a)yahoo.com.br> escreveu: Bom dia André, Inicialmente eu sugiro desinstalar manualmente esses pacotes com o "uninstall.packages()" e te tentar novamente a instalação. Uma atualização de todos os pacotes e do R (e do R Studio se você usa) pode ajudar também, pois algo pode ter sido corrigido nos últimos patches. Se nada disso funcionar, reinstalar o R não costuma dar tanto trabalho e não afeta seu trabalho já feito, já que você não perde nada. Se alguma dessas dicas resolver, avise. Rodrigo Sent from Yahoo Mail on Android On Mon, Apr 27, 2020 at 9:11, Andre Oliveira por (R-br)<r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: bom dia, mesmo depois de executar o R como administrador tenho alguns problemas para instalar alguns pacotes no R (nlme e lubridate entre outros). Alguma dica para solução deste problema? > install.packages("nlme") Installing package into 'C:/Users/andreoliveira/Documents/R/win-library/3.6' (as 'lib' is unspecified) tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/.../contrib/3.6/nlme_3.1-147.zip' Content type 'application/zip' length 2374568 bytes (2.3 MB) downloaded 2.3 MB package 'nlme' successfully unpacked and MD5 sums checked Warning: cannot remove prior installation of package 'nlme' Warning: restored 'nlme' The downloaded binary packages are in C:\Users\andreoliveira\AppData\Local\Temp\RtmpMH69CO\downloaded_packages Warning message: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) : problem copying C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\00LOCK\nlme\libs\x64\nlme.dll to C:\Users\andreoliveira\Documents\R\win-library\3.6\nlme\libs\x64\nlme.dll: Permission denied att,.André _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

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Subset a data.frame com base no valor absoluto de uma coluna
by Marcelo Laia 26 Abr '20

26 Abr '20

Prezado(a), Tenho o seguinte problema: data <- replicate(5, rnorm(10)) colnames(data) <- paste("Sample", c(1:ncol(data))) rownames(data) <- paste("Gene", c(1:nrow(data))) head(data) Sample 1 Sample 2 Sample 3 Sample 4 Sample 5 Gene 1 -1.29177540 2.61720282 -0.64705357 -2.05636255 0.5752323 Gene 2 -1.20619719 1.13791932 1.12844157 -0.04053514 1.2973240 Gene 3 -0.15952476 -0.56391140 -1.34226004 -1.21020574 -1.1353717 Gene 4 1.58893451 -1.33082381 0.02267418 1.42659928 2.2377680 Gene 5 -0.56417983 -0.14454059 -0.14543579 0.43021823 -1.1564112 Gene 6 -0.01443123 0.08013149 0.44877039 -0.38360173 1.7286058 Gene 7 -0.40133700 -0.84755154 -1.05251409 1.87298617 0.7788947 Gene 8 -1.81773166 -1.50967753 0.30168885 1.06245963 0.2409281 Gene 9 -2.27682903 0.83455263 -0.93035283 -0.49503281 -0.7293654 Gene 10 -0.19309118 -0.84698014 -0.12649364 -1.32398348 1.3218277 Eu desejo fazer um subset em um novo data.frame com os dados das colunas 1 e 2 (Sample 1 e Sample 2) baseados no valor absoluto da coluna 4 (Sample 4). Eu tentei o seguinte: mydata <- subset(data, (data[ ,4]>abs(1.3))) mydata Sample 1 Sample 2 Sample 3 Sample 4 Sample 5 Gene 4 1.588935 -1.3308238 0.02267418 1.426599 2.2377680 Gene 7 -0.401337 -0.8475515 -1.05251409 1.872986 0.7788947 No entanto, neste primeiro passo ele só pega os positivos da coluna 4 que são maiores que 1,3. Os valores negativos maiores que módulo de -1,3 são todos excluídos. No segundo passo eu excluiria as colunas 3, 4 e 5. myvars <- colnames(mydata) %in% c("Sample 3", "Sample 4", "Sample 5") mydata2 <- mydata[!myvars] Como não consegui obter o primeiro passo, o segundo também não rodou. Obrigado -- Marcelo

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Manter o R atualizado no linux mint 9.3
by Emerson Cotta Bodevan 24 Abr '20

24 Abr '20

Pessoal não estou obtendo sucesso para manter o R atualizado no linux mint 9.3. O que estou fazendo: Adicionei o repositório deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ pelo synaptic Quando pedi para recarregar aconteceu o seguinte erro ##### Não foi possível baixar todos os índices de repositórios O repositório pode não estar mais disponível ou pode não ter sido possível entrar em contato com o mesmo devido a problemas de rede. Caso esteja disponível, uma versão mais antiga do índice que falhou será usada. Senão o repositório será ignorado. Verifique sua conexão de rede e certifique-se de que o endereço do repositório esteja correto nas preferências. The repository 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Release' does not have a Release file. ###### Depois disso minha intenção é instalar o pacote Rcmdr, pois com a versão atual do R 3.4.4 está ocorrendo o seguinte erro: #### > install.packages("Rcmdr") Installing package into ‘/home/ecbodevan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’ (as ‘lib’ is unspecified) Warning message: package ‘Rcmdr’ is not available (for R version 3.4.4) #### Alguém poderia me ajudar? *Emerson*

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Rotina: interferência de plantas daninhas
by Cleiton Fernando Barbosa Brito 22 Abr '20

22 Abr '20

Boa tarde, Alguém poderia disponibilizar uma rotina sobre a determinação dos períodos críticos de interferência de plantas daninhas. Cleiton Fernando Barbosa Brito

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Regressão Logística pode ser influenciada pelo balanceamento de resultados de variável dependente
by Elias Carvalho 22 Abr '20

22 Abr '20

Tenho um banco de dados com 3074 linhas sem missing. Uma variável dependente binária e mais 42 variáveis independentes também binárias (todas como fator). Minha pergunta é quals VIs contribuem para a doença que está em VD. Meu summary da VD apresenta o seguinte resultado: summary(data.to.work.train$NMM) Sem doença Com doença 2715 359 removi as variáveis com alta correlação (multicolinearidade) e fiz uma RL com todas as variáveis e nada deu signficativo. Fiz tambem com variáveis individuais e nada de significativo. A maioria das variáveis apresenta uma prevalência pequena da doença: Não Sim Não 2683 32 Sim 353 6 Alguém poderia opinar sobre uma possível solução? Ou outros passos a seguir? -- *In Jesu et Maria* *Obrigado* *Prof. Elias Carvalho* *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"*

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