Novembro 2019 - R-br

Última Versão do R em ambiente Linux
by Eduardo Bearzoti 12 Nov '19

12 Nov '19

Prezados colegas: Utilizo o sistema operacional linux (Linux Mint 18.3), e gostaria (precisaria) muito de utilizar o R mais novo, versão 3.6. Embora use o Mint 18.3, tentei seguir as instruções deste link sugeridas para instalar o R no Mint 19, mas não deu certo. Após seguir as instruções, ao rodar: sudo apt-get install r-baseobtive: Os pacotes a seguir têm dependências desencontradas: r-base : Depende: r-base-core (>= 3.6.1-3bionic) mas não será instalado Depende: r-recommended (= 3.6.1-3bionic) mas não será instalado E: Impossível corrigir problemas, você manteve (hold) pacotes quebrados. E ao tentar rodar, por exemplo:sudo apt-get install r-base-coreobtive: Os pacotes a seguir têm dependências desencontradas: r-base-core : Depende: libc6 (>= 2.27) mas 2.23-0ubuntu11 está para ser instalado Depende: libcurl4 (>= 7.28.0) mas não é instalável Depende: libicu60 (>= 60.1-1~) mas não é instalável Depende: libreadline7 (>= 6.0) mas não é instalável E: Impossível corrigir problemas, você manteve (hold) pacotes quebrados. Parece-me assim que instalar a versão mais nova do R não é trivial, pois dependeria de bibliotecas que não estão disponíveis em minha versão do Mint. Como acredito que haja colegas aqui que também têm o Linux como sistema operacional, gostaria de consultá-los, se têm conseguido utilizar a versão mais nova do R, ou se isto realmente não é possível. Qualquer dica/informação será muito bem vinda. Abraços a todos,Eduardo. | | | | | | | | | | | How to Install R on Linux Mint 19 | Linux4one Table of ContentsPrerequisitesInstalling R on Linux MintRun Simple Hello World Program In RConclusion Install R ... | | | ******************************************** Prof. Eduardo Bearzoti Universidade Federal de Ouro Preto Departamento de Estatística - ICEB Campus Morro do Cruzeiro, s/n 35400-000 - Ouro Preto, MG, Brasil

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densidade de uma variável
by Nilson Guiotoku 11 Nov '19

11 Nov '19

Pessoal, Estou com uma dúvida sobre a aplicação da função density, em um banco de dados de uma distribuição normal. Após fazer uma transformação encontrando o score (componente principal), ao aplicar a função density, eu esperava que os valores deveriam variar de 0 a 1. Plotei até o histograma da densidade. Por que a densidade não está no intervalo 0 a 1? Gerei um código reproduzível, porém, minha variável que estou aplicando, não necessariamente é exatamente uma variável normal. set.seed(23) X = cbind( 1:230, rnorm(230, 450, 20)) X[,2] <- (X[,2] - min(X[,2]))/(max(X[,2])-min(X[,2])) #plot(X) X[,1] <- X[,1]-mean(X[,1]) X[,2] <- X[,2]-mean(X[,2]) C <- cov(X) E <- eigen(C) score <- X %*% E$vectors densidade = density(score[,2], n=100) # os valores da densidade não estão dentro do intervalo [0,1] a = hist(score[,2], freq = F) lines(densidade)

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 107, assunto 7
by Vanessa Gomes 07 Nov '19

07 Nov '19

ah ótimo! Já deu pra entender. Muito obrigada. *Vanessa Matos Gomes* *Laboratório de Ecologia Evolutiva e Biodiversidade* Departamento de Ecologia, Genética e Evolução Instituto de Ciências Biológicas UFMG - Brasil *Ecosystem Restoration and Intervention Ecology * School of Biological Science University of Western Australia Em qui., 7 de nov. de 2019 às 22:00, <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > Enviar submissões para a lista de discussão R-br para > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou > corpo da mensagem para > r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo > endereço > r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br > > Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será > mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." > > > Tópicos de Hoje: > > 1. Re: Dúvida de 'warning message' (Cesar Rabak) > > > ---------------------------------------------------------------------- > > Message: 1 > Date: Wed, 6 Nov 2019 15:00:53 -0300 > From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> > To: a lista Brasileira oficial de discussÃ£o do programa R. > <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> > Subject: Re: [R-br] Dúvida de 'warning message' > Message-ID: > <CAKrF98nhAu8hnzfXocqKyY5Jgnrvfz= > UG0hK96vnoMLaBfFx9A(a)mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8" > > Você entende o mecanismo de criação de "postos" (*ranks* em inglês)? > > Quando dois ou mais deles têm a mesma posição devido ao cálculo como é > feito, você tem o *empate*. > > Caso você precise aprofundar, um livro texto de Estatística tem o material > para esclarecer esse assunto. > > HTH > -- > Cesar Rabak > > > On Wed, Nov 6, 2019 at 3:08 AM Vanessa Gomes por (R-br) < > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > > > Olá pessoal, > > > > após rodar correlação de Spearman no R, recebi a seguinte warning > message: In > > cor.test.default(EEG, DP, method = "spearman") : Impossível calcular o > > valor exato de p com empates > > > > Alguém sabe me dizer o que isso significa? > > > > Obrigada. > > > > *O que rodei foi:* > > > > > plot(EEG,DP) > > > cor(EEG,DP,method = "spearman") > > [1] 0.3688426 > > > cor.test(EEG,DP,method = "spearman") > > > > Spearman's rank correlation rho > > > > data: EEG and DP > > S = 6728.1, p-value = 0.01918 > > alternative hypothesis: true rho is not equal to 0 > > sample estimates: > > rho > > 0.3688426 > > > > Warning message: > > In cor.test.default(EEG, DP, method = "spearman") : > > Impossível calcular o valor exato de p com empates > > > > > > *Vanessa Matos Gomes* > > > > *Laboratório de Ecologia Evolutiva e Biodiversidade* > > Departamento de Ecologia, Genética e Evolução > > Instituto de Ciências Biológicas > > UFMG - Brasil > > *Ecosystem Restoration and Intervention Ecology * > > School of Biological Science > > University of Western Australia > > _______________________________________________ > > R-br mailing list > > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > > código mínimo reproduzível. > > > -------------- Próxima Parte ---------- > Um anexo em HTML foi limpo... > URL: < > http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20191106/808f721a/atta… > > > > ------------------------------ > > Subject: Legenda do Digest > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > > > ------------------------------ > > Fim da Digest R-br, volume 107, assunto 7 > ***************************************** >

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Dúvida de 'warning message'
by Vanessa Gomes 06 Nov '19

06 Nov '19

Olá pessoal, após rodar correlação de Spearman no R, recebi a seguinte warning message: In cor.test.default(EEG, DP, method = "spearman") : Impossível calcular o valor exato de p com empates Alguém sabe me dizer o que isso significa? Obrigada. *O que rodei foi:* > plot(EEG,DP) > cor(EEG,DP,method = "spearman") [1] 0.3688426 > cor.test(EEG,DP,method = "spearman") Spearman's rank correlation rho data: EEG and DP S = 6728.1, p-value = 0.01918 alternative hypothesis: true rho is not equal to 0 sample estimates: rho 0.3688426 Warning message: In cor.test.default(EEG, DP, method = "spearman") : Impossível calcular o valor exato de p com empates *Vanessa Matos Gomes* *Laboratório de Ecologia Evolutiva e Biodiversidade* Departamento de Ecologia, Genética e Evolução Instituto de Ciências Biológicas UFMG - Brasil *Ecosystem Restoration and Intervention Ecology * School of Biological Science University of Western Australia

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(sem assunto)
by Jersiton Tiago Pereira Matos 04 Nov '19

04 Nov '19

Bom dia, prezados. Tenho uma dúvida, é possível remover valores repetidos em uma coluna dado um critério de uma outra coluna do mesmo dataframe? att. Jersiton Mattos

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Design of Experiments: replicatas no ponto central e intervalo de confiança
by Nei 03 Nov '19

03 Nov '19

Prezados e Prezadas, Estou estudando Planejamento Fatorial Completo de 2 níveis. Fiz um planejamento completo para 4 fatores em 2 níveis e para isso fiz 16 experimentos (2^4), sem replicatas. Agora pretendo fazer 3 replicatas no ponto central para estimar o desvio padrão e a partir daí calcular o intervalo de confiança e avaliar a significância dos parâmetros do modelo. Mas estou com dificuldades para encontrar um tutorial explicando como calcular o erro padrão e como definir o número de graus de liberdade para o valor de t para poder calcular o intervalo de confiança. Alguém saberia me dar uma dica? Obrigado, Nei

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derivada da densidade de probabilidade
by Nilson Guiotoku 02 Nov '19

02 Nov '19

Pessoal, eu tenho uma variável que segue uma distribuição bimodal, e eu preciso encontrar o melhor ponto que separa essas bimodais, de forma lógica matematicamente. Então eu pensei em gerar a curva de densidade e encontrar a derivada dessa curva. O local em que a derivada for zero eu teria o valor critico e também o ponto de mínimo, portanto, o melhor valor para determinar o corte e encontrar os dois grupos distintos. Como encontrar a derivada primeira e segunda da densidade? # Código mínimo executável: X = c(rnorm(100, 10, 3), rnorm(50, 40, 5)) # Variável bimodal hist(X, freq = F) denfuncao = density(X) lines(denfuncao, lwd = 2) # como encontrar a derivada de uma curva se não conheço a função de # densidade? deriv(expr = denfuncao$x, namevec = denfuncao$x)

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Analise conjunta R
by Jose Wellingthon Dos Santos 01 Nov '19

01 Nov '19

Prezado prof Walmes, bom dia. Em uma análise conjunta que fiz, a interação Cultivar x Local foi significativa. Precisa desdobrá-la e aplicar o teste Skott-Knott nas medias de cultivar dentro de cada Local. Como fazê-lo? Att -- José Wellingthon dos Santos Pesquisador - Métodos Quantitativos Embrapa Algodão Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) Campina Grande, PB jose-wellingthon.santos(a)embrapa.br Telefone: +55 (83) 3182-4401 | Fax: +55 (83) 3182-4367 www.embrapa.br/algodao | https://twitter.com/embrapa_algodao Confira também: www.facebook.com/agrosustentavel ____________________________________________________________________________ Aviso de confidencialidade Esta mensagem da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), empresa publica federal regida pelo disposto na Lei Federal no. 5.851, de 7 de dezembro de 1972, e enviada exclusivamente a seu destinatario e pode conter informacoes confidenciais, protegidas por sigilo profissional. Sua utilizacao desautorizada e ilegal e sujeita o infrator as penas da lei. Se voce a recebeu indevidamente, queira, por gentileza, reenvia-la ao emitente, esclarecendo o equivoco. Confidentiality note This message from Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), a government company established under Brazilian law (5.851/72), is directed exclusively to its addressee and may contain confidential data, protected under professional secrecy rules. Its unauthorized use is illegal and may subject the transgressor to the law's penalties. If you are not the addressee, please send it back, elucidating the failure.

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