Dezembro 2016 - R-br

[OFF -Tópic] Cotas em concursos para negros e índios!
by Andre Oliveira 12 Jun '49

12 Jun '49

Pessoal, tem um colegar meu que vou fazer um concurso ele é descendente de negro ele é pardo. Ele veio com a pergunta como provar que sou negro, pois, tem vagas reservada para negros e índios? Eu sinceramente não sei e não tenho ideia pois nunca tive esta curiosidade. O que de fato comprova sua raça? Algum documento? O que são usados em concursos para provar? obrigado André Oliveira Souza

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Legenda eixo X
by Luciano F. Sgarbi 10 Jun '49

10 Jun '49

Prezados, Estou tentando centralizar a legenda do eixo X em uma figura com vários gráficos. Estou conseguindo centralizar a legenda da linha inferior como no exemplo, mas as linhas do meio não. par(mfrow=c(2,2)) plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 1",outer=TRUE) ### o problema está aqui, pois a legenda desce para a parte inferior da figura. plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 2",outer=TRUE)## Esse dá certo Alguém podia dar uma luz de como eu posso fazer isso? Abraços -- *Luciano F. Sgarbi* Mestrando em Ecologia e Evolução Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222) Departamento de Ecologia Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1 Universidade Federal de Goiás, campus II Goiânia-GO 74001-970 Brazil

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dose-resposta
by Maurício Lordêlo 27 Jan '17

27 Jan '17

Caros, Foi realizado um experimento no qual deseja-se saber qual composto extraído de uma determinada espécie vegetal é mais eficiente para matar uma determinado tipo de inseto. Foram utilizadas 32 placas cada uma contendo 10 insetos vivos. Em cada placa, foram realizadas 4 repetições das 8 diferentes doses do composto de cada espécie. O número de insetos mortos foi registrado após um determinado período de tempo. O objetivo é encontrar qual a dose, para cada um das três espécies, que mata 50% dos insetos. Alguma sugestão de como encontrar os modelos para as três espécies? dose = rep(c(0,0.15625,0.31250,0.62500,1.2500, 2.5000, 5.0000, 10.000), each=4) n_insetos = rep(10,32) m_especie1 = c(1,3,4,0,5,2,5,5,4,4,2,2,0,3,3,5,10,10,7,0,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10) m_especie2 = c(0,3,4,4,1,0,4,0,0,1,0,0,3,2,0,3,3,2,0,3,3,3,3,6,9,4,7,2,10, 10, 10, 10) m_especie3 = c(4,2,2,3,4,6,8,6,4,6,6,5,5,9,5,8,10,8,5,5,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10,10) pm_especie1 = m_especie1/n_insetos pm_especie2 = m_especie2/n_insetos pm_especie3 = m_especie3/n_insetos dose.fator = as.factor(dose) boxplot(pm_especie1~dose.fator, xlab= "Dose", ylab="Proporção de mortos espécie 1",cex.axis=.85) boxplot(pm_especie2~dose.fator, xlab= "Dose", ylab="Proporção de mortos espécie 2",cex.axis=.85) boxplot(pm_especie3~dose.fator, xlab= "Dose", ylab="Proporção de mortos espécie 3",cex.axis=.85) bartlett.test(pm_especie1~dose.fator) bartlett.test(pm_especie2~dose.fator) bartlett.test(pm_especie3~dose.fator) modelo1 = glm(cbind(good=m_especie1, bad=n_insetos-m_especie1)~dose,family="binomial", data=dados) par(mfrow=c(2,2)) plot(modelo1) shapiro.test(modelo1$residuals) modelo2 = glm(cbind(good=m_especie2, bad=n_insetos-m_especie2)~dose,family="binomial", data=dados) par(mfrow=c(2,2)) plot(modelo2) shapiro.test(modelo2$residuals) modelo3 = glm(cbind(good=m_especie3, bad=n_insetos-m_especie3)~dose,family="binomial", data=dados) par(mfrow=c(2,2)) plot(modelo2) shapiro.test(modelo3$residuals)

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Modelo linear com autocorrelação
by Paulo Dick 02 Jan '17

02 Jan '17

Caros colegas, Gostaria da ajuda de vocês com um problema, que tem um pouco de novidade para mim. Possuo uma série de 19 resultados agregados por trimestre, para os quais espero que haja uma estrutura de correlação temporal. Gostaria de fazer um modelo linear que relacione a variável y (média de rendimentos) às variáveis x1 (medida derivada do salário mínimo) e x2 (medida derivada do PIB). Pensei em fazer um autorregressivo de ordem 1, de acordo com a estrutura a seguir (omiti algumas passagens das saídas): dados <- structure(list(periodo = structure(1:19, .Label = c("2012_01", "2012_02", "2012_03", "2012_04", "2013_01", "2013_02", "2013_03", "2013_04", "2014_01", "2014_02", "2014_03", "2014_04", "2015_01", "2015_02", "2015_03", "2015_04", "2016_01", "2016_02", "2016_03"), class = "factor"), y = c(733.384601, 744.827647, 753.5034207, 753.1709712, 768.7507878, 777.6006481, 791.1782806, 791.9151729, 811.0964066, 780.0872518, 767.3666407, 793.1892722, 812.0534955, 797.8992735, 786.6962087, 776.6167214, 781.8815115, 778.9038465, 783.0461686), x1 = c(8.569195652, 8.466388156, 8.389005478, 8.243063605, 8.786043379, 8.665048836, 8.619304392, 8.494686625, 8.877923393, 8.69843061, 8.641290323, 8.512972168, 8.971745386, 8.727847168, 8.587190411, 8.386888367, 9.078997556, 8.915777833, 8.8), x2 = c(163.19, 167.97, 173.63, 171.91, 167.62, 174.71, 178.42, 176.29, 173.51, 174.02, 177.27, 175.74, 170.41, 168.87, 169.24, 165.62, 161.17, 162.82, 164.38)), .Names = c("periodo", "y", "x1", "x2"), row.names = c(NA, -19L), class = "data.frame") > # Modelo sem correlacao *> summary(lm(log(y) ~ x1 + x2, data = dados))* [...] Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) 5.4405431 0.3047514 17.852 5.47e-12 *** x1 0.0884444 0.0234849 3.766 0.00169 ** x2 0.0026444 0.0009688 2.730 0.01484 * --- Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 > # Modelo com correlacao *> summary(gls(log(y) ~ x1 + x2, data = dados, correlation = corARMA(p=1)))* [...] Correlation Structure: AR(1) Formula: ~1 Parameter estimate(s): Phi 0.8897408 Coefficients: Value Std.Error t-value p-value (Intercept) 6.025572 0.3182184 18.935334 0.0000 x1 0.042154 0.0168588 2.500400 0.0237 x2 0.001515 0.0012822 1.181606 0.2546 Estranhei a diferença relativamente grande nos coeficientes estimados do modelo a partir da inclusão. Graficamente, testei fazer apenas com x1 e o modelo pareceu não ter ajuste "bom". plot(log(y) ~ x1, dados); abline(gls(log(y) ~ x1, data = dados, correlation = corARMA(p=1)), col="blue") Ficou então a dúvida se procedi corretamente na sintaxe do modelo (ou na definição do modelo?). O que acham? Agradeço desde já. Abraços *Paulo Dick* Estatístico / Epidemiologia em Saúde Pública Tel.: (55 21) 99591-2716

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RStudio para criar e testar pacotes
by Elias Carvalho 01 Jan '17

01 Jan '17

Ola Pessoal Tenho usado o RStudio versão 1.0.39 e Roxygen2 versão 5.0.1 para criar e documentar um pacote, porém estou enfrentando os seguintes erros de forma aleatória quando tento executar meu pacote. - 'data' must be of a vector type, was 'NULL' quando passo um dataframe como parametro para a função, o estranho aqui é que hora funciona e hora dá esse erro - Error in fetch(key) : lazy-load database '......descopl.rdb' is corrupt, mesmo comentário A poucos dias atras rodava tudo certinho. Alguém usa RStudio para criar e documentar pacotes, me parece que ele anda instável ? O que recomendam ? ps:Uso linux Mint 18 Sara com interface Cinamon ( Mutter (Muffin)) -- *In Jesu et Maria* *Obrigado* *Prof. Elias Carvalho* *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"*

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Bundle - Aplicativos em Shiny
by leodesouza10＠hotmail.com 31 Dez '16

31 Dez '16

Bom dia pessoal!! Estou com problemas na hora de upar a pasta do meu aplicativo para os servidores do shinyapps.io. O banco de dados que o aplicativo analisa foi upado conjuntamente com o UI e o SERVER da aplicação, o banco de dados está em formato CSV e funciona perfeitamente. O problema é que meu aplicativo usa mapas, e quando eu tento upar os arquivos da shapefiles do mapa para o servidor do shiny aparece os seguintes erros: Error: Unhandled Exception: Child Task 320015626 failed: Error parsing manifest: Bundle does not contain manifest file: www/MUNICIPIOS_polígonos.txt Error: Unhandled Exception: Child Task 320015627 failed: Error parsing manifest: Bundle does not contain manifest file: www/MUNICIPIOS_polígonos.prj Error: Unhandled Exception: Child Task 320015628 failed: Error parsing manifest: Bundle does not contain manifest file: www/MUNICIPIOS_polígonos.shp Error: Unhandled Exception: Child Task 320015629 failed: Error parsing manifest: Bundle does not contain manifest file: www/MUNICIPIOS_polígonos.shx Com isso, o aplicativo não chega a ser enviado completamente, consequentemente não funciona. O único jeito de fazer o upload funcionar é tirando todos os arquivos shapefiles da pasta do aplicativo e depois reenviar. Por favor me ajudem, não consigo resolver isso em canto nenhum, já tentei entrar em contato com os administradores do site shinyapps.io e não obtive resposta. LINK DO APLICATIVO (SEM MAPAS): https://ovgam.shinyapps.io/ovgam/ _____________________________________ Sent from http://r-br.2285057.n4.nabble.com

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R companies
by Felipe Barletta 30 Dez '16

30 Dez '16

Para quem ainda acha que o R é usado apenas na academia. http://www.listendata.com/2016/12/companies-using-r.html?m=1&_utm_source=1-…

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Re: [R-br] Digest R-br, volume 72, assunto 26
by marcos paulo 30 Dez '16

30 Dez '16

Olá Walmes, bom dia! Grato pela sugestão, a modificação deu certo. Abraço. Att., Marcos Paulo Técnico Agrícola em Zootecnia Bacharel em Agronomia Mestrando em Produção Vegetal - Universidade Federal de Goiás Estagiário de Pós-Graduação da Embrapa Arroz e Feijão/CNPAF-Santo Antônio de Goiás-GO Contato: (62) 85075783 http://lattes.cnpq.br/4322347592884852 ________________________________ De: R-br <r-br-bounces(a)listas.c3sl.ufpr.br> em nome de r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> Enviado: sexta-feira, 30 de dezembro de 2016 12:00 Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Digest R-br, volume 72, assunto 26 Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Re: Atualização da função cld() (Walmes Zeviani) 2. Re: R companies (Cesar Rabak) 3. Re: R companies (Leonardo Aguirre) 4. Re: RStudio para criar e testar pacotes (Karina Rebuli) 5. Proxy RStudio (Emilio Higashikawa) 6. Re: Proxy RStudio (Karina Rebuli) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Thu, 29 Dec 2016 14:11:39 -0200 From: Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> To: marcos paulo <marcospaulo_agronomo(a)hotmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Atualização da função cld() Message-ID: <CAFU=EkaF6sWEiFw1vSf-Je3qhK6umH4j017W6FMRJB1qNTEHQA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Marcos, Eu não sei te dizer o que mudou na mulcomp::cld() mas na época dessa matéria ela devia funcionar. Para situações semelhantes a essa do fatorial, eu acabei fazendo uma cópia da cld() e modifiquei algumas coisas para que pudesse usá-la. Ela está disponível no fonte de um pacote onde mantenho uma miscelânea de funções: github.com/walmes/wzRfun. O código abaixo usa a cld2() que é a cópia que mencionei. # source(" https://raw.githubusercontent.com/walmes/wzRfun/master/R/pairwise.R") # cld2(c0) # Função disponível no pacote wzRfun: github.com/walmes/wzRfun. cld2 <- function(object, level = 0.05) { lvl_order <- unique(unlist( strsplit(rownames(object$linfct), "-"))) signif <- (object$test$pvalues < level) ret <- list() ret$signif <- signif ret$comps <- do.call(rbind, strsplit(rownames(object$linfct), "-")) # Modificação feita aqui. ret$mcletters <- multcomp:::insert_absorb(x = signif, decreasing = FALSE, comps = ret$comps, lvl_order = lvl_order) class(ret) <- "cld" return(ret) } cld2(c0) result$cld <- cld2(c0)$mcletters$Letters result[with(result, order(Estimate)), ] ordered_cld <- function(x) { s <- strsplit(x, "") ul <- unique(unlist(s)) UL <- toupper(sort(ul, decreasing = TRUE)) l <- sapply(s, FUN = function(i) { tolower(paste(sort(UL[match(i, table = ul)]), collapse = "")) }) return(l) } # Ordena o vetor de letras pelas médias dos tratamentos. v <- result[with(result, order(Estimate)), ]$cld result$cld <- ordered_cld(v) À disposição. Walmes. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161229/a7fff636/atta…> ------------------------------ Message: 2 Date: Thu, 29 Dec 2016 16:26:52 -0200 From: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com> To: Felipe Barletta <felipe.e.barletta(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] R companies Message-ID: <CAKrF98kWvpebrW6ULvLj0cRYyvR=UZ987tKbBSdjg-SnF3BCLQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Enquanto a lista é alvissareira e nos dá munição para evitar críticas ao tentar usá-lo em algum ambiente que seja mais avesso a software livre, etc., é importante ver que algumas empresas são tão usuárias do R como de todos os outros SW estatísticos, e portanto a lista acaba tendo apenas valor moral. A Microsoft comprou a Revolution R que imediatamente a renomeou "Microsoft R". . . note-se que a dita cuja Revolution R foi fundada pelo ex dono da SPSS, que foi vendida para IBM (que passou a denominar-se comercialmente IBM SPSS Statistics), esta IBM que tem como política estar em todas e todos os lugares faz *também* parte do R Consortium Group. . . Neste momento do ciclo de vida do R, é tautológico querer afirmar algo sobre ele apresentando a lista de usuários, da mesma forma que é possível, sem medo de errar de trocar as duas listas apresentadas nos links como usuárias do Linux e do Windows da Microsoft (aliás isso vale também para banco de dados Oracle e um equivalente open source como MySQL, etc.)! Empresas de porte enorme e com ziliões de aplicações e usuários com diferentes necessidades e históricos... Meus 0,019999... -- Cesar Rabak 2016-12-28 20:13 GMT-02:00 Felipe Barletta via R-br < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>: > Para quem ainda acha que o R é usado apenas na academia. > > http://www.listendata.com/2016/12/companies-using-r. > html?m=1&_utm_source=1-2-2 > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161229/0e3ac5db/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Thu, 29 Dec 2016 17:15:19 -0200 From: Leonardo Aguirre <leoaguirre32(a)gmail.com> To: Cesar Rabak <cesar.rabak(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] R companies Message-ID: <CAAdDf_MadyiGs3V1rv-AgvL9iwyYuSOY8SW-51uj2qHV_H=9hg(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Pra complementar, segue artigo com as principais linguagens de programação de 2016 (R em 5º): http://spectrum.ieee.org/computing/software/the-2016-top-programming-langua… Abraços, Leonardo Em 29 de dezembro de 2016 16:26, Cesar Rabak via R-br < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > Enquanto a lista é alvissareira e nos dá munição para evitar críticas ao > tentar usá-lo em algum ambiente que seja mais avesso a software livre, > etc., é importante ver que algumas empresas são tão usuárias do R como de > todos os outros SW estatísticos, e portanto a lista acaba tendo apenas > valor moral. > > A Microsoft comprou a Revolution R que imediatamente a renomeou "Microsoft > R". . . note-se que a dita cuja Revolution R foi fundada pelo ex dono da > SPSS, que foi vendida para IBM (que passou a denominar-se comercialmente > IBM SPSS Statistics), esta IBM que tem como política estar em todas e todos > os lugares faz *também* parte do R Consortium Group. . . > > Neste momento do ciclo de vida do R, é tautológico querer afirmar algo > sobre ele apresentando a lista de usuários, da mesma forma que é possível, > sem medo de errar de trocar as duas listas apresentadas nos links como > usuárias do Linux e do Windows da Microsoft (aliás isso vale também para > banco de dados Oracle e um equivalente open source como MySQL, etc.)! > > Empresas de porte enorme e com ziliões de aplicações e usuários com > diferentes necessidades e históricos... > > Meus 0,019999... > > -- > Cesar Rabak > > > 2016-12-28 20:13 GMT-02:00 Felipe Barletta via R-br < > r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>: > >> Para quem ainda acha que o R é usado apenas na academia. >> >> http://www.listendata.com/2016/12/companies-using-r.html?m= >> 1&_utm_source=1-2-2 >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- Leonardo de Lima Aguirre mobile: +55 (61) 98133-8373 email: leoaguirre32(a)gmail.com <http://facebook.com/leoaguirre32> <http://linkedin.com/in/leonardo-aguirre-1965a660> <http://instagram.com/leoaguirre32> -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161229/84163aa0/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Fri, 30 Dec 2016 09:41:43 +0000 From: Karina Rebuli <karina.rebuli(a)gmail.com> To: Elias Carvalho <ecacarva(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br>, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> Subject: Re: [R-br] RStudio para criar e testar pacotes Message-ID: <CALfxEuW65hQGqM6eLjrtKZvcXZMfm3DhP6h3Xc429CSZv0LDrQ(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Bom dia, Elias! Conseguiu resolver o problema? >>> 'data' must be of a vector type, was 'NULL' quando passo um dataframe como parametro para a função... >>> Error in fetch(key) : lazy-load database '......descopl.rdb' is corrupt Só com esses dados que você passou, parece que ambos os erros são causados por um problema na hora de gerar, ler ou utilizar o data.frame: o primeiro diz que o objeto é NULL e o segundo não encontra alguma chave no objeto - o que pode ser por ele estar NULL mesmo. Ou pode ser que você não esteja passando o objeto vazio, mas utilizando alguma função específica de vectors em um data.frame. Não ficou claro para mim se o 'data' deveria ser um vector ou data.frame. O R é bastante flexível quanto à classe dos objetos (S3), mas tem algumas coisas que precisam do objeto na classe certa mesmo. >>> Isso acontece quando tento usar alguma função do pacote Quaisquer funções? No desenvolvimento funciona e depois que você vai usar o pacote compilado e instalado dá erro? O objeto de dados deveria fazer parte do pacote? Pelo menos eu, para poder ajudar, preciso de mais informação. Caso ainda esteja ocorrendo, você poderia passar o código de uma função que dá esse erro? Abs, Karina On Tue, Dec 20, 2016 at 11:05 PM Elias Carvalho via R-br < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > Ola Valmes > > Obrigado pelo retorno > > Isso acontece quando tento usar alguma função do pacote > > Em 17 de dezembro de 2016 10:37, Walmes Zeviani <walmeszeviani(a)gmail.com> > escreveu: > > Professor Elias, > > Eu uso os recursos do roxygen2 e devtools, porém sem usar o RStudio. Ainda > não me deparei com os problemas que você mencionou. Isso está acontecendo > quando roda o check()? > > À disposição. > Walmes. > > > > > > -- > > > *In Jesu et Maria* > *Obrigado* > *Prof. Elias Carvalho* > > *"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he > who has been able to understand the cause of things"* > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161230/bed84914/atta…> ------------------------------ Message: 5 Date: Fri, 30 Dec 2016 08:32:52 -0400 From: Emilio Higashikawa <emilio.higashikawa(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: [R-br] Proxy RStudio Message-ID: <CAMe-7A411_3hTYpi3dfti13Viade5KxqaUQRpMzu-anZQVFyCg(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Bom dia moçada..... Estou eu tentando baixar um script feito por um pesquisador porem, ele deixou disponível no github para a gente testar. O problema e que não consigo baixar o pacote. E mesmo baixando o pacote no site do github não consigo carregar o pacote. Fiz os procedimentos para configurar o proxy pro R e RStudio, funciona para baixar os pacotes e atualização deste mas, não funciona com o script disponibilizado no github. Alguém já passou por isso ? Abraço. -- *Emílio Manabu Higashikawa* -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161230/6ef2bef0/atta…> ------------------------------ Message: 6 Date: Fri, 30 Dec 2016 12:41:22 +0000 From: Karina Rebuli <karina.rebuli(a)gmail.com> To: Emilio Higashikawa <emilio.higashikawa(a)gmail.com>, a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Proxy RStudio Message-ID: <CALfxEuVSGsFES2V_2VBXcyRdhSp-MNTnnP65HNRZuY5Q_+-q=g(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Bom dia, Emílio! Se você baixou o pacote e está instalando do fonte local, verifique: (i) se o pacote foi instalado corretamente. (ii) pode ter alguma dependência que ainda está bloqueada pelo proxy (deve dar erro ainda na instalação do pacote). (iii) já tentou instalar outro pacote do github? (iv) nunca vi problema de proxy ao carregar pacote; mas se o pacote faz download de alguma coisa quando é carregado, teria que ver o que ele tenta baixar. Se você puder mandar mais informações, ajuda. Retorno do sessionInfo() e as mensagens de erro ajudam. Se quiser passar o path do repositório, testo aqui também :) Abs, Karina On Fri, Dec 30, 2016 at 10:33 AM Emilio Higashikawa via R-br < r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: > Bom dia moçada..... > Estou eu tentando baixar um script feito por um pesquisador porem, ele > deixou disponível no github para a gente testar. > O problema e que não consigo baixar o pacote. E mesmo baixando o pacote no > site do github não consigo carregar o pacote. > Fiz os procedimentos para configurar o proxy pro R e RStudio, funciona > para baixar os pacotes e atualização deste mas, não funciona com o script > disponibilizado no github. > Alguém já passou por isso ? > > Abraço. > > -- > *Emílio Manabu Higashikawa* > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20161230/77a44be2/atta…> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 72, assunto 26 *****************************************

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Proxy RStudio
by Emilio Higashikawa 30 Dez '16

30 Dez '16

Bom dia moçada..... Estou eu tentando baixar um script feito por um pesquisador porem, ele deixou disponível no github para a gente testar. O problema e que não consigo baixar o pacote. E mesmo baixando o pacote no site do github não consigo carregar o pacote. Fiz os procedimentos para configurar o proxy pro R e RStudio, funciona para baixar os pacotes e atualização deste mas, não funciona com o script disponibilizado no github. Alguém já passou por isso ? Abraço. -- *Emílio Manabu Higashikawa*

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Atualização da função cld()
by marcos paulo 29 Dez '16

29 Dez '16

Olá prezados, boa tarde! Estou com uma dificuldade para efetuar os contrastes de tratamentos de um ensaio em DBC 3*3 + 2. Minha situação assemelha-se a do código: https://ridiculas.wordpress.com/tag/fatorial/ Entretanto quando chego na parte de apresentar os contrastes utilizando da função cld() aparece o seguinte erro: Trecho do código: > #----------------------------------------------------------------------------- > # fazendo as comparações com a glht, método para correção de p-valor > # fdr, o single-step demora muito > c0 <- summary(glht(m6, linfct=Xc), test=adjusted(type="fdr")) > c0 Simultaneous Tests for General Linear Hypotheses Fit: lm(formula = y ~ -1 + mm, data = fu) Linear Hypotheses: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) benlate:puro-benlate:antes == 0 0.008761 0.070134 0.125 0.901153 benlate:puro-benlate:misturado == 0 -0.100584 0.070134 -1.434 0.249216 benlate:puro-captam:puro == 0 -0.364723 0.070134 -5.200 1.71e-05 *** benlate:puro-captam:antes == 0 -0.055481 0.070134 -0.791 0.554020 benlate:puro-captam:misturado == 0 -0.302970 0.070134 -4.320 0.000201 *** benlate:puro-derosal:puro == 0 0.027171 0.070134 0.387 0.755244 benlate:puro-derosal:antes == 0 0.040517 0.070134 0.578 0.649000 benlate:puro-derosal:misturado == 0 0.072273 0.070134 1.031 0.436194 benlate:puro-polimero:polimero == 0 -0.375107 0.070134 -5.348 1.19e-05 *** benlate:puro-testemunha:testemunha == 0 -0.417647 0.070134 -5.955 2.98e-06 *** benlate:antes-benlate:misturado == 0 -0.109345 0.070134 -1.559 0.204047 benlate:antes-captam:puro == 0 -0.373485 0.070134 -5.325 1.20e-05 *** benlate:antes-captam:antes == 0 -0.064242 0.070134 -0.916 0.496458 benlate:antes-captam:misturado == 0 -0.311731 0.070134 -4.445 0.000147 *** benlate:antes-derosal:puro == 0 0.018409 0.070134 0.262 0.839986 benlate:antes-derosal:antes == 0 0.031756 0.070134 0.453 0.718215 benlate:antes-derosal:misturado == 0 0.063512 0.070134 0.906 0.496458 benlate:antes-polimero:polimero == 0 -0.383869 0.070134 -5.473 9.13e-06 *** benlate:antes-testemunha:testemunha == 0 -0.426409 0.070134 -6.080 2.36e-06 *** benlate:misturado-captam:puro == 0 -0.264140 0.070134 -3.766 0.001033 ** benlate:misturado-captam:antes == 0 0.045103 0.070134 0.643 0.625923 benlate:misturado-captam:misturado == 0 -0.202386 0.070134 -2.886 0.011843 * benlate:misturado-derosal:puro == 0 0.127755 0.070134 1.822 0.129457 benlate:misturado-derosal:antes == 0 0.141101 0.070134 2.012 0.092362 . benlate:misturado-derosal:misturado == 0 0.172857 0.070134 2.465 0.033547 * benlate:misturado-polimero:polimero == 0 -0.274524 0.070134 -3.914 0.000685 *** benlate:misturado-testemunha:testemunha == 0 -0.317064 0.070134 -4.521 0.000121 *** captam:puro-captam:antes == 0 0.309242 0.070134 4.409 0.000158 *** captam:puro-captam:misturado == 0 0.061754 0.070134 0.881 0.502026 captam:puro-derosal:puro == 0 0.391894 0.070134 5.588 6.78e-06 *** captam:puro-derosal:antes == 0 0.405241 0.070134 5.778 4.37e-06 *** captam:puro-derosal:misturado == 0 0.436997 0.070134 6.231 1.70e-06 *** captam:puro-polimero:polimero == 0 -0.010384 0.070134 -0.148 0.899323 captam:puro-testemunha:testemunha == 0 -0.052924 0.070134 -0.755 0.568124 captam:antes-captam:misturado == 0 -0.247489 0.070134 -3.529 0.002019 ** captam:antes-derosal:puro == 0 0.082652 0.070134 1.178 0.364093 captam:antes-derosal:antes == 0 0.095998 0.070134 1.369 0.271962 captam:antes-derosal:misturado == 0 0.127755 0.070134 1.822 0.129457 captam:antes-polimero:polimero == 0 -0.319626 0.070134 -4.557 0.000113 *** captam:antes-testemunha:testemunha == 0 -0.362166 0.070134 -5.164 1.81e-05 *** captam:misturado-derosal:puro == 0 0.330141 0.070134 4.707 7.29e-05 *** captam:misturado-derosal:antes == 0 0.343487 0.070134 4.898 4.13e-05 *** captam:misturado-derosal:misturado == 0 0.375243 0.070134 5.350 1.19e-05 *** captam:misturado-polimero:polimero == 0 -0.072138 0.070134 -1.029 0.436194 captam:misturado-testemunha:testemunha == 0 -0.114678 0.070134 -1.635 0.181928 derosal:puro-derosal:antes == 0 0.013347 0.070134 0.190 0.882020 derosal:puro-derosal:misturado == 0 0.045103 0.070134 0.643 0.625923 derosal:puro-polimero:polimero == 0 -0.402278 0.070134 -5.736 4.53e-06 *** derosal:puro-testemunha:testemunha == 0 -0.444818 0.070134 -6.342 1.45e-06 *** derosal:antes-derosal:misturado == 0 0.031756 0.070134 0.453 0.718215 derosal:antes-polimero:polimero == 0 -0.415625 0.070134 -5.926 2.98e-06 *** derosal:antes-testemunha:testemunha == 0 -0.458165 0.070134 -6.533 1.45e-06 *** derosal:misturado-polimero:polimero == 0 -0.447381 0.070134 -6.379 1.45e-06 *** derosal:misturado-testemunha:testemunha == 0 -0.489921 0.070134 -6.986 6.60e-07 *** polimero:polimero-testemunha:testemunha == 0 -0.042540 0.070134 -0.607 0.640414 --- Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 (Adjusted p values reported -- fdr method) > c0$focus <- "comparacoes" # para poder usar a cld() > cld(c0) Error in contrMat(table(x), type = "Tukey") : less than two groups > fdr(c0) Error: could not find function "fdr" > Achei que poderia ser algo relacionado com atualização da função cld(), porém, buscando em outros CMR não encontrei uma resposta pertinente. Na tentantiva de uma solução, conto com a ajuda de vcs. Att., Marcos Paulo fatorial | Ridículas<https://ridiculas.wordpress.com/tag/fatorial/> ridiculas.wordpress.com Posts sobre fatorial escritos por Walmes Zeviani and fernandohtoledo Técnico Agrícola em Zootecnia Bacharel em Agronomia Mestrando em Produção Vegetal - Universidade Federal de Goiás Estagiário de Pós-Graduação da Embrapa Arroz e Feijão/CNPAF-Santo Antônio de Goiás-GO Contato: (62) 85075783 http://lattes.cnpq.br/4322347592884852

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