Janeiro 2014 - R-br

Rmpi
by Vinicius Brito Rocha 08 Jan '14

08 Jan '14

Pessoal, estou começando a estudar processamento em paralelo. O pacote Rmpi não possui versão para windows. É isso mesmo? Pelo que vi o pacote snow utiliza dependências desses pacotes. trabalho em uma maquina co win 7 e 4gb. Abs -- *Vinicius Brito Rocha.* *Estatístico e Atuário * * M.Sc. Engenharia de Produção/PO*

2 2

Duvida sobre expressões regulares.
by Augusto Ribas 07 Jan '14

07 Jan '14

Ola a todos, e feliz ano novo. Suponha que eu tenho o seguinte exemplo: # exemplo<-c("Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Bursey et al. (2001)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); Martins and Fabio (2005)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Martins and Fabio (2005)", "Walton (1935)", "Yamaguti (1958)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Iannacone (2003a)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Goldberg and Bursey (2003)", "Combes and Laurent (1978)", "Baker (1980a)", "Yamaguti (1961); Sueldo and Ramirez (1976); Baker (1987) ", "Lent and Freitas (1948); Ramirez et al. (1979)", "Ramallo et al. (2007)", "Ramallo et al. (2007)", "Yamaguti (1958)", "Travassos et al. (1969)", "Travassos et al. (1969)", "González and Hamann (2007a; 2007b)" , "González and Hamann (2007a; 2007b)" , "González and Hamann (2007b)" , "Travassos (1926a)", "Vicente et al. (1991); McAllister et al. (2010b)", "Kloss (1971; 1974)", "Rodrigues et al. (1982); Vicente et al. (1991)", "Walton (1935); Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "Walton (1935); Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "McAllister et al. (2010b)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991)", "Vicente et al. (1991); McAllister et al. (2010b)", "Vicente et al. (1991)" ) # Isso esta como uma coluna de um data-frame na verdade. Eu gostaria de fazer uma expressão regular que encontra-se casos como "González and Hamann (2007a; 2007b)", mas não os outros. Então seria algo como abre parenteses, 4 números, uma letra, ponto e virgula, espaço 4 números e uma letra, fecha parenteses. Eu tentei varias coisas e não consegui. Eu imagino que se eu fizer algo para encontrar abre parenteses, ponto e virgula, fecha parenteses, sendo o independente do conteudo dentro do parenteses, basta abrir o parenteses, ter um ponto e virgula e fechar o parenteses, ja resolveria, sendo que o antes do parenteses podem ter qualquer coisas (nome de autores). Então alguém poderia me ajudar a conseguir uma expressão regular que pega-se casos como esse exemplo "González and Hamann (2007a; 2007b)" em que há dois anos e um ponto e virgula dentro do parenteses mas não pegue outros casos? Bem é isso, agradeço desde ja qualquer ajuda :) -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

3 2

(sem assunto)
by Ari Clecius 06 Jan '14

06 Jan '14

Bom dia alguém sabe como acrescento o valor da média e do desvio padrão em cada ,ponto deste gráfico, ou seja, um label para cada ponto? Att, Ari Clecius Alves de Lima Engenheiro Químico Me. Engenharia Civil (085)87687786 (085)33669042 #código library(scatterplot3d) x=c(-1,-1,-1,-1,-1,0,1,0,0,1,0,0,1,1,0) y=c(-1,-1,0,1,0,1,0,-1,-1,-1,-1,1,1,0,0) z=c(-1,0,1,0,-1,-1,-1,-1,1,0,-1,1,0,1,0) w=scatterplot3d(x,y,z, highlight.3d = T, angle = 45, scale.y = .5,xlab="Concentração", ylab="pH",zlab="Agitação",col.axis="blue",type="n") w$points3d(x,y,z,col="red",pch=20,cex=5)

3 3

Problemas ao instalar Vim e vim-r-plugin
by Fernando 04 Jan '14

04 Jan '14

Caros amigos, Estou tentando instalar o editor Vim e o plugin Vim-r-plugin seguindo as recomendações existentes no endereço: http://www.lepem.ufc.br/jaa/r-plugin.html#r-plugin-installation, escrito pelo Jackson A. Aquino e o José Claudio Faria, autores do plugin. Eu instalei o Gvim, R, Tmux,Vimcom plus e screen.vba. Então seguindo as recomendações, estou tendo dificuldades na seguinte parte: Start a terminal emulator, go to the directory where you have downloaded the plugin and type: | vim Vim-R-plugin.vmb| Then, in Vim, type: | :so %| Press|<Enter>| and the plugin will be installed (because the plugin has many files, you have to press the space bar a few times to finish the installation). You should, then, quit Vim.|Note:| if you need too install the plugin in a non default directory, do :UseVimball [path]. Eu adicionei o comando "|vim Vim-R-plugin.vmb|" no terminal o que fez o editor Vim abrir no entanto ao inserir o comando so% aparece o seguinte mensagem: Erro detectado ao processar function vimball#Vimball: linha 10: (Vimball) The current file does not appear to be a Vimball! Aperte ENTER ou digite um comando para continuar É a primeira vez que estou instalando o Vim e por isso não tenho noção de onde estou errando. Alguém pode me guiar de forma mais simples (para Dummies mesmo!) em como fazer a instalação? Atenciosamente

3 11

Pacote incompatível com R 3.0.0
by Jefferson Ferreira Ferreira 04 Jan '14

04 Jan '14

Colegas, Estou tentando trabalhar com os pacotes PPAHomeRange e DI_func ( http://www.geog.uvic.ca/spar/PPAHomeRange/index.html / http://www.geog.uvic.ca/spar/DynamicInteraction/index.html) No entanto, estou recebendo a mensagem package ‘PPAHomeRange’ is not available (for R version 3.0.0). Algum de vocês acha que há uma forma de contornar esse problema sem ter que fazer um "downgrade" ? Abraço -- *Jefferson Ferreira Ferreira* Geógrafo – GEOPROCESSAMENTO IDSM | Coordenadoria de TI Jefferson.ferreira(a)mamiraua.org.br *Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá* Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação Telefone: +55 97 3343-9710 *Google Maps* - Mapas deste e-mail: Exibir mapa ampliado<https://maps.google.com.br/maps?q=-3.355557,-64.731151&ll=-3.355471,-64.731…> *Contatos particulares:* *(55) 9615-0100MSN: jecogeo(a)yahoo.com.br <jecogeo(a)yahoo.com.br>*

3 3

Enc: Dúvida Análise de agrupamento
by Nathalia Sousa 03 Jan '14

03 Jan '14

Oie David e todos do grupo Esses são os dados que eu tenho, com as espécies e a abundância de cada uma de acordo com o registro. > dat.alim[c(1:10),c(1:5)] Reg PEI CAM BRA CRUS GAS 26 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 27 1 6 0 0 0 28 1 0 5 0 0 29 3 0 0 0 0 30 0 0 1 0 0 31 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 32 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 33 2 3 1 0 0 34 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 35 0 0 0 1 0 Também estou mandando os comandos que eu tenho para fazer o agrupamento, onde tenho que retirar as linhas que contenham os zeros. # Dissimilaridade e medidas de distancia para dados (semi) quantitativos dat.alim2<- dat.alim [c(2:5,8,10:14,16,17,19:31,33,34,36,37,40:42,44:49),] # nesse comando eu tive que eliminar as linhas com zeros para poder continuar fazendo a dissimilaridade. É nesse ponto que eu preciso de ajuda. Sem eliminar essas linhas com os zeros não funciona,mas eu preciso manter esses dados! dis.bra <- vegdist(log1p(dat.alim2))# Bray-Curtis sobre dados transformados por log head(dis.bra) Obrigada. Aguardo. Att., Nathalia de Sousa Motta Oceanógrafa/Oceanographer Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca ________________________________ De: David Feitosa <contato(a)davidfeitosa.com> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br; Nathalia Sousa <nathalia_sousam(a)yahoo.com.br> Enviadas: Sexta-feira, 3 de Janeiro de 2014 16:22 Assunto: Re: [R-br] Dúvida Análise de agrupamento Nathalia, Vc teria como dar um head/tail pra gente ter noção de uma amostra desses dados? Creio que facilitaria para alguém responder e te ajudar. Atenciosamente, David Feitosa (\_(\ (=°;°) (("")("") Em 3 de janeiro de 2014 14:25, Nathalia Sousa <nathalia_sousam(a)yahoo.com.br> escreveu: Boa tarde, > > >Sou iniciante no R e queria uma ajuda com meus dados do mestrado. >Estou tentando fazer uma análise de agrupamento (cluster) com dados de abundância de 5 espécies, porém tenho algumas datas que não tenho nenhum exemplar coletado. Na hora que vou tentar fazer o cluster, tenho que eliminar essas linhas vazias, mas eu preciso delas pois essas ausências das espécies são dados importantes, que quero analisar. >Com os comandos que tenho, preciso tirar essas linhas, mas não posso e preciso fazer o cluster com todos esses dados. > Alguém pode me ajudar com esses comandos??? > > >Desde já, agradeço. >Aguardo. >Att., > >Nathalia de Sousa Motta >Oceanógrafa/Oceanographer >Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >

1 0

Dúvida Análise de agrupamento
by Nathalia Sousa 03 Jan '14

03 Jan '14

Boa tarde, Sou iniciante no R e queria uma ajuda com meus dados do mestrado. Estou tentando fazer uma análise de agrupamento (cluster) com dados de abundância de 5 espécies, porém tenho algumas datas que não tenho nenhum exemplar coletado. Na hora que vou tentar fazer o cluster, tenho que eliminar essas linhas vazias, mas eu preciso delas pois essas ausências das espécies são dados importantes, que quero analisar. Com os comandos que tenho, preciso tirar essas linhas, mas não posso e preciso fazer o cluster com todos esses dados. Alguém pode me ajudar com esses comandos??? Desde já, agradeço. Aguardo. Att., Nathalia de Sousa Motta Oceanógrafa/Oceanographer Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca

2 1

Regressão por quadrados mínimos parciais (PLS)
by ASANTOS 03 Jan '14

03 Jan '14

Bom dia Pessoal, Gostaria de saber que materiais os membros dos grupos teriam para indicar de Regressão por quadrados mínimos parciais (PLS) em ambiente R, pois estou migrando da abordagem de Regressão linear múltipla para PLS, Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

4 6