Fevereiro 2013 - R-br

Re: [R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
by Pedro Rafael 06 Jul '13

06 Jul '13

Obrigado pela opinião Leonard Mendonça. [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 17 de novembro de 2012 14:45, Pedro Rafael < pedro.rafael.marinho(a)gmail.com> escreveu: > Obrigado pela opinião Leonard Mendonça. > > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > Em 17 de novembro de 2012 12:13, Leonard Mendonça de Assis [via R-br] < > ml-node+s2285057n4657102h39(a)n4.nabble.com> escreveu: > > No meu entendimento é uma nova versão >> >> []s >> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis >> >> Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu: >> >> Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R mas >> nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do pacote >> pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz informando >> a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes, por >> exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do >> pacote? Isso pode ser feito? >> ---------- Mensagem encaminhada ---------- >> >> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=0> >> > >> Data: 16/11/2012 17:50 >> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R. >> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=1> >> > >> >> >> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds". >> On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>> >> wrote: >> >>> Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em >>> alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. >>> Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios >>> nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN? >>> ---------- Mensagem encaminhada ---------- >>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>> >>> >>> >>> Data: 16/11/2012 17:01 >>> Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>> >>> >>> >>> >>> Se vc rodar >>> >>> R CMD check pacote >>> >>> ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo >>> dos logs? >>> >>> 2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0> >>> > >>> >>> O meu path esta configurado da seguinte forma: >>> >>> C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program >>> Files\Common Files\Microsoft >>> Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program >>> Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer >>> >>> Você vê algum problema? >>> >>> Att. >>> >>> Tiago. >>> >>> ------------------------------ >>> Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200 >>> >>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1> >>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2> >>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >>> >>> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o >>> rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo) >>> >>> []s >>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis >>> >>> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu: >>> >>> O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD >>> Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9, >>> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9. >>> >>> Att. >>> >>> Tiago. >>> >>> ------------------------------ >>> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200 >>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3> >>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4> >>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >>> >>> RTools, errei o nome >>> >>> voce acha no CRAN >>> >>> []s >>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis >>> >>> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu: >>> >>> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? >>> >>> Att. >>> >>> Tiago. >>> >>> ------------------------------ >>> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 >>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5> >>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6> >>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >>> >>> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que >>> estamos usando. >>> >>> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei >>> quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os >>> 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. >>> >>> []s >>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis >>> >>> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: >>> >>> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu >>> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R >>> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão >>> antiga do MikTex que eu não estou usando. >>> >>> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de >>> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este >>> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. >>> Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd >>> com algumas mensagens de erro. >>> >>> Espero ter te ajudado. >>> >>> Att. >>> >>> Tiago. >>> >>> ------------------------------ >>> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 >>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7> >>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8> >>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >>> >>> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro >>> na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da >>> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? >>> >>> OBS: Estou em uma máquina Linux. >>> >>> * using log directory >>> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ >>> * using R version 2.15.1 (2012-06-22) >>> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) >>> * using session charset: UTF-8 >>> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK >>> * checking extension type ... Package >>> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ >>> * checking package namespace information ... OK >>> * checking package dependencies ... OK >>> * checking if this is a source package ... OK >>> * checking if there is a namespace ... OK >>> * checking for executable files ... OK >>> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK >>> * checking installed package size ... OK >>> * checking package directory ... OK >>> * checking for portable file names ... OK >>> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK >>> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK >>> * checking top-level files ... OK >>> * checking index information ... OK >>> * checking package subdirectories ... OK >>> * checking R files for non-ASCII characters ... OK >>> * checking R files for syntax errors ... OK >>> * checking whether the package can be loaded ... OK >>> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies >>> ... OK >>> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK >>> * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies >>> ... OK >>> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK >>> * checking for unstated dependencies in R code ... OK >>> * checking S3 generic/method consistency ... OK >>> * checking replacement functions ... OK >>> * checking foreign function calls ... OK >>> * checking R code for possible problems ... OK >>> * checking Rd files ... WARNING >>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section >>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section >>> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value >>> * checking Rd metadata ... OK >>> * checking Rd cross-references ... OK >>> * checking for missing documentation entries ... OK >>> * checking for code/documentation mismatches ... OK >>> * checking Rd \usage sections ... OK >>> * checking Rd contents ... OK >>> * checking for unstated dependencies in examples ... OK >>> * checking examples ... OK >>> * checking PDF version of manual ... ERROR >>> Rd conversion errors: >>> Warning: unknown option '-' >>> Warning in file(con, "r") : >>> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or >>> directory >>> Error in file(con, "r") : cannot open the connection >>> >>> >>> [ ], >>> Pedro Rafael Diniz Marinho. >>> >>> >>> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9> >>> > escreveu: >>> >>> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas >>> informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei >>> meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que >>> eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código. >>> Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar >>> algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome >>> dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por >>> uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara >>> de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e >>> depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". >>> Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção >>> do pacote que deve ser respeitada? >>> >>> [ ], >>> Pedro Rafael Diniz Marinho. >>> >>> >>> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden >>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>escreveu: >>> >>> >>> >>> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: >>> >>> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo >>> de submissão? >>> >>> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto >>> em >>> detalhes. >>> >>> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : >>> >>> R CMD check SEU_PACOTE >>> >>> e corrija todos os eventuais problemas >>> >>> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira >>> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu >>> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as >>> atualizações >>> > fiquem disponíveis? >>> >>> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION >>> >>> > >>> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote >>> não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele >>> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem >>> que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela >>> primeira >>> > vez? >>> > >>> >>> Bem vindo ao Universo do Software livre >>> >>> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que >>> quiser >>> >>> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. >>> Leia sobre licxancas GPL e análogas >>> >>> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e >>> livre-se destas preocupacoes >>> >>> > >>> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. >>> >>> Nao sao somente suas. >>> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem >>> controvérsias! >>> >>> > >>> > Obrigado à todos. >>> > [ ], >>> > Pedro Rafael Diniz Marinho. >>> > >>> > >>> > >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list >>> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>> código mínimo reproduzível. >>> >>> ------------------------------ >>> If you reply to this email, your message will be added to the >>> discussion below: >>> >>> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp46… >>> To unsubscribe from R-br, click here. >>> NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_view…> >>> >>> >>> >>> >>> _______________________________________________ R-br mailing list [hidden >>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=11> >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de >>> postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo >>> reproduz�vel. >>> >>> >>> _______________________________________________ >>> R-br mailing list[hidden email] 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Gerar mapa de distribuição por UF
by Kaue Veras 04 Mar '13

04 Mar '13

Bom dia Senhores (as), Eu tenho uma base com três colunas e mais de 100000 linhas que contém a UF o CEP e a Quantidade de clientes por cada CEP/UF, eu gostaria de saber se alguém conhece algum pacote ou meio que eu possa inserir esses dados numa distribuição por UF no mapa do Brasil. Desde já agradeço. Atenciosamente, Kauê P. Veras da Cunha Estatística - UERJ Cel: (21) 8254-9601

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Quadrado médio de duas características QM(y1+y2)
by Tiago Souza Marçal 01 Mar '13

01 Mar '13

Boa noite pessoal, estou querendo estimar a correlação genética entre duas variáveis (y1 e y2). Entretanto, para isso eu preciso do quadrado médio de a mais b QM (a+b). Alguém sabe como estimar este quadrado médio para as duas variáveis no R. Att. Tiago.

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Re: [R-br] Resolvendo uma distribuição Uniforme SIMPLES.
by Ivan Bezerra Allaman 01 Mar '13

01 Mar '13

Eu não entendi muito bem o que vc quer realmente, mais você pode fazer algo deste tipo: http://nbcgib.uesc.br/lec/prof/ivan/sim/fdpu Para saber como fazer o que está no link abaixo acesse: http://www.rstudio.com/shiny/ (S,f,P) Allaman

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Gerar números aleatórios de um dist. T mutivariada
by Carlos Pereira 28 Fev '13

28 Fev '13

Bom dia pessoal, Queria saber se tem um pacote que gera números aleatórios de uma distribuição T multivariada. Carlos Pereira da Silva Bacharel em Estatística – UEPB Mestrando em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA Lavras - MG Cel: 035 - 9119 - 2245 Email: ccpsilva81(a)hotmail.com __________________________________________ Tenha Um Dia Abençoado Por DEUS!!! Sl – 34, 8

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encontrar resposta no tempo anterior
by Maurício Lordêlo 27 Fev '13

27 Fev '13

Saudações a todos desta lista. Estou precisando de uma ajuda no sentido de definir uma nova variável em função de outra já existente. No exemplo ilustrativo, tenho uma variável resposta binária (denominada de "resp") observada em quatro indivíduos (id) e medida em quatro momentos distintos (time). Preciso desta resposta no tempo anterior (inicialmente de primeira e segunda ordem). A resposta prévia de primeira ordem (resp_ant1) indica o valor da resposta daquele indivíduo no tempo imediatamente anterior. De forma análoga, tem-se a resposta prévia de segunda ordem (resp_ant2). Neste exemplo com poucas observações fica "fácil" visualizar estas respostas prévias e criar estas novas variáveis. Alguém teria uma sugestão de uma forma mais simples para encontrar as variáveis "resp_ant1" e "resp_ant2"? Desde já agradeço, Maurício id=rep(1:4, each = 4) time=rep(1:4, 4) resp=c(1,1,0,1,0,0,0,1,0,1,1,1,0,1,0,1) resp_ant1=c(NA,1,1,0,NA,0,0,0,NA,0,1,1,NA,0,1,0) resp_ant2=c(NA,NA,1,1,NA,NA,0,0,NA,NA,0,1,NA,NA,0,1)

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Vaga para Professor Visitante UFMG
by Carolina Pena 27 Fev '13

27 Fev '13

Bom dia, Gostaria de divulgar vaga de Professor Visitante na UFMG. As inscrições já estão abertas. Perfil do candidato: Graduação em Turismo, Estatística,Economia e Administração e Doutorado em Turismo, Estatística, Economia ou áreas afins (Área 1) https://www2.ufmg.br/ concursos/Concursos/Professor- Substituto-Visitante/ Editais352 Abraços, Carolina Pena

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Dados de solos do Brasil
by Alisson Lucrecio 26 Fev '13

26 Fev '13

Caros Colegas R-br, Boa tarde. Eu estou precisando de dados de solos do Brasil. Alguém sabe onde posso encontrar um lista ou planilha com esses dados? Obrigado. Alisson Lucrécio da Costa

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Pesquisar elementos dentro de uma variável
by Victor Eduardo 26 Fev '13

26 Fev '13

Pessoal, tem como eu pesquisar dentro de uma variável no R apenas algumas siglas ou números? Tenho um banco de dados com mais de 5000 observações e estou interessado apenas na região nordeste, ou seja, preciso fazer uma busca no meu banco de dados para que pegue somente essa região. A variável está dessa maneira: [1] "EBA2927400001" "EDF5300100001" "EES3205300001" "EMS5002700001" "EMS5002700002" [6] "EPI2211000001" "EPR4106900002" "ERJ3304551111" "ERS" "ERS4314900001" [11] "ESC4205400001" "ESP3550309999" "ETO1721000001" "MAC1200200001" "MAC1200200002" [16] "MAC1200300001" "MAC1200340001" "MAC1200400001" "MAC1200430001" "MAL2700100001" No caso, pegaria BA, AC, AL e os demais estados do nordeste. Como posso fazer uma busca dentro dessa variável para me retornar apenas as siglas que quero? Abraços e ótima semana!

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formato do output
by alanarocha＠sapo.pt 26 Fev '13

26 Fev '13

bom dia, o meu quadro das estatísticas do output esta de uma forma estranha: > # Estatística por ano > porano<-apply(dados[,-1],2,function(x)c(summary(x),0)[1:7]) > desviopadrão<-sd(dados[,-1], na.rm= TRUE) Warning message: sd(<data.frame>) is deprecated. Use sapply(*, sd) instead. > variância<-var(dados[,-1], na.rm= TRUE) > amplitude<-apply(dados[,-1],2,range, na.rm= TRUE) > rownames(porano) <- c('Minimo','Primeiro > quartil','Mediana','Média','Terceiro Quartil','Máximo','NAs') > porano<-rbind(porano,'Desviopadrão','Variância','Amplitude') > colnames(porano) = 2008:2012 > desviopadrão X2008 X2009 X2010 X2011 X2012 5.492936 4.433807 4.226329 3.919534 4.968671 > variância X2008 X2009 X2010 X2011 X2012 X2008 30.172348 15.315341 12.590909 13.140152 8.883523 X2009 15.315341 19.079545 13.514205 9.153409 5.238636 X2010 12.590909 13.514205 18.329545 11.909091 5.261364 X2011 13.140152 9.153409 11.909091 15.047348 8.272727 X2012 8.883523 5.238636 5.261364 8.272727 13.528409 > amplitude X2008 X2009 X2010 X2011 X2012 [1,] 61 64 68 65 57 [2,] 82 83 84 85 85 > porano 2008 2009 2010 2011 Minimo "61" "64" "68" "65" Primeiro quartil "70" "71" "72.25" "75" Mediana "74" "75" "75.5" "77" Média "72.88" "74.09" "75.68" "76.97" Terceiro Quartil "76" "76" "79" "78.75" Máximo "82" "83" "84" "85" NAs "4" "3" "3" "3" "Desviopadrão" "Desviopadrão" "Desviopadrão" "Desviopadrão" "Variância" "Variância" "Variância" "Variância" "Amplitude" "Amplitude" "Amplitude" "Amplitude" 2012 Minimo "57" Primeiro quartil "75" Mediana "78" Média "77.08" Terceiro Quartil "81" Máximo "85" NAs "0" "Desviopadrão" "Variância" "Amplitude" > > eu quero da forma: 2008 2009 2010 2011 2012 name.est valor de cada ano sem aspas exemplo: mínimo valor2008 valor2009 valor2010 valor2011 valor2012 desviopadrão valor2008 valor2009 valor2010 valor2011 valor2012 o que poderá estar a acontecer? Cumprimentos Ana Rocha

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