Setembro 2012 - R-br

Enc: Problemas com rgl!
by Ivan Bezerra Allaman 22 Nov '12

22 Nov '12

Boa tarde Daniel! Tenho a seguinte mensagem como camando: Lendo listas de pacotes... Pronto Construindo árvore de dependências Lendo informação de estado... Pronto E: Você deve colocar algumas URIs 'source' em seu sources.list O que isso quer dizer eu não sei, só sei que tenho a seguinte conteúdo no meu sources.list: deb http://mint-packages.c3sl.ufpr.br/ maya main upstream import deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ precise main restricted universe multiverse deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ precise-updates main restricted universe multiverse deb http://security.ubuntu.com/ubuntu/ precise-security main restricted universe multiverse deb http://archive.canonical.com/ubuntu/ precise partner deb http://packages.medibuntu.org/ precise free non-free # deb http://archive.getdeb.net/ubuntu precise-getdeb apps # deb http://archive.getdeb.net/ubuntu precise-getdeb games #Repositório do R deb http://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu precise/ deb http://cran-r.c3sl.ufpr.br/ precise-backports main restricted universe Inté, \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5596 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature} ________________________________ De: Daniel C Bezerra <danielcbezerra(a)gmail.com> Para: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br; Ivan Bezerra Allaman <ivanalaman(a)yahoo.com.br> Enviadas: Sábado, 8 de Setembro de 2012 15:57 Assunto: Re: [R-br] Problemas com rgl! Tente rodar no terminal: sudo apt-get build-dep r-cran-rgl On Sat, Sep 8, 2012 at 3:30 PM, Ivan Bezerra Allaman <ivanalaman(a)yahoo.com.br> wrote: Boa tarde senhores! > > >Ao rodar um gráfico em 3D com a rgl percebi que estava muito lento, travando. Então descobri que não estava instalado o driver de vídeo da minha máquina. Ao instalar e tentar usar a rgl obtive erros. Então removi o pacote que estava dentro do usr blablab e tentei reinstalar o pacote sem sucesso com o seguinte erro: > > >* installing *source* package ‘rgl’ ... >** package ‘rgl’ successfully unpacked and MD5 sums checked >checking for gcc... gcc -std=gnu99 >checking whether the C compiler works... yes >checking for C compiler default output file name... a.out >checking for suffix of executables... >checking whether we are cross compiling... no >checking for suffix of object files... o >checking whether we are using the GNU C compiler... yes >checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes >checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed >checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E >checking for gcc... (cached) gcc -std=gnu99 >checking whether we are using the GNU C compiler... (cached) yes >checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... (cached) yes >checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... (cached) none needed >checking for libpng-config... yes >configure: using libpng-config >configure: using libpng dynamic linkage >checking for X... libraries , headers >checking GL/gl.h usability... yes >checking GL/gl.h presence... yes >checking for GL/gl.h... yes >checking GL/glu.h usability... yes >checking GL/glu.h presence... yes >checking for GL/glu.h... yes >checking for glEnd in -lGL... yes >checking for gluProject in -lGLU... yes >checking for freetype-config... yes >configure: using Freetype and FTGL >configure: creating ./config.status >config.status: creating src/Makevars > >. >. >. > >Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rgl', details: > call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) > error: impossível carregar objeto compartilhado '/usr/local/lib/R/site-library/rgl/libs/rgl.so': > libGL.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory >Erro: loading failed >Execução interrompida >ERROR: loading failed >* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/rgl’ > >The downloaded source packages are in > ‘/tmp/RtmpS6wZHV/downloaded_packages’ >Mensagens de aviso perdidas: >In install.packages("rgl") : > installation of package ‘rgl’ had non-zero exit status > > >Já pesquisei em vários lugares, instalar várias coisas e o erro persiste. Grato se alguém puder ajudar. Utilizo o mint 13 maya ubuntu. > > >Abraços! > > > >\begin{signatu ><<>>= >Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman >Universidade Estadual de Santa Cruz >Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas >Ilhéus/BA - Brasil >Fone: +55 73 3680-5596 >E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com >@ >\end{signature} >_______________________________________________ >R-br mailing list >R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >

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Organizacao de dados Netcdf
by Humberto Hazin 03 Out '12

03 Out '12

Bom dia pessoal, Estou tentando extrair variáveis ambientais de arquivos formato netcdf. Até um certo momento consigo separtar em arquivos as Latitudes, Longitudes, time (mes/ano) e a dml (exemplo que mando aqui). Link para baixar os dados do exemplo https://www.dropbox.com/s/66dp4rgei791r52/DML05_12.nc nc <- open.nc("DML05_12.nc", write=TRUE) print.nc(nc) lat<-var.get.nc(nc, "LAT46_103") lon<-var.get.nc(nc, "LONN55_12") time<-var.get.nc(nc, "TIME") dml<-var.get.nc(nc, "MLD") Meu problema é que nao estou conseguindo organizar eles em colunas com seus respectivos valores para cada latitude, longitude, time e dml. o output final deveria ficar assim: lat lon time dml 1 -44.5 -55.5 2 -43.5 -55.5 3 -42.5 -55.5 4 -41.5 -55.5 5 -40.5 -55.5 6 -39.5 -55.5 Agradeço a ajuda desde já Humberto __________________________________________________ Prof. Dr. Humberto Gomes Hazin Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE Unidade Acadêmica de Serra Talhada - UAST Coordenador do Curso de Engenharia de Pesca Fazenda Saco, S/N - Caixa Postal 063 CEP 56900-000 Serra Talhada - PE Tel.(87) 3831-2206/3831-1927 Cel.(81) 9158 0564

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Colocar frequências num gráfico de barras do ggplot
by Eduardo Carvalho da Silva 01 Out '12

01 Out '12

Olá a todos! Estou precisando gerar um gráfico de barras de uma variável X, particionando cada barra pela distribuição de uma outra variável Z. Até aí, tudo bem. O problema é que preciso colocar as frequências relativas de cada categoria da variável Z nas barras das categorias da variável X. Só consegui colocar as frequências considerando todas as observações. O que preciso é colocar as frequências considerando o número de observações em cada barra. Alguém saberia como resolver isso? Desde já agradeço, __ * Eduardo Carvalho da Silva *

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Chave de licença pública para R: Ubuntu 12.04
by Vinícius Lionel Mateus 30 Set '12

30 Set '12

Prezados, Não consigo fazer atualizações através dos repositórios por conta da ausência da chave de licença pública. Segui as dicas que constam em http://cran.fiocruz.br/, mas na hora de atualizar o sistema "diz": "Necessita instalação de pacotes não confiáveis" "A ação deve requerer a instalação de pacotes de fontes não autenticadas." ...e por fim não consigo fazer o download. Alguém encontrou o mesmo problema no Ubuntu? Vinícius -- -- Atenciosamente, VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio) Rua Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brasil CEP.: 22451-900 Telefone: (+55) (21) 3527-1327 (+55) (21) 9358-8051 www.puc-rio.br

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Não consigo ler shapefile
by Emerson Cotta Bodevan 28 Set '12

28 Set '12

Prezados, tenho mais uma dúvida. Primeiramente, uso o UBUNTU e o EMACS. Estou tentando ler um shapefile que baixei do site do IBGE. São dois arquivos: 31mu2500gsd.shp e 31mu2500gsr.shp Instalei o pacote maptools e não consegui instalar o rgeos (dúvida enviada para a lista em outro e-mail) ao digitar o comando: mg<-readShapePoly("31mu2500gsr.shp") ou mg<-readShapePoly("31mu2500gsd.shp") Aparece a mensagem mg<-readShapePoly("31mu2500gsd.shp") Erro em make.names(onames, unique = TRUE) : string multibyte inválida 5 mg<-readShapePoly("31mu2500gsr.shp") Erro em make.names(onames, unique = TRUE) : string multibyte inválida 5 Qualquer ajuda será bem vinda. Att., Emerson.

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Re: [R-br] (sem assunto)
by Ivan Bezerra Allaman 28 Set '12

28 Set '12

?descr \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5596 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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Modo mais inteligente?(STRING)
by Ivan Bezerra Allaman 28 Set '12

28 Set '12

Bom dia senhores!! Suponha que eu tenha o seguinte vetor: vet <- paste(seq(1:12),1:5,sep='.') Eu terei sempre um 'ponto' e um número a direita de cada elemento do vetor. O meu objetivo, é pegar exatamente qualquer coisa que esteja à esquerda deste ponto. Então fiz: unlist(lapply(strsplit(vet,split='[[:punct:]][[:alnum:]]'),function(x)sample(x[1]))) Tem algum modo mais inteligente? Desde já, grato! \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5596 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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Remover coluna de um data.frame dentro de uma lista!
by Ivan Bezerra Allaman 28 Set '12

28 Set '12

Bom dia senhores! Novamente venho recorrer a ajuda dos senhores! Vamos supor o seguinte: DADOSS <- expand.grid(sitio=1,ponto=as.character(c('SS')),serie=2,camara=as.character(LETTERS[1:5]),tempo=c(0,15,30,45),armazen=c('VIDRO','HEAD','PP')) which <- 'armazen' x <- DADOSS[,c(1,3,5)] y <- DADOSS vars <- list() for(i in levels(y[[which]])){ vars[[i]] <- subset(cbind(x,groups=y[[which]]), groups==i) vars[[i]][,!(colnames(dd[[i]]) %in% c('groups'))] } vars Vejam que o meu objetivo é remover a coluna 'groups' de cada lista. No entanto, a linha " vars[[i]][,!(colnames(dd[[i]]) %in% c('groups'))]" não funciona! Alguém tem alguma sugestão? OBS: 'Éder, peguei o seu CMR emprestado ok?' Desde já, grato novamente! \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5596 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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Como arrumar um banco de dados
by Humberto Hazin 28 Set '12

28 Set '12

Meu caros, eu tenho uma base de dados da seguinte formar: coordinates 51.5W 50.5W 49.5W 48.5W 54.5S 999.48389 999.59149 999.69275 999.78772 53.5S 1001.4836 1001.6042 1001.7177 1001.8221 52.5S 1003.4236 1003.5513 1003.671alguem ppoderia me ajudar a converter conforme abaixo: lat long SPL 54.5S 51.5W 999.48389 53.5S 51.5W 1001.4836 52.5S 51.5W 1003.4236 54.5S 50.5W 999.59149 53.5S 50.5W 1001.6042 52.5S 50.5W 1003.5513 . . . Obrigado __________________________________________________ Prof. Dr. Humberto Gomes Hazin Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE Unidade Acadêmica de Serra Talhada - UAST Coordenador do Curso de Engenharia de Pesca Fazenda Saco, S/N - Caixa Postal 063 CEP 56900-000 Serra Talhada - PE Tel.(87) 3831-2206/3831-1927 Cel.(81) 9158 0564

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(sem assunto)
by Edson Lira 28 Set '12

28 Set '12

Caros amigos da lista, tenho um banco que está postado no http://www.datafilehost.com/download-67f45d08.html. Uma das variáveis é a zona em que o entrevistado reside, como façõ para fazer o cruzamento da zona com todas as outras variáveis em um único comonado. [ ]' s. Edson Lira Estatístico Manaus-Amazonas

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