<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763">Saudações amigos do R, </div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763">Estou as voltas de estimar taxas de eventos e estou batendo cabeça. Antes de escrever uma função eu mesmo para fazer uma tabela com alguns valores gostaria de uma luz dos amigos de R.</div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763">O banco aml está no pacote survival então bastaria carregar o pacote pra reproduzir o exemplo. Eu gostaria de ver em formato de tabela alguns momentos específicos da tabela de sobrevivência. Só que o summary.survfit só retorna a sobrevivência e não a taxa cumulativa. </div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763"><br></div><span class="gmail_default" style="color:rgb(7,55,99)"><font face="monospace" style="" size="1">library("survival")</font></span><div><span class="gmail_default" style="color:rgb(7,55,99)"><font face="monospace" style="" size="1"></font></span> <font face="monospace" size="1">fit <span class="gmail_default" style="color:rgb(7,55,99)"></span><- survfit(Surv(time, status) ~ x, data = aml) <br>> fit<br>Call: survfit(formula = Surv(time, status) ~ x, data = aml)<br><br>                 n events median 0.95LCL 0.95UCL<br>x=Maintained    11      7     31      18      NA<br>x=Nonmaintained 12     11     23       8      NA<br><span class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:rgb(7,55,99)"># Summary com todos os momentos de eventos</span><br></font></div><div><font face="monospace" size="1">> summary(fit)<br>Call: survfit(formula = Surv(time, status) ~ x, data = aml)<br><br>                x=Maintained <br> time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI<br>    9     11       1    0.909  0.0867       0.7541        1.000<br>   13     10       1    0.818  0.1163       0.6192        1.000<br>   18      8       1    0.716  0.1397       0.4884        1.000<br>   23      7       1    0.614  0.1526       0.3769        0.999<br>   31      5       1    0.491  0.1642       0.2549        0.946<br>   34      4       1    0.368  0.1627       0.1549        0.875<br>   48      2       1    0.184  0.1535       0.0359        0.944<br><br>                x=Nonmaintained <br> time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI<br>    5     12       2   0.8333  0.1076       0.6470        1.000<br>    8     10       2   0.6667  0.1361       0.4468        0.995<br>   12      8       1   0.5833  0.1423       0.3616        0.941<br>   23      6       1   0.4861  0.1481       0.2675        0.883<br>   27      5       1   0.3889  0.1470       0.1854        0.816<br>   30      4       1   0.2917  0.1387       0.1148        0.741<br>   33      3       1   0.1944  0.1219       0.0569        0.664<br>   43      2       1   0.0972  0.0919       0.0153        0.620<br>   45      1       1   0.0000     NaN           NA           NA<br><br><span class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:rgb(7,55,99)"># Summary com os momentos desejados</span><br>> <span class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:rgb(7,55,99)"></span>summary(fit, times = c(14,28,35))<br>Call: survfit(formula = Surv(time, status) ~ x, data = aml)<br><br>                x=Maintained <br> time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI<br>   14      8       2    0.818   0.116        0.619        1.000<br>   28      6       2    0.614   0.153        0.377        0.999<br>   35      3       2    0.368   0.163        0.155        0.875<br><br>                x=Nonmaintained <br> time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI<br>   14      7       5    0.583   0.142       0.3616        0.941<br>   28      4       2    0.389   0.147       0.1854        0.816<br>   35      2       2    0.194   0.122       0.0569        0.664<br><br></font><span style="font-family:monospace;font-size:x-small">> plot(fit)</span><font face="monospace" size="1"><br></font></div><div><font face="monospace" size="1">> plot(fit, cumhaz = T) </font><br><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763"><span style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:small;color:rgb(34,34,34)">></span> </div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763">Reparem que há uma opção para o gráfico cumhaz = T, o que significa que o cumhaz está depositado no objeto, inclusive dentro do summary também. Tipo summary(fit)$cumhaz. Só que não há uma opção summary(fit, cumhaz = T) que retorne o cumhaz ao invés da sobrevivência. Alguém tem algum bizu pra fazer  isso organizado, extrair a mesma tabela só que com o cumhaz, como <span class="gmail_default"></span><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:monospace;font-size:x-small">summary(fit, times = c(14,28,35)) </span>sem muito trabalho?  </div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:monospace,monospace;font-size:large;color:#073763">Abraço forte,</div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="'courier new', monospace" style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#000066" size="4">Pedro Brasil</font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>