<div dir="ltr">Os mapas de indivíduos para as duas primeiras dimensões mostram que há uma melhor representatividade dos valores extremos (v. <font face="monospace">Plano.png</font>) onde o cos² é maior.<div><br></div><div>Para as três variáveis categóricas que você usou (raças, planos e vol. conc) as elipses de confiança (que presumo sejam 95%) indicam que para essa amostra os dados não indicam diferenças com significância estatística dentro dos limiares usuais.</div><div><br></div><div>Minhas referências de estudo para esse assunto :</div><div><br></div><div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-size:medium">Foucart, T.<span class="gmail-Apple-converted-space"> </span></span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-weight:bold">L’analyse des données, mode d’emploi : méthodes et études de cas</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-size:medium">. Rennes.] Presses Univ. de Rennes, 1997.</span><br></div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-size:medium">Escofier, B.; Pagès, J.<span class="gmail-Apple-converted-space"> </span></span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-weight:bold">Analyses factorielles simples et multiples: Objectifs, méthodes et interprétation</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-size:medium">. Paris. Dunod, 2008.</span></div></div><div><br></div><div>A última trabalha bem a questão da interpretação com casos mais recentes, embora a primeira seja bem equilibrada entre teoria e exemplos práticos. </div><div><br></div><div>Há material na Internet, mas não posso opinar sobre eles, inclusive vídeos.<br><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:-webkit-standard;font-size:medium"></span></div><div><br></div><div>HTH</div><div>--</div><div>Cesar Rabak</div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Apr 23, 2020 at 4:57 PM Fernando Souza por (R-br) <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Olá Cesar</div><div><br></div><div>Obrigado pelo retorno!</div><div><br></div><div>Eu montei os gráficos (mapa de indivíduos) conforme sugerido e adicionei no link. Você poderia me orientar sobre a interpretação. Eu fiz uma aqui mas não estou seguro e gostaria de ouvir a opinião de alguém mais experiente para comparar com as que fiz. Você poderia me dizer o que pode concluir dos gráficos?</div><div><br></div><div><a href="https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks" target="_blank">https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks</a></div><div><br></div><div>Aproveito para pedir dicas de boas referencias para estudo, principalmente como tirar as conclusões do PCA para o modelo.<br></div><div><br></div><div>Atenciosamente</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Em qua., 22 de abr. de 2020 às 22:03, Cesar Rabak por (R-br) <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>> escreveu:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Fernando,<div><br></div><div>Há dois aspectos a ser vistos na sua ACP.</div><div><br></div><div>O número de variáveis que você tem antes da ACP e número de casos para você fazer uma análise multivariada (nos dois casos).  </div><div><br></div><div>Um gráfico muito interessante para auxiliá-lo a decidir sobre seus resultados é o "mapa de indivíduos" que plota cada caso no plano das CP, sendo as primeiras componentes as mais "interessantes" posto que "espalham" mais os dados por terem sido resultado de uma operação matemática que maximiza a variâncias nesses dados.</div><div><br></div><div>Nesses mapas de indivíduos você pode rotular com cores ou símbolos aspectos da sua investigação.</div><div><br></div><div>O uso das primeiras CP usando o diagrama <i>scree</i> ajuda, <u>mas</u> a interpretação da multivariada que você venha a fazer precisará de mais trabalho, porém você escapa do problema de ter mais variáveis que casos, que exigiria uso de técnicas de validação cruzada, etc.</div><div><br></div><div>HTH</div><div>--</div><div>Cesar Rabak</div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Apr 22, 2020 at 6:26 PM Fernando Souza por (R-br) <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Olá pessoal tudo bem</div><br><div>Estou realizando uma análise de 
componentes principais, com o objetivo de selecionar as melhores 
variáveis para uma análise multivariada.  </div><br><div>Gostaria de uma orientação sobre a  interpretação. Eu interpretei de forma correta? 
Variáveis que possuem alta correlação com um CP também estão 
correlacionadas entre si. Isso significa que posso utilizar somente uma 
das principais variáveis do CP1 (por exemplo) para incluir no modelo 
multivariado? No caso a variável que apresentar significado para o trabalho.<br></div><div><br></div><div>Os círculos de correlação, screem plot e corrplot geradas pelo Pca estão disponíveis no link<br></div><div><a href="https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks" target="_blank">https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks</a></div><div><br></div><div>A interpretação que fiz foi a seguinte:</div><div><br></div><div><div>Considerei as variáveis 
PC,IC e Prod leite (Azul no gráfico) como variável suplementar 
quantitativa.  Baseado no ScreenPlot selecionei somente 5 CP para 
avaliação que explicaram 67,80% da variancia total. Pela minha 
interpretação cheguei as seguintes conclusões</div><br><div>Principais variáveis para cada componente:</div><br><div>Consumos (CP1): CMS,CMO,CPB,CEE,CCNF,CFDNcp,CFDA,CNDT,CEB,CED,CEM,CEL</div><br><div>Energia (CP2) : EB,ED,EM,EL</div><br><div>Peso (CP3): PV,PCJ,PCVZ,PCVZ075</div><br><div>Composição do Leite(CP4) : Solido e DCNF</div><br><div>Variaveis sanguíneas (CP5): PT e ALBUMINA</div></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Segue uma descrição do trabalho para compreensão. Aceito sugestões sobre a melhor forma trabalhar esses dados<br></div><br><div>O
 banco de dados é oriundo  dois estudos realizados pelo mesmo grupo de 
pesquisa nas mesmas condições experimentais (animais,instalação,dieta,manejo) e avaliaram 48 variáveis.</div><div>Os fatores experimentais foram<span>:</span></div><div><strong><span>Raça</span></strong><span>:</span> Estudo 1 avaliou 12 animais (6 raça1 e 6 da raça 2). O estudo 2 avaliou 13 animais (6 raça 1 e 7 raça 2)</div><div><strong>Plano nutricional:</strong>  O estudo 1 avaliou os níveis (0,15,30) o estudo 2 avaliou os níveis (0,5,10,20)</div><div><strong>Dias em lactação-DEL</strong>
 (medidas repetidas no tempo):  Estudo 1, dias dispersos entre os 
períodos de 30 a 120 dias. No estudo 2 os DEL foram avaliados em dias 
entre 150 a 250 dias. </div><div><br></div><div><br></div><div>Eu realizei uma análise gráfica e 
não há indicações de haver diferenças entre estudos, o que era de certo 
modo esperado. Raça e DEL parecem ser os fatores que afetam as variáveis
 respostas.</div><br><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span>=========================================<br>
Fernando Souza<br>
Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal<br>
Celular: (31)99796-8781 (Vivo)<br>
<a href="mailto:e-mail%3Anandodesouza@gmail.com" target="_blank">E-mail:nandodesouza@gmail.com</a><br>
Lattes: <a href="http://lattes.cnpq.br/6519538815038307" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/6519538815038307</a><br>
Blog: <a href="https://producaoanimalcomr.wordpress.com/" target="_blank">https://producaoanimalcomr.wordpress.com/</a><br>
==========================================</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="noreferrer" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote></div>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="noreferrer" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span>=========================================<br>
Fernando Souza<br>
Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal<br>
Celular: (31)99796-8781 (Vivo)<br>
<a href="mailto:e-mail%3Anandodesouza@gmail.com" target="_blank">E-mail:nandodesouza@gmail.com</a><br>
Lattes: <a href="http://lattes.cnpq.br/6519538815038307" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/6519538815038307</a><br>
Blog: <a href="https://producaoanimalcomr.wordpress.com/" target="_blank">https://producaoanimalcomr.wordpress.com/</a><br>
==========================================</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="noreferrer" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote></div>