<p dir="ltr">O grupo rstats-db hoje desenvolve o DBI, responsável pelas ligações de SGBD com o R.<br>
Recomendo uso deste pacote quando for lidar com conexão odbc.</p>
<br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On sex, 25 de ago de 2017 11:55 Cesar Rabak <<a href="mailto:cesar.rabak@gmail.com">cesar.rabak@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Ah. . . a ditadura dos SW proprietários...<div><br></div><div>Pelo menos resolveu seu problema e pode seguir com a parte que interessa que são as análises!</div><div><br></div><div>Sucesso.</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2017-08-25 10:33 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil via R-br <span dir="ltr"><<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">Ei pessoal,</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">Obrigado pelas sugestões de todos. Não sei de onde veio essa informação de que RODBC estaria "deprecated" olhei no r-forge e parece estar ativo. A ultima atualização é do primeiro semestre de 2016. </div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">A saida do meu problema foi usando Rclient. Um R disponibilizado no sítio da microsoft, que já vem instalados com uma série de pacotes proprietários da Microsoft para integração com o SQL server 2016/2017. O nome do pacote é RevoScaleR.</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">Ao invés de fazer ...</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><span><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px">> p <- "SELECT model FROM [tempo_permanencia_models] WHERE id_model = 1022"</div></span><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px">> mod.teste.peq <- sqlQuery(conn, p) # que retorna o erro de memória!</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px">Eu fiz ...</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">mod.teste.peq</span><span style="font-size:12.8px"> </span> <- RxOdbcData(sqlQuery = "SELECT model FROM tempo_permanencia_models WHERE id_model=1018" ,connectionString = dbconn)</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">mod.teste.peq</span><span style="font-size:12.8px"> </span> <- rxReadObject(<span style="font-size:12.8px">mod.teste.peq </span>, decompress = "none")</div></div></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">Agora dá pra fazer as previsões novamente...</div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)">Abraço forte a todos, </div><span class="m_8756678615324381953HOEnZb"><font color="#888888"><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"> </div><div class="gmail_default" style="font-family:"arial black",sans-serif;font-size:small;color:rgb(7,55,99)"><br></div></font></span></div><div class="gmail_extra"><span class="m_8756678615324381953HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="'courier new', monospace" style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#000066">Pedro Brasil</font></div></div></div></div></div></div></font></span><div><div class="m_8756678615324381953h5">
<br><div class="gmail_quote">Em 2 de agosto de 2017 15:20, Leonard Assis via R-br <span dir="ltr"><<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>></span> escreveu:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="auto">RSQLServer não é boa alternativa, não sofre manutenção a tempos e depende de Java na máquina. Sugiro o pacote odbc.<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">SQL Server é mestre em dar problema no R comigo, mas o problema é na autenticação.</div></div><div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641HOEnZb"><div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">Em 1 de ago de 2017 9:14 AM, "Zhu Sha Zang via R-br" <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>> escreveu:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
<p>Parece que RODBC está "deprecated", tente usar o pacote
RSQLServer.</p>
<p><br>
</p>
<p>Atenciosamente<br>
</p>
<br>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850moz-cite-prefix">On 07/31/2017 01:53 PM, Cesar Rabak via
R-br wrote:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">Correto Pedro!
<div><br>
</div>
<div>Contudo, não entendo porque. . .</div>
<div><br>
</div>
<div>Minha forma de atacar esse problema seria mandar os dados
para o BD por outra maneira (que ñ via R) e tentar conectar
apenas para puxar os dados: aí a gente vê se é na criação do
BD via R que ele deixa em aberto um tamanho default muito
grande ou se é a chamada que por alguma coincidência cria um
default exigindo tanta memória (embora nos OSs modernos isso
não deveria gerar problema porque existem os gerenciadores de
memória virtual).</div>
<div><br>
</div>
<div>HTH</div>
<div>--</div>
<div>Cesar Rabak</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">2017-07-31 10:32 GMT-03:00 Pedro
Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil <span dir="ltr"><<a href="mailto:emmanuel.brasil@gmail.com" target="_blank">emmanuel.brasil@gmail.com</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763">Cesar,</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763"><br>
</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763">A função
RODBC::sqlQuery não tem exemplo, mas já usei diversas
vezes com outros scripts e funciona. Esse problema está
acontecendo somente no exemplo dessa conexão em
específico. Então estou entendendo a partir de agora que
alguma configuração da conexão está pedindo pra
reservar memória mais do que o a máquina possui. </div>
</div>
<div class="gmail_extra"><span class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all">
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="'courier new', monospace" color="#000066">Pedro Brasil</font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</font></span>
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850h5">
<br>
<div class="gmail_quote">Em 29 de julho de 2017 20:45,
Cesar Rabak <span dir="ltr"><<a href="mailto:cesar.rabak@gmail.com" target="_blank">cesar.rabak@gmail.com</a>></span>
escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Pedro,
<div><br>
</div>
<div>Calloc é uma chamada "primitiva" para o R,
uma função da biblioteca C e é uma função
feita para "alocar" (reservar) memória e
zerá-la.</div>
<div><br>
</div>
<div>O estranho, para mim, é a tentativa do
aplicativo de reservar <b>tanta</b> memória
assim na chamada da função do R.</div>
<div><br>
</div>
<div>Essa função sqlQuery() pode ser testada
fazendo:</div>
<div><br>
</div>
<div>> example(sqlQuery)</div>
<div><br>
</div>
<div>?</div>
<div><br>
</div>
<div>Se o exemplo do próprio pacote funcionar,
aí teremos que fazer uma busca para ver de
onde vem esse comportamento.</div>
<div><br>
</div>
<div>HTH</div>
<div>--</div>
<div>Cesar Rabak</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055HOEnZb">
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055h5">
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">2017-07-28 17:12
GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga
Americano do Brasil <span dir="ltr"><<a href="mailto:emmanuel.brasil@gmail.com" target="_blank">emmanuel.brasil@gmail.com</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763">Ei
Cesar,</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763"><br>
</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763">Eu
tenho pouco familiaridade com SQL, e
o amigo da TI que tem e faz
manutenção do servidor diz que o
erro é na minha estação com R. Eu
acho que não, mas não tenho certeza
porque eu não sei ao certo o que
quer dizer esse erro. O que seria
essa "Calloc"? É uma coisa natural
do R?</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763"><br>
</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:arial black,sans-serif;font-size:small;color:#073763">Abraço,</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566m_-2957336891499193865gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="'courier new',
monospace" color="#000066">Pedro
Brasil</font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566h5">
<br>
<div class="gmail_quote">Em 28 de
julho de 2017 16:59, Cesar Rabak
<span dir="ltr"><<a href="mailto:cesar.rabak@gmail.com" target="_blank">cesar.rabak@gmail.com</a>></span>
escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Pedro,
<div><br>
</div>
<div>Mesmo sem poder fazer
uma tentativa, me parece
que o erro é estranho
demais para não ser
notado: a chamada à
primitiva da ling. C
"calloc" está pedindo 200
Gbytes, que falha e me
parece algo grande demais
para um "default" da
chamada a sqlQuery().</div>
<div><br>
</div>
<div>HTH</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566m_-2957336891499193865h5">2017-07-28
9:42 GMT-03:00 Pedro
Emmanuel Alvarenga
Americano do Brasil
via R-br <span dir="ltr"><<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>></span>:<br>
</div>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566m_-2957336891499193865h5">
<div dir="ltr">
<div class="gmail_default">Amigos
de R,</div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">Estou
envolvido numa
tarefa que
importo um banco
SQL de um
servidor, faço
uma modelagem,
salvo o modelo
no SQL através
de uma
seriliazação, e
depois carrego
esse modelo do
SQL para fazer
previsões em
novos dados. </div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">Estou
seguindo um
exemplo
disponível nessa
página:</div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763"><a href="https://docs.microsoft.com/pt-br/sql/advanced-analytics/tutorials/walkthrough-deploy-and-use-the-model" target="_blank">https://docs.microsoft.com/pt-br/sql/advanced-analytics/tutorials/walkthrough-deploy-and-use-the-model</a></font><br>
</div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763"><br>
</font></div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763">Sei
que esse
exemplo não é
reproduzível
porque depende
da conexão com
o servidor e
credenciais
que não posso
divulgar. Mas
se alguem já
passou por
esse problema
poderia pelo
menos indicar
aonde está o
problema que
não estou
sabendo
identificar?
Acho que muito
provavelmente
seria uma
configuração
do SQL no
servidor... </font></div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763"><br>
</font></div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763">
<div class="gmail_default">library(RODBC) </div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">#
define
database
connection
string</div>
<div class="gmail_default">dbconn
<-
'Driver={SQL
Server};Server=BLABLABLA;Database=BLABLABLA;Trusted_Connection=yes;' </div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">#
define a
connection</div>
<div class="gmail_default">conn
<-
odbcDriverConnect(connection
= dbconn) </div>
</font></div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763"><br>
</font></div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763">#
Estou fazendo
o exemplo com
o objeto
LETTERS só pra
ter certeza
que é um
objeto pequeno
e que não
deveria ser um
problema de
memória do R.</font></div>
<div class="gmail_default"><span>>
LETTERS</span><br>
</div>
<div class="gmail_default"><font face="arial
black,
sans-serif" color="#073763">
<div class="gmail_default"> [1]
"A" "B" "C"
"D" "E" "F"
"G" "H" "I"
"J" "K" "L"
"M" "N" "O"
"P" "Q" "R"
"S" "T" "U"
"V" "W" "X"</div>
<div class="gmail_default">[25]
"Y" "Z"</div>
<div class="gmail_default">>
teste_pequeno
<-
serialize(LETTERS,
connection =
NULL)</div>
<div class="gmail_default">>
teste_pequeno
<-
paste(teste_pequeno,
collapse = "")</div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">#
o EXEC
PersistModel
faz </div>
<div class="gmail_default">#
insert into
[tempo_permanencia_models]
(model,
[description])
values
(convert(varbinary(max),@m,2),
@description)</div>
<div class="gmail_default">#
insere o
modelo e uma
descricao</div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">>
p <-
paste("EXEC
PersistModel
@m='",
teste_pequeno,"',
@description =
'Teste de
serialização
objeto
pequeno'", sep
= "")</div>
<div class="gmail_default">>
sqlQuery(conn,
p)</div>
<div class="gmail_default">character(0)</div>
<div class="gmail_default">>
rm(teste_pequeno)</div>
<div class="gmail_default">>
p <-
"SELECT model
FROM
[tempo_permanencia_models]
WHERE id_model
= 1022"</div>
<div class="gmail_default">>
mod.teste.peq
<-
sqlQuery(conn,
p)</div>
<div class="gmail_default">Error
in
odbcQuery(channel,
query,
rows_at_time)
: </div>
<div class="gmail_default">
'Calloc' could
not allocate
memory
(214748364800
of 1 bytes)</div>
<div class="gmail_default">>
p <-
paste0("SELECT
id_model,
description
FROM
[tempo_permanencia_models]
WHERE id_model
= 1022")<br>
</div>
<div class="gmail_default">>
sqlQuery(conn,
p) #</div>
<div class="gmail_default">
id_model
description</div>
<div class="gmail_default">1
1022
Teste de
serialização
objeto pequeno<br>
</div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">Reparem
que o objeto
está salvo no
servidor. Foi
salvo a partir
do R, mas não
retorna para o
R por conta do
erro de
memoria. Eu
não estou
sabendo nem
por onde
começar.</div>
</font></div>
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div class="gmail_default">Que
a força esteja
sempre com vocês
e abraço forte. </div>
<span class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566m_-2957336891499193865m_-5822651748509058777HOEnZb"><font color="#888888">
<div class="gmail_default"><br>
</div>
<div>
<div class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850m_1601941344025199055m_-5566544572137748566m_-2957336891499193865m_-5822651748509058777m_2794565606116428888gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="'courier new',
monospace" color="#000066">Pedro
Brasil</font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</font></span></div>
<br>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
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e forneça código mínimo
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Leia o guia de postagem (<a class="m_8756678615324381953m_-5413603082970993641m_8560778172532389016m_2731189320189225850moz-txt-link-freetext" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</pre>
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