<div dir="ltr">Mauricio,<div><br></div><div>1) Penso que seja apropriado que um tema novo seja encaminhado por meio de e-mail específico. Fica mais fácil o acompanhamento da discussão e os e-mails ficam menos poluídos.</div><div><br></div><div>2) Estou interessado na geração de matriz de dissimilaridade com dados qualitativos e quantitativos. Qual é a função que você está utilizando? Ou, que tipo de distancia está utilizando?</div><div><br></div><div>Luiz Roberto.</div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div>Luiz Roberto Martins Pinto<br>Prof. Pleno/DCET/UESC</div><div>Laboratório de Estatística Computacional</div><div>Universidade Estadual de Santa Cruz</div><div>Ilhéus-Bahia-Brasil<br><br><a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com" target="_blank">luizroberto.uesc@gmail.com</a><br>skype: lrmpinto</div>
<div><a href="http://lattes.cnpq.br/2732314327604831" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/2732314327604831</a> <br><br><br></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">Em 9 de fevereiro de 2016 14:55, <span dir="ltr"><<a href="mailto:mau.gm@hotmail.com" target="_blank">mau.gm@hotmail.com</a>></span> escreveu:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<p dir="ltr">Boa tarde. <br>
Estou tentando obter uma matriz de dissimilaridade genética, a partir de dados qualitativos e quantitativos, de 208 linhagens de mamoneira.
<br>
Entretanto só consigo visualizar parte da matriz. Como obter a matriz completa e salvá-la em planilha Excel?
</p>
<p dir="ltr">Obrigado </p>
<p dir="ltr">Maurício Silva</p>
<p dir="ltr">Enviado do <a href="https://aka.ms/blhgte" target="_blank">Outlook Mobile</a><br>
</p>
<br>
<br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Tue, Feb 9, 2016 at 6:00 AM -0800, <span dir="ltr"><<a href="mailto:r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br</a>></span> wrote:<br>
<br>
</div>
<div>
<div>Enviar submissões para a lista de discussão R-br para <br>
<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<br>
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço<br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou<br>
corpo da mensagem para <br>
<a href="mailto:r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<br>
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo<br>
endereço<br>
<a href="mailto:r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<br>
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será<br>
mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."<br>
<br>
<br>
Tópicos de Hoje:<br>
<br>
1. Re: Bug report (Thiago V. dos Santos)<br>
2. Re: Função com vários if e else if que não é<br>
SpatialGridDataFrame (Éder Comunello)<br>
3. Re: Número máximo de variáveis (Éder Comunello)<br>
4. Re: Função com vários if e else if que não é<br>
SpatialGridDataFrame [RESOLVIDO] (ASANTOS)<br>
5. Re: Número máximo de variáveis (Alexandre Loures)<br>
6. Re: Bug report (Leonard Assis)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Mon, 8 Feb 2016 14:42:22 +0000 (UTC)<br>
From: "Thiago V. dos Santos" <<a href="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br" target="_blank">thi_veloso@yahoo.com.br</a>><br>
To: "<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>" <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>><br>
Subject: Re: [R-br] Bug report<br>
Message-ID:<br>
<<a href="mailto:1313169499.699118.1454942542137.JavaMail.yahoo@mail.yahoo.com" target="_blank">1313169499.699118.1454942542137.JavaMail.yahoo@mail.yahoo.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Se você já tem certeza que é bug, o primeiro passo que eu daria seria contatar os autores e/ou mantenedores do pacote: <a href="https://cran.r-project.org/web/packages/neuralnet/index.html" target="_blank">https://cran.r-project.org/web/packages/neuralnet/index.html</a> Greetings, --
Thiago V. dos Santos<br>
PhD studentLand and Atmospheric ScienceUniversity of Minnesota <br>
<br>
On Monday, February 8, 2016 6:56 AM, Leonard de Assis <<a href="mailto:assis.leonard@gmail.com" target="_blank">assis.leonard@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
<br>
<!--#yiv2394202994 _filtered #yiv2394202994 {font-family:"Cambria Math";panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;} _filtered #yiv2394202994 {font-family:Calibri;panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}#yiv2394202994 #yiv2394202994 p.yiv2394202994MsoNormal, #yiv2394202994 li.yiv2394202994MsoNormal,
#yiv2394202994 div.yiv2394202994MsoNormal {margin:0cm;margin-bottom:.0001pt;font-size:11.0pt;font-family:"Calibri", sans-serif;}#yiv2394202994 a:link, #yiv2394202994 span.yiv2394202994MsoHyperlink {color:#0563C1;text-decoration:underline;}#yiv2394202994 a:visited,
#yiv2394202994 span.yiv2394202994MsoHyperlinkFollowed {color:#954F72;text-decoration:underline;}#yiv2394202994 span.yiv2394202994EstiloDeEmail17 {font-family:"Calibri", sans-serif;color:windowtext;}#yiv2394202994 .yiv2394202994MsoChpDefault {font-family:"Calibri",
sans-serif;} _filtered #yiv2394202994 {margin:70.85pt 3.0cm 70.85pt 3.0cm;}#yiv2394202994 div.yiv2394202994WordSection1 {}-->Bom dia a todos Eu estava (na verdade, ainda estou) com um problema no pacote neuralnet. O fato é que se descobriu que o problema
é bug do pacote, a pergunta então fica: como devo fazer para reportar este problema? <br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forne� c�igo m�imo reproduz�el.<br>
<br>
<br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/f9835033/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/f9835033/attachment-0001.html</a>><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo não-texto foi limpo...<br>
Nome: não disponível<br>
Tipo: image/png<br>
Tamanho: 7861 bytes<br>
Descrição: não disponível<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/f9835033/attachment-0001.png" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/f9835033/attachment-0001.png</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Mon, 8 Feb 2016 12:14:38 -0300<br>
From: Éder Comunello <<a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">comunello.eder@gmail.com</a>><br>
To: ASANTOS <<a href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>><br>
Cc: "<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>" <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>><br>
Subject: Re: [R-br] Função com vários if e else if que não é<br>
SpatialGridDataFrame<br>
Message-ID:<br>
<<a href="mailto:CABmC8gnHfswFsZPumokW-e563HRQY1mqGpzmNyCz52-NoJbDpQ@mail.gmail.com" target="_blank">CABmC8gnHfswFsZPumokW-e563HRQY1mqGpzmNyCz52-NoJbDpQ@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Alexandre, bom dia!<br>
<br>
Fiz apenas uma pequena alteração indicada no código.<br>
<br>
### <code r><br>
require(raster)<br>
require(sp)<br>
<br>
# RasterLayer inventado<br>
r <- raster(nrows=10, ncols=10)<br>
r <- setValues(r, 1:ncell(r))<br>
plot(r)<br>
<br>
band2<- as(r, 'SpatialGridDataFrame') ### transforma em<br>
SpatialGridDataFrame<br>
<br>
<br>
##Função para conversão DN para radiância - LISS III<br>
---------------------------<br>
radconvL<-function(x, band = 2)<br>
{<br>
Lmax <- switch(as.character(band),<br>
"2" = 120.64,<br>
"3" = 151.31,<br>
"4" = 157.57,<br>
"5" = 69.03,<br>
NA)<br>
<br>
if (<a href="http://is.na" target="_blank">is.na</a>(Lmax)) stop("invalid band")<br>
<br>
Lmin = 0<br>
Qmax = 127<br>
x <- as.vector(as.matrix(x))<br>
results <- band2 ### <==== alterado aqui!!!<br>
<br>
x <- Lmin + ((Lmax-Lmin)*x)/Qmax<br>
if (class(results) == "SpatialGridDataFrame")<br>
results@data[, 1] <- x<br>
else if (is.data.frame(x))<br>
results <- data.frame(matrix(x, nrow = nrow(results),<br>
ncol = ncol(results)))<br>
else results <- x<br>
print(paste(band, Lmax))<br>
print(results)<br>
results<br>
}<br>
######--<br>
<br>
teste2<-radconvL(band2, band = 2)<br>
spplot(teste2)<br>
<br>
teste3<-radconvL(band2, band = 3)<br>
teste1<-radconvL(band2, band = 1)<br>
<br>
### </code><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
================================================<br>
Éder Comunello<br>
PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)<br>
Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)<br>
Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]<br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/09d04cf3/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/09d04cf3/attachment-0001.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 3<br>
Date: Mon, 8 Feb 2016 13:53:55 -0300<br>
From: Éder Comunello <<a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">comunello.eder@gmail.com</a>><br>
To: "<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>" <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>><br>
Subject: Re: [R-br] Número máximo de variáveis<br>
Message-ID:<br>
<CABmC8gmDnz4f0E2FdoQ=<a href="mailto:c7_hYF7ab4GigVZr2FMN5J2FRi24Bg@mail.gmail.com" target="_blank">c7_hYF7ab4GigVZr2FMN5J2FRi24Bg@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Alexandre, boa tarde!<br>
<br>
Acredito que o que esteja dando problemas não é o número de colunas, mas<br>
sim o tamanho dos objetos. Verifique com memory.size() antes da operação e<br>
veja se há espaço suficiente para alocar object.size() do último objeto.<br>
Pra funcionar, além de quantidade, é necessário que o espaço de memória<br>
esteja em um bloco de endereço contínuo.<br>
<br>
Abaixo fiz um teste com cbind, trabalhando com 1000x mais colunas e rodou<br>
legal. Só que o tamanho dos objetos é pequeno...<br>
<br>
### <code r><br>
n <- c(30, 217, 181, 4123, 3439)<br>
n <- n*1000<br>
<br>
for (i in 1:5) assign(letters[i], t(cbind(rnorm(n[i]), runif(n[i]))))<br>
ls() # [1] "a" "b" "c" "d" "e" "i" "n"<br>
<br>
for (i in 1:5) print(object.size(get(letters[i])), units="Mb")<br>
# 0.5 Mb<br>
# 3.3 Mb<br>
# 2.8 Mb<br>
# 62.9 Mb<br>
# 52.5 Mb<br>
<br>
x <- cbind(a, b, c, d, e)<br>
str(x)<br>
# num [1:2, 1:7990000] 0.675 0.15 -0.979 0.681 -0.944 ...<br>
<br>
print(object.size(x), units="Mb")<br>
# 121.9 Mb<br>
<br>
gc()<br>
### </code><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
================================================<br>
Éder Comunello<br>
PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)<br>
Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)<br>
Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
Em 7 de fevereiro de 2016 14:12, Alexandre Loures <<br>
<a href="mailto:alexandre.loures@ymail.com" target="_blank">alexandre.loures@ymail.com</a>> escreveu:<br>
<br>
> Boa tarde pessoal!<br>
><br>
> Estou tentando fazer um cbind em cinco objetos (a, b, c, d, e). Porém no<br>
> último (fiz separado para ter certeza quando apareceria o erro) aparece a<br>
> seguinte mensagem de erro:<br>
><br>
> Erro: não é possível alocar vetor de tamanho 2.0 Mb<br>
><br>
> Tenho a seguinte quantidade de variáveis em cada um dos objetos:<br>
><br>
> a = 30<br>
> b = 217<br>
> c = 181<br>
> d = 4123<br>
> e = 3439<br>
><br>
> Total = 7990<br>
><br>
> Minha dúvida é: há limite de variáveis no R e por isso está reportando o<br>
> erro supracitado.<br>
><br>
><br>
> Desde já muito obrigado!<br>
><br>
><br>
> --<br>
> *Alexandre Rodrigues Loures*<br>
> Doutorando em Economia Aplicada<br>
> Universidade Federal da Paraíba - UFPB<br>
> Centro de Ciências Sociais Aplicadas - CCSA<br>
> Programa de Pós-Graduação em Economia - PPGE<br>
> Site: <a href="http://www.ccsa.ufpb.br/ppge" target="_blank">www.ccsa.ufpb.br/ppge</a><br>
> [image: orcid] <a href="http://www.orcid.org/0000-0002-1288-0135" target="_blank">www.orcid.org/0000-0002-1288-0135</a><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
> código mínimo reproduzível.<br>
><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/93ba6dcb/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/93ba6dcb/attachment-0001.html</a>><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo não-texto foi limpo...<br>
Nome: iD icon.gif<br>
Tipo: image/gif<br>
Tamanho: 1221 bytes<br>
Descrição: não disponível<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/93ba6dcb/attachment-0001.gif" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/93ba6dcb/attachment-0001.gif</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 4<br>
Date: Mon, 8 Feb 2016 17:36:23 -0300<br>
From: ASANTOS <<a href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>><br>
To: <a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">comunello.eder@gmail.com</a><br>
Cc: "<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>" <<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>><br>
Subject: Re: [R-br] Função com vários if e else if que não é<br>
SpatialGridDataFrame [RESOLVIDO]<br>
Message-ID: <<a href="mailto:56B8FC47.6010309@yahoo.com.br" target="_blank">56B8FC47.6010309@yahoo.com.br</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"<br>
<br>
Muito obrigado Éder, funcionou perfeitamente!!!!!!<br>
<br>
Também tem outra alteração que resolve o meu problema e aumenta <br>
a velocidade de processamento, uma vez que tenho rasters muito grandes, <br>
sendo:<br>
<br>
radconvL <- function(x, band = 2) {<br>
Lmax <- switch(band,<br>
"2" = 120.64,<br>
"3" = 151.31,<br>
"4" = 157.57,<br>
"5" = 69.03,<br>
NA)<br>
<br>
if (<a href="http://is.na" target="_blank">is.na</a>(Lmax)) stop("invalid band")<br>
Lmin = 0<br>
Qmax = 127<br>
setValues(x, Lmin + ((Lmax-Lmin)*values(x))/Qmax)<br>
}<br>
<br>
library(raster)<br>
b <- brick(system.file("external/rlogo.grd", package="raster"))<br>
test <- radconvL(b[[2]], band = 2)<br>
<br>
Abraços,<br>
<br>
-- <br>
======================================================================<br>
Alexandre dos Santos<br>
Proteção Florestal<br>
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso<br>
Campus Cáceres<br>
Caixa Postal 244<br>
Avenida dos Ramires, s/n<br>
Bairro: Distrito Industrial<br>
Cáceres - MT CEP: 78.200-000<br>
Fone: <a href="tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112" value="+556581328112" target="_blank">(+55) 65 8132-8112</a> (TIM) <a href="tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970" value="+556596866970" target="_blank">(+55) 65 9686-6970</a> (VIVO)<br>
<a href="mailto:e-mails%3Aalexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br</a><br>
<a href="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br" target="_blank">alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br</a><br>
Lattes: <a href="http://lattes.cnpq.br/1360403201088680" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/1360403201088680</a><br>
OrcID: <a href="http://orcid.org/0000-0001-8232-6722" target="_blank">orcid.org/0000-0001-8232-6722</a><br>
Researchgate: <a href="https://www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10</a><br>
LinkedIn: <a href="https://br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635" target="_blank">https://br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635</a><br>
======================================================================<br>
<br>
Em 08/02/2016 12:14, Éder Comunello escreveu:<br>
> Alexandre, bom dia!<br>
><br>
> Fiz apenas uma pequena alteração indicada no código.<br>
><br>
> ### <code r><br>
> require(raster)<br>
> require(sp)<br>
><br>
> # RasterLayer inventado<br>
> r <- raster(nrows=10, ncols=10)<br>
> r <- setValues(r, 1:ncell(r))<br>
> plot(r)<br>
><br>
> band2<- as(r, 'SpatialGridDataFrame') ### transforma em <br>
> SpatialGridDataFrame<br>
><br>
><br>
> ##Função para conversão DN para radiância - LISS III <br>
> ---------------------------<br>
> radconvL<-function(x, band = 2)<br>
> {<br>
> Lmax <- switch(as.character(band),<br>
> "2" = 120.64,<br>
> "3" = 151.31,<br>
> "4" = 157.57,<br>
> "5" = 69.03,<br>
> NA)<br>
><br>
> if (<a href="http://is.na" target="_blank">is.na</a> <<a>http://is.na>(Lmax</a>)) stop("invalid band")<br>
><br>
> Lmin = 0<br>
> Qmax = 127<br>
> x <- as.vector(as.matrix(x))<br>
> results <- band2 ### <==== alterado aqui!!!<br>
><br>
> x <- Lmin + ((Lmax-Lmin)*x)/Qmax<br>
> if (class(results) == "SpatialGridDataFrame")<br>
> results@data[, 1] <- x<br>
> else if (is.data.frame(x))<br>
> results <- data.frame(matrix(x, nrow = nrow(results),<br>
> ncol = ncol(results)))<br>
> else results <- x<br>
> print(paste(band, Lmax))<br>
> print(results)<br>
> results<br>
> }<br>
> ######--<br>
><br>
> teste2<-radconvL(band2, band = 2)<br>
> spplot(teste2)<br>
><br>
> teste3<-radconvL(band2, band = 3)<br>
> teste1<-radconvL(band2, band = 1)<br>
><br>
> ### </code><br>
><br>
><br>
><br>
> <br>
> ================================================<br>
> Éder Comunello<br>
> PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)<br>
> Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)<br>
> Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]<br>
><br>
><br>
><br>
<br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/319620ad/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/319620ad/attachment-0001.html</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 5<br>
Date: Mon, 8 Feb 2016 20:03:47 -0300<br>
From: Alexandre Loures <<a href="mailto:alexandre.loures@ymail.com" target="_blank">alexandre.loures@ymail.com</a>><br>
To: <a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>, <a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">comunello.eder@gmail.com</a><br>
Subject: Re: [R-br] Número máximo de variáveis<br>
Message-ID: <<a href="mailto:56B91ED3.4040107@ymail.com" target="_blank">56B91ED3.4040107@ymail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"<br>
<br>
Boa noite Éder! Muito obrigado pelo retorno!<br>
<br>
Meus objetos possuem:<br>
<br>
72.7 Mb<br>
455.6 Mb<br>
382.4 Mb<br>
8401.1 Mb<br>
7009.7 Mb<br>
<br>
Mas defini o uso da memória em 36Gb. Logo não estou entendo porque não <br>
consigo fazer o cbind dos cinco objetos.<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
Em 08/02/2016 13:53, Éder Comunello escreveu:<br>
> Alexandre, boa tarde!<br>
><br>
> Acredito que o que esteja dando problemas não é o número de colunas, <br>
> mas sim o tamanho dos objetos. Verifique com memory.size() antes da <br>
> operação e veja se há espaço suficiente para alocar object.size() do <br>
> último objeto. Pra funcionar, além de quantidade, é necessário que o <br>
> espaço de memória esteja em um bloco de endereço contínuo.<br>
><br>
> Abaixo fiz um teste com cbind, trabalhando com 1000x mais colunas e <br>
> rodou legal. Só que o tamanho dos objetos é pequeno...<br>
><br>
> ### <code r><br>
> n <- c(30, 217, 181, 4123, 3439)<br>
> n <- n*1000<br>
><br>
> for (i in 1:5) assign(letters[i], t(cbind(rnorm(n[i]), runif(n[i]))))<br>
> ls() # [1] "a" "b" "c" "d" "e" "i" "n"<br>
><br>
> for (i in 1:5) print(object.size(get(letters[i])), units="Mb")<br>
> # 0.5 Mb<br>
> # 3.3 Mb<br>
> # 2.8 Mb<br>
> # 62.9 Mb<br>
> # 52.5 Mb<br>
><br>
> x <- cbind(a, b, c, d, e)<br>
> str(x)<br>
> # num [1:2, 1:7990000] 0.675 0.15 -0.979 0.681 -0.944 ...<br>
><br>
> print(object.size(x), units="Mb")<br>
> # 121.9 Mb<br>
><br>
> gc()<br>
> ### </code><br>
><br>
><br>
><br>
> <br>
> ================================================<br>
> Éder Comunello<br>
> PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)<br>
> Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)<br>
> Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> Em 7 de fevereiro de 2016 14:12, Alexandre Loures <br>
> <<a href="mailto:alexandre.loures@ymail.com" target="_blank">alexandre.loures@ymail.com</a> <<a href="mailto:alexandre.loures@ymail.com" target="_blank">mailto:alexandre.loures@ymail.com</a>>> escreveu:<br>
><br>
> Boa tarde pessoal!<br>
><br>
> Estou tentando fazer um cbind em cinco objetos (a, b, c, d, e).<br>
> Porém no último (fiz separado para ter certeza quando apareceria o<br>
> erro) aparece a seguinte mensagem de erro:<br>
><br>
> Erro: não é possível alocar vetor de tamanho 2.0 Mb<br>
><br>
> Tenho a seguinte quantidade de variáveis em cada um dos objetos:<br>
><br>
> a = 30<br>
> b = 217<br>
> c = 181<br>
> d = 4123<br>
> e = 3439<br>
><br>
> Total = 7990<br>
><br>
> Minha dúvida é: há limite de variáveis no R e por isso está<br>
> reportando o erro supracitado.<br>
><br>
><br>
> Desde já muito obrigado!<br>
><br>
><br>
> -- <br>
> *Alexandre Rodrigues Loures*<br>
> Doutorando em Economia Aplicada<br>
> Universidade Federal da Paraíba - UFPB<br>
> Centro de Ciências Sociais Aplicadas - CCSA<br>
> Programa de Pós-Graduação em Economia - PPGE<br>
> Site: <a href="http://www.ccsa.ufpb.br/ppge" target="_blank">www.ccsa.ufpb.br/ppge</a> <<a href="http://www.ccsa.ufpb.br/ppge" target="_blank">http://www.ccsa.ufpb.br/ppge</a>><br>
> orcid <a href="http://www.orcid.org/0000-0002-1288-0135" target="_blank">www.orcid.org/0000-0002-1288-0135</a><br>
> <<a href="http://www.orcid.org/0000-0002-1288-0135" target="_blank">http://www.orcid.org/0000-0002-1288-0135</a>><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a> <<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e<br>
> forneça código mínimo reproduzível.<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.<br>
<br>
-- <br>
*Alexandre Rodrigues Loures*<br>
Doutorando em Economia Aplicada<br>
Universidade Federal da Paraíba - UFPB<br>
Centro de Ciências Sociais Aplicadas - CCSA<br>
Programa de Pós-Graduação em Economia - PPGE<br>
Site: <a href="http://www.ccsa.ufpb.br/ppge" target="_blank">www.ccsa.ufpb.br/ppge</a><br>
orcid <a href="http://www.orcid.org/0000-0002-1288-0135" target="_blank">www.orcid.org/0000-0002-1288-0135</a><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0001.html</a>><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo não-texto foi limpo...<br>
Nome: não disponível<br>
Tipo: image/gif<br>
Tamanho: 1221 bytes<br>
Descrição: não disponível<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0002.gif" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0002.gif</a>><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo não-texto foi limpo...<br>
Nome: iD icon.gif<br>
Tipo: image/gif<br>
Tamanho: 1221 bytes<br>
Descrição: não disponível<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0003.gif" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160208/2b057d21/attachment-0003.gif</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 6<br>
Date: Tue, 9 Feb 2016 10:33:43 -0200<br>
From: Leonard Assis <<a href="mailto:assis.leonard@gmail.com" target="_blank">assis.leonard@gmail.com</a>><br>
To: "Thiago V. dos Santos" <<a href="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br" target="_blank">thi_veloso@yahoo.com.br</a>>,<br>
<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
Subject: Re: [R-br] Bug report<br>
Message-ID:<br>
<<a href="mailto:CAEG0FK8CG0H%2B4u5ZyS0uazg3hcG%2Bw6GqaGDpwCxtf8-shgjF5A@mail.gmail.com" target="_blank">CAEG0FK8CG0H+4u5ZyS0uazg3hcG+w6GqaGDpwCxtf8-shgjF5A@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
É bug<br>
Já até sei como corrige (e já corrigi nos fontes deles).<br>
É um erro louco no plot.nn que não gera o plot no rmarkdown<br>
Em 8 de fev de 2016 12:42 PM, "Thiago V. dos Santos" <<br>
<a href="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br" target="_blank">thi_veloso@yahoo.com.br</a>> escreveu:<br>
<br>
> Se você já tem certeza que é bug, o primeiro passo que eu daria seria<br>
> contatar os autores e/ou mantenedores do pacote:<br>
> <a href="https://cran.r-project.org/web/packages/neuralnet/index.html" target="_blank">https://cran.r-project.org/web/packages/neuralnet/index.html</a><br>
><br>
> Greetings,<br>
> -- Thiago V. dos Santos<br>
><br>
> PhD student<br>
> Land and Atmospheric Science<br>
> University of Minnesota<br>
><br>
><br>
> On Monday, February 8, 2016 6:56 AM, Leonard de Assis <<br>
> <a href="mailto:assis.leonard@gmail.com" target="_blank">assis.leonard@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
><br>
> Bom dia a todos<br>
><br>
> Eu estava (na verdade, ainda estou) com um problema no pacote neuralnet.<br>
><br>
> O fato é que se descobriu que o problema é bug do pacote, a pergunta então<br>
> fica: como devo fazer para reportar este problema?<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forne� c�igo<br>
> m�imo reproduz�el.<br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
> código mínimo reproduzível.<br>
><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo em HTML foi limpo...<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160209/133a879d/attachment-0001.html" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160209/133a879d/attachment-0001.html</a>><br>
-------------- Próxima Parte ----------<br>
Um anexo não-texto foi limpo...<br>
Nome: não disponível<br>
Tipo: image/png<br>
Tamanho: 7861 bytes<br>
Descrição: não disponível<br>
URL: <<a href="http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160209/133a879d/attachment-0001.png" target="_blank">http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20160209/133a879d/attachment-0001.png</a>><br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Subject: Legenda do Digest<br>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Fim da Digest R-br, volume 62, assunto 9<br>
****************************************<br>
</div>
</div>
</div>
<br>_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="noreferrer" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></blockquote></div><br></div>