<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<title></title>
</head>
<body><div>Luiz Roberto,<br></div>
<div> </div>
<div>O que o exemplo está medindo é se a proporção de fumantes é diferente entre os quatro grupos; "pacientes" é o denominador e "fumantes" é o numerador. O exemplo não está comparando uma terceira característica entre dois grupos diferentes. Por isso a função não aceita valores faltantes: é impossível calcular a proporção de um grupo quando seu numerador ou denominador está faltando.<br></div>
<div> </div>
<div>Att,<br></div>
<div> </div>
<div id="sig4487139"><div class="signature" id="signature"><a href="http://lattes.cnpq.br/9234772336296638" title="Currículo Lattes">Leonardo Ferreira Fontenelle</a><br></div>
</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>Em Qua 19 ago. 2015, às 19:17, Luiz Roberto Martins Pinto escreveu:<br></div>
<blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div>Eu recorri à função que o Leonardo sugeriu... e rodei..<br></div>
<div> </div>
<div># Sugestão do Leonardo:<br></div>
<div> </div>
<div><div style="font-size:12.8px;"><div style="font-size:12.8px;">A1= as.integer(c("1",NA,"1","0","1","0","1","1","0","1","1","0","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1",NA,"1",NA,"0","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","0","1","0","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","0"))<br></div>
<div style="font-size:12.8px;">A2= as.integer(c("1","1","1","0","1","0","1","1","0","1","1","0","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"1","0","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","0","1","0","1",NA,NA,"1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1"))<br></div>
<div style="font-size:12.8px;"> </div>
</div>
<div><div style="font-size:12.8px;"> sucA1=sum(A1, na.rm = TRUE)<br></div>
<div style="font-size:12.8px;"> sucA2=sum(A2, na.rm = TRUE)<br></div>
<div><div style="font-size:12.8px;"> tenA1=length(na.omit(A1))<br></div>
<div style="font-size:12.8px;"> tenA2=length(na.omit(A2))<br></div>
<div><span style="font-size:12.8px" class="size">prop.test(c(sucA1,sucA2),c(tenA1,tenA2)).</span><br></div>
</div>
</div>
<div> </div>
<div># De acordo com a função:<br></div>
<div> </div>
<div><div>smokers <- c( 83, 90, 129, 70 )<br></div>
<div>patients <- c( 86, 93, 136, 82 )<br></div>
<div>prop.test(smokers, patients) <br></div>
</div>
<div> </div>
<div># Então, semelhantemente, rodei:<br></div>
<div> </div>
<div>prop.test(A1, A2) <br></div>
<div> </div>
<div># Output:<br></div>
<div> </div>
<div>Erro em prop.test(A1, A2) : elements of 'n' must be positive.<br></div>
<div> </div>
<div>Comentário: acredito que a função não admite dados perdidos 'NA'.<br></div>
<div> </div>
<div>É isto mesmo?<br></div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
</div>
</div>
<div><div> </div>
<div><div><div dir="ltr"><div><div><div>Luiz Roberto Martins Pinto<br></div>
<div>Prof. Pleno/DCET/UESC<br></div>
</div>
<div>Laboratório de Estatística Computacional<br></div>
<div>Universidade Estadual de Santa Cruz<br></div>
<div><div>Ilhéus-Bahia-Brasil<br></div>
<div> </div>
<div><a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a><br></div>
<div>skype: lrmpinto<br></div>
</div>
<div><div><a href="http://lattes.cnpq.br/2732314327604831">http://lattes.cnpq.br/2732314327604831</a> <br></div>
<div> </div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div> </div>
<div><div>Em 19 de agosto de 2015 18:57, Luiz Roberto Martins Pinto <span dir="ltr"><<a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a>></span> escreveu:<br></div>
<blockquote style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex;"><div dir="ltr"><div>Semelhança no perfil.<br></div>
<div> </div>
<div>O perfil de cada acesso é descrito por 101 marcadores moleculares.<br></div>
<div> </div>
<div>Pensando, agora, na sugestão do Leonardo, e pensando no seu questionamento, talvez avaliar a proporção de marcadores iguais fosse uma boa análise deste perfil. Não tinha pensado nisto...<br></div>
<div> </div>
<div> </div>
<div><span><span style="color:rgb(136, 136, 136)" class="colour">Luiz Roberto.</span></span><br></div>
<div> </div>
<div> </div>
</div>
<div><div><span><br clear="all"></span></div>
<div><div><div dir="ltr"><div><div><span>Luiz Roberto Martins Pinto<br>Prof. Pleno/DCET/UESC</span></div>
<div><span>Laboratório de Estatística Computacional</span><br></div>
<div><span>Universidade Estadual de Santa Cruz</span><br></div>
<div><span>Ilhéus-Bahia-Brasil<br><br><a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a><br>skype: lrmpinto</span></div>
<div><span><a href="http://lattes.cnpq.br/2732314327604831">http://lattes.cnpq.br/2732314327604831</a> <br><br></span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div> </div>
<div><div><div><div>Em 19 de agosto de 2015 18:36, Cesar Rabak <span dir="ltr"><<a href="mailto:cesar.rabak@gmail.com">cesar.rabak@gmail.com</a>></span> escreveu:<br></div>
<blockquote style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex;"><div dir="ltr"><div>Luiz Roberto,<br></div>
<div> </div>
<div>Frente a sua resposta para o Leonardo, é imperioso propor-lhe a questão:<br></div>
<div> </div>
<div>Qual seria a definição de semelhança entre os dois acessos?<br></div>
<div> </div>
<div>Com essa informação podemos tentar encontrar um teste estatístico com mais potência para a comparação...<br></div>
<div> </div>
<div>HTH<br></div>
<div>--<br></div>
<div>Cesar Rabak<br></div>
<div> </div>
</div>
<div><div><div><div> </div>
<div><div>2015-08-19 16:10 GMT-03:00 Luiz Roberto Martins Pinto <span dir="ltr"><<a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a>></span>:<br></div>
<blockquote style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex;"><div dir="ltr"><div>Leonardo,<br></div>
<div> </div>
<div>Agradeço a sugestão. Mas é possível que as proporções sejam as mesmas entre dois acessos diferentes, se os marcadores estiverem em posições diferentes.<br></div>
<div> </div>
<div> </div>
<div><span><span style="color:rgb(136, 136, 136)" class="colour">Luiz Roberto.</span></span><br></div>
<div> </div>
</div>
<div><div><span><br clear="all"></span></div>
<div><div><div dir="ltr"><div><div><span>Luiz Roberto Martins Pinto<br>Prof. Pleno/DCET/UESC</span></div>
<div><span>Laboratório de Estatística Computacional</span><br></div>
<div><span>Universidade Estadual de Santa Cruz</span><br></div>
<div><span>Ilhéus-Bahia-Brasil<br><br><a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a><br>skype: lrmpinto</span></div>
<div><span><a href="http://lattes.cnpq.br/2732314327604831">http://lattes.cnpq.br/2732314327604831</a> <br><br></span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div> </div>
<div><div><div><div>Em 19 de agosto de 2015 15:07, Leonardo Ferreira Fontenelle <span dir="ltr"><<a href="mailto:leonardof@leonardof.med.br">leonardof@leonardof.med.br</a>></span> escreveu:<br></div>
<blockquote style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex;"><div><u></u><br></div>
<div><div>Luiz Roberto, como estou sem R ao alcance vou fornecer uma solução aproximada.<br></div>
<div> </div>
<div>Em primeiro lugar, você vai querer transformar esses vetores de texto em vetores de números inteiros, utilizando a função <a href="https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/integer.html">as.integer()</a>. Quanto à comparação dos vetores propriamente dita, a solução mais simples é com a função <a href="https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/prop.test.html">prop.test()</a>. Utilize <a href="https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/sum.html">sum(x, na.rm = TRUE)</a> para calcular o número de sucessos em cada vetor, e <a href="https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/length.html">length</a>(na.omit(x)) ou length(x[!<a href="http://is.na">is.na</a>(x)]) para calcular o número de tentativas em cada vetor. Então utilize a função prop.test, informando como primeiro argumento c(sucessosA1, sucessosA2) e segundo argumento c(tentativasA1, tentativasA2).<br></div>
<div> </div>
<div><div><a title="Currículo Lattes" href="http://lattes.cnpq.br/9234772336296638">Leonardo Ferreira Fontenelle</a><br></div>
</div>
<div><div><div> </div>
<div> </div>
<div>Em Qua 19 ago. 2015, às 14:46, Luiz Roberto Martins Pinto escreveu:<br></div>
</div>
</div>
<blockquote type="cite"><div><div><div dir="ltr"><div>Caros companheiros da Lista R,<br></div>
<div> </div>
<div><div># Os dados abaixo referem-se a 2 acessos de mandioca (A1 e A2), e 101 marcadores RAPD (1=presença da marca; 0=ausência da marca; NA=dado perdido); portanto os dados são binários.<br></div>
<div> </div>
<div># Preciso de uma função que me retorne a probabilidade (p-value) do acesso A1 ser semelhante ao acesso A2.<br></div>
<div> </div>
<div>A1=c("1",NA,"1","0","1","0","1","1","0","1","1","0","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1",NA,"1",NA,"0","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","0","1","0","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","0")<br></div>
<div>A2=c("1","1","1","0","1","0","1","1","0","1","1","0","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1","1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"1","0","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","0","1","0","1",NA,NA,"1","1","1","1","1","1","1","1","0","0","1","1","1","1","1","1","0","1","1","1","1","1","1","1")<br></div>
</div>
<div> </div>
<div>Agradeço a boa-vontade de quem puder ajudar.<br></div>
<div> </div>
<div>Abraços,<br></div>
<div> </div>
<div>Luiz Roberto.<br></div>
<div> </div>
<div><div><div dir="ltr"><div><div><div>Luiz Roberto Martins Pinto<br></div>
<div>Prof. Pleno/DCET/UESC<br></div>
</div>
<div>Laboratório de Estatística Computacional<br></div>
<div>Universidade Estadual de Santa Cruz<br></div>
<div><div>Ilhéus-Bahia-Brasil<br></div>
<div> </div>
<div><a href="mailto:luizroberto.uesc@gmail.com">luizroberto.uesc@gmail.com</a><br></div>
<div>skype: lrmpinto<br></div>
</div>
<div><div><a href="http://lattes.cnpq.br/2732314327604831">http://lattes.cnpq.br/2732314327604831</a> <br></div>
<div> </div>
</div>
</div>
</div>
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<div>R-br mailing list<br></div>
<div><a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>
<div><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>
<div>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>
</blockquote><div> </div>
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<div>_______________________________________________<br></div>
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R-br mailing list<br></div>
<div> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>
<div> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>
<div>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>
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R-br mailing list<br></div>
<div> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>
<div> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>
<div>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>
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R-br mailing list<br></div>
<div> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>
<div> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>
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<div>R-br mailing list<br></div>
<div><a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>
<div><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>
<div>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>
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