
<!DOCTYPE html>

<html>

<head>

<title></title>

</head>

<body><div>O R tem a mania de manter os objetos completamente na memória. Isso simplifica o código e agiliza as operações (depois dos dados terem sido lidos ao menos uma vez), mas por outro lado torna as operações com dados grandes propensas a estourar a memória. (Já ouvi dizer que é mais barato comprar RAM do que SAS, mas nunca me dei ao trabalho de conferir...) Se você não está recebendo mensagens sobre incapacidade de alocar memória, então talvez a memória não esteja limitando seu processamento. Ou talvez você esteja usando memória virtual (acho que é assim que se chama no Windows) no lugar de memória RAM.<br></div>

<div> </div>

<div>Quem vai saber lhe informar isso é o administrador do servidor. Ele também vai saber informar se o sistema operativo está impondo algum limite sobre a memória e a capacidade de processamento disponíveis para cada usuário e para cada programa.<br></div>

<div> </div>

<div>PS:<br></div>

<div> </div>

<div>Você pode usar a função <code><span class="pln">object.size</span></code>() para saber quanta memória um objeto ocupa. Você pode encontrar outras dicas em:<br></div>

<div> </div>

<ul><li><div><a href="http://stackoverflow.com/questions/1358003/tricks-to-manage-the-available-memory-in-an-r-session">http://stackoverflow.com/questions/1358003/tricks-to-manage-the-available-memory-in-an-r-session</a><br></div>

</li><li><div><a href="http://stackoverflow.com/questions/1358003/tricks-to-manage-the-available-memory-in-an-r-session">http://adv-r.had.co.nz/memory.html</a><br></div>

</li></ul><div> </div>

<div id="sig4487139"><div class="signature" id="signature"><a href="http://lattes.cnpq.br/9234772336296638" title="Currículo Lattes">Leonardo Ferreira Fontenelle</a><br></div>

</div>

<div> </div>

<div> </div>

<div>Em Ter 2 jun. 2015, às 14:23, Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil escreveu:<br></div>

<blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Ei Leonardo, <br></div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Duas dicas boas em que eu não tinha pensado. De fato eu já consigo carregar os dados, mas eu gostaria mesmo é de não ficar esperando 10 segundos pra fazer uma tabela. Assim uma edição em que eu preciso olhar varias tabelas pra verificar se o que eu estou fazendo está como esperado, eu acabo esperando horas ao longo do dia. Estou olhando o data.table agora e não me parece dificil.<br></div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Enquanto a ajustar o tamanho da memoria que o R pode usar, pode ser de alguma utilidade?<br></div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:courier new,monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Queria olhar o pacote bigmemory mas parece que ele não está disponíel para a versão 3.1.3<br></div>

<div><div> </div>

<div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="background-color: rgb(255, 255, 255)" class="highlight">Pedro Brasil</span><br></div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

<div> </div>

<div><div>Em 2 de junho de 2015 12:03, Leonardo Ferreira Fontenelle <span dir="ltr"><<a href="mailto:leonardof@leonardof.med.br">leonardof@leonardof.med.br</a>></span> escreveu:<br></div>

<blockquote style="margin-top:0px;margin-right:0px;margin-bottom:0px;margin-left:0.8ex;margin-left-ltr-source:physical;margin-left-rtl-source:physical;margin-right-ltr-source:physical;margin-right-rtl-source:physical;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204, 204, 204);border-left-width-ltr-source:physical;border-left-width-rtl-source:physical;border-left-style-ltr-source:physical;border-left-style-rtl-source:physical;border-left-color-ltr-source:physical;border-left-color-rtl-source:physical;padding-left:1ex;padding-left-ltr-source:physical;padding-left-rtl-source:physical;"><div><u></u><br></div>

<div><div>A seguinte página deve lhe apresentar as ferramentas disponíveis: <a href="http://cran.r-project.org/web/views/HighPerformanceComputing.html">http://cran.r-project.org/web/views/HighPerformanceComputing.html</a><br></div>

<div> </div>

<div>Pelo que você está dizendo, parece que você já consegue carregar todos os dados na memória, o problema é o tempo de processamento. Talvez valha a pena começar usando uma <a>data.table</a> em vez de data.frame. Eu costumo utilizar sempre que possível os pacotes que já vêm instalados com o R, e mesmo assim eventualmente "me rendi" ao data.table. Uso para microdados de inquéritos do IBGE, e ocasionalmente até mesmo para dados "pequenos".<br></div>

<div> </div>

<div>Outra dica é utilizar apenas uma amostra de seus dados em procedimentos iniciais, como por exemplo testar se um determinado código funciona ou verificar a distribuição de uma variável.<br></div>

<div> </div>

<div>Boa sorte,<br></div>

<div> </div>

<div><div><a title="Currículo Lattes" href="http://lattes.cnpq.br/9234772336296638">Leonardo Ferreira Fontenelle</a><br></div>

</div>

<div><div><div> </div>

<div> </div>

<div>Em Ter 2 jun. 2015, às 11:47, Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil escreveu:<br></div>

</div>

</div>

<blockquote type="cite"><div><div><div dir="ltr"><div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Amigos de R,<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Eu venho com um dúvida de iniciante, porque nunca trabalhei assim. Eu não entendo muito de informática por isso estou sem luz no caminho. Bom, a minha questão é que me envolvi num projeto em que os dado são na caso de centenas de milhares de linhas, com umas 150 colunas. <br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Estou trabalhando numa área de trabalho remota num servidor windows 2008. Eu não sei quais as especificaçõs do servidor, mas essa área esta servidor está servindo somente para esse fim. <br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Então gostaria de uma luz ou do que ler para otimizar o tempo de processamento nas ediçoes e nas análises. Algum tutorial ou alguma dica que aproveite melhor o meu tempo de espera. <br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">O que ja fucei que é pouco... <br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">> memory.size(max = FALSE)<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">[1] 1044.11<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">> memory.size(max = T)<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">[1] 1814.94<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">> memory.limit(size = NA)<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">[1] 4095<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">>  <br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);">Abraço,<br></div>

<div style="font-family:"courier new",monospace;color:rgb(0, 0, 102);"> </div>

<div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="background-color: rgb(255, 255, 255)" class="highlight">Pedro Brasil</span><br></div>

</div>

</div>

</div>

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<div>R-br mailing list<br></div>

<div><a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br></div>

<div><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br></div>

<div>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>

</blockquote><div> </div>

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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div>

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