<div dir="ltr">Eder, muito obrigada!<div><br></div><div>O problema era realmente com os strings e eu não sabia como resolver.</div><div><br></div><div>Obrigada mesmo!! : )</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2015-03-29 7:04 GMT-04:00 Éder Comunello <span dir="ltr"><<a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">comunello.eder@gmail.com</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Ludmilla, bom dia!<div><br></div><div>Não cheguei a rodar seu script, mas percebo que as formulas que você está gerando não estão com a referência correta. Os colnames ("resp_1", "pred_1",) estão diferentes da notação da formula (resp1~pred1). </div><div><br></div><div><font face="monospace, monospace"><span style="font-size:12.8000001907349px"># formulas<-paste("resp",1:37,"~</span><span style="font-size:12.8000001907349px">pred",1:6,sep='')</span><br></font></div><div><font face="monospace, monospace"><span style="font-size:12.8000001907349px">formulas<-paste("resp_",1:37,"~</span><span style="font-size:12.8000001907349px">pred_",1:6,sep='') ### alterar para essa forma</span></font><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Outra coisa é verificar se a função está entendendo as strings como formulas. Pra testar, se a primeira forma não rodar, tente a segunda.</span><br></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><font face="monospace, monospace">glmmadmb(formulas[1],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)</font><br></div><div><span style="font-family:monospace,monospace">glmmadmb(as.formula(formulas[1]),data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)</span></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Espero que ajude,</font></div><div><br></div><div class="gmail_extra"><div><div><div dir="ltr">Éder Comunello <<a href="mailto:comunello.eder@gmail.com" target="_blank">c</a><a href="mailto:omunello.eder@gmail.com" target="_blank">omunello.eder@gmail.com</a>> <br>Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]<br></div></div></div>
<div class="gmail_extra"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div><div class="h5">Em 28 de março de 2015 18:44, Ludmila Rattis <span dir="ltr"><<a href="mailto:ludmilarattis@gmail.com" target="_blank">ludmilarattis@gmail.com</a>></span> escreveu:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5"><div dir="ltr">Ola,<div><br></div><div>Tenho uma serie de modelos para rodar e quando tento colocar a funcao glmmadmb, pertencente ao pacote glmmADMB, num looping, retorna o seguinte erro:</div><div><br></div><div>Error in if (rchar == "") rchar <- "1" : missing value where TRUE/FALSE needed</div><div><br></div><div>Procurei por esse erro no google e nao encontrei nada semelhante. Quando tento fora do looping, a funcao roda normalmente. Eis um codigo de exemplo:</div><div><br></div><div><div>install.packages("glmmADMB", repos="<a href="http://r-forge.r-project.org" target="_blank">http://r-forge.r-project.org</a>", type="source")</div><div>data<-matrix(0,180,43);for(i in 1:43){data[,i]<-rnorm(180,mean=0,sd=1) }<br></div><div>landscape<-factor(sort(rep(1:30,6)))</div><div>resp<-paste("resp_",1:37,sep='')</div><div>pred<-paste("pred_",1:6,sep='')</div><div>data<-cbind(data,landscape)</div><div>colnames(data)<-c(resp,pred,"landscape")</div><div>formulas<-paste("resp",1:37,"~pred",1:6,sep='')</div><div>fitted.glmm<-list()</div><div>for (i in 1:length(formulas)){</div><div>  fitted.glmm[[]]<-glmmadmb(formulas[i],data=data,random=1|~landscape,family="nbinom",zeroInflation=FALSE)}</div></div><div><br></div><div><br></div><div>Alguem poderia me dizer o que esta acontecendo?</div><div><br></div><div>Muito obrigada, Lud</div><span><font color="#888888"><div><br></div><div><br></div><div>-- <br><div><div dir="ltr"><b>Ludmila Rattis</b><br>Programa de Pós-graduação em Ecologia/UNICAMP<br>Geomatics and Landscape Ecology Research Laboratory (Carleton University - Canada)<div><a href="http://www.glel.carleton.ca/" target="_blank">http://www.glel.carleton.ca</a><br><div>Conservation Biogeography Lab (Goias Federal University - Brazil)<br></div><div><a href="http://rdloyola.wix.com/cblab" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">rdloyola.wix.com/cblab</a><br><a href="http://sites.ffclrp.usp.br/ficus" target="_blank"></a></div></div></div></div>
</div></font></span></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></blockquote></div><br></div></div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><b>Ludmila Rattis</b><br>Programa de Pós-graduação em Ecologia/UNICAMP<br>Geomatics and Landscape Ecology Research Laboratory (Carleton University - Canada)<div><a href="http://www.glel.carleton.ca/" target="_blank">http://www.glel.carleton.ca</a><br><div>Conservation Biogeography Lab (Goias Federal University - Brazil)<br></div><div><a href="http://rdloyola.wix.com/cblab" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">rdloyola.wix.com/cblab</a><br><a href="http://sites.ffclrp.usp.br/ficus" target="_blank"></a></div></div></div></div>
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