<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:HelveticaNeue, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif;font-size:10pt"><div><span style="font-size: 10pt;">Oie David e todos do grupo</span><br></div><div style="font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 10pt;"><div style="font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 12pt;"><div class="y_msg_container"><div id="yiv7607511411"><div><div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 10pt;"><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13px; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br clear="none"></span></div><div
style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13px; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Esses são os dados que eu tenho, com as espécies e a abundância de cada uma de acordo com o registro.</span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13px; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br clear="none"></span></div><div style="background-color:transparent;">> dat.alim[c(1:10),c(1:5)]</div><div style="background-color:transparent;"><br clear="none"></div><div style="background-color:transparent;">Reg PEI CAM BRA CRUS GAS</div><div style="background-color:transparent;">26 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados</div><div
style="background-color:transparent;">27 1 6 0 0 0</div><div style="background-color:transparent;">28 1 0 5 0 0</div><div style="background-color:transparent;">29 3 0 0 0 0</div><div style="background-color:transparent;">30 0 0 1
0 0</div><div style="background-color:transparent;">31 0 0 0 0 0 <span style="font-size: 10pt;"># linha zerada, sem dados</span></div><div style="background-color:transparent;">32 0 0 0 0 0 <span style="font-size: 10pt;"># linha zerada, sem dados</span></div><div style="background-color:transparent;">33 2 3 1 0 0</div><div style="background-color:transparent;">34 0 0 0 0 0 <span style="font-size: 10pt;"># linha zerada, sem dados</span></div><div style="background-color:transparent;"><span></span></div><div
style="background-color:transparent;">35 0 0 0 1 0</div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13px; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br clear="none"></span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13px; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span> Também estou mandando os comandos que eu tenho para fazer o agrupamento, onde tenho que retirar as linhas que contenham os zeros.</span></div><div></div><div> </div><div><br clear="none"></div><div><div># Dissimilaridade e medidas de distancia para dados (semi) quantitativos</div><div><br clear="none"></div><div>dat.alim2<- dat.alim
[c(2:5,8,10:14,16,17,19:31,33,34,36,37,40:42,44:49),] # nesse comando eu tive que eliminar as linhas com zeros para poder continuar fazendo a dissimilaridade. É nesse ponto que eu preciso de ajuda. Sem eliminar essas linhas com os zeros não funciona,mas eu preciso manter esses dados!</div><div><br clear="none"></div><div> dis.bra
<- vegdist(log1p(dat.alim2))<span class="yiv7607511411Apple-tab-span" style="white-space:pre;"> </span># Bray-Curtis sobre dados transformados por log</div><div>head(dis.bra)</div><div><br clear="none"></div><div><br></div><div>Obrigada. Aguardo.</div><div><br clear="none"></div></div><div>Att.,
<br clear="none">
<br clear="none">Nathalia de Sousa Motta
<br clear="none">Oceanógrafa/Oceanographer
<br clear="none">Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca</div><div><br clear="none"></div> <div class="yiv7607511411yqt0626390285" id="yiv7607511411yqt64311"><div class="yiv7607511411" style="font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 10pt;"> <div class="yiv7607511411" style="font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 12pt;"> <div dir="ltr"> <hr size="1"> <font size="2" face="Arial"> <b><span style="font-weight:bold;">De:</span></b> David Feitosa <contato@davidfeitosa.com><br clear="none"> <b><span style="font-weight:bold;">Para:</span></b> r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Nathalia Sousa <nathalia_sousam@yahoo.com.br> <br clear="none"> <b><span style="font-weight:bold;">Enviadas:</span></b> Sexta-feira, 3 de Janeiro de 2014 16:22<br clear="none"> <b><span style="font-weight:bold;">Assunto:</span></b> Re: [R-br] Dúvida Análise
de agrupamento<br clear="none"> </font> </div> <div class="yiv7607511411"><br clear="none"><div id="yiv7607511411"><div><div dir="ltr">Nathalia, <div><br clear="none"></div><div>Vc teria como dar
um head/tail pra gente ter noção de uma amostra desses dados?<div>Creio que facilitaria para alguém responder e te ajudar.</div></div></div><div class="yiv7607511411">
<br clear="all"><div><div><br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>Atenciosamente,</div><div><br clear="none"></div>David Feitosa<br clear="none"><div><div></div></div><div><br clear="none"></div><div><div>(\_(\</div><div>(=°;°)</div><div>(("")("")</div>
</div></div>
<br clear="none"><br clear="none"><div class="yiv7607511411">Em 3 de janeiro de 2014 14:25, Nathalia Sousa <span dir="ltr"><<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:nathalia_sousam@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:nathalia_sousam@yahoo.com.br">nathalia_sousam@yahoo.com.br</a>></span> escreveu:<br clear="none"><blockquote class="yiv7607511411" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div class="yiv7607511411" id="yiv7607511411yqt20140"><div><div class="yiv7607511411" style="font-size: 10pt; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif;"><div>Boa tarde,</div><div><br clear="none"></div><div class="yiv7607511411" style="font-style: normal; font-size: 13px; background-color: transparent; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif;">
Sou iniciante no R e queria uma ajuda com meus dados do mestrado.</div><div class="yiv7607511411" style="font-style: normal; font-size: 13px; background-color: transparent; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif;">
Estou tentando fazer uma análise de agrupamento (cluster) com dados de abundância de 5 espécies, porém tenho algumas datas que não tenho nenhum exemplar coletado. Na hora que vou tentar fazer o cluster, tenho que eliminar essas linhas vazias, mas eu preciso delas pois essas ausências das espécies são
dados importantes, que quero analisar. </div><div class="yiv7607511411" style="font-style: normal; font-size: 13px; background-color: transparent; font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif;">
Com os comandos que tenho, preciso tirar essas linhas, mas não posso e preciso fazer o cluster com todos esses dados.</div><div></div><div> Alguém pode me ajudar com esses comandos???</div><div><br clear="none"></div><div>Desde já, agradeço.</div>
<div>Aguardo.</div><div>Att.,
<br clear="none">
<br clear="none">Nathalia de Sousa Motta
<br clear="none">Oceanógrafa/Oceanographer
<br clear="none">Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca</div></div></div></div><br clear="none">_______________________________________________<br clear="none">
R-br mailing list<br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br clear="none">
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Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br clear="none"></blockquote></div><br clear="none"></div></div></div><br clear="none"><br clear="none"></div> </div> </div></div> </div></div></div><br><br></div> </div> </div> </div></body></html>