<div dir="ltr"><div><div><div>O rgdal precisa do GDAL e do PROJ.4, que são programas externos ao R (isso está na página do pacote no CRAN <a href="http://cran.r-project.org/web/packages/rgdal/index.html">http://cran.r-project.org/web/packages/rgdal/index.html</a>). Você precisa instalar os pacotes necessários antes<br>
<br></div>sudo apt-get install gdal-bin libgdal-dev libgdal1 libgdal1-dev libproj0 libproj-dev<br><br></div>Quanto aos pacotes duplicados vc pode deletar um ou mais diretórios que vc acha que nao sao necessarios, e definir uma (ou mais) biblioteca pessoal com a variavel de ambiente R_LIBS dento do ~/.Renviron, por exemplo a minha é<br>
<br>R_LIBS=~/R_environment/my_library<br><br></div>e reinstale os pacotes. Veja ?.libPaths e ?packageStatus<br><div><br><div><br><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div dir="ltr">---<br>Fernando de Pol Mayer<br>
Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica<br>Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ<br>Universidade de São Paulo - USP<br>URL: <a href="http://fernandomayer.github.com" target="_blank">http://fernandomayer.github.io</a><br>
e-mail: fernando.mayer [@] {<a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a>, <a href="http://usp.br" target="_blank">usp.br</a>}</div></div>
<br><br><div class="gmail_quote">2013/9/18 ASANTOS <span dir="ltr"><<a href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
Fernando funcionou o Rstudio, porém,<br>
<br>
Solicitou que eu criasse uma library pessoal e criei, mas
vários pacote ficaram duplicados quando fiz:<br>
<br>
update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE) <br>
<br>
E não consigo instalar o rgdal, apresenta o seguinte erro:<br>
<br>
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’<br>
* removing ‘/home/santos-a/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rgdal’<br>
Warning in install.packages :<br>
installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status<br>
<br>
Tem mais alguma coisa que eu poderia fazer?<br>
<br>
Obrigado,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<br>
<div>Em 17/09/2013 14:05, Fernando Mayer
escreveu:<br>
</div><div><div class="h5">
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>Tem que configurar o R como uma shared library para
ter o libR.so.<br>
<br>
</div>
Desinstale e faça novamente com<br>
<br>
</div>
./configure --enable-R-shlib<br>
</div>
make<br>
</div>
sudo make install<br>
<br>
<div>
<div>
<div><br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div dir="ltr">---<br>
Fernando de Pol Mayer<br>
Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica<br>
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ<br>
Universidade de São Paulo - USP<br>
URL: <a href="http://fernandomayer.github.com" target="_blank">http://fernandomayer.github.io</a><br>
e-mail: fernando.mayer [@] {<a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a>, <a href="http://usp.br" target="_blank">usp.br</a>}</div>
</div>
<br>
<br>
<div class="gmail_quote">2013/9/17 ASANTOS <span dir="ltr"><<a href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF"> Obrigado Fernando,<br>
<br>
A instalação funcionou, porém como fiz:
<div><br>
<br>
./configure<br>
make<br>
sudo make install<br>
<br>
</div>
No diretório: santos-a@santosa-K43E:~/Documentos$ R-2.15.2<br>
<br>
No terminal o R funcionou OK, mas quando instalei o
Rstudio após ele não funciona e acusa a seguinte mensagem:<br>
<br>
R Not Found<br>
<br>
R shared library (/usr/local/lib/R/lib/libR.so) not find.
If this is a custom build of R, was it build with the
enable –R-shlib option<br>
<br>
<br>
Eu teria que ter instalado a pasta em outro local?<br>
<br>
Obrigado,<br>
<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<div>Em 06/09/2013 13:53, Fernando Mayer escreveu:<br>
</div>
<div>
<div>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>1) Vc precisa conferir se os
pacotes que vc diz serem
incompativeis com o R 3.0.1 são
realmente incompativeis, ou se falta
alguma configuração (ou pacote) no
seu sistema. Acredito que a grande
maioria dos pacotes seja compatível
pois esse versão já foi lançada há
alguns meses.<br>
<br>
</div>
2) Caso você veja que é realmente
necessário instalar (e _compilar_) a
versão anterior (2.15.2), vc precisa
antes ter todas as ferramentas
necessárias para a compilação (que
aparentemente não estão instaladas).
Faça:<br>
<br>
</div>
sudo apt-get install build-essential<br>
</div>
sudo apt-get buil-dep r-base<br>
<br>
</div>
E depois <br>
<br>
</div>
./configure<br>
</div>
make<br>
</div>
sudo make install<br>
<br>
<br>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div><br>
<div><br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div dir="ltr">---<br>
Fernando de Pol Mayer<br>
Doutorando em Estatística e Experimentação
Agronômica<br>
Escola Superior de Agricultura "Luiz de
Queiroz" - ESALQ<br>
Universidade de São Paulo - USP<br>
URL: <a href="http://fernandomayer.github.com" target="_blank">http://fernandomayer.github.io</a><br>
e-mail: fernando.mayer [@] {<a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a>,
<a href="http://usp.br" target="_blank">usp.br</a>}</div>
</div>
<br>
<br>
<div class="gmail_quote">2013/9/6 Teodoro Calvo <span dir="ltr"><<a href="mailto:teocalvo2@gmail.com" target="_blank">teocalvo2@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
<div>Olá, bom dia ! Tudo bem ?<br>
<br>
O senhor já tentou instala-lo pelo central
de aplicativos Ubuntu ? Ao invés de
baixa-lo em formato .tar.gz ?<br>
<br>
Acredito que seja uma boa saída.<br>
<br>
Tenho utilizado o RKWard, que utiliza o R
2.15. como base. Este também esta
disponível no Central de Aplicativos
Ubuntu.<br>
<br>
Caso não goste de usa um GUI para o R,
também há possibilidade de utilização
diretamente no terminal.<br>
<br>
Ctrl + Alt + t<br>
<br>
depois simplesmente digitando : R<br>
<br>
Espero que dê certo e tenha ajudado de
alguma forma.<br>
<br>
Caso dê erro, possivelmente deve-se
verificar se o R 3.0 foi totalmente
removido.<br>
<br>
Boa sorte.<br>
<br>
Att Téo Calvo.<br>
<br>
<br>
<br>
Em 06-09-2013 10:59, ASANTOS escreveu:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div> Bom dia pessoal,<br>
<br>
<br>
Precisei reinstalar meu ubuntu
12.04 64bits e abaixei o
R.2.15.2.tar.gz, pois vários pacotes
são incompatíveis com o R.3.0, ou
tenho que ficar buscando soluções para
cada pacote devido, error zero status
na instalação, portanto descompactei o
R.2.15.2.tar.gz na área de trabalho e
quando faço ./ configure LIBnn=libmake
, recebo o seguinte erro:<br>
<br>
<p>santos-a@santosa-K43E:~/Área de
Trabalho/R-2.15.2$ ./configure
LIBnn=libmake</p>
<p>checking build system type...
i686-pc-linux-gnu</p>
<p>checking host system type...
i686-pc-linux-gnu</p>
<p>loading site script './config.site'</p>
<p>loading build-specific script
'./config.site'</p>
<p>checking for pwd... /bin/pwd</p>
<p>checking whether builddir is
srcdir... yes</p>
<p>checking for working aclocal...
missing</p>
<p>checking for working autoconf...
missing</p>
<p>checking for working automake...
missing</p>
<p>checking for working autoheader...
missing</p>
<p>checking for gawk... no</p>
<p>checking for mawk... mawk</p>
<p>checking whether ln -s works... yes</p>
<p>checking for bison... no</p>
<p>checking for byacc... no</p>
<p>checking for ar... ar</p>
<p>checking for a BSD-compatible
install... /usr/bin/install -c</p>
<p>checking for sed... /bin/sed</p>
<p>checking for which...
/usr/bin/which</p>
<p>checking for less... /usr/bin/less</p>
<p>checking for gtar... no</p>
<p>checking for gnutar... no</p>
<p>checking for tar... /bin/tar</p>
<p>checking for tex... no</p>
<p>checking for pdftex... no</p>
<p>configure: WARNING: you cannot
build PDF versions of the R manuals</p>
<p>checking for pdflatex... no</p>
<p>configure: WARNING: you cannot
build PDF versions of vignettes and
help pages</p>
<p>checking for makeindex... no</p>
<p>checking for makeinfo... no</p>
<p>configure: WARNING: you cannot
build info or HTML versions of the R
manuals</p>
<p>checking for texi2dvi... no</p>
<p>checking for kpsewhich... no</p>
<p>checking for unzip...
/usr/bin/unzip</p>
<p>checking for zip... /usr/bin/zip</p>
<p>checking for gzip... /bin/gzip</p>
<p>checking for bzip2... /bin/bzip2</p>
<p>checking for firefox...
/usr/bin/firefox</p>
<p>using default browser ...
/usr/bin/firefox</p>
<p>checking for acroread... no</p>
<p>checking for acroread4... no</p>
<p>checking for xdg-open...
/usr/bin/xdg-open</p>
<p>checking for notangle... false</p>
<p>checking for pkg-config...
/usr/bin/pkg-config</p>
<p>checking for gcc... gcc</p>
<p>checking whether the C compiler
works... yes</p>
<p>checking for C compiler default
output file name... a.out</p>
<p>checking for suffix of
executables...</p>
<p>checking whether we are cross
compiling... no</p>
<p>checking for suffix of object
files... o</p>
<p>checking whether we are using the
GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g...
yes</p>
<p>checking for gcc option to accept
ISO C89... none needed</p>
<p>checking how to run the C
preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long
lines and -e... /bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /bin/grep -E</p>
<p>checking whether gcc needs
-traditional... no</p>
<p>checking how to run the C
preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for gfortran... no</p>
<p>checking for f95... no</p>
<p>checking for fort... no</p>
<p>checking for xlf95... no</p>
<p>checking for ifort... no</p>
<p>checking for ifc... no</p>
<p>checking for efc... no</p>
<p>checking for pgf95... no</p>
<p>checking for lf95... no</p>
<p>checking for gfortran... no</p>
<p>checking for ftn... no</p>
<p>checking for g95... no</p>
<p>checking for f90... no</p>
<p>checking for xlf90... no</p>
<p>checking for pgf90... no</p>
<p>checking for pghpf... no</p>
<p>checking for epcf90... no</p>
<p>checking for g77... no</p>
<p>checking for f77... no</p>
<p>checking for xlf... no</p>
<p>checking for frt... no</p>
<p>checking for pgf77... no</p>
<p>checking for cf77... no</p>
<p>checking for fort77... no</p>
<p>checking for fl32... no</p>
<p>checking for af77... no</p>
<p>checking for fc... no</p>
<br>
<br>
Alguém poderia me ajudar a selecionar
o problema, tudo que tentei no R help
Simple compilation não funcionou,<br>
<br>
Obrigado,<br>
<pre cols="72">--
======================================================================
Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
Campus Cáceres
Caixa Postal 244
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Cáceres - MT CEP: 78.200-000
Fone: <a href="tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112" value="+556581328112" target="_blank">(+55) 65 8132-8112</a> (TIM) <a href="tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970" value="+556596866970" target="_blank">(+55) 65 9686-6970</a> (VIVO)
<a href="mailto:e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank">e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>
<a href="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br" target="_blank">alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br</a>
Lattes: <a href="http://lattes.cnpq.br/1360403201088680" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/1360403201088680</a>
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<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
<br>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote>
</div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
<br>
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Alexandre dos Santos
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Fone: <a href="tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112" value="+556581328112" target="_blank">(+55) 65 8132-8112</a> (TIM) <a href="tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970" value="+556596866970" target="_blank">(+55) 65 9686-6970</a> (VIVO)
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</pre>
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R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote>
</div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
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