<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><span>Tito, </span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br></span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;">Você pode mostrar a imagem que está tentando abrir?</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style:
normal;">Idealmente, importá-la no R deveria ser tão fácil quanto isso:</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><br></div><div style="background-color: transparent;">library(raster)</div><div style="background-color: transparent;">r <- raster('A20072132007243.L3m_MO_CHL_chlor_a_4km')</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> </div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">Porém, dependendo de como o hdf estiver organizado, o mais recomendado é usar o gdal_translate para converter a banda que você quer em um formato mais acessível, digamos .tif:</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif;
font-size: 12pt;"><br></div><div><div>system('gdal_translate -of GTiff HDF4_SDS:SEAWIFS_L2:"S2006365040146.L2_GAC_OC":26 /home/thiago/Downloads/seawifs.tif')</div><div>library(raster)</div><div>r<-raster('seawifs.tif')</div></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">O comando acima converterá a banda 26 do arquivo S2006365040146.L2_GAC_OC no arquivo seawifs.tif, que depois é facilmente aberto pelo raster.</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">Você pode ver as bandas disponíveis no HDF usando o gdalinfo ou abrindo o arquivo no QGIS. Você precisará instalar o GDAL para usar essas ferramentas. Se estiver no ubuntu, o pacote é o
gdal-bin.</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">Saudações,<br>--<br>Thiago V. dos Santos<br>PhD student<br>Land and Atmospheric Science<br>University of Minnesota<br>http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm<br>Phone: (612) 323 9898</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><br></div> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> <div dir="ltr"> <hr size="1"> <font size="2" face="Arial"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b> Tito Conte <tito.conte@gmail.com><br> <b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> "r-br@listas.c3sl.ufpr.br"
<r-br@listas.c3sl.ufpr.br>; Thiago V. dos Santos <thi_veloso@yahoo.com.br> <br> <b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Monday, August 12, 2013 8:03 PM<br> <b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> Re: [R-br] Arquivos hdf<br> </font> </div> <div class="y_msg_container"><br><div id="yiv3982809569"><div dir="ltr">Benilton, o hdf5 não abre o arquivo<div><br></div><div>Thiago os arquivos são do seawifs, ao que parece não tem que processar a imagem, o problema é abri-los mesmo</div><div class="yiv3982809569gmail_extra"><br clear="all">
<div>Tito Conte</div></div></div></div><br><br></div> </div> </div> </div></body></html>