<div dir="ltr">Oi Benilton,<div><br><div style>Não funciona...acho que o problema é o Windows mesmo.</div><div style>Vou ter que baixar os arquivos para ler.</div><div style><br></div><div style>Obrigada,</div><div style>Heloise</div>
</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">Em 13 de junho de 2013 11:53, Benilton Carvalho <span dir="ltr"><<a href="mailto:beniltoncarvalho@gmail.com" target="_blank">beniltoncarvalho@gmail.com</a>></span> escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Ha' rumores de que o ncdf para Windows nao esteja pronto para<br>
OPeNDAP... e eles (os rumores) parecem se confirmar, conforme mostro<br>
abaixo.<br>
<br>
Note que estou usando a (pen)ultima versao do R (aconselho voce usar<br>
sempre a ultima)... em Linux...<br>
<br>
Se, com a mesma versao do R e ncdf, vc nao conseguir... entao e',<br>
infelizmente, limitacao da versao Windows (o que eu sinceramente<br>
esperava nao acontecer).<br>
<br>
b<br>
<br>
> library(ncdf)<br>
<div class="im">> dataset <- open.ncdf('<a href="http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967" target="_blank">http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967</a>')<br>
</div>> dataset<br>
[1] "file <a href="http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967" target="_blank">http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967</a><br>
has 4 dimensions:"<br>
[1] "depth0 Size: 1"<br>
[1] "lat0 Size: 90"<br>
[1] "lon0 Size: 180"<br>
[1] "time0 Size: 1"<br>
[1] "------------------------"<br>
[1] "file <a href="http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967" target="_blank">http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967</a><br>
has 1 variables:"<br>
[1] "float g_sea_water_temperature_at_sea_surface_skin[lon0,lat0,depth0,time0]<br>
Longname:Surface Skin Temperature Missval:1e+30"<br>
> sessionInfo()<br>
R version 3.0.0 (2013-04-03)<br>
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)<br>
<br>
locale:<br>
[1] LC_CTYPE=pt_BR.utf8 LC_NUMERIC=C<br>
[3] LC_TIME=pt_BR.utf8 LC_COLLATE=pt_BR.utf8<br>
[5] LC_MONETARY=pt_BR.utf8 LC_MESSAGES=pt_BR.utf8<br>
[7] LC_PAPER=C LC_NAME=C<br>
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C<br>
[11] LC_MEASUREMENT=pt_BR.utf8 LC_IDENTIFICATION=C<br>
<br>
attached base packages:<br>
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base<br>
<br>
other attached packages:<br>
[1] ncdf_1.6.6<br>
<br>
loaded via a namespace (and not attached):<br>
[1] tcltk_3.0.0 tools_3.0.0<br>
><br>
<br>
Em 13 de junho de 2013 11:06, Heloíse Pavanato<br>
<<a href="mailto:helopavanato@gmail.com">helopavanato@gmail.com</a>> escreveu:<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">> Já tentei..não deu certo =/<br>
><br>
><br>
> Em 13 de junho de 2013 11:00, Rodrigo Plei <<a href="mailto:rodrigo.plei@gmail.com">rodrigo.plei@gmail.com</a>><br>
> escreveu:<br>
><br>
>> Tente usar uma versão mais antiga do R também.<br>
>><br>
>> R.<br>
>><br>
>><br>
>> Em 13 de junho de 2013 10:57, Heloíse Pavanato <<a href="mailto:helopavanato@gmail.com">helopavanato@gmail.com</a>><br>
>> escreveu:<br>
>><br>
>>> Obrigada por todas as ajudas!<br>
>>><br>
>>> Eu baixei o ncdf4, mas não deu certo ler direto do link.<br>
>>> Dai baixei o arquivo vinculado ao link opendap e então ele leu.<br>
>>><br>
>>> Ou seja, é possível ler .nc com no windows, mas não deu certo com o<br>
>>> opendap.<br>
>>> Outras pessoas tem lido do opendap com o pacote ncdf em Linux sem<br>
>>> problemas..<br>
>>><br>
>>> Obrigada!<br>
>>><br>
>>> Att,<br>
>>> Heloise<br>
>>><br>
>>><br>
>>> Em 13 de junho de 2013 09:51, Tito Conte <<a href="mailto:tito.conte@gmail.com">tito.conte@gmail.com</a>> escreveu:<br>
>>><br>
>>>> Heloíse verifique os seus pacotes do windows para netcdf<br>
>>>><br>
>>>> Tito Conte<br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>> 2013/6/13 Thiago V. dos Santos <<a href="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br">thi_veloso@yahoo.com.br</a>><br>
>>>><br>
>>>>> Heloíse,<br>
>>>>><br>
>>>>> O pacote ncdf é antigo e deve ser descontinuado em breve. Instale o<br>
>>>>> ncdf4 no lugar. Os binários para windows não existem no CRAN, mas estão<br>
>>>>> disponíveis no site do autor: <a href="http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/" target="_blank">http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/</a>. Esse<br>
>>>>> pacote deve suportar o protocolo opendap.<br>
>>>>><br>
>>>>> Caso ele não suporte, uma solução temporária é baixar o arquivo para<br>
>>>>> testar localmente (download.file('url_to_file')), e em seguida escrever para<br>
>>>>> os autores dos pacotes (incluindo o Robert Hijmans do raster) perguntando se<br>
>>>>> eles têm algum plano de incluir o opendap em um futuro próximo.<br>
>>>>><br>
>>>>> Alternativamente, existe uma opção mais complicada de compilar o pacote<br>
>>>>> gdal com suporte a opendap. Porém, não sei se isso pode ser feito em<br>
>>>>> Windows.<br>
>>>>><br>
>>>>> Saudações,<br>
>>>>> --<br>
>>>>> Thiago V. dos Santos<br>
>>>>> PhD student<br>
>>>>> Land and Atmospheric Science<br>
>>>>> University of Minnesota<br>
>>>>><br>
>>>>> <a href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm" target="_blank">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
>>>>> Phone: <a href="tel:%28612%29%20323%209898" value="+16123239898">(612) 323 9898</a><br>
>>>>> ________________________________<br>
>>>>> From: Heloíse Pavanato <<a href="mailto:helopavanato@gmail.com">helopavanato@gmail.com</a>><br>
>>>>> To: <a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>>>> Sent: Wednesday, June 12, 2013 9:45 PM<br>
>>>>> Subject: [R-br] arquivo netcdf<br>
>>>>><br>
>>>>> Olá,<br>
>>>>> Tenho tentado abrir um arquivo netcdf mas sem êxito.<br>
>>>>> Tentei com o pacote ncdf para abrir um arquivo através de um link<br>
>>>>> OPeNDAP<br>
>>>>> dataset <-<br>
>>>>> open.ncdf('<a href="http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967" target="_blank">http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967</a>')<br>
>>>>> e através do RNetCDF<br>
>>>>> dataset <-<br>
>>>>> <a href="http://open.nc" target="_blank">open.nc</a>('<a href="http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967" target="_blank">http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967</a>')<br>
>>>>> e sempre dá o Error in open.ncdf trying to open file.....<br>
>>>>><br>
>>>>> Estou trabalhando em ambiente Windows. Isso seria um problema?<br>
>>>>> Alguém tem alguma dica para me dar?<br>
>>>>><br>
>>>>> Grata,<br>
>>>>> Heloise<br>
>>>>><br>
>>>>> _______________________________________________<br>
>>>>> R-br mailing list<br>
>>>>> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>>>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>>>>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>>>><br>
>>>>><br>
>>>>> _______________________________________________<br>
>>>>> R-br mailing list<br>
>>>>> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>>>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>>>>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>> _______________________________________________<br>
>>>> R-br mailing list<br>
>>>> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>>>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>><br>
>>><br>
>>><br>
>>> _______________________________________________<br>
>>> R-br mailing list<br>
>>> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>>> código mínimo reproduzível.<br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> --<br>
>> =8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8--><br>
>><br>
>> Rodrigo Silvestre Martins, PhD<br>
>> Bolsista FAPESP Pós-Doutorado<br>
>><br>
>> Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)<br>
>> Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico<br>
>> Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)<br>
>> Butantã - São Paulo/SP, Brasil<br>
>> 05508-900<br>
>> Tel: +55 11 3091 6549<br>
>> Email: <a href="mailto:rodrigo.plei@gmail.com">rodrigo.plei@gmail.com</a> ; <a href="mailto:ocersm@lycos.com">ocersm@lycos.com</a>; <a href="mailto:rsmartins@usp.br">rsmartins@usp.br</a><br>
>><br>
>> CV Lattes: <a href="http://lattes.cnpq.br/5350064124902777" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/5350064124902777</a><br>
>><br>
>> Google Scholar:<br>
>> <a href="http://scholar.google.com.br/citations?user=zX_EezEAAAAJ&hl=pt-BR" target="_blank">http://scholar.google.com.br/citations?user=zX_EezEAAAAJ&hl=pt-BR</a><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> R-br mailing list<br>
>> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>> código mínimo reproduzível.<br>
><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código<br>
> mínimo reproduzível.<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>