<p dir="ltr">Eu não recomendei sem os cabeçalhos. Eu recomendei sem a coluna 2 (label) e, possivelmente, sem a coluna acet. </p>
<div class="gmail_quote">On Jun 9, 2013 4:49 AM, "Vinícius Lionel Mateus" <<a href="mailto:vinynegrelli@gmail.com">vinynegrelli@gmail.com</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div><div><div>Vou cuidar melhor dos CMR, Benilton.<br></div>Tem como não incluir os nomes das colunas no PCA? Como fica a organização?<br></div><br></div><div>Benilton, reproduzi a análise sem os cabeçalhos, conforme você sugeriu, mas também não houve sucesso.<br>
</div><div><br>#carreguei meus dados conforme, mas agora indiquei que não existe cabeçalho<br></div><div>> read.table(file = "clipboard", header = F, sep = "\t", dec = ",")-> TSF<br></div>
>TSF<br></div>#chequei os nomes das colunas para confirmar<br><div><div>> names(TSF)<br> [1] "V1" "V2" "V3" "V4" "V5" "V6" "V7" "V8" "V9" "V10" "V11" "V12" "V13"<br>
</div><div>#rodando o PCA<br></div><div>> model <- prcomp(TSF, scale = TRUE)<br>Erro em svd(x, nu = 0) : infinite or missing values in 'x'<br><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">
Em 9 de junho de 2013 01:50, Benilton Carvalho <span dir="ltr"><<a href="mailto:beniltoncarvalho@gmail.com" target="_blank">beniltoncarvalho@gmail.com</a>></span> escreveu:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Vc tem certeza que quer incluir "Label" na PCA? E ja' que estamos no<br>
assunto, Acet tambem? A variavel Label e' texto e calcular media de<br>
texto e' indefinido, portanto a falha... Sobre 'Acet', veja o seu<br>
banco de dados e infira o motivo da minha sugestao.<br>
<br>
Deixo tbm uma recomendacao para leitura:<br>
<a href="https://gist.github.com/benilton/1088208" target="_blank">https://gist.github.com/benilton/1088208</a><br>
<br>
b<br>
<br>
Em 9 de junho de 2013 01:41, Vinícius Lionel Mateus<br>
<div><div><<a href="mailto:vinynegrelli@gmail.com" target="_blank">vinynegrelli@gmail.com</a>> escreveu:<br>
> Simone,<br>
> Obrigado testei a classe do objeto e realmente é um data.frame.<br>
><br>
> Para tornar o exemplo mais reprodutível, compartilho o link dos dados:<br>
> <a href="https://www.dropbox.com/s/qopz8pg29pe3z3p/2013%2005%2009%20PCA_R.xls" target="_blank">https://www.dropbox.com/s/qopz8pg29pe3z3p/2013%2005%2009%20PCA_R.xls</a><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> Em 7 de junho de 2013 22:37, Sérgio Henrique almeida da silva ju<br>
> <<a href="mailto:sergio.edfisica@gmail.com" target="_blank">sergio.edfisica@gmail.com</a>> escreveu:<br>
><br>
>> Bom, eu não chutei nada, só estou interpretando a saída do R. Mas, algo<br>
>> mais reproduzível ajudaria mais.<br>
>><br>
>> Abraços<br>
>><br>
>><br>
>> Em 7 de junho de 2013 22:36, Benilton Carvalho<br>
>> <<a href="mailto:beniltoncarvalho@gmail.com" target="_blank">beniltoncarvalho@gmail.com</a>> escreveu:<br>
>><br>
>>> Se o exemplo fosse de fato reproduzível, ninguém ficaria chutando qual é<br>
>>> o problema....<br>
>>><br>
>>> On Jun 7, 2013 10:28 PM, "Sérgio Henrique almeida da silva ju"<br>
>>> <<a href="mailto:sergio.edfisica@gmail.com" target="_blank">sergio.edfisica@gmail.com</a>> wrote:<br>
>>>><br>
>>>> Simone<br>
>>>><br>
>>>> Tanto faz você trabalhar com data.frame ou matriz, basta a variável<br>
>>>> estar como numérica.<br>
>>>><br>
>>>> Abraços<br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>> Em 7 de junho de 2013 22:25, Simone D. Sartorio<br>
>>>> <<a href="mailto:sisartorio@yahoo.com.br" target="_blank">sisartorio@yahoo.com.br</a>> escreveu:<br>
>>>>><br>
>>>>> Na verdade Sérgio, como vc está fazendo uma ACP, seu "x" deve ser uma<br>
>>>>> matriz e provavelmente seu "x" está como um data.frame<br>
>>>>><br>
>>>>> Verifique a classe do seu "x" assim:<br>
>>>>><br>
>>>>> class(x)<br>
>>>>><br>
>>>>> Se a resposta for diferente de uma matriz, pronto, é só transformar seu<br>
>>>>> x em 1 matriz!<br>
>>>>> ok?<br>
>>>>><br>
>>>>> abraços<br>
>>>>> Si<br>
>>>>><br>
>>>>><br>
>>>>> ***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***<br>
>>>>> * Simone Daniela Sartorio<br>
>>>>> * Professora Adjunta I da UFSCar, Centro de Ciências Agrárias, Campus<br>
>>>>> Araras/SP.<br>
>>>>> * Doutora e Mestre em Estatística e Experimentação Agronômica -<br>
>>>>> ESALQ/USP;<br>
>>>>> * Licenciada em Matemática - UNESP/Rio Claro.<br>
>>>>><br>
>>>>> ***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***<br>
>>>>><br>
>>>>> Tenha um bom dia! ;)<br>
>>>>><br>
>>>>> ________________________________<br>
>>>>> De: Sérgio Henrique almeida da silva ju <<a href="mailto:sergio.edfisica@gmail.com" target="_blank">sergio.edfisica@gmail.com</a>><br>
>>>>> Para: <a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>>>>> Enviadas: Sexta-feira, 7 de Junho de 2013 21:21<br>
>>>>> Assunto: Re: [R-br] Remover NA: PCA<br>
>>>>><br>
>>>>> O R esta entendendo que sua variavel não é numérica.<br>
>>>>> Tente<br>
>>>>> Tsfa$x = as.numeric(Tsfa$x)<br>
>>>>> Em 07/06/2013 20:52, "Vinícius Lionel Mateus" <<a href="mailto:vinynegrelli@gmail.com" target="_blank">vinynegrelli@gmail.com</a>><br>
>>>>> escreveu:<br>
>>>>><br>
>>>>> Prezados,<br>
>>>>><br>
>>>>> Estou executando o seguinte CRM:<br>
>>>>><br>
>>>>> read.table(file = "clipboard", header = TRUE, sep = "\t", dec = ",")-><br>
>>>>> TSF<br>
>>>>> > TSF<br>
>>>>> > names(TSF)<br>
>>>>> [1] "Date" "Label" "PMF" "BC" "Acet" "Form" "Cl." "NO3."<br>
>>>>> "PO43." "SO42." "Na." "K."<br>
>>>>> [13] "Mg2." "Ca2." "NH4."<br>
>>>>> > TSFa <- TSF[,2:15]<br>
>>>>> > model <- prcomp(TSFa, scale = TRUE)<br>
>>>>> Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico<br>
>>>>> > model <- prcomp(TSFa, na.rm = TRUE, scale = TRUE)<br>
>>>>> Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico<br>
>>>>><br>
>>>>> Tentei diferentes métodos para remover o "NAs", mas não obtive sucesso.<br>
>>>>> Alguém tem alguma dica?<br>
>>>>><br>
>>>>> --<br>
>>>>> Vinícius<br>
>>>>> --<br>
>>>>> --<br>
>>>>> Atenciosamente,<br>
>>>>><br>
>>>>> VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (<a href="http://lattes.cnpq.br/6501001637020665" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/6501001637020665</a>)<br>
>>>>> Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica<br>
>>>>> Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química<br>
>>>>> Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio)<br>
>>>>> Rua Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brasil<br>
>>>>> CEP.: 22451-900<br>
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>>>>><br>
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>>>>> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>>>>> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça<br>
>>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>>>><br>
>>>>><br>
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>>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>>>><br>
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>>>>> código mínimo reproduzível.<br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>><br>
>>>> --<br>
>>>> Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior<br>
>>>> Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública<br>
>>>> Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ<br>
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>>><br>
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>><br>
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> Atenciosamente,<br>
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> VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (<a href="http://lattes.cnpq.br/6501001637020665" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/6501001637020665</a>)<br>
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> mínimo reproduzível.<br>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
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