<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Alexandro</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Vi sua msg sobre valores do predict, me interessa também, vou tentar.</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
Olhando seu CRM em:</div><div class="im" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><div><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif">pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é dado por seq </span><br>
</div><div><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif"><br></span></div></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif">não teria de colocar um parentesis antes de dividir? (</span><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif">1.0-0.0)/30</span></div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif"><br></span></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:Verdana,Geneva,Helvetica,Arial,sans-serif">Hélio</span></div>
</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">Em 7 de abril de 2013 03:55, Thiago Veloso [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="mailto:ml-node+s2285057n4658914h2@n4.nabble.com" target="_blank">ml-node+s2285057n4658914h2@n4.nabble.com</a>></span> escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="font-size:12pt;font-family:times new roman,new york,times,serif"><div><div><div style="font-size:12pt;font-family:'times new roman','new york',times,serif"><div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt">
<span>Alexandre,</span></div><div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif"><span><br></span></div><div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif">
Você já tem o polígono gridPol de onde você quer criar a média da krigagem. Não conheço bem as classes do pacote geoR, mas as coordenadas do kc$predict parecem estar no objeto pred.grid. <span style="font-size:12pt">A abordagem que eu usaria seria criar um objeto raster da krigagem e em seguida contar os valores usando a função extract (raster) usando como argumentos o raster da krigagem e o gridPol.</span></div>
<div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif"><br></div><div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif">
Além da ajuda para
a função extract no manual do raster, talvez o último exemplo dessa página possa te ajudar: <a href="http://stackoverflow.com/questions/14682606/extract-value-from-raster-stack-from-spatialpolygondataframe" style="font-size:12pt" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://stackoverflow.com/questions/14682606/extract-value-from-raster-stack-from-spatialpolygondataframe</a></div>
<div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif"><br></div><div style="font-style:normal;font-size:16px;background-color:transparent;font-family:'times new roman','new york',times,serif">
Mas não estou certo se era isso que você estava buscando. Acho que o Paulo vai te ajudar melhor.</div><div class="im"><div></div><div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt">
</div><div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt">Saudações,<br>--<br>Thiago V. dos Santos<br>PhD student<br>Land and Atmospheric Science<br>University of Minnesota<br>
<a href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm" target="_blank">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>Phone: <a href="tel:%28612%29%20323%209898" value="+16123239898" target="_blank">(612) 323 9898</a><br>
</div> </div><div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt"> <div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt"> <div dir="ltr">
<font face="Arial"><div class="im"> <hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold">From:</span></b> ASANTOS <<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>><br>
</div><b><span style="font-weight:bold">To:</span></b> <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>; Thiago V. dos Santos <<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>> <br>
<b><span style="font-weight:bold">Sent:</span></b> Saturday, April 6, 2013 10:26 PM<div><div class="h5"><br> <b><span style="font-weight:bold">Subject:</span></b> Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por krigagem<br>
</div></div></font> </div><div><div class="h5"> <br><div>
<div>
Thiago,<br>
<br>
Já pensei isto, mas para SpatialPoints(vp), preciso fazer um
list() das coordenadas dos pixels (vp$x e vp$y) e isto não tenho e
nem sei como recuperar o valor de um pixel à partir de uma
coordenada conhecida.<br>
<br>
Abraço,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<br>
<div>Em 06/04/2013 21:32, Thiago V. dos
Santos escreveu:<br>
</div>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" type="cite">
<div style="font-size:12pt;font-family:'times new roman','new york',times,serif">
<div><span>Nao conheco bem todas as funcoes do sp, mas para pela
mensagem de erro eu transformaria a tabela vp em
SpatialPoints, que eh o argumento esperado pela funcao over.</span></div>
<div> </div>
<div>Saudações,<br>
--<br>
Thiago V. dos Santos<br>
PhD student<br>
Land and Atmospheric Science<br>
University of Minnesota<br>
<a rel="nofollow" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm" link="external" target="_blank">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
Phone: <a href="tel:%28612%29%20323%209898" value="+16123239898" target="_blank">(612) 323 9898</a><br>
</div>
<div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt">
<div style="font-family:'times new roman','new york',times,serif;font-size:12pt">
<div dir="ltr"> <font face="Arial">
<hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold">From:</span></b>
ASANTOS <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=3" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
<b><span style="font-weight:bold">To:</span></b>
<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=4" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a> <br>
<b><span style="font-weight:bold">Sent:</span></b>
Saturday, April 6, 2013 8:12 PM<br>
<b><span style="font-weight:bold">Subject:</span></b>
Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem
gerada por krigagem<br>
</font> </div>
<br>
Boa noite pessoal,<br>
<br>
Acho evoluí um pouco na questão, mas agora a
dificuldade esta em contar os pixels contidos no interior
das malhas, quando tento um over(), ocorre o seguinte erro:<br>
<br>
Erro em function (classes, fdef, mtable) :<br>
unable to find an inherited method for function "over",
for signature "table", "SpatialPolygons"<br>
<br>
<br>
segue CRM:<br>
#<br>
require(geoR)<br>
plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord
X", ylab="Coord Y")<br>
loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1),
ncol=2)<br>
text(loci, as.character(1:4), col="red")<br>
polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)<br>
<br>
# Fitting models with nugget fixed to zero<br>
ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)<br>
<br>
# defining the grid<br>
pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51))<br>
# kriging calculations<br>
kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige =
krige.control(obj.m = ml))<br>
# displaying predicted values<br>
image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
#<br>
<br>
#Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2<br>
p0<-c(0.1,0.1)<br>
#<br>
c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)<br>
d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)<br>
d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)<br>
points(d1[,1],d1[,2],col="red")<br>
ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
abline(v=ver, col="red")<br>
abline(h=hor, col="red")<br>
#<br>
require(sp)<br>
grid=GridTopology(c(0.1,0.1), c(0.2,0.2), c(5,5))### Cria as
área<br>
grid=SpatialGrid(grid=grid)<br>
class(grid) ## SpatialPixels<br>
gridPol <- as(grid, "SpatialPolygons") ## Transfoma as
areas em polígonos espaciais<br>
options(digits=5)<br>
pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é
dado por seq Xmaior - Xmenor/l * Ymaior-Ymenor/l<br>
vp <- table(area <- kc$predict)## Valor dos pixels<br>
count.pix<-table(over(vp, gridPol)) #contar quantos
pontos tem em cada area<br>
<br>
<br>
Obrigado,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
Em 06/04/2013 17:11, ASANTOS escreveu:<br>
> Boa noite membros da lista,<br>
> <br>
> Gostaria de receber ideias para calcular o valor
médio dos pixel em uma imagem gerada por krigagem em
sub-regiões de interesse na imagem, por exemplo usando um
exemplo do Prof. Paulo, onde ajusta-se um semivariograma e
faz a krigagem ordinária dos dados:<br>
> <br>
> #<br>
> require(geoR)<br>
> plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
> loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0,
1.1), ncol=2)<br>
> text(loci, as.character(1:4), col="red")<br>
> polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)<br>
> <br>
> # Fitting models with nugget fixed to zero<br>
> ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)<br>
> <br>
> # defining the grid<br>
> pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1,
l=51))<br>
> # kriging calculations<br>
> kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige =
krige.control(obj.m = ml))<br>
> # displaying predicted values<br>
> image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
> #<br>
> <br>
> #Agora vou dividir esta área em 25 partes e lançar os
centroides destas subáreas:<br>
> <br>
> #Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2<br>
> p0<-c(0.1,0.1)<br>
> #<br>
> c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)<br>
> d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)<br>
> d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)<br>
> points(d1[,1],d1[,2],col="red")<br>
> ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
> hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
> abline(v=ver, col="red")<br>
> abline(h=hor, col="red")<br>
> #<br>
> <br>
> E aqui vem minha pergunta, como calcular o valor médio
dos pixels contidos em cada subárea de 0.2 x 0.2?<br>
> <br>
> Obrigado,<br>
> <br>
<br>
--
======================================================================<br>
Alexandre dos Santos<br>
Proteção Florestal<br>
Coordenador do curso Técnico em Florestas<br>
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal<br>
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia
de Mato Grosso<br>
Campus Cáceres<br>
Caixa Postal 244<br>
Avenida dos Ramires, s/n<br>
Bairro: Distrito Industrial<br>
Cáceres - MT CEP: 78.200-000<br>
Fone: <a href="tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112" value="+556581328112" target="_blank">(+55) 65 8132-8112</a> (TIM) <a href="tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970" value="+556596866970" target="_blank">(+55) 65 9686-6970</a> (VIVO)<br>
e-mails:<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=5" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
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======================================================================<br>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=7" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
<a rel="nofollow" href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
<fieldset></fieldset>
<br>
<pre>_______________________________________________
R-br mailing list
<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=8" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>
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Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
<br>
<pre>--
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Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
Coordenador do curso Técnico em Florestas
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
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</pre>
</div>
</div><br><br> </div></div></div> </div> </div></div></div></div><div><div class="h5"><br>_______________________________________________
<br>R-br mailing list
<br><a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=11" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>
<br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.
<br>
<br>
<hr noshade size="1" color="#cccccc">
</div></div><div style="color:#444;font:12px tahoma,geneva,helvetica,arial,sans-serif"><div><div class="h5">
<div style="font-weight:bold">If you reply to this email, your message will be added to the discussion below:</div>
</div></div><a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Obter-valor-medio-dos-pixels-de-uma-imagem-gerada-por-krigagem-tp4658903p4658914.html" target="_blank">http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Obter-valor-medio-dos-pixels-de-uma-imagem-gerada-por-krigagem-tp4658903p4658914.html</a>
</div><div class="HOEnZb"><div class="h5">
<div style="color:#666;font:11px tahoma,geneva,helvetica,arial,sans-serif;margin-top:.4em;line-height:1.5em">
To unsubscribe from R-br, <a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=aGVsaW9nYWxsb3JvY2hhQGdtYWlsLmNvbXwzMzU3OTgyfC0xMzQ3NTkwMDY4" target="_blank">click here</a>.<br>
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</div></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Hélio Gallo Rocha<br>IFSULDEMINAS - Câmpus Muzambinho<br>
</div>