<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><span>Alexandre, </span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br></span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Acredito que o codigo no final dessa mensagem funcione. </span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br></span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0);
background-color: transparent; font-style: normal;"><span>O maior problema foi converter o seu shapefile de polylines para polygons (voce tinha mencionado na primeira pergunta). So consegui fazer isso usando uma combinacao de funcoes dos pacores maptools e PBSmapping - voce deve instalar esse pacote. </span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br></span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Primeiro eu converti as polylines para polysets (classe do pacote PBSmapping) e em seguida polysets para poligonos. O fluxo subsequente foi o mesmo que eu tinha te passado anteriormente.</span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color:
rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br></span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Alem disso, carreguei a banda que voce mandou como brick (ao inves de stack) para para fins de simplicidade. Se voce fizer questao do stack para aplicar a todas as bandas da imagem, entao tera que fazer um loop entre elas - for (i in 1:nbands(land)){}.</span></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span style="font-size: 12pt;"> </span><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">---------------------------------------------------</div><div><div># Require
packages</div><div>require(raster)</div><div>require(maptools)</div><div>require(PBSmapping)</div><div><br></div><div>#Load data</div><div>land <- raster("LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif")</div><div>contorno_line <- readShapeLines ("Catas_Altas.shp", proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south +datum=WGS84 +units=m +no_defs"))<br></div><div><br></div><div># Convert SpatialLines to PolySet and then to SpatialPolygons - this will require package PBSmapping</div><div>contorno_poly <- PolySet2SpatialPolygons (SpatialLines2PolySet(contorno_line), close_polys=TRUE)</div><div><br></div><div># Then, perform crop and mask procedures as usual</div><div>land.crop <- crop(land, extent(contorno_poly), snap='out')</div><div>contorno.na <- setValues(land.crop, NA)</div><div>contorno.r <- rasterize(contorno_poly, contorno.na)</div><div>land_mask <- mask(x=land.crop, mask=contorno_poly)</div><div><br></div><div>#Check
final result</div><div>plot(land_mask)</div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><span style="font-size: 12pt;">---------------------------------------------------</span><br></div></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><br></div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">Saudações,<br>--<br>Thiago V. dos Santos<br>PhD student<br>Land and Atmospheric Science<br>University of Minnesota<br>http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm<br>Phone: (612) 323 9898<br></div> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> <div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial"> <hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b> ASANTOS
<alexandresantosbr@yahoo.com.br><br> <b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Thiago V. dos Santos <thi_veloso@yahoo.com.br> <br> <b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Saturday, April 6, 2013 1:17 PM<br> <b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> Re: [R-br] Criando uma mascara com shapefile sobre raster<br> </font> </div> <br><div id="yiv1497405944">
<div>
Thiago<br>
<br>
Segue dbf e shx, prj não foi projetado ainda não,<br>
<br>
<a rel="nofollow" target="_blank" href="https://www.dropbox.com/s/p0idcxmh7td8hgi/Catas_Altas.dbf">https://www.dropbox.com/s/p0idcxmh7td8hgi/Catas_Altas.dbf</a>
## Dbf<br>
<br>
<a rel="nofollow" target="_blank" href="https://www.dropbox.com/s/mssh8lq6cy61ncd/Catas_Altas.shx">https://www.dropbox.com/s/mssh8lq6cy61ncd/Catas_Altas.shx</a>
## Shx,<br>
<br>
<br>
Muito obrigado,<br>
<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<br>
<div class="yiv1497405944moz-cite-prefix">Em 06/04/2013 14:05, Thiago V. dos
Santos escreveu:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">
<div><span>Alexandre,</span></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br>
</span></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span style="
font-size:12pt;"><span style="font-size:12pt;">O .shp é só uma parte
do dado, a geometria. </span>Para reproduzir o seu
problema, vou precisar também do .dbf e do .shx, além do
.prj se ele já estiver projetado.</span></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span style="
font-size:12pt;"> </span><br>
</div>
<div>Saudações,<br>
--<br>
Thiago V. dos Santos<br>
PhD student<br>
Land and Atmospheric Science<br>
University of Minnesota<br>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
Phone: (612) 323 9898<br>
</div>
<div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">
<div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">
<div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial">
<hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b>
ASANTOS <a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br"><alexandresantosbr@yahoo.com.br></a><br>
<b><span style="font-weight:bold;">To:</span></b>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-abbreviated" ymailto="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a> <br>
<b><span style="font-weight:bold;">Sent:</span></b>
Saturday, April 6, 2013 11:32 AM<br>
<b><span style="font-weight:bold;">Subject:</span></b>
Re: [R-br] Criando uma mascara com shapefile sobre
raster<br>
</font> </div>
<br>
<div id="yiv1497405944">
<div> Obrigado pela atenção Thiago,<br>
<br>
Tentei fazer um CRM, mas com raster estava difícil,
coloquei no dropbox mesmo, segue a ultima tentativa que
fiz com suas dicas:<br>
<br>
#<br>
require(raster)<br>
<br>
#Dados<br>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="https://www.dropbox.com/s/lzj71k9vt6dbou1/LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif#Raster">https://www.dropbox.com/s/lzj71k9vt6dbou1/LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif#Raster</a>
in tiff<br>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="https://www.dropbox.com/s/bfcwpbw36gdlwjq/Catas_Altas.shp#contorno">https://www.dropbox.com/s/bfcwpbw36gdlwjq/Catas_Altas.shp#contorno</a>
em shapefile<br>
#<br>
land.img<-
stack(c("LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif"))
## Imagem Landsat 5<br>
plotRGB(land.img,1) #Plota a banda 7 da imagem<br>
<br>
#Poligono de interesse em shapefile comm coordenadas em
UTM<br>
contorno<- readShapeLines("Catas_Altas.shp",
proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south +datum=WGS84
+units=m +no_defs"))<br>
#<br>
#Quero selecionar os pixels da imagem que estão contidos
no interior do polígono contorno<br>
A.crop <- crop(land.img, extent(contorno),
snap='out')<br>
contorno.na<-setValues(A.crop, NA)<br>
contorno.r<-rasterize(contorno, contorno.na) <br>
C <- mask(x=A.crop, mask=contorno.r)<br>
#<br>
<br>
<br>
<div class="yiv1497405944moz-cite-prefix">Em 05/04/2013
09:18, Thiago V. dos Santos escreveu:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">
<div><span>Mas você recebe algum erro ou o resultado
é diferente do esperado?</span></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br>
</span></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>O melhor mesmo seria fornecer seus
dados para tentarmos reproduzir o problema. Não
dá pra colocar no dropbox? 50Mb não é nada tão
grande assim...</span></div>
<div> </div>
<div>Saudações,<br>
--<br>
Thiago V. dos Santos<br>
PhD student<br>
Land and Atmospheric Science<br>
University of Minnesota<br>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
Phone: (612) 323 9898<br>
</div>
<div style="font-family:'times new roman', 'new
york', times, serif;font-size:12pt;">
<div style="font-family:'times new roman', 'new
york', times, serif;font-size:12pt;">
<div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial">
<hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b>
ASANTOS <a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br"><alexandresantosbr@yahoo.com.br></a><br>
<b><span style="font-weight:bold;">To:</span></b>
<a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-abbreviated" ymailto="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>;
Thiago V. dos Santos <a rel="nofollow" class="yiv1497405944moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:thi_veloso@yahoo.com.br"><thi_veloso@yahoo.com.br></a>
<br>
<b><span style="font-weight:bold;">Sent:</span></b>
Thursday, April 4, 2013 9:23 PM<br>
<b><span style="font-weight:bold;">Subject:</span></b>
Re: [R-br] Criando uma mascara com shapefile
sobre raster<br>
</font> </div>
<br>
Thiago,<br>
<br>
Explicando melhor teoricamente, pois um
CRM implicaria em uma <br>
imagem de 50MB, tenho:<br>
<br>
1) Uma imagem do landsat 5 com um quadrante de
interesse;<br>
2)Um contorno em shapefile de uma área de 200
hectares.<br>
<br>
Quero utilizar apenas os pixels da imagem
contidos no interior da <br>
área de 200 hectares, para tanto extend() não
resolve pois utiliza <br>
apenas utiliza coordenadas max e min e não
considera a forma (contorno) <br>
do meu polígono para seleção dos pixels contidos
nele.<br>
<br>
Não consegui realizar o que desejo com a
rotina sugerida. Mascara, <br>
usei como um termo que implica em área útil da
imagem, não quero o <br>
quadrante todo oferecido pela imagem, mas aquilo
que esta contido no meu <br>
shapefile.<br>
<br>
Obrigado pela atenção,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<br>
<br>
Em 04/04/2013 21:03, Thiago V. dos Santos
escreveu:<br>
> Alexandre,<br>
><br>
> O que a área do raster tem a ver com o tipo
de função usada para carregar o shapefile?<br>
><br>
> Você não consegui recortar o raster com o
shapefile usando os comandos que eu eu sugeri? O
que exatamente você quis dizer com criar uma
máscara na pergunta inicial?<br>
><br>
> Saudações,<br>
> --<br>
> Thiago V. dos Santos<br>
> PhD student<br>
> Land and Atmospheric Science<br>
> University of Minnesota<br>
> <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
> Phone: (612) 323 9898<br>
><br>
><br>
> ----- Original Message -----<br>
> From: ASANTOS <<a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>><br>
> To: <a rel="nofollow" ymailto="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> Cc:<br>
> Sent: Thursday, April 4, 2013 5:14 PM<br>
> Subject: Re: [R-br] Criando uma mascara com
shapefile sobre raster<br>
><br>
> Thiago,<br>
><br>
> Não deu certo não, transformei
em<br>
>
SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(contorno2)),"contorno2"))),<br>
> prefiro continuar tentando com
readShapeLines("Catas_Altas.shp",<br>
> proj4string=CRS("+proj=utm +zone=23 +south
+datum=WGS84 +units=m<br>
> +no_defs")), porque consigo visualizar a
área sobre o raster, achei<br>
> alguns posts mais usando o GRASS, mas
gostaria de fazer tudo só no R.<br>
><br>
> Obrigado,<br>
><br>
> Alexandre<br>
><br>
><br>
> Em 04/04/2013 12:18, Thiago V. dos Santos
escreveu:<br>
>> Alexandre,<br>
>><br>
>> a) Tente ler o seu shapefile com a
funcao readShapePoly.<br>
>><br>
>> b) Se nao der certo, sugiro uma
combinacao das funcoes crop e raster. Nesse
caso, experimente rodar o seu codigo com as
seguintes mudancas:<br>
>><br>
>> require("raster")<br>
>> A <-
stack("LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif")<br>
>> contorno<-
readShapePoly("Catas_Altas.shp")<br>
>><br>
>> A.crop <- crop(A, extent(contorno),
snap='out')<br>
>><br>
>> contorno.na<-setValues(A.crop, NA)<br>
>> contorno.r<-rasterize(contorno,
contorno.na) ### isso pode demorar, dependendo
do seu shapefile<br>
>> C <- mask(x=A.crop, mask=contorno.r)<br>
>><br>
>><br>
>> Saudações,<br>
>><br>
>> --<br>
>> Thiago V. dos Santos<br>
>> PhD student<br>
>> Land and Atmospheric Science<br>
>> University of Minnesota<br>
>> <a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
>> Phone: (612) 323 9898<br>
>><br>
>><br>
>> ----- Original Message -----<br>
>> From: ASANTOS<<a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a>><br>
>> To:<a rel="nofollow" ymailto="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>> Cc:<br>
>> Sent: Thursday, April 4, 2013 10:31 AM<br>
>> Subject: [R-br] Criando uma mascara com
shapefile sobre raster<br>
>><br>
>> Boa tarde pessoal,<br>
>><br>
>> Estou com um problema e não
consigo criar uma mascara com um arquivo no
formato shapefile sobre raster usando a função
crop() do pacote raster, por algum motivo meu
objeto contorno que é um SpatialLinesDataFrame
não esta servido para oferecer o polígono
limítrofe da área, alguém poderia me dar um
help, segue CRM:<br>
>><br>
>> require("raster")<br>
>> A <-
stack(c("LANDSAT_5_TM_20100506_217_074_L2_BAND7.tif"))##
Imagem<br>
>> plotRGB(A) ## Plota a imagem<br>
>> contorno<-
readShapeLines("Catas_Altas.shp") ## Contorno
da área<br>
>> lines(contorno, col="red")Plota o
contorno<br>
>> C <- crop(A,contorno) ## Recorta o
que esta contido no contorno na imagem<br>
>> Erro em .local(x, y, ...) :<br>
>> nenhum slot de nome "legend" para
esse objeto de classe "RasterStack"<br>
>><br>
>><br>
>> --
======================================================================<br>
>> Alexandre dos Santos<br>
>> Proteção Florestal<br>
>> Coordenador do curso Técnico em
Florestas<br>
>> Vice Coordenador do curso de Engenharia
Florestal<br>
>> IFMT - Instituto Federal de Educação,
Ciência e Tecnologia de Mato Grosso<br>
>> Campus Cáceres<br>
>> Caixa Postal 244<br>
>> Avenida dos Ramires, s/n<br>
>> Bairro: Distrito Industrial<br>
>> Cáceres - MT CEP:
78.200-000<br>
>> Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55)
65 9686-6970 (VIVO)<br>
>> e-mails:<a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a><br>
>> <a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br" target="_blank" href="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br">alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br</a><br>
>>
======================================================================<br>
>><br>
>>
_______________________________________________<br>
>> R-br mailing list<br>
>> <a rel="nofollow" ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
>> <a rel="nofollow" target="_blank" href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
>> Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
>><br>
>><br>
<br>
-- <br>
======================================================================<br>
Alexandre dos Santos<br>
Proteção Florestal<br>
Coordenador do curso Técnico em Florestas<br>
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IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e
Tecnologia de Mato Grosso<br>
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9686-6970 (VIVO)<br>
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<br>
<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<br>
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Alexandre dos Santos
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Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
Coordenador do curso Técnico em Florestas
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
Campus Cáceres
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