<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div id="yiv232405379"><div><div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"><span id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_103">Alexandre,</span></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><span id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_106"><br></span></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color:
transparent; font-style: normal;">Você já tem o polígono gridPol de onde você quer criar a média da krigagem. Não conheço bem as classes do pacote geoR, mas as coordenadas do kc$predict parecem estar no objeto pred.grid. <span style="font-size: 12pt;">A abordagem que eu usaria seria criar um objeto raster da krigagem e em seguida contar os valores usando a função extract (raster) usando como argumentos o raster da krigagem e o gridPol.</span></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family:'times new roman', 'new york', times, serif;font-size:16px;color:rgb(0, 0, 0);background-color:transparent;font-style:normal;" class="yui_3_7_2_19_1365302541879_57"><br></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family:'times new roman', 'new york', times, serif;font-size:16px;color:rgb(0, 0, 0);background-color:transparent;font-style:normal;" class="yui_3_7_2_19_1365302541879_57">Além da ajuda para
a função extract no manual do raster, talvez o último exemplo dessa página possa te ajudar: <a href="http://stackoverflow.com/questions/14682606/extract-value-from-raster-stack-from-spatialpolygondataframe" style="font-size: 12pt;">http://stackoverflow.com/questions/14682606/extract-value-from-raster-stack-from-spatialpolygondataframe</a></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;"><br></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_54" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 16px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: transparent; font-style: normal;">Mas não estou certo se era isso que você estava buscando. Acho que o Paulo vai te ajudar melhor.</div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_56" style="font-family: 'times new
roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"></div><div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_58" style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;"> </div><div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;">Saudações,<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_61">--<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_64">Thiago V. dos Santos<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_67">PhD student<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_70">Land and Atmospheric Science<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_73">University of Minnesota<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_76">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_79">Phone: (612) 323 9898<br id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_82"></div> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york',
times, serif; font-size: 12pt;" id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_85" class="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_84"> <div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;" class="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_87"> <div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial"> <hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b> ASANTOS <alexandresantosbr@yahoo.com.br><br> <b><span style="font-weight:bold;">To:</span></b> r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Thiago V. dos Santos <thi_veloso@yahoo.com.br> <br> <b><span style="font-weight:bold;">Sent:</span></b> Saturday, April 6, 2013 10:26 PM<br> <b><span style="font-weight:bold;">Subject:</span></b> Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por krigagem<br> </font> </div> <br><div id="yiv232405379">
<div id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_179">
Thiago,<br>
<br>
Já pensei isto, mas para SpatialPoints(vp), preciso fazer um
list() das coordenadas dos pixels (vp$x e vp$y) e isto não tenho e
nem sei como recuperar o valor de um pixel à partir de uma
coordenada conhecida.<br>
<br>
Abraço,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
<br>
<div class="yiv232405379moz-cite-prefix">Em 06/04/2013 21:32, Thiago V. dos
Santos escreveu:<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;" class="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_93">
<div><span>Nao conheco bem todas as funcoes do sp, mas para pela
mensagem de erro eu transformaria a tabela vp em
SpatialPoints, que eh o argumento esperado pela funcao over.</span></div>
<div> </div>
<div>Saudações,<br>
--<br>
Thiago V. dos Santos<br>
PhD student<br>
Land and Atmospheric Science<br>
University of Minnesota<br>
<a rel="nofollow" class="yiv232405379moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm">http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm</a><br>
Phone: (612) 323 9898<br>
</div>
<div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;" class="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_94">
<div style="font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 12pt;" class="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_95" id="yiv232405379yui_3_7_2_18_1365302541879_182">
<div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial">
<hr size="1"> <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b>
ASANTOS <a rel="nofollow" class="yiv232405379moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br"><alexandresantosbr@yahoo.com.br></a><br>
<b><span style="font-weight:bold;">To:</span></b>
<a rel="nofollow" class="yiv232405379moz-txt-link-abbreviated" ymailto="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a> <br>
<b><span style="font-weight:bold;">Sent:</span></b>
Saturday, April 6, 2013 8:12 PM<br>
<b><span style="font-weight:bold;">Subject:</span></b>
Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem
gerada por krigagem<br>
</font> </div>
<br>
Boa noite pessoal,<br>
<br>
Acho evoluí um pouco na questão, mas agora a
dificuldade esta em contar os pixels contidos no interior
das malhas, quando tento um over(), ocorre o seguinte erro:<br>
<br>
Erro em function (classes, fdef, mtable) :<br>
unable to find an inherited method for function "over",
for signature "table", "SpatialPolygons"<br>
<br>
<br>
segue CRM:<br>
#<br>
require(geoR)<br>
plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord
X", ylab="Coord Y")<br>
loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1),
ncol=2)<br>
text(loci, as.character(1:4), col="red")<br>
polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)<br>
<br>
# Fitting models with nugget fixed to zero<br>
ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)<br>
<br>
# defining the grid<br>
pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51))<br>
# kriging calculations<br>
kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige =
krige.control(obj.m = ml))<br>
# displaying predicted values<br>
image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
#<br>
<br>
#Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2<br>
p0<-c(0.1,0.1)<br>
#<br>
c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)<br>
d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)<br>
d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)<br>
points(d1[,1],d1[,2],col="red")<br>
ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
abline(v=ver, col="red")<br>
abline(h=hor, col="red")<br>
#<br>
require(sp)<br>
grid=GridTopology(c(0.1,0.1), c(0.2,0.2), c(5,5))### Cria as
área<br>
grid=SpatialGrid(grid=grid)<br>
class(grid) ## SpatialPixels<br>
gridPol <- as(grid, "SpatialPolygons") ## Transfoma as
areas em polígonos espaciais<br>
options(digits=5)<br>
pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é
dado por seq Xmaior - Xmenor/l * Ymaior-Ymenor/l<br>
vp <- table(area <- kc$predict)## Valor dos pixels<br>
count.pix<-table(over(vp, gridPol)) #contar quantos
pontos tem em cada area<br>
<br>
<br>
Obrigado,<br>
<br>
Alexandre<br>
<br>
Em 06/04/2013 17:11, ASANTOS escreveu:<br>
> Boa noite membros da lista,<br>
> <br>
> Gostaria de receber ideias para calcular o valor
médio dos pixel em uma imagem gerada por krigagem em
sub-regiões de interesse na imagem, por exemplo usando um
exemplo do Prof. Paulo, onde ajusta-se um semivariograma e
faz a krigagem ordinária dos dados:<br>
> <br>
> #<br>
> require(geoR)<br>
> plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
> loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0,
1.1), ncol=2)<br>
> text(loci, as.character(1:4), col="red")<br>
> polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)<br>
> <br>
> # Fitting models with nugget fixed to zero<br>
> ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)<br>
> <br>
> # defining the grid<br>
> pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1,
l=51))<br>
> # kriging calculations<br>
> kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige =
krige.control(obj.m = ml))<br>
> # displaying predicted values<br>
> image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)),
xlab="Coord X", ylab="Coord Y")<br>
> #<br>
> <br>
> #Agora vou dividir esta área em 25 partes e lançar os
centroides destas subáreas:<br>
> <br>
> #Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2<br>
> p0<-c(0.1,0.1)<br>
> #<br>
> c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)<br>
> d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)<br>
> d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)<br>
> points(d1[,1],d1[,2],col="red")<br>
> ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
> hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)<br>
> abline(v=ver, col="red")<br>
> abline(h=hor, col="red")<br>
> #<br>
> <br>
> E aqui vem minha pergunta, como calcular o valor médio
dos pixels contidos em cada subárea de 0.2 x 0.2?<br>
> <br>
> Obrigado,<br>
> <br>
<br>
--
======================================================================<br>
Alexandre dos Santos<br>
Proteção Florestal<br>
Coordenador do curso Técnico em Florestas<br>
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal<br>
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia
de Mato Grosso<br>
Campus Cáceres<br>
Caixa Postal 244<br>
Avenida dos Ramires, s/n<br>
Bairro: Distrito Industrial<br>
Cáceres - MT CEP: 78.200-000<br>
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)<br>
e-mails:<a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br" target="_blank" href="mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br">alexandresantosbr@yahoo.com.br</a><br>
<a rel="nofollow" ymailto="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br" target="_blank" href="mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br">alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br</a><br>
======================================================================<br>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a rel="nofollow" ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a rel="nofollow" target="_blank" href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" target="_blank" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
<fieldset class="yiv232405379mimeAttachmentHeader"></fieldset>
<br>
<pre>_______________________________________________
R-br mailing list
<a rel="nofollow" class="yiv232405379moz-txt-link-abbreviated" ymailto="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank" href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>
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Leia o guia de postagem (<a rel="nofollow" class="yiv232405379moz-txt-link-freetext" target="_blank" href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
<br>
<pre class="yiv232405379moz-signature">--
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Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
Coordenador do curso Técnico em Florestas
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
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