<p>Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes, por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do pacote? Isso pode ser feito?</p>
<div class="gmail_quote">---------- Mensagem encaminhada ----------<br>De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <<a href="mailto:ml-node%2Bs2285057n4657087h74@n4.nabble.com">ml-node+s2285057n4657087h74@n4.nabble.com</a>><br>
Data: 16/11/2012 17:50<br>Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br>Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <<a href="mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com">pedro.rafael.marinho@gmail.com</a>><br>
<br type="attribution">
<p dir="ltr">Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds". </p>
<div class="gmail_quote"><div class="quoted-text">On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>> wrote:<br type="attribution">
</div><blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="quoted-text">
<p>Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN? </p>
</div><div class="gmail_quote">---------- Mensagem encaminhada ----------<br>De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>><div class="quoted-text">
<br>
Data: 16/11/2012 17:01<br>Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br></div>Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>><div class="elided-text">
<br>
<br type="attribution">
<div>Se vc rodar<br></div><div><br></div><div> R CMD check pacote</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo dos logs?<br><br><div class="gmail_quote">
2012/11/16 tiago souza marçal <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span><div>
<br>
<div><div dir="ltr">
O meu path esta configurado da seguinte forma:<div><br></div><div>C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer</div>
<div><br></div><div>Você vê algum problema?</div><div><br></div><div>Att.</div><div><br></div><div>Tiago.<br><br><div><div></div><hr>Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200<div><div><br>From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br><br>
<div>na minha vm windows, eu instalei
primeiro o miktex, depois instalei o rtools. Deve ser alguma
loucura do windows (Path faltando, por exemplo)<br>
<pre>[]s
Leonard de Assis
<a href="http://about.me/ldeassis" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://about.me/ldeassis</a></pre>
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:<br>
</div>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
<div dir="ltr">
O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF (
R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do
MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
<div><br>
</div>
<div>Att.</div>
<div><br>
</div>
<div>Tiago. <br>
<br>
<div>
<hr>Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200<br>
From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br>
<br>
<div>RTools, errei o nome<br>
<br>
voce acha no CRAN<br>
<pre>[]s
Leonard de Assis
<a href="http://about.me/ldeassis" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://about.me/ldeassis</a></pre>
Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:<br>
</div>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
<div dir="ltr"> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
<div><br>
</div>
<div>Att.</div>
<div><br>
</div>
<div>Tiago.<br>
<br>
<div>
<hr>Date: Thu, 15 Nov 2012
09:28:46 -0200<br>
From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o
R.<br>
<br>
<div>No Windows tem que
instalar o rutil recomendado para a versão do R
que estamos usando.<br>
<br>
Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os
problemas que encontrei quando fuçei com pacotes
foram referentes ao R não localizar todos os
'bichinhos' do Rutil os quais precisava.<br>
<pre>[]s
Leonard de Assis
<a href="http://about.me/ldeassis" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://about.me/ldeassis</a></pre>
Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:<br>
</div>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
<div dir="ltr"> Estou com um problema parecido com
o seu, porém, no Windows . No meu caso o check
do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser
gerado (<font face="Courier New">R CMD Rd2pdf</font>)
uma mensagem de erro e retornada informando uma
versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
<div><br>
</div>
<div>Mas no seu caso você observou mensagem de
erro no processo de instalação do pacote (<font face="Courier New">R CMD INSTALL</font>) ?
Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o
problema, em função de algum erro na edição do
arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você
um <span style="font-size:10pt"> </span><span style="font-size:10pt">WARNING no check dos
arquivos.Rd com </span><span style="font-size:10pt">algumas mensagens de
erro.</span></div>
<div><span style="font-size:10pt"><br>
</span></div>
<div><span style="font-size:10pt">Espero ter te
ajudado.</span></div>
<div><span style="font-size:10pt"><br>
</span></div>
<div><span style="font-size:10pt">Att.</span></div>
<div><span style="font-size:10pt"><br>
</span></div>
<div><span style="font-size:10pt">Tiago. </span></div>
<div><br>
<div>
<hr>Date: Wed, 14 Nov
2012 23:27:37 -0300<br>
From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes
para o R.<br>
<br>
Pessoal estou estudando como criar pacotes
no R e tive o seguinte erro na hora de dar o
check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o
pdf da documentação não é criado. Alguém
saberia me informar onde estaria o erro?<br>
<br>
OBS: Estou em uma máquina Linux.<br>
<br>
* using log directory
‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’<br>
* using R version 2.15.1 (2012-06-22)<br>
* using platform: x86_64-pc-linux-gnu
(64-bit)<br>
* using session charset: UTF-8<br>
* checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ...
OK<br>
* checking extension type ... Package<br>
* this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’<br>
* checking package namespace information ...
OK<br>
* checking package dependencies ... OK<br>
* checking if this is a source package ...
OK<br>
* checking if there is a namespace ... OK<br>
* checking for executable files ... OK<br>
* checking whether package ‘PRDM’ can be
installed ... OK<br>
* checking installed package size ... OK<br>
* checking package directory ... OK<br>
* checking for portable file names ... OK<br>
* checking for sufficient/correct file
permissions ... OK<br>
* checking DESCRIPTION meta-information ...
OK<br>
* checking top-level files ... OK<br>
* checking index information ... OK<br>
* checking package subdirectories ... OK<br>
* checking R files for non-ASCII characters
... OK<br>
* checking R files for syntax errors ... OK<br>
* checking whether the package can be loaded
... OK<br>
* checking whether the package can be loaded
with stated dependencies ... OK<br>
* checking whether the package can be
unloaded cleanly ... OK<br>
* checking whether the namespace can be
loaded with stated dependencies ... OK<br>
* checking whether the namespace can be
unloaded cleanly ... OK<br>
* checking for unstated dependencies in R
code ... OK<br>
* checking S3 generic/method consistency ...
OK<br>
* checking replacement functions ... OK<br>
* checking foreign function calls ... OK<br>
* checking R code for possible problems ...
OK<br>
* checking Rd files ... WARNING<br>
prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text
must be in a section<br>
prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text
must be in a section<br>
prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty
section \value<br>
* checking Rd metadata ... OK<br>
* checking Rd cross-references ... OK<br>
* checking for missing documentation entries
... OK<br>
* checking for code/documentation mismatches
... OK<br>
* checking Rd \usage sections ... OK<br>
* checking Rd contents ... OK<br>
* checking for unstated dependencies in
examples ... OK<br>
* checking examples ... OK<br>
* checking PDF version of manual ... ERROR<br>
Rd conversion errors:<br>
Warning: unknown option '-'<br>
Warning in file(con, "r") :<br>
cannot open file
'/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such
file or directory<br>
Error in file(con, "r") : cannot open the
connection<br>
<br>
<div> <br clear="all">
[ ],<br>
Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
<br>
<br>
<div>Em 14 de
novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span>
escreveu:<br>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">Grande Paulo
Justiniano, como vai? Muito obrigado
pelas suas informações. Uso o Linux
faz uns 6 anos mas nunca contribui ou
publiquei meus códigos. Estava vendo
que a linguagem Julia vem com a
licença MIT que eu não acho muito
interessante porque quem quiser pode
vender o código. Minha dúvida sobre a
licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa
poderá desmanchar algum código que fiz
ou mudar completamente o foco do
pacote, retirar nome dos autores, etc.
Existe um pacote hoje muito usado no R
que foi feito por uma pessoa e depois
de um tempo parou de ser mantido.
Chegou um outro cara de fora e
reimplementou o pacote e tirou o nome
dos autores antigos e depois muita
luta o nome dessas pessoas permaneceu
como "autores antigos". Isso ocorre
com certa frequência? Existe alguma
periodicidade de manutenção do pacote
que deve ser respeitada? <br>
<div>
<div><br clear="all">
[ ],<br>
Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
<br>
<br>
</div>
<div>Em 14 de
novembro de 2012 20:28, Paulo
Justiniano [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span>
escreveu:
<div>
<div><br>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em" style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
<div> <br>
<br>
On Wed, 14 Nov 2012, Pedro
Rafael wrote: <br>
<br>
> Pessoal, digamos que
faço um pacote para o R.
Como funciona o professo
de submissão? <br>
<br>
</div>
1. Leia atentamente o manual
"Writing R extensions" que
descreve isto em <br>
detalhes. <br>
<br>
2 certifique-se que voce
testou o seu pacote : <br>
<br>
R CMD check SEU_PACOTE <br>
<br>
e corrija todos os eventuais
problemas <br>
<div><br>
> Digamos que eu
submeta um pacote
"meu_pacote" e depois
queira <br>
> fazer modificações no
mesmo. Para acrescentar
essas modificações eu
tenho que submeter
novamente o pacote com o
mesmo nome para que as
atualizações <br>
> fiquem disponíveis? <br>
<br>
</div>
Sim. Para isto voce alter a
numero da versao no arquivo
DESCRIPTION <br>
<div><br>
> <br>
> Outra dúvida que
tenho é sobre a segurança
que tenho que meu pacote
não seja modificado.
Qualquer pessoa pode pegar
esse pacote e alterar ele
<br>
> completamente sem
nenhuma permissão minha ou
qualquer modificação tem
que ser acompanhada por
intermédio da pessoa que
submeteu o pacote pela
primeira <br>
> vez? <br>
> <br>
<br>
</div>
Bem vindo ao Universo do
Software livre <br>
<br>
Note que se voce quiser voce
pode baixar os fontes do R e
mudar o que <br>
quiser <br>
<br>
Falando mais seriamente no
DESCRIPTION voce define a
licenca. <br>
Leia sobre licxancas GPL e
análogas <br>
<br>
Minha sugestao: internalize
completamente o conceito de
software livre e <br>
livre-se destas
preocupacoes <br>
<div><br>
> <br>
> São dúvidas bestas
mas que nunca entendi
direito. <br>
<br>
</div>
Nao sao somente suas. <br>
Não é por acaso que há uma
diversidade de tipos de
licensas, não sem <br>
controvérsias! <br>
<div><br>
> <br>
> Obrigado à todos. <br>
> [ ], <br>
> Pedro Rafael Diniz
Marinho. <br>
> <br>
> <br>
><br>
</div>
_______________________________________________
<br>
R-br mailing list <br>
<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden
email]</a> <br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo
reproduzível. <br>
<br>
<hr color="#cccccc" size="1">
<div>
<div style="font-weight:bold">If
you reply to this email,
your message will be
added to the discussion
below:</div>
<a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657009.html" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657009.html</a>
</div>
<div>
To unsubscribe from R-br,
<a rel="nofollow" link="external">click
here</a>.<br>
<a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml" rel="nofollow" link="external" target="_blank">NAML</a>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
<br>
_______________________________________________
R-br mailing list <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=11" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</div>
</div>
</div>
<br>
<fieldset></fieldset>
<br>
<pre>_______________________________________________
R-br mailing list
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</blockquote>
<br>
<br>
_______________________________________________ R-br
mailing list <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=13" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</div>
</div>
</div>
<br>
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</blockquote>
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forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</div></div></div></div> </div>
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<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></div></div></div></div></div>
</blockquote></div><div class="elided-text"><br>
<div>
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<br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.
<br>
<br>
<hr noshade size="1" color="#cccccc">
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