<b>O engraçado é que o pacote instala e funciona sem problemas. Consigo ver a documentação em html mas o PDF não foi gerado. Quando dou o R CMD check na hora de gerar o pdf ocorre o seguinte erro:</b><br><br>* checking for missing documentation entries ... OK<br>
* checking for code/documentation mismatches ... OK<br>* checking Rd \usage sections ... OK<br>* checking Rd contents ... OK<br>* checking for unstated dependencies in examples ... OK<br>* checking examples ... OK<br>* checking PDF version of manual ... ERROR<br>
Rd conversion errors:<br>Warning: unknown option '-'<br>Warning in file(con, "r") :<br>  cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or directory<br>Error in file(con, "r") : cannot open the connection<br>
<br><b>No arquivo 00install.out aparece como se tivesse tudo ok:</b><br><br>* installing *source* package ‘PRDM’ ...<br>** R<br>** preparing package for lazy loading<br>** help<br>*** installing help indices<br>** building package indices<br>
** testing if installed package can be loaded<br><br>* DONE (PRDM)<br><br><div class="gmail_extra"><br clear="all">[   ],<br>Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
<br><br><div class="gmail_quote">Em 15 de novembro de 2012 12:47, Pedro Rafael <span dir="ltr"><<a href="mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com" target="_blank">pedro.rafael.marinho@gmail.com</a>></span> escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">O erro persiste. Eu acho que o problema não está no exemplo, tanto que posso omitir. O meu exemplo poderia ser um comentário. <br>
<div class="im"><br><br>* checking PDF version of manual ... ERROR<br>Rd conversion errors:<br>Warning: unknown option '-'<br>
Warning in file(con, "r") :<br><br></div><div class="gmail_extra"><div class="im"><br clear="all">[   ],<br>Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
<br><br></div><div class="gmail_quote">Em 15 de novembro de 2012 12:39, Tiago de Souza [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="mailto:ml-node+s2285057n4657028h45@n4.nabble.com" target="_blank">ml-node+s2285057n4657028h45@n4.nabble.com</a>></span> escreveu:<div>
<div class="h5"><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

        


<div dir="ltr">
Vamos fazer o seguinte eu te envio um exemplo que esta dando certo aqui e você tenta fazer ele ai.<div><br></div><div>anova.fat.dic<-function(fat1, fat2,resp){</div><div><br></div><div>fat1<-factor(fat1)</div><div>

<br></div><div>fat2<-factor(fat2)</div><div><br></div><div>av<-aov(resp ~ fat1*fat2)</div><div><br></div><div>y<-summary(av)</div><div><br></div><div>return(y)</div><div><br></div><div>}</div><div><br></div><div>

Eu não uso o linux mas espero que o exemplo te ajude.</div><div><br></div><div>Att.</div><div><br></div><div>Tiago.<br><div>   <br><br><div><div></div><hr>Date: Thu, 15 Nov 2012 11:24:42 -0300<div><br>From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657028&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>

To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657028&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>Subject: Re: [R-br]   [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br><br></div><div>
Olá  <span>Tiago de Souza como vai? Obrigado pela ajuda. No arquivo .Rd que você me enviou está ocorrendo o erro que segue:<br><br>* checking examples ... ERROR<br>Running examples in ‘PRDM-Ex.R’ failed<br>
The error most likely occurred in:<br><br>> ### Name: prdm<br>> ### Title: Meu Pacote<br>> ### Aliases: prdm<br>> <br>> ### ** Examples<br>> <br>>  fdp<- #defina o quem e esta variavel<br>+  fda<- #defina o quem e esta variavel<br>


+  chuetes<- #defina o quem e esta variavel<br>+  dados<- #defina qual o conjunto de dados<br>+  prdm(fdp, fda, chutes, dados, method = "Nelder-Mead")<br>Error in optim(chutes, fn = vero, x = dados, control = list(maxit = 50000),  : <br>


  object 'chutes' not found<br>Calls: prdm -> optim<br>Execution halted<br><br>Você acredita que o erro estava no exemplo?<br><br></span></div><div><div><br clear="all">[   ],<br>Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>



<br><br></div><div>Em 15 de novembro de 2012 10:02, Tiago de Souza [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657028&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span> escreveu:<div>

<div><br>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">

        


<div dir="ltr">
Pedro, fiz algumas alterações no tópico <font face="Courier New">arguments</font> da uma olhada para ver se você concorda. Deixei algumas instruções no tópico <span style="font-family:'Courier New'">examples </span>caso o problema persista me envie este arquivo com as variáveis fdp, fda, chutes e dados definidas no tópico <span style="font-family:'Courier New'">examples</span> e eu posso tentar te ajudar.<div>


<br></div><div>Att.</div><div><br></div><div>Tiago.<br><div><br></div><div>     <br><br><div><div></div><hr>Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:42 -0300<div><br>From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>


To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>Subject: Re: [R-br]   [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br><br></div><div>
Segue em anexo o pacote. Basta descompactar. Não estou vendo o erro. <br><br><br><br>Obrigado.<br><br><br><br></div><div><div><br clear="all">[   ],<br>Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
<br><br></div><div>Em 15 de novembro de 2012 08:52, Pedro Rafael <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span> escreveu:<br>



<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em"><div>No INSTALL não deu nenhum erro. O processo de instalação foi normal. Será que eu poderia anexar meu exemplos para vocês dá uma olhada?<br>
<br><br>Obrigado.<br></div><div><div><div><br clear="all">[   ],<br>Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>

<br><br></div></div><div>Em 15 de novembro de 2012 08:42, Tiago de Souza [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=3" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span> escreveu:<div>


<div><div>
<div><br>
<blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">

        


<div dir="ltr">
Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?<div><br></div><div>Att.</div><div><br></div><div>Tiago.<br><br><div><div></div><hr>Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200<div><div><br>From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=0" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>




To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=1" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br><br>
  
    
  
  
    <div>No Windows tem que instalar o rutil
      recomendado para a versão do R que estamos usando.<br>
      <br>
      Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que
      encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não
      localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.<br>
      <pre>[]s
Leonard de Assis
<a href="http://about.me/ldeassis" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://about.me/ldeassis</a></pre>
      Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:<br>
    </div>
    <blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
      
      <div dir="ltr">
        Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No
        meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser
        gerado (<font face="Courier New">R CMD Rd2pdf</font>) uma
        mensagem de erro e retornada informando uma versão antiga do
        MikTex que eu não estou usando.  
        <div><br>
        </div>
        <div>Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo
          de instalação do pacote (<font face="Courier New">R CMD
            INSTALL</font>) ? Caso isso tenha ocorrido este pode ter
          sido o problema, em função de algum erro na edição do
          arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um <span style="font-size:10pt"> </span><span style="font-size:10pt">WARNING no check dos arquivos.Rd com </span><span style="font-size:10pt">algumas mensagens de erro.</span></div>





        <div><span style="font-size:10pt"><br>
          </span></div>
        <div><span style="font-size:10pt">Espero ter te ajudado.</span></div>
        <div><span style="font-size:10pt"><br>
          </span></div>
        <div><span style="font-size:10pt">Att.</span></div>
        <div><span style="font-size:10pt"><br>
          </span></div>
        <div><span style="font-size:10pt">Tiago.   </span></div>
        <div><br>
          <div>
            <hr>Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300<br>
            From: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=2" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
            To: <a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=3" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a><br>
            Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.<br>
            <br>
            Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o
            seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o
            arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é criado.
            Alguém saberia me informar onde estaria o erro?<br>
            <br>
            OBS: Estou em uma máquina Linux.<br>
            <br>
            * using log directory
            ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’<br>
            * using R version 2.15.1 (2012-06-22)<br>
            * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)<br>
            * using session charset: UTF-8<br>
            * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK<br>
            * checking extension type ... Package<br>
            * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’<br>
            * checking package namespace information ... OK<br>
            * checking package dependencies ... OK<br>
            * checking if this is a source package ... OK<br>
            * checking if there is a namespace ... OK<br>
            * checking for executable files ... OK<br>
            * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK<br>
            * checking installed package size ... OK<br>
            * checking package directory ... OK<br>
            * checking for portable file names ... OK<br>
            * checking for sufficient/correct file permissions ... OK<br>
            * checking DESCRIPTION meta-information ... OK<br>
            * checking top-level files ... OK<br>
            * checking index information ... OK<br>
            * checking package subdirectories ... OK<br>
            * checking R files for non-ASCII characters ... OK<br>
            * checking R files for syntax errors ... OK<br>
            * checking whether the package can be loaded ... OK<br>
            * checking whether the package can be loaded with stated
            dependencies ... OK<br>
            * checking whether the package can be unloaded cleanly ...
            OK<br>
            * checking whether the namespace can be loaded with stated
            dependencies ... OK<br>
            * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ...
            OK<br>
            * checking for unstated dependencies in R code ... OK<br>
            * checking S3 generic/method consistency ... OK<br>
            * checking replacement functions ... OK<br>
            * checking foreign function calls ... OK<br>
            * checking R code for possible problems ... OK<br>
            * checking Rd files ... WARNING<br>
            prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a
            section<br>
            prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a
            section<br>
            prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value<br>
            * checking Rd metadata ... OK<br>
            * checking Rd cross-references ... OK<br>
            * checking for missing documentation entries ... OK<br>
            * checking for code/documentation mismatches ... OK<br>
            * checking Rd \usage sections ... OK<br>
            * checking Rd contents ... OK<br>
            * checking for unstated dependencies in examples ... OK<br>
            * checking examples ... OK<br>
            * checking PDF version of manual ... ERROR<br>
            Rd conversion errors:<br>
            Warning: unknown option '-'<br>
            Warning in file(con, "r") :<br>
              cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No
            such file or directory<br>
            Error in file(con, "r") : cannot open the connection<br>
            <br>
            <div>
              <br clear="all">
              [   ],<br>
              Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
              <br>
              <br>
              <div>Em 14 de novembro de 2012
                20:43, Pedro Rafael <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=4" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span>
                escreveu:<br>
                <blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">Grande
                  Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas
                  informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca
                  contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que
                  a linguagem Julia vem com a licença MIT  que eu não
                  acho muito interessante porque quem quiser pode vender
                  o código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2  é
                  se uma pessoa poderá desmanchar algum código que fiz
                  ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome
                  dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no
                  R que foi feito por uma pessoa e depois de um tempo
                  parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora  e
                  reimplementou  o pacote e tirou o nome dos autores
                  antigos e depois muita luta o nome dessas pessoas
                  permaneceu  como "autores antigos". Isso ocorre com
                  certa frequência? Existe alguma periodicidade de
                  manutenção do pacote que deve ser respeitada? <br>
                  <div>
                    <div><br clear="all">
                      [   ],<br>
                      Pedro Rafael Diniz Marinho.<br>
                      <br>
                      <br>
                    </div>
                    <div>Em 14 de novembro de
                      2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <span dir="ltr"><<a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=5" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>></span>
                      escreveu:
                      <div>
                        <div><br>
                          <blockquote style="border-left:2px solid #cccccc;padding:0 1em">
                            <div> <br>
                              <br>
                              On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
                              <br>
                              <br>
                              > Pessoal, digamos que faço um pacote
                              para o R. Como funciona o professo de
                              submissão?
                              <br>
                              <br>
                            </div>
                            1. Leia atentamente o manual "Writing R
                            extensions"  que descreve isto em <br>
                            detalhes.
                            <br>
                            <br>
                            2 certifique-se que voce testou o seu pacote
                            :
                            <br>
                            <br>
                            R CMD check SEU_PACOTE
                            <br>
                            <br>
                            e corrija todos os eventuais problemas
                            <br>
                            <div><br>
                              > Digamos que eu submeta um pacote
                              "meu_pacote" e depois queira
                              <br>
                              > fazer modificações no mesmo. Para
                              acrescentar essas modificações eu tenho
                              que submeter novamente o pacote com o
                              mesmo nome para que as atualizações
                              <br>
                              > fiquem disponíveis?
                              <br>
                              <br>
                            </div>
                            Sim. Para isto voce alter a numero da versao
                            no arquivo DESCRIPTION
                            <br>
                            <div><br>
                              > <br>
                              > Outra dúvida que tenho é sobre a
                              segurança que tenho que meu pacote não
                              seja modificado. Qualquer pessoa pode
                              pegar esse pacote e alterar ele
                              <br>
                              > completamente sem nenhuma permissão
                              minha ou qualquer modificação tem que ser
                              acompanhada por intermédio da pessoa que
                              submeteu o pacote pela primeira
                              <br>
                              > vez?
                              <br>
                              >
                              <br>
                              <br>
                            </div>
                            Bem vindo ao Universo do Software livre
                            <br>
                            <br>
                            Note que se voce quiser voce pode baixar os
                            fontes do R e mudar o que <br>
                            quiser
                            <br>
                            <br>
                            Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce
                            define a licenca.
                            <br>
                            Leia sobre licxancas GPL e análogas
                            <br>
                            <br>
                            Minha sugestao: internalize completamente o
                            conceito de software livre e <br>
                            livre-se  destas preocupacoes
                            <br>
                            <div><br>
                              > <br>
                              > São dúvidas bestas mas que nunca
                              entendi direito.
                              <br>
                              <br>
                            </div>
                            Nao sao somente suas.
                            <br>
                            Não é por acaso que há uma diversidade de
                            tipos de licensas, não sem <br>
                            controvérsias!
                            <br>
                            <div><br>
                              > <br>
                              > Obrigado à todos.
                              <br>
                              > [   ],
                              <br>
                              > Pedro Rafael Diniz Marinho.
                              <br>
                              > <br>
                              > <br>
                              ><br>
                            </div>
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                            <br>
                            R-br mailing list
                            <br>
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                            <br>
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                            e forneça código mínimo reproduzível. <br>
                            <br>
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                            </div>
                            <div>
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            forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.</div>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" rel="nofollow" link="external" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
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        <br>
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        </div><div><div>
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</div><div><br><img> <strong>anova.fat.dic.Rd</strong> (904 bytes) <a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/attachment/4657028/0/anova.fat.dic.Rd" rel="nofollow" link="external" target="_blank">Download Attachment</a></div>



        
        
        
        <br>
        <br>
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                </div><a href="http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657028.html" target="_blank">http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657028.html</a>
        </div><div><div>
        <div style="color:#666;font:11px tahoma,geneva,helvetica,arial,sans-serif;margin-top:.4em;line-height:1.5em">
                
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