Prezados Daniel e Benilton,<br><br>obrigado pela ajuda. O problema foi resolvido com os comandos:<br><br>sudo apt-get build-dep r-cran-rJava<br>sudo R CMD javareconf<br><br>Atenciosamente,<br>Emerson.<br><br><div class="gmail_quote">
2012/10/29 Benilton Carvalho <span dir="ltr"><<a href="mailto:beniltoncarvalho@gmail.com" target="_blank">beniltoncarvalho@gmail.com</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
vc tentou a sugestao que lhe foi dada na mensagem de erro?<br>
<div class="im"><br>
configure: error: Java Development Kit (JDK) is missing or not registered in R<br>
Make sure R is configured with full Java support (including JDK). Run<br>
R CMD javareconf<br>
as root to add Java support to R.<br>
<br>
If you don't have root privileges, run<br>
R CMD javareconf -e<br>
to set all Java-related variables and then install rJava.<br>
<br>
<br>
</div>e o q obteve?<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888">b<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On 29 October 2012 16:15, Emerson Cotta Bodevan <<a href="mailto:bodevan.ec@gmail.com">bodevan.ec@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Prezados,<br>
><br>
> minha intenção é instalar o pacote speedR. No entanto, ao tentar instalá-lo,<br>
> aparece a mensagem de que está faltando o rJava.<br>
><br>
> Bom... ao tentar instalar o rJava aparece a mensagem abaixo:<br>
><br>
>> install.packages()<br>
> Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto<br>
> --- Please select a CRAN mirror for use in this session ---<br>
> Installing package(s) into<br>
> ‘/home/ecbodevan/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14’<br>
> (as ‘lib’ is unspecified)<br>
> tentando a URL '<a href="http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz" target="_blank">http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz</a>'<br>
> Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb)<br>
> URL aberta<br>
> ==================================================<br>
> downloaded 524 Kb<br>
><br>
> * installing *source* package ‘rJava’ ...<br>
> ** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked<br>
> checking for gcc... gcc -std=gnu99<br>
> checking for C compiler default output file name... a.out<br>
> checking whether the C compiler works... yes<br>
> checking whether we are cross compiling... no<br>
> checking for suffix of executables...<br>
> checking for suffix of object files... o<br>
> checking whether we are using the GNU C compiler... yes<br>
> checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes<br>
> checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed<br>
> checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E<br>
> checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep<br>
> checking for egrep... /bin/grep -E<br>
> checking for ANSI C header files... yes<br>
> checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes<br>
> checking for sys/types.h... yes<br>
> checking for sys/stat.h... yes<br>
> checking for stdlib.h... yes<br>
> checking for string.h... yes<br>
> checking for memory.h... yes<br>
> checking for strings.h... yes<br>
> checking for inttypes.h... yes<br>
> checking for stdint.h... yes<br>
> checking for unistd.h... yes<br>
> checking for string.h... (cached) yes<br>
> checking sys/time.h usability... yes<br>
> checking sys/time.h presence... yes<br>
> checking for sys/time.h... yes<br>
> checking for unistd.h... (cached) yes<br>
> checking for an ANSI C-conforming const... yes<br>
> checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes<br>
> configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline...<br>
> yes<br>
> checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes<br>
> checking whether sigsetjmp is declared... yes<br>
> checking whether siglongjmp is declared... yes<br>
> checking Java support in R... present:<br>
> interpreter : '/usr/bin/java'<br>
> archiver    : ''<br>
> compiler    : ''<br>
> header prep.: ''<br>
> cpp flags   : ''<br>
> java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server<br>
> -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386<br>
> -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386<br>
> -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni<br>
> -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib<br>
> -L/usr/lib -ljvm'<br>
> configure: error: Java Development Kit (JDK) is missing or not registered in<br>
> R<br>
> Make sure R is configured with full Java support (including JDK). Run<br>
> R CMD javareconf<br>
> as root to add Java support to R.<br>
><br>
> If you don't have root privileges, run<br>
> R CMD javareconf -e<br>
> to set all Java-related variables and then install rJava.<br>
><br>
> ERROR: configuration failed for package ‘rJava’<br>
> * removing ‘/home/ecbodevan/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/rJava’<br>
><br>
> The downloaded packages are in<br>
>     ‘/tmp/RtmpTC1ljU/downloaded_packages’<br>
> Mensagens de aviso perdidas:<br>
> In install.packages() :<br>
>   installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status<br>
><br>
><br>
> Alguém sabe como resolver? Agradeço qualquer ajuda.<br>
><br>
> Atenciosamente,<br>
> Emerson.<br>
><br>
> OBS.: ao tentar instalar o speedR e o rJava, eu rodava o R como "sudo". Uso<br>
> o ubuntu.<br>
><br>
</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5">> _______________________________________________<br>
> R-br mailing list<br>
> <a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
> <a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
> Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código<br>
> mínimo reproduzível.<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</div></div></blockquote></div><br>