Td otimo Olympio.<div><br></div><div>Abs<br><br><div class="gmail_quote">Em 9 de maio de 2012 20:54, Olympio Neto <span dir="ltr"><<a href="mailto:olympiotneto@gmail.com" target="_blank">olympiotneto@gmail.com</a>></span> escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
Ferraudo, tudo bem?<br>
<br>
Cara, quando li a mensagem, pensei a mesma coisa! Cada dia aprendo
mais com o Walmes. <br>
Parabéns, Walmes. Poucas vezes li uma explicação tão simples e
didática de uma análise de covariâncias.<br>
<br>
Abs<br>
<br>
Olympio<br>
<br>
<br>
Em 09/05/2012 18:29, Guilherme Moraes Ferraudo escreveu:
<blockquote type="cite">Walmes, o mestre da didática. Parabéns!!
<div><br>
</div>
<div>Walmes não deu para assistir a sua comunicação. Esepro que
tenha transcorrido tudo bem.</div>
<div><br>
</div>
<div>Abs<br>
<br>
<div class="gmail_quote">Em 9 de maio de 2012 16:05, Walmes
Zeviani <span dir="ltr"><<a href="mailto:walmeszeviani@gmail.com" target="_blank">walmeszeviani@gmail.com</a>></span>
escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><font face="trebuchet ms,sans-serif">Ivan,<br>
<br>
Vamos primeiro primeiro apodar as arestas a fim de fazer a
coisa rolar. Você tem um experimento com um fator de 5
níveis nominais, denominado de F. Cada animal é uma
unidade experimental do qual se observa uma resposta y e
uma covariável x. Acredita-se que x afeta y e portanto
quer-se remover esse efeito para poder estudar a variação
explicada por F. Pode-se supor que F e x tenham efeitos
aditivos (sem interação) ou pode-se assumir que existe
interação. Na ausência de interação as diferenças entre
níveis de F são as mesmas sem importar o nível de x, mas o
mesmo não vale para presença de interação, de forma que,
você deve definir antecipadamente em que nível(is) de x
quer comparar níveis de F. Não sei o CMR é exatamente o
que você tem, pois o CMR não parece ser um caso de modelo
misto porque animal é a unidade experimental e não um
fator de agrupamento (embora para Poisson este seja um
modelo estimável), enfim... vou considerar um glm fixo,
daí é só fazer as devidas extensões para o glmm.<br>
<br>
<span style="font-family:courier new,monospace">da <-
data.frame(F=gl(5,20), x=runif(5*20))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">da$Ey
<- with(da,
exp(1+as.numeric(F)/2+(as.numeric(F)-2)/3*x))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">da$y <-
with(da, rpois(F,
lambda=exp(1+as.numeric(F)/2+(as.numeric(F)-2)/3*x)))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">with(da,
tapply(y, F, mean))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">require(lattice)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">xyplot(y~x,
groups=F, data=da, type="a")</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">ac0 <-
glm(y~F*x, data=da, family=poisson)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">anova(ac0,
test="Chisq")</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">betas
<- coef(ac0)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">require(doBy)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace"># médias
populacionais marginais em x=0.5</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">mpm <-
popMatrix(ac0, effect="F", at=list(x=0.5))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">mpm%*%betas</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">exp(mpm%*%betas)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">#
diferença nas médias populacionais marginais duas à duas</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">nlevels(da$F)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">comp <-
t(combn(1:nlevels(da$F), 2))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">rownames(comp)
<- apply(comp, 1, paste, collapse="-")</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">dmpm <-
t(apply(comp, 1, function(vs) mpm[vs[1],]-mpm[vs[2],]))</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">rownames(dmpm)
<- rownames(comp)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">apply(dmpm,
1, function(x) x%*%betas)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">require(multcomp)</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">summary(glht(ac0,
linfct=mpm)) # médias populacionais marginais</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace">summary(glht(ac0,
linfct=dmpm)) # contraste entre as médias populacionais
marginais</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br style="font-family:courier new,monospace">
<span style="font-family:courier new,monospace"># na
verdade isso não é a média, mas sim o exp() disso</span><br style="font-family:courier new,monospace">
<br>
E é isso aí Ivan. Esse procedimento aí que fiz foi o que
deixou um determinado software famoso por dar esses
resultados aos usuários. Trata-se de algo que, depois de
fazer pela primeira vez e entender, passa a ser trivial.<br>
<br>
À disposição.<br>
Walmes.<br>
<br clear="all">
</font><span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">==========================================================================</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Walmes
Marques Zeviani</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">LEG
(Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S,
49.231759 W)</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Departamento
de Estatística - Universidade Federal do Paraná</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">fone: <a href="tel:%28%2B55%29%2041%203361%203573" value="+554133613573" target="_blank">(+55) 41 3361 3573</a></span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">VoIP:
(3361 3600) 1053 1173</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">e-mail: <a href="mailto:walmes@ufpr.br" target="_blank">walmes@ufpr.br</a></span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">twitter:
@walmeszeviani</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">homepage:
<a href="http://www.leg.ufpr.br/%7Ewalmes" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/~walmes</a></span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">linux user
number: 531218</span><br style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">
<span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">==========================================================================</span><br>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all"><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div>Guilherme Moraes Ferraudo</div>
<div>Jaboticabal/Campinas - SP</div>
<div><a href="http://lattes.cnpq.br/2096118558794430" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/2096118558794430</a></div>
<br>
</font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
<br>
<fieldset></fieldset>
<br>
<pre>_______________________________________________
R-br mailing list
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
</font></span></blockquote>
<br>
</div>
<br>_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>
<div>Guilherme Moraes Ferraudo</div><div>Jaboticabal/Campinas - SP</div><div><a href="http://lattes.cnpq.br/2096118558794430" target="_blank">http://lattes.cnpq.br/2096118558794430</a></div><br>
</div>