nao tenho como ter ideia sobre as "5 colunas", afinal escrevi o codigo sem saber o que sao os dados.<div><br></div><div>se vc se refere a concatenar todos os data.frames resultantes num data.frame maior, use:</div>
<div><br></div><div>resultados = do.call(rbind, resultados)</div><div><br></div><div>b</div><div><br><div class="gmail_quote">2012/3/30 Humberto Hazin <span dir="ltr"><<a href="mailto:hghazin@hotmail.com">hghazin@hotmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
Benilton,<br>
<br>
Muito obrigado! Resolveu meu problema! <br>
So mais uma pergunta. Caso eu queira que os valores fique em apenas
5 colunas como o exemplo abaixo<br>
Lat Long Year Mes SST <br>
23 49 2009 1<br>
22 49 2007 1<br>
21 49 2009 2<br>
21 49 2010 1<br>
. . . . <br>
. . . .<br>
. . . . <br>
<br>
<br>
Obrigado também ao Cleber!<br>
<br>
Um abraço<br>
<br>
Humberto<br>
<br>
Em 3/30/2012 12:10 PM, Benilton Carvalho escreveu:
<div><div class="h5"><blockquote type="cite">f = function(fname){
<div> year = substr(fname, 2, 5)</div>
<div> day1 = as.integer(substr(fname, 6, 8))</div>
<div> month = format(as.Date(strptime(paste(year, "01", "01",
sep='-'), '%Y-%m-%d'))+day1-1, '%m')</div>
<div> objOut = paste('m', substr(year, 3, 4), month, sep='')</div>
<div><br>
</div>
<div> hdf4to5(fname)</div>
<div> assign(objOut, satinGet(paste(fname, 5, sep=''),
lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype='oceancolor'))</div>
<div> assign(objOut, data.frame(extract(simplifySat(get(objOut),
extent=1))))</div>
<div> assign(objOut, cbind(get(objOut), mes=as.integer(month),
year=as.integer(year)))</div>
<div> return(get(objOut)<br>
<div>}</div>
<div><br>
</div>
<div>## vetor com o nome de todos os arquivos hdf4</div>
<div>fns = list.files(pattern='\\.hdf$')</div>
<div>resultados = lapply(fns, f)</div>
<div><br>
</div>
<div>Claramente, eu nao experimentei o codigo acima... e fica
pra vc a tarefa de testar e corrigir algum parenteses que
esteja faltando ou algum outro problema.</div>
<div><br>
</div>
<div>benilton</div>
<div><br>
<div class="gmail_quote">2012/3/30 Humberto Hazin <span dir="ltr"><<a href="mailto:hghazin@hotmail.com" target="_blank">hghazin@hotmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
<div> Bom dia Benilton,<br>
<br>
Obrigado por responder!<br>
<br>
É o seguinte quando baixo a imagem ela já vem com esse
número todo (S20040322004060) onde S=seawifs, em
seguida vem o ano 2004032 2004060 significa o periodo
da coleta do satélite ou seja 032-60 dias de 2004, ou
seja mes 2. Assim para o outro arquivo S20040012004031
001-31 dias de 2004 ou seja mes 1<br>
<br>
Esse arquivos estão em hdf4 porém preciso converter
para hdf5 para poder trabalhar! Então criei uma função
no R (hdf4to5) para para ler um executavel de um
programa (H4H5TOOLS-2.2.1-win764-vs10static) em
segundo plano para esse fim! Uso o pacote Satin para
ler o arquivo convertido em hdf5 e fazer as extrações
da área que quero ter esses dados
"satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30),
lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")" como preciso de
quadrantes de 1x1 grau uso a função
"simplifySat(m0401, extent=1)" em seguida criei uma
função no R "extract(m0401)" para extrair tudo em
coluna Lat, Long, Parametro...<br>
<br>
<br>
</div>
<div> hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401
<- satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30),
lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")<br>
m0401<-(simplifySat(m0401,
extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1;
m0401$year<-2004<br>
<br>
hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <-
satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10, -30),
lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")<br>
m0402<-(simplifySat(m0402,
extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2;
m0402$year<-2004<br>
<br>
</div>
<div> Eu não sei se ficou mais claro agora!<br>
<br>
Humberto<br>
<br>
<br>
Em 3/29/2012 9:25 PM, Benilton Carvalho escreveu: </div>
<blockquote type="cite">Sim, alguem pode te ajudar...
mas depende muito de vc ajudar o alguem primeiro....
Qual o truque para sair de S20040322004060 para "mes
2"? (minha bola de cristal diz que o ano corresponde
aos 4 primeiros digitos apos S, mas isso eh soh uma
hipotese, jah que vc nao disse explicitamente)
<div>
<div>
<div> <br>
</div>
<div>b<br>
<br>
<div class="gmail_quote">2012/3/29 Humberto
Hazin <span dir="ltr"><<a href="mailto:hghazin@hotmail.com" target="_blank">hghazin@hotmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"> Prezados,<br>
<br>
Venho mais uma vez pedir ajuda a voces para
resolver um problema!<br>
<br>
baixei uma série de images de satelite, por
ano e mes (2004 a 2010) totalizando 163
arquivos ate ai tudo bem! Por termos de
comodidade gostaria de criar um loop para
nao ter que digitar essas 163 linhas ou mais
para extrair latitude, longitude e SST.
conforme o codigo abaixo:<br>
<br>
hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401 <-
satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10,
-30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")<br>
m0401<-(simplifySat(m0401,
extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1;
m0401$year<-2004<br>
<br>
hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <-
satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10,
-30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")<br>
m0402<-(simplifySat(m0402,
extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2;
m0402$year<-2004<br>
<br>
Alguem poderia me ajudar!<br>
<br>
Nao coloquei o arquivo pois é muito grande
quase 36gigas porém caso precisem posso
colocar o parte do codigo para baixarem um
ou mais arquivos e testarem<br>
<br>
Humberto<br>
<br>
_______________________________________________<br>
R-br mailing list<br>
<a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br>
<a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>)
e forneça código mínimo reproduzível.<br>
</blockquote>
</div>
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</div>
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<fieldset></fieldset>
<br>
<pre>_______________________________________________
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.</pre>
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