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<div class=Section1>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Obrigado Prof. Paulo e Walmes deu certo,<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'> <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'> Respondendo a pergunta Walmes, já tinha retirado a
Parcelle do modelo esta errado mesmo, e agora declarei as.factor() para as
variáveis antes da glm, obrigado facilitou bem as coisas, ficando:<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText>> m4<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoPlainText>Call: glm(formula = Infestacao ~ Altitude + Vegetation +
<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText>Altitude:Vegetation, family = "binomial",
data = H.termes)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>Coefficients:<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>
(Intercept) <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>Altitudebaixa
Vegetationpature<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>
-2.1772 <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>1.9240 -0.8366<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>Altitudebaixa:Vegetationpature<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US> -1.1144<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>Degrees of Freedom: 1532 Total (i.e.
Null); 1529 Residual<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText>Null Deviance: 1579<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText>Residual Deviance: 1323 AIC: 1331<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoPlainText> > ##Fazendo os contrastes<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText> <span lang=EN-US>> require(contrast)<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US> > contr<-contrast(m4, <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>list(Altitude=levels(H.termes$Altitude),Vegetation="pature"),<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>+
list(Altitude=levels(H.termes$Altitude), <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>Vegetation="foret"),type="average")<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US> > print(contr,X=TRUE)<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US>glm model parameter contrast<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText><span lang=EN-US> Contrast S.E. Lower
Upper t df Pr(>|t|)<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoPlainText>1 -1.393758 0.2035796 -1.793083 -0.9944332 -6.85
1529 0<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoPlainText>Contrast coefficients:<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText> (Intercept) Altitudebaixa Vegetationpature
Altitudebaixa:Vegetationpature<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText>1 0 0
1 0.5<o:p></o:p></p>
<p class=MsoPlainText> ><o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Obrigado,<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Alexandre dos Santos<o:p></o:p></span></b></p>
<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>Ingenieur forestier, Msc.<o:p></o:p></span></b></p>
<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'>INRA- Biostatistique et Processus Spatiaux (BioSP)<o:p></o:p></span></b></p>
<p class=MsoNormal><b><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:
"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Domaine Saint-Paul<br>
Site Agroparc <br>
84914 - Avignon - France<br>
Tél. : +33 (0)6 87 95 16 29<o:p></o:p></span></b></p>
<p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";
color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm'>
<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br
[mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] <b>On Behalf Of </b>Walmes Zeviani<br>
<b>Sent:</b> terça-feira, 26 de abril de 2011 09:11<br>
<b>To:</b> r-br@listas.c3sl.ufpr.br<br>
<b>Subject:</b> Re: [R-br] Dúvida contrast() glm binomial<o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-family:"Trebuchet MS","sans-serif"'>Alexandre,<br>
<br>
Recomendo que passe as variáveis para fator antes da glm(), isso para evitar
que elas sejam convertidas para fator dentro da função e você tenha que ficar
usando as.factor() dentro da contrast(). O fator "group" não existe
nas análises que você postou o summary aqui, então por isso que a função
retorna "group não faz parte do delineamento", porque ela não é termo
declarado na formula do modelo, apenas foi declarado "Altitute",
"Vegetation" e "Parcelle". Parcelle não é uma variável
categórica? Você usou ela como variável regressora (contínua) no modelo. Isso
está correto?<br>
<br>
À disposição.<br>
Walmes.<br>
<br clear=all>
==========================================================================<br>
Walmes Marques Zeviani<br>
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)<br>
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná<br>
fone: (+55) 41 3361 3573<br>
VoIP: (3361 3600) 1053 1173<br>
e-mail: <a href="mailto:walmes@ufpr.br" target="_blank">walmes@ufpr.br</a><br>
twitter: @walmeszeviani<br>
homepage: <a href="http://www.leg.ufpr.br/%7Ewalmes" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/~walmes</a><br>
linux user number: 531218<br>
==========================================================================</span><o:p></o:p></p>
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