É Tura, vou voltar ao Free BSD ou mesmo o Linux devido estes gerenciar de uma melhor forma a memória. Vou investir alguns reais em uma CPU. Meu problema eu já resolvi filtrando as variáveis de interesse o que reduziu  e muito em MB a o tamanho da base de dados. Estou agora tentando entender e me pondo em uma situação que tenho uma base de dados enorme e como tratar esse problema no R. Estou percebendo que caso o que eu precise trabalha em uma base de dados que seja realmente grande, ou seja, se mesmo depois de filtrar meus interesses no banco o a base continua com vários GB tenho que ter uma memória RAM elevada. Vou olhar com mais carinho o pacote bigmemory e o SOAR.<div>

<br></div><div>Pedro<br><br><div class="gmail_quote">---------- Mensagem encaminhada ----------<br>De: <b class="gmail_sendername">Bernardo Rangel Tura [via R-br]</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:ml-node%2B3411136-758674982-223914@n4.nabble.com">ml-node+3411136-758674982-223914@n4.nabble.com</a>></span><br>

Data: 28 de março de 2011 06:21<br>Assunto: Re: [R-br] Fwd: [Dúvida] Ler dados direto no HD<br>Para: Pedro Rafael Diniz Marinho <<a href="mailto:pedro.rafael.marinho@gmail.com">pedro.rafael.marinho@gmail.com</a>><br>

<br><br><div class="im">

        On Sun, 2011-03-27 at 15:20 -0300, Pedro Rafael wrote:

<div><br>> Tura,

<br>>  

> mas mesmo assim isso é um grande problema. Você leu uma base de 12 gb.

> Se tivesse lido uma de 1 tera. O R iria tentar colocar tudo na RAM?

<br>> Era pra existir algum gerenciamente automático de memória. Se agrava

<br>> ainda mais quando estou no Windows. Eu trabalho na secretaria de saúde

<br>> com dados do SIM, SINAN e SINASC e na verdade não tenho grandes

<br>> problemas mas tava pensando como seria trabalhar com uma base de dados

<br>> 50 vezes maior como seria usando o R....? Acho que vou montar um bom

<br>> computador com memória RAM lá em cima e comprar uma placa de vídeo da

<br>> nvidia e programar em Cuda para fazer as contas diretamente na placa

<br>> de video que é mais rápido kkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkkk

<br>> Sim Tura ajudou as dicas, como você falou para as base de dados os

<br>> comandos que você me passou em que não trasformam em fatores algumas

> variaveis melhorou um pouco o problema.

<br>>  

<br>> -- 

<br>> Saudações,

<br>> Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB

</div><br></div>Rafael,

Acho que você não entende o problema ...

<br><br>Se você precisa realmente manipular X Gb de dados você tem que ter mais

<br>de X Gg de RAM. Volto a repetir nenhum programa do mundo pode trabalhar

com dados fora da RAM. Se você usar o dado ele tem que estar na RAM.

<br><br>Acho que você está confundindo o tamanho da base de dados com quanto de

<br>RAm você precisa para trabalhar. Recentemente para uma demanda precisei

<br>avaliar todas as internações no Brasil em 2008. Ao todo são 324 arquivos

<br>totalizando 4,8 Gb logo a maior parte das pessoa dirão preciso de 6 Gb

<br>ou mais para mexer nesta base. Porém o conjunto de dados que preciso

<br>para a análise totalizava 141 Mb. 

<br><br>Desta form fiz um script que li cada base de dados em um diretório

<br>selecionava o conjunto de dados (subset) num arquivo temporário e

<br>escrevia em csv no disco. Após isto lia todos os arquivos csv de uma vez

<br>só e os unificava com rbind em um único arquivo que utilizando save se

transformou em 1 arquivo .RData de 141 mb.

<br><br>Este script pode se rodado num computador com 2 Gb de RAM! Afinal o

maior arquivo tem menos de 100 Mb.

Vou te dar um conselho de alguém que mexe com bases DATASUS faz tempo.

<br>larga o windows, os paciente com demência gerenciam suas memorias melhor

que ele em 2006 larguei o windows justamente por isso.

<br><br>Se quiser comprar um computador escolha um com vários núcleos (Phenom X6

<br>por exemplo)  e compre RAM. Na minha experiência usar CUDA não vale a

<br>pena para isto. CUDA é bom para situações onde vc tem uma quantidade

<br>enorme de cálculos e não manipulação de dados

<br><div class="im"><br><br><br>-- 

<br>[]s

<br>Tura

<br><br>_______________________________________________

<br>R-br mailing list

<br><a href="http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3411136&i=0&by-user=t" rel="nofollow" link="external" target="_blank">[hidden email]</a>

<br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" rel="nofollow" link="external" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>

        <br>

        <br>

        <hr noshade size="1" color="#cccccc">

        </div><div style="color:#444;font:12px tahoma,geneva,helvetica,arial,sans-serif"><div class="im">

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<br>

</div>