[R-br] Teste de Qui-quadrado aplicado para a distribuição binomial
Cesar Rabak
cesar.rabak em gmail.com
Qua Mar 6 20:41:09 -03 2019
Na minha tentativa de rodar s/exemplo antes da linha
> res
As seguintes msgs de alerta são impressas:
Warning messages:
1: In densfun(x, parm[1], parm[2], ...) : NaNs produzidos
2: In chisq.test(table(emp), table(est), correct = TRUE) :
Aproximação do qui-quadrado pode estar incorreta
3: In densfun(x, parm[1], parm[2], ...) : NaNs produzidos
4: In densfun(x, parm[1], parm[2], ...) : NaNs produzidos
5: In chisq.test(table(emp), table(est), correct = TRUE) :
Aproximação do qui-quadrado pode estar incorreta
6: In chisq.test(table(emp), table(est), correct = TRUE) :
Aproximação do qui-quadrado pode estar incorreta
CONFERE?
On Tue, Mar 5, 2019 at 5:07 PM ASANTOS por (R-br) <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
wrote:
> Prezados Membros,
>
> Estou tentando realizar um teste de aderência (Qui-quadrado) aplicado
> a dados com distribuição binomial negativa sem sucesso. Em meu CRM:
>
> #Pacote MASS
> library(MASS)
>
> #Crio um banco de dados simulado
> Features<-sort(rep(1:3,100))
> Resp1<-rnbinom(200,0.75,0.10) ##60 dados com distribuição binomial negativa
> Resp2<-rpois(100,10) ##30 dados com distribuição de Poisson
> Resp<-c(Resp1,Resp2)
> d<-as.data.frame(cbind(Features,Resp))
>
> #Criando um loop para realizar o teste de Chi quadrado para os três
> conjuntos de dados - Feature 1, 2 e 3
> uniq <- unique(unlist(d$Features))
> res<-NULL
> for (i in 1:length(uniq)){
> data_1 <- subset(d, Features == uniq[i])
> k <- fitdistr(data_1$Resp,"negative binomial") #Extração dos
> parâmetros média e mu da binomial negativa
> par <- k$estimate
> size <- par[1]#Parâmetro k
> mu <- par[2]#Média
> N <- length(data_1$Resp)
> est <-N*dnbinom(data_1$Resp,size=size,mu=mu) ## Criando valores
> estimados
> fecdf <- ecdf(data_1$Resp) ###ecdf- Cria a distribuição cumulativa
> empírica
> knotsX <- knots(fecdf)
> emp <- fecdf(c(knotsX,Inf)) # Distribuição empírica
> testChi<-chisq.test(table(emp),table(est),correct=TRUE) #Teste de
> Qui-quadrado sobre a contagem dos dados empíricos versus estimados
> result<-ifelse(testChi$p.value>0.05,"Binomial Negative","Other
> distribution") ## Classifica os testes em binomial negativa ou outra
> distribuição
> res<-rbind(res,c(uniq[i],result))
> colnames(res)<-c("Features","Distribution")
> }
> res
>
> Meu output é:
> Features Distribution
> [1,] "1" "Other distribution"
> [2,] "2" "Other distribution"
> [3,] "3" "Binomial Negative"
> Ou seja, dá o resultado errado, na verdade as Features 1 e 2 é que são binomial negativa e a Feature 3 que são dados com distribuição de Poisson que tem que dar "Other distribution".
> Alguém teria alguma sugestão para dar?
> Obrigado
>
> --
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