[R-br] Digest R-br, volume 104, assunto 2

Maurício Sangiogo ms_sangiogo em hotmail.com
Qui Ago 8 14:51:52 -03 2019 

Fernando Souza, quando não uso uma tabela com as medianas, uso um gráfico Box Plot, eu acho a apresentação desse gráfico interessante para esse tipo de dados.

Att,
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Eng. Agr. Maurício Sangiogo
Doutorando em Fitossanidade - UFPel
Analista Ambiental - FEPAM

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De: R-br <r-br-bounces em listas.c3sl.ufpr.br> em nome de r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br>
Enviado: quinta-feira, 8 de agosto de 2019 12:00
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Assunto: Digest R-br, volume 104, assunto 1

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Tópicos de Hoje:

   1. Contrastes - MLG (Andre Oliveira)
   2. Graficos para não parametrica (Fernando Souza)
   3. Re: Contrastes - MLG (Cesar Rabak)


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Message: 1
Date: Wed, 7 Aug 2019 19:47:49 +0000 (UTC)
From: Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R.
        <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Contrastes - MLG
Message-ID: <642002604.1904317.1565207269786 em mail.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"


Boa tarde!

Tem como inverter a ordem do contraste que vem por padrão na função glht do pacote multcomp? Digo inverter para bater com o padrão do resultado do summary(fit) onde coloca t1-t2 e não t2 - t1 como fica no objeto p.

dados <- read.table("http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/dados/exemplo01.txt", head = T)

attach(dados)

boxplot(resp~trat, col=8)

hist(resp, col=8)

fit=glm(resp~trat, family = Gamma)

summary(fit)

require(multcomp)

p <- glht(fit, linfct = mcp(trat = "Tukey"))
plot(p, main= "", xlab = "")

obg

att.André
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Message: 2
Date: Wed, 7 Aug 2019 17:20:06 -0300
From: Fernando Souza <nandodesouza em gmail.com>
To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Graficos para não parametrica
Message-ID:
        <CAFrWFsm3a-MUoh1+rRRK4SnQikyfjt=H+BXfqNYbckSn5Tmq-A em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"

Pessoal
Gostari de uma informação. Qual o melhor gráfico para utilizar com dados
não paramétricos?
Fiz uma análise utiizando a função art() do pacote ARTols do R o qual me
permitiu testar interações não parametrica.
Porém para mostrar os dados na forma gráfica e ilustrar uma interação
significativa, há alguma forma?

Desde já agradeço


--
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Fernando Souza
Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
Celular: (31)99796-8781 (Vivo)
E-mail:nandodesouza em gmail.com <e-mail%3Anandodesouza em gmail.com>
Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307
Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/
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Message: 3
Date: Wed, 7 Aug 2019 18:57:00 -0300
From: Cesar Rabak <cesar.rabak em gmail.com>
To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R.
        <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] Contrastes - MLG
Message-ID:
        <CAKrF98=k=uudnQ8aJECUSoj+j2-HGECsGSH=Sxh2LM3u3esWUA em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"

André,

A função glht está usando a ordem "alfabética" dos seus fatores, como a
função não deve ter meios de mudar isso (você já *olhou* no FM, não
*olhou*?) ?,
a única forma seria fazer uma cópia do objeto retornado 'p' neste teu
exemplo, e inverter os sinais de *todos* os contrastes e colocar os
*labels* manualmente
no gráfico.

HTH
--
Cesar Rabak


On Wed, Aug 7, 2019 at 4:50 PM Andre Oliveira por (R-br) <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:

> Boa tarde!
>
> Tem como inverter a ordem do contraste que vem por padrão na função glht
> do pacote multcomp? Digo inverter para bater com o padrão do resultado do
> summary(fit) onde coloca t1-t2 e não t2 - t1 como fica no objeto p.
>
> dados <- read.table("http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/dados/exemplo01.txt
> <https://l.facebook.com/l.php?u=http%3A%2F%2Fwww.leg.ufpr.br%2F%7Epaulojus%2Fdados%2Fexemplo01.txt%3Ffbclid%3DIwAR2krDEvOI3rtXw4xASIrG0AxtCOmoRmbY0gt0SGuBk-7g3PhQcb3fS8o9o&h=AT3yPMcJkTSq7ku8iquqWH8fXOHRd76dpt80tMGemb1IX4c-yDBvcK2kBDS9NehkvTxIwEZkPdQWWtusjgFnfpytgzMKEyTEuIfdENjzZl7RO8VxxlRP3fhEUIwedOiNIZlwR5o_3H0>",
> head = T)
>
> attach(dados)
>
> boxplot(resp~trat, col=8)
>
> hist(resp, col=8)
>
> fit=glm(resp~trat, family = Gamma)
>
> summary(fit)
>
> require(multcomp)
>
> p <- glht(fit, linfct = mcp(trat = "Tukey"))
> plot(p, main= "", xlab = "")
>
> obg
>
> att.
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