[R-br] Duvidas acerca de teste estatistico.
Fernando Souza
nandodesouza em gmail.com
Quarta Janeiro 24 20:22:56 -02 2018
Um simples google
https://pt.wikipedia.org/wiki/Logaritmo_natural
Em 24 de janeiro de 2018 19:34, Mauro Sznelwar via R-br <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
> Logaritmos neperiano é na base 10? É na base 'e' que é aprox. 2,7.....
>
> Boa tarde,
>
> desculpe a demora em responder.
> @Cesar Rabak: a transformacao foi feita em logaritmos neperianos (base
> 10). Fui aconselhado a utilizar o teste de Mann-Whitnney pois minhas
> amostras tem distribuicao normal.
> Acho isso estranho! O motivo de se transformar para log é justamente esse:
> trazer as amostras para uma distribuicao normal.
> O que voce me aconselharia: t-test???
> Quero apenas comparar dois grupos, independentes e nao pareados.
>
> Obrigado
>
>
>
> Em 18 de janeiro de 2018 00:00, Cesar Rabak <cesar.rabak em gmail.com
> <http://../../../undefined//compose?to=cesar.rabak@gmail.com>> escreveu:
>
>> Vinícius,
>>
>> Testes estatísticos *podem* ter resultados significantes
>> estatisticamente e as diferenças serem clinicamente ou na forma a avaliar
>> no domínio do problema sem significância prática. Uma forma disso
>> acontecer é a amostra ser suficientemente grande para que uma diferença
>> muito diminuta gere as estatísticas dos testes com "significância" (a.k.a.
>> valor-p menor que o limiar para definir a significância).
>>
>> Como já comentado, ao aplicar uma transformação por logaritmos você
>> transformou o teste para um teste de relações na escala original. Não está
>> claro para mim se a transformação foi feita usando logaritmos de Briggs ou
>> Neperianos por isso, não dá para dizer o quê 0,5 de diferença significa em
>> termos de relação entre um grupo e outro.
>>
>> Uma outra coisa que me parece curiosa é o seguinte: por que depois do
>> trabalho para transformar os dados, ainda assim você optou por um teste com
>> menos poder que um paramétrico?
>>
>> HTH
>> --
>> Cesar Rabak
>>
>>
>> 2018-01-17 18:03 GMT-02:00 Vinicius Reis via R-br <
>> r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>> <http://../../../undefined//compose?to=r-br@listas.c3sl.ufpr.br>>:
>>
>>> Boa tarde,
>>>
>>> Encontrei esta lista de discussões em um website sobre estatística, o
>>> que na verdade estava procurando informacoes sobre problemas que venho
>>> tenho com testes estatísticos.
>>> Minha área é Ciências Biológicas, especificamente Microbiologia.
>>> Trabalho com um modelo in vitro de células que são deficientes para um
>>> determinado gene e para realizar meus ensaios uso o respectivo tipo
>>> selvagem. Ou seja, tenho duas linhagens celulares uma wild-type e uma
>>> knockout. Assim sendo, o meu trabalho consiste em analisar se a delecao do
>>> dado gene altera a infeccao bacteriana. Nesse caso, fiz o delineamento
>>> experimental e pretendo analisar diferentes aspectos da infeccao bacteriana
>>> como por exemplo adesão, internalizacao e replicacao. Para fins de analise
>>> estatística, os experimentos foram realizados em triplicata e tres
>>> experimentos independente. Ao final da coleta de dados, essas amostras
>>> foram quantificadas e transformadas em log e assim, apliquei o teste de
>>> Mann-Whitney para detectar diferenças entre os grupos. Grosseiramente, em
>>> alguns experimentos tenho uma diferença de aproximadamente 0.5 log do grupo
>>> wild-type para o grupo knockout. Isso significa que a presença de tal gene
>>> influencia a infeccao bacteriana. Entretanto, essa diferença parece ser tao
>>> pequena (pra nao dizer miserável) que fica até difícil fazer alguma
>>> inferência se essa diferença reflete relevância biológica. Entretanto, o
>>> teste de Mann-Whitney demonstrou que essa diferenca é extremamente
>>> significante (p=0.0001) ou seja o teste estatístico mostra uma extrema
>>> significância.
>>> Em ambos os grupos, tenho 9 replicatas (3 experimentos independentes com
>>> 3 replicatas cada).
>>> Gostaria muito de obter sugestões sobre como proceder nesse caso dos
>>> testes estatísticos pois da forma como é mostrado, parece bastante
>>> estranho: um gráfico mostrando absolutamente pouca ou nenhuma diferença e
>>> um teste estatístico mostrando extrema significância.
>>> Alguém pode orientar-me com este tipo de analise?
>>> Abaixo, seguem algumas informcoes sobre o teste.
>>>
>>> Agradeco imensamente qualquer ajuda.
>>> P.S.; desculpe a falta de acentuação mas no momento estou no exterior e
>>> o teclado não possui tal função.
>>>
>>> Column A MEF-WT vs.vs, Column B MEF-PPR-/- Mann Whitney test P value
>>> 0,0008 Exact or approximate P value? Exact P value summary*** Significantly
>>> different? (P < 0.05)Yes One- or two-tailed P value? Two-tailed Sum of
>>> ranks in column A,B121,0 , 50,00 Mann-Whitney U 5,000 Difference between
>>> medians Median of column A 6,176 Median of column B 5,964 Difference:
>>> Actual 0,2125 Difference: Hodges-Lehmann0,2266 96.01% CI of
>>> difference0,1040 to 0,3490 Exact or approximate CI? Exact
>>>
>>>
>>> MEF-WT vs MEF-PPR-/- Number of values9 9; Minimum 5,964 5,737; 25%
>>> Percentile 6,090 5,835; Median 6,176 5,964; 75% Percentile 6,246 6,035;
>>> Maximum 6,313 6,086; Mean 6,158 5,933 Std. Deviation 0,1092 0,1169; Std.
>>> Error of Mean 0,03639 0,03898; Lower 95% CI 6,074 5,843; Upper 95% CI 6,242
>>> 6,023; Mean ranks13,44 5,556
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> <https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=webmail> Virenfrei.
>>> www.avast.com
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>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>> código mínimo reproduzível.
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>>
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Fernando Souza
Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
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