[R-br] Instalar o pacote BRugs no MAC OS X

Manoel Galdino mcz.fea em gmail.com
Terça Junho 20 08:28:02 -03 2017


Não responde sua pergunta, mas se vai usar bugs, hoje em dia é melhor usar
o Stan. Mais rápido e mais poderoso. E a lógica geral é similar, ainda que
a sintaxe seja um pouco diferente.
Se você realmente quiser ficar na sintaxe antiga, tem tbm o JAGS, que é
quase todo igual ao bugs. E ambos rodam em Mac.
Abraços

Em 19 de jun de 2017 15:15, "Fernando Antonio de souza via R-br" <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Talvez esse post possa te ajudar
>
> http://www.davideagle.org/r-2/bayesian-modeling-using-
> winbugs-and-openbugs/running-openbugs-on-mac-using-wine
>
> <https://n1.nylas.com/link/432141c426b83f8371bdb468ce6a5bdc10c1facc0c896d908a5238bcd6685d31/0?redirect=http%3A%2F%2Fwww.davideagle.org%2Fr-2%2Fbayesian-modeling-using-winbugs-and-openbugs%2Frunning-openbugs-on-mac-using-wine&recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>
>
> =========================================
> Fernando Souza
> Celular: (31)99796-8781 <(31)%2099796-8781> (Vivo)
> E-mail:nandodesouza em gmail.com
> <https://n1.nylas.com/link/432141c426b83f8371bdb468ce6a5bdc10c1facc0c896d908a5238bcd6685d31/1?redirect=mailto%3Ae-mail%253Anandodesouza%40gmail.com&recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>
> ==========================================
>
> On Jun 19 2017, at 3:15 pm, Fernando Antonio de souza <
> nandodesouza em gmail.com> wrote:
>
>> Você precisa instalar o openBugs em seu sistema primeiro,pois o BRugs
>> depende que esse  pacote esteja instalado no  sistema
>> https://cran.r-project.org/web/packages/BRugs/index.html
>>
>> <https://n1.nylas.com/link/432141c426b83f8371bdb468ce6a5bdc10c1facc0c896d908a5238bcd6685d31/0?redirect=https%3A%2F%2Fcran.r-project.org%2Fweb%2Fpackages%2FBRugs%2Findex.html&recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>
>> Tentei ver como instalar openBugs no mac . Pelo que entendi esse pacote
>> não está disponível para mac. No entanto ele parece rodar com o wine.
>> https://cddesjardins.wordpress.com/2009/06/15/
>> openbugs-and-winbugs-on-mac-os-x/
>> <https://n1.nylas.com/link/432141c426b83f8371bdb468ce6a5bdc10c1facc0c896d908a5238bcd6685d31/1?redirect=https%3A%2F%2Fcddesjardins.wordpress.com%2F2009%2F06%2F15%2Fopenbugs-and-winbugs-on-mac-os-x%2F&recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>,
>> no entanto  não sei se rodando sobre o wine o pacote BRugs é capaz de
>> identificá-lo.
>>
>> Talvez alguém na lista apresente uma solução.
>>
>> att
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> =========================================
>> Fernando Souza
>> Celular: (31)99796-8781 <(31)%2099796-8781> (Vivo)
>> E-mail:nandodesouza em gmail.com
>> <https://n1.nylas.com/link/432141c426b83f8371bdb468ce6a5bdc10c1facc0c896d908a5238bcd6685d31/2?redirect=mailto%3Ae-mail%253Anandodesouza%40gmail.com&recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>
>> ==========================================
>>
>> On Jun 19 2017, at 2:53 pm, Ana Roberta dos Santos Silva via R-br <
>> r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>>
>> Prezado(a), boa tarde!
>>
>> Gostaria de saber como instalar o pacote BRugs no MAC OS X. Quando coloco
>> no R, aparece uma mensagem na qual um dos erros é: OpenBUGS 3.2.2 or later
>> not found. Install it, or specify its location using, for example, R CMD
>> INSTALL BRugs --configure-args='--with-openbugs=/usr/local'
>>
>> No entanto já fiz isso que processo, e mesmo assim não consigo instalar.
>>
>> Alguém sabe como instalar esse pacote no MAC OS X? Segue abaixo a
>> mensagem que aparece no R:
>>
>> > install.packages("BRugs")
>> --- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
>> Package which is only available in source form, and
>>   may need compilation of C/C++/Fortran: ‘BRugs’
>> Do you want to attempt to install these from sources?
>> y/n: y
>> installing the source package ‘BRugs’
>>
>> tentando a URL 'https://vps.fmvz.usp.br/CRAN/
>> src/contrib/BRugs_0.8-6.tar.gz
>> <https://vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/BRugs_0.8-6.tar.gz?recipient=r-br%40listas.c3sl.ufpr.br>
>> '
>> Content type 'application/x-gzip' length 96175 bytes (93 KB)
>> ==================================================
>> downloaded 93 KB
>>
>> * installing *source* package ‘BRugs’ ...
>> ** package ‘BRugs’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>> checking for prefix by checking for OpenBUGS... no
>> configure: error: OpenBUGS 3.2.2 or later not found. Install it, or
>> specify its location using, for example, R CMD INSTALL BRugs
>> --configure-args='--with-openbugs=/usr/local'
>> ERROR: configuration failed for package ‘BRugs’
>> * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/
>> Resources/library/BRugs’
>>
>> The downloaded source packages are in
>> ‘/private/var/folders/yv/sy0zx8153kscltzr7z9zj7k00000gn
>> /T/Rtmp2b3isg/downloaded_packages’
>> Warning message:
>> In install.packages("BRugs") :
>>   installation of package ‘BRugs’ had non-zero exit status
>>
>>
>> Grata pela atenção!
>>
>>
>> --
>>
>> Att.
>>
>> Ana Roberta dos Santos Silva
>>
>>
>>
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