[R-br] Instalação da lme4

[FHRB Toledo]

Não sei sua distribuição qual é, mas se for alguma baseada em Debian (com
aptitude), instale pelo terminal o pacote *.deb ao invés do pacote CRAN, ou
seja:

$ sudo apt-get install r-cran-lme4

Pela mensagem de erro, o que te falta é a dependência do RcppEigen.

HTH

FH

2017-07-05 17:45 GMT-05:00 Andre Oliveira via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>:

> Boa noite, estou usando o terminal Karina.Vinícius os avisos são estes!
>
> > install.packages("lme4")
> Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
> (as ‘lib’ is unspecified)
> tentando a URL 'https://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/lme4_1.1-13.
> tar.gz'
> Content type 'application/x-gzip' length 3624472 bytes (3.5 MB)
> ==================================================
> downloaded 3.5 MB
>
> * installing *source* package ‘lme4’ ...
> ** package ‘lme4’ successfully unpacked and MD5 sums checked
> ** libs
> g++  -I/usr/share/R/include -DNDEBUG  -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"
> -I"/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include"   -DNDEBUG
> -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -fpic  -g -O2 -fstack-protector
> --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security
> -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c external.cpp -o external.o
> In file included from external.cpp:8:0:
> predModule.h:12:23: fatal error: RcppEigen.h: Arquivo ou diretório não
> encontrado
>  #include <RcppEigen.h>
>                        ^
> compilation terminated.
> make: ** [external.o] Erro 1
> ERROR: compilation failed for package ‘lme4’
> * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
> Warning in install.packages :
>   installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
>
> The downloaded source packages are in
>     ‘/tmp/RtmpNtJzRo/downloaded_packages’
>
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
>
>
> Em Quarta-feira, 5 de Julho de 2017 17:48, Vinícius Lionel Mateus via R-br
> <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>
> André,
>
> Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE.
> No meu caso, havia dependências não atendidas.
>
> Existe mais informação antes do output que você postou?
>
> Abs,
> Vinícius
>
> On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote:
>
>  Bom dia,
> alguém está com mesmo problema na instalação da lme4?
>
> compilation terminated.
> make: ** [external.o] Erro 1
> ERROR: compilation failed for package ‘lme4’
> * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
>
> The downloaded source packages are in
>     ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’
> Warning message:
> In install.packages("lme4") :
>   installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
> > library(lme4)
> Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
>
>
> Grato
>
> André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística
> aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito
> Santo.  IFES
>
>
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> R-br mailing listR-br em listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
>
>
> --
> Best regards,
>
> Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665)
> Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry
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