[R-br] Como ver o que uma função faz

Tiago Fragoso fragoso2718 em gmail.com
Sexta Agosto 25 14:53:55 -03 2017


Olá,

Essa função não aparece nem pra mim nem pro Marcus quando usamos methods(),
capaz que ela não esteja em versões posteriores do Hmisc.

O asterisco na saida do methods() indica uma função não exportada. Nesse
caso, Hmisc:::Function.cph deveria achar a função. Note os três ":".

2017-08-25 14:10 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil via
R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:

> Ei Marcus,
>
> No meu caso, eu gostaria de ver a Function.cph, mas ela aparece com um
> asterisco que eu não sei o que é. Então...
>
> > Function.cph
> Error: object 'Function.cph' not found
> > Function.cph*
> +
>
> E a função não aparece.
>
> Pedro Brasil
>
> Em 25 de agosto de 2017 13:37, Marcus Nunes <marcus.nunes em gmail.com>
> escreveu:
>
>> Use `methods` para encontrar os métodos da função desejada:
>>
>> > methods(Function)
>> [1] Function.areg.boot Function.transcan
>> see '?methods' for accessing help and source code
>>
>> Esta função tem dois métodos associados a ela: Function.areg.boot e
>> Function.transcan. Agora é só pedir pra ver o código fonte do método que te
>> interessa:
>>
>> > Function.areg.boot
>> function (object, type = c("list", "individual"), ytype =
>> c("transformed",
>>     "inverse"), prefix = ".", suffix = "", pos = -1, ...)
>> {
>>     type <- match.arg(type)
>>     ytype <- match.arg(ytype)
>>     if (missing(type) && !(missing(prefix) & missing(suffix) &
>>         missing(pos)))
>>         type <- "individual"
>>     fit <- object$fit
>>     k <- length(fit)
>>     nam <- names(fit)
>>     g <- vector("list", k)
>>     xtype <- object$xtype
>>     typey <- object$ytype
>>     catl <- object$cat.levels
>>     names(g) <- nam
>>     for (i in 1:k) {
>>         typ <- if (i == 1)
>>             typey
>>         else xtype[i - 1]
>>         if (typ == "c") {
>>             if (i == 1 && ytype == "inverse")
>>                 stop("currently does not handle ytype=\\"inverse\\" when
>> y is categorical")
>>             h <- function(x, trantab) {
>>                 if (is.factor(x))
>>                   x <- as.character(x)
>>                 trantab[x]
>>             }
>>             w <- fit[[i]]$y
>>             names(w) <- catl[[nam[i]]]
>>             formals(h) <- list(x = numeric(0), trantab = w)
>>         }
>>         else {
>>             h <- function(x, trantab) {
>>                 s <- !is.na(x)
>>                 res <- rep(NA, length(x))
>>                 res[s] <- approxExtrap(trantab, xout = x[s])$y
>>                 res
>>             }
>>             fiti <- fit[[i]]
>>             formals(h) <- list(x = numeric(0), trantab = if (i ==
>>                 1 && ytype == "transformed") list(x = fiti[[2]],
>>                 y = fiti[[1]]) else fiti)
>>         }
>>         g[[i]] <- h
>>     }
>>     if (type == "list")
>>         return(g)
>>     fun.name <- paste(prefix, nam, suffix, sep = "")
>>     for (i in 1:k) assign(fun.name[i], g[[i]], pos = pos)
>>     invisible(fun.name)
>> }
>> <environment: namespace:Hmisc>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> --
>> Marcus Nunes
>> Professor Adjunto
>> Universidade Federal do Rio Grande do Norte
>> Centro de Ciências Exatas e da Terra
>> Departamento de Estatística
>> Laboratório de Estatística Aplicada
>> marcus.nunes em ccet.ufrn.br
>> http://marcusnunes.me/
>>
>>
>> 2017-08-25 13:21 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>> via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:
>>
>>> Amigos de R,
>>>
>>> Gostaria de poder ver a sequencia de operações que uma função faz. Na
>>> maioria das funções, basta digitar o nome da função no console, por exemplo
>>>
>>> > trimws
>>> function (x, which = c("both", "left", "right"))
>>> {
>>>     which <- match.arg(which)
>>>     mysub <- function(re, x) sub(re, "", x, perl = TRUE)
>>>     if (which == "left")
>>>         return(mysub("^[ \t\r\n]+", x))
>>>     if (which == "right")
>>>         return(mysub("[ \t\r\n]+$", x))
>>>     mysub("[ \t\r\n]+$", mysub("^[ \t\r\n]+", x))
>>> }
>>> <bytecode: 0x0000000002fdbd78>
>>> <environment: namespace:base>
>>>
>>> No entanto, algumas funções não seguem essa regra e eu não sei como
>>> fazer. Por exemplo
>>>
>>> library(Hmisc)
>>> > Function
>>> function (object, ...)
>>> UseMethod("Function")
>>> <environment: namespace:Hmisc>
>>>
>>> Alguma dica pra conseguir enxergar as operações dessa função?
>>>
>>> Abraço forte,
>>>
>>> Pedro Brasil
>>>
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