[R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência

Terça Outubro 4 18:35:23 BRT 2016

Rafael e demais,

Se não me engano, a Microsoft liberou um programa chamado Powershell que
tem diversas funcionalidades do bash. Este programa é gratuito e tem
versões para Windows (não apenas 10), Mac e Linux.

Em 4 de out de 2016 18:10, "Rafael Tieppo via R-br" <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Eder, tudo bem?
> Tentando ajudar, caso tenha alguma máquina com linux, tenho a seguinte
> sugestão.
> obs.: parece que o update do windows 10 tem ou terá uma layer do shell do
> linux
>
> test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500",
>          "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500")
>
> write.csv(test, "eder.csv", row.names = FALSE)
>
>
> ## indo para o Shell
>
> grep -v "MS" < eder.csv
>
> ## para salvar em outro arquivo
>
> grep -v "MS" < eder.csv > eder2.csv
>
> cat eder2.csv
>
> espero ter ajudado
> Saudações
>
> Rafael Tieppo
> State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering
> site: http://docente.unemat.br/rafaeltieppo/ *blog*:
> https://fuidebicicleta.wordpress.com
> "Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com
> o ambiente".
>
>
> On Tuesday, October 4, 2016 11:00 AM, "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <
> r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
>
> Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
>     r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
>     https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
> corpo da mensagem para
>     r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
> endereço
>     r-br-owner em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
> mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
>
>
> Tópicos de Hoje:
>
>   1. "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett
>       (Luiz Leal)
>   2. Re: Processamento paralelo para um modelo de treinamento
>       (Tito Conte)
>   3. Re: "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett
>       (Tito Conte)
>   4. Identificar variáveis dicotomicas (Elias Carvalho)
>   5. Re: Identificar variáveis dicotomicas (Eduardo Junior)
>   6. Re: Identificar variáveis dicotomicas (Felipe)
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>       (Luiz Henrique Leal)
>   8. Regexp no grep para linhas que não iniciam com sequência
>       (Éder Comunello)
>   9. Re: Regexp no grep para linhas que não iniciam com
>       sequência (Marcus Nunes)
>
>
> ----------------------------------------------------------------------
>
> Message: 1
> Date: Mon, 3 Oct 2016 16:24:09 +0000 (UTC)
> From: Luiz Leal <richfield1974 em yahoo.com>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de
>     Dunnett
> Message-ID: <318158849.4552633.1475511849793 em mail.yahoo.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Boa tarde a todos.Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica"
> para o teste de Dunnett?Desde já agradeçoLuiz
>
> ...Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a
> number of treatments with a single control.
> ...
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/
> 20161003/2222ae8c/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Mon, 3 Oct 2016 17:37:36 -0300
> From: Tito Conte <tito.conte em gmail.com>
> To: Fernando Gama <f.fabiogama88 em gmail.com>,  a lista Brasileira
>     oficial de discussão do programa R.  <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] Processamento paralelo para um modelo de
>     treinamento
> Message-ID:
>     <CACqq46womHtn9eivqKSQG2K_SdSD9zuSF=9JQG82wWoJuJQAYQ em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Ele está rodando paralelo? Você verificou?
>
> Se unix use o comando top e aperte 1
> Se windows abra o gerenciador de tarefas e verifique os núcleos de
> trabalho.
>
> Aproveite para ver se é a CPU do seu PC o problema. Pode ser a memória ou a
> escrita do disco.
>
> Uma solução de baixissimo nível, mas que funciona. é você quebrar o código.
> Em partes e rodar vários Rs, cada um com uma etapa, gerar uns arquivos
> intermediários e depois concatena tudo.
>
>
> Tito Conte
>
>
> Em 2 de outubro de 2016 08:41, Fernando Gama via R-br <
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
> > Pessoal,
> >
> > Estou tentando treinar um modelo com 192 atributos e meu objetivo é, no
> > pós-treinamento, identificar os atributos mais importantes. (seleção de
> > features).
> >
> > A questão é que estou tendo problemas para treinar o modelo porque o
> > processamento é extremamente lento. Pesquisei sobre o parallel e o
> > doParallel e coloquei no meu código mas aparentemente não obtive
> resultados
> > segue um trecho do código:
> >
> > library(caret)
> > library(doParallel)
> >
> > myControl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats =
> 3,
> > allowParallel = TRUE)
> >
> > t<-proc.time()
> >
> > cl <- makeCluster(detectCores())
> >
> > registerDoParallel(cl)
> >
> > model <- train(GENRE~., data=dtset_genres, method="lvq", preProcess =
> > "scale", trControl = myControl)
> >
> > stopCluster(cl)
> >
> > proc.time()-t
> >
> >
> > Alguma sugestão?
> >
> > --
> > Att,
> >
> > | Fernando Gama da Mata |
> > | Database Specialist | Master's Degree UFPA |
> >
> > | Contacts: +55 91 99150 0365 | f.fabiogama88 em gmail.com | Social
> > Networks: [ <https://www.facebook.com/fernando.gama.13>][
> > <https://plus.google.com/+FernandoGama13>][
> > <https://www.linkedin.com/in/fernandogama>] |
> >
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
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> URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/
> 20161003/6d0dada5/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Mon, 3 Oct 2016 17:38:38 -0300
> From: Tito Conte <tito.conte em gmail.com>
> To: Luiz Leal <richfield1974 em yahoo.com>,  a lista Brasileira oficial
>     de discussão do programa R.  <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de
>     Dunnett
> Message-ID:
>     <CACqq46zura6UmNb=YD0RG84RF4hucLL-MT2aRKQQC8aXVbqnsQ em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Achei isso:
>
> "I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use
> Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups
> you need to run to take a conservative approach."
>
> Tito Conte
>
>
> 2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:
>
> > Boa tarde a todos.
> > Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de
> > Dunnett?
> > Desde já agradeço
> > Luiz
> >
> > ...
> > *Dunnett's test* is a multiple comparison
> > <https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_comparisons> procedure to
> compare
> > each of a number of treatments with a single control.
> > ...
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
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> 20161003/1a2c2fb0/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 4
> Date: Mon, 3 Oct 2016 20:18:27 -0300
> From: Elias Carvalho <ecacarva em gmail.com>
> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R.
>     <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas
> Message-ID:
>     <CAH8E6UvJE4FJdg3sqPSyEJuUy1QR45KEW0B3kTS4i6QUCyypEw em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Boa noite pessoal
>
> Existe alguma função do R que permite identificar variáveis dicotomicas em
> um dataframe ?
>
> Como por exemplo: 0 e 1 ou 1 e 2 no mesmo dataframe
>
> Obrigado
>
> --
>
>
> *In Jesu et Maria*
> *Obrigado*
> *Prof. Elias Carvalho*
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/
> 20161003/4c256e4c/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 5
> Date: Mon, 3 Oct 2016 20:48:23 -0300
> From: Eduardo Junior <edujrrib em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas
> Message-ID:
>     <CAO7eVPz+Nbop7a6e6=yvmMcT4ab2jJOp7KWQoHYvcbT_omCeDA em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> As funções nativas.
>
> ## Mostra quantos valores unicos tem em cada coluna
> sapply(dados, function(x) length(unique(x)))
>
> ## Os iguais a dois ...
> sapply(dados, function(x) length(unique(x))) == 2L
>
> Att,
> Eduardo E. R, Junior <http://jreduardo.github.io/>
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> 20161003/bf2f4bad/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 6
> Date: Mon, 3 Oct 2016 20:57:38 -0300
> From: Felipe <felipe.e.barletta em gmail.com>
> To: Elias Carvalho <ecacarva em gmail.com>, a lista Brasileira oficial de
>     discussão do programa R.  <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] Identificar variáveis dicotomicas
> Message-ID: <efd9e8d7-87a5-26cf-bca9-3bf1576561b0 em gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset=utf-8; format=flowed
>
> Se as variáveis dicotômicas tiverem valores 0 ou 1, pode tentar da
> seguinte maneira:
>
>
> dados <- data.frame(x1=rbinom(100,1,.5),x2=rnorm(100))
> sapply(dados, function(x) all(x%in%c(0,1)))
>     x1    x2
>   TRUE FALSE
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 7
> Date: Mon, 03 Oct 2016 22:50:14 -0300
> From: Luiz Henrique Leal <richfield1974 em yahoo.com>
> To: Tito Conte <tito.conte em gmail.com>
> Cc:     a lista Brasileira oficial de discussão do programa R.
>     <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de
>     Dunnett
> Message-ID: <owgspse5irq36a1succbe6m8.1475545814367 em email.android.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Muito obrigado
>
> Conectado pela Motorola
>
> Tito Conte <tito.conte em gmail.com> escreveu:
>
> >Achei isso:
> >
> >"I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use
> Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups
> you need to run to take a conservative approach."
> >
> >
> >Tito Conte
> >
> >
> >2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:
> >
> >Boa tarde a todos.
> >
> >Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de
> Dunnett?
> >
> >Desde já agradeço
> >
> >Luiz
> >
> >
> >...
> >
> >Dunnett's test is a multiple comparison procedure to compare each of a
> number of treatments with a single control.
> >
> >...
> >
> >
> >_______________________________________________
> >R-br mailing list
> >R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> >https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
> >
> >
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/
> 20161003/8ca1874d/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 8
> Date: Tue, 4 Oct 2016 08:49:15 -0400
> From: Éder Comunello <comunello.eder em gmail.com>
> To: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com
>     sequência
> Message-ID:
>     <CABmC8gmXyf0Cv1movTQqUktHucnSUSd-rxLWv0CLDZLcG6aEcw em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Senhores, bom dia!
>
> Considerando o vetor:
>
> test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500",
>           "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500")
>
> Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS":
> grep("^MS", test, val=T)
>
> # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500"
>
>
> Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam com
> a sequência foi:
> grep("^!(MS)", test, val=T)
> # character(0)
>
> Consegui uma solução estranha com:
> grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T)
>
> # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500"
>
>
> Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como "MSC".
>
> Embora existam alternativas como:
> test[-grep("^MSC", test)]
>
> # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400"
> "MTK500"
>
>
> Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente
> uma regexp.
>
> Grato,
>
> ================================================
> Éder Comunello
> Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
> DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
> MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM)
> ---
> Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>|
> ================================================
> GEO, -22.2752, -54.8182, 408m
> UTC-04:00 / DST: UTC-03:00
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/
> 20161004/ed7972df/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Message: 9
> Date: Tue, 4 Oct 2016 10:14:36 -0300
> From: Marcus Nunes <marcus.nunes em gmail.com>
> To: comunello.eder em gmail.com,  a lista Brasileira oficial de
>     discussão do programa R.  <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] Regexp no grep para linhas que não iniciam com
>     sequência
> Message-ID:
>     <CA+QGQvvMACE6i_RA46nvpY-T34QS9hxZadhbNsaezwhXTg4SbQ em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Se entendi corretamente o teu problema, não é necessário utilizar uma
> regex:
>
> test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500", "PRA100",
> "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500")
>
> grep("MS", test, val=T, invert=T)
>
>
>
> 2016-10-04 9:49 GMT-03:00 Éder Comunello via R-br <
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> :
>
> > Senhores, bom dia!
> >
> > Considerando o vetor:
> >
> > test <- c("SPA100", "MSA200", "MSB300", "MSC400", "MSC500",
> >          "PRA100", "PRC200", "MGV100", "MTJ400", "MTK500")
> >
> > Posso obter facilmente os valores iniciados com a sequência "MS":
> > grep("^MS", test, val=T)
> >
> > # [1] "MSA200" "MSB300" "MSC400" "MSC500"
> >
> >
> > Uma primeira tentativa, sem sucesso, para obter linhas que não iniciam
> com
> > a sequência foi:
> > grep("^!(MS)", test, val=T)
> > # character(0)
> >
> > Consegui uma solução estranha com:
> > grep("^[^M]|^M[^S]", test, val=T)
> >
> > # [1] "SPA100" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400" "MTK500"
> >
> >
> > Mas essa solução é limitada quando usando strings maiores, tal como
> "MSC".
> >
> > Embora existam alternativas como:
> > test[-grep("^MSC", test)]
> >
> > # [1] "SPA100" "MSA200" "MSB300" "PRA100" "PRC200" "MGV100" "MTJ400"
> "MTK500"
> >
> >
> > Gostaria de saber se há uma forma fácil de fazer isso usando diretamente
> > uma regexp.
> >
> > Grato,
> >
> > ================================================
> > Éder Comunello
> > Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
> > DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
> > MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM)
> > ---
> > Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>|
> > ================================================
> > GEO, -22.2752, -54.8182, 408m
> > UTC-04:00 / DST: UTC-03:00
> >
> >
> >
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
>
>
>
> --
> Marcus Nunes
> http://marcusnunes.me/
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> 20161004/585080f4/attachment-0001.html>
>
> ------------------------------
>
> Subject: Legenda do Digest
>
> _______________________________________________
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> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>
>
> ------------------------------
>
> Fim da Digest R-br, volume 70, assunto 6
> ****************************************
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
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