[R-br] Processamento paralelo para um modelo de treinamento

Tito Conte tito.conte em gmail.com
Segunda Outubro 3 17:37:36 BRT 2016


Ele está rodando paralelo? Você verificou?

Se unix use o comando top e aperte 1
Se windows abra o gerenciador de tarefas e verifique os núcleos de trabalho.

Aproveite para ver se é a CPU do seu PC o problema. Pode ser a memória ou a
escrita do disco.

Uma solução de baixissimo nível, mas que funciona. é você quebrar o código.
Em partes e rodar vários Rs, cada um com uma etapa, gerar uns arquivos
intermediários e depois concatena tudo.


Tito Conte


Em 2 de outubro de 2016 08:41, Fernando Gama via R-br <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Pessoal,
>
> Estou tentando treinar um modelo com 192 atributos e meu objetivo é, no
> pós-treinamento, identificar os atributos mais importantes. (seleção de
> features).
>
> A questão é que estou tendo problemas para treinar o modelo porque o
> processamento é extremamente lento. Pesquisei sobre o parallel e o
> doParallel e coloquei no meu código mas aparentemente não obtive resultados
> segue um trecho do código:
>
> library(caret)
> library(doParallel)
>
> myControl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats = 3,
> allowParallel = TRUE)
>
> t<-proc.time()
>
> cl <- makeCluster(detectCores())
>
> registerDoParallel(cl)
>
> model <- train(GENRE~., data=dtset_genres, method="lvq", preProcess =
> "scale", trControl = myControl)
>
> stopCluster(cl)
>
> proc.time()-t
>
>
> ​Alguma sugestão?​
>
> --
> Att,
>
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> | Database Specialist | Master's Degree UFPA |
>
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