[R-br] Diagrama de abundância-rank no R

Éder Comunello comunello.eder em gmail.com
Quarta Março 23 14:44:07 BRT 2016


Sergio, boa tarde!

Você teria um conjunto de dados pra testar? No teste que fiz usei o
logaritmo dos valores de dados para representar no gráfico, substituindo a
notação do eixo (-1, 0, 1, 2) pelos valores na escala original (.1, 1, 10,
100).

### <code r>
dados <- structure(c(1, 3, 4, 5, 8, 13, 25, 32, 36, 45, 55, 35, 12, 10,
8, 7, 3, 2, 1, NA, 66, 29, 15, 15, 14, 12, 3, 0.5, 0.4, 0.3,
72, 50, 35, 33, 23, 16, 4, 1, NA, NA), .Dim = c(10L, 4L), .Dimnames = list(
    NULL, c("rank", "alto", "medio", "baixo")))

dados.log <- cbind(dados[,1], log10(dados[,2:4]))

log10(c(.1, 1, 10, 100)) # [1] -1  0  1  2
plot(1:50, seq(-1, 2, len=50), type="n", xlab="Ranking", ylab="Abundância
relativa %", yaxt="n")
axis(side=2, at=c(-1, 0, 1, 2), labels=c(.1,1,10,100), tick = TRUE)

lines(dados.log[,c(1,2)], lty=1, lwd=2, col=2)
lines(dados.log[,c(1,3)], lty=2, lwd=2, col=3)
lines(dados.log[,c(1,4)], lty=3, lwd=2, col=4)
abline(h=c(-1,0,1,2), lty=3, col=1)
legend(35,1.5, legend = c("alto", "médio", "baixo"), col = 2:4, lty=1:3,
cex = .75, lwd = 2)
### </code>

[image: Imagem inline 2]


​
================================================
Éder Comunello
Agronomist (UEM), MSc in Environ. Sciences (UEM)
DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
Dourados, MS, Brazil |<O>|
================================================
GEO, -22.2752, -54.8182, 408m
UTC-04:00 / DST: UTC-03:00




Em 23 de março de 2016 02:17, sergio simao joao <sergiosimaojoao em live.com>
escreveu:

>
>
> ------------------------------
> Bom dia.
> Alguém sabe quais os comandos a usar no R para construir um diagrama como
> o que segue abaixo.
>
> [image: Inline images 1]
>
>
>
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Tipo: image/png
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